Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,360 |
+G |
coding (166/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,358 | 1 | . | G | 99.5%
| 703.2
/ ‑3.7
| 194 | coding (164/1314 nt) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base G (90/103); total (90/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.41e-01 |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑GGACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544283‑3544437
|
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGcc < 2:317085/93‑1 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGcc > 1:1757879/1‑93 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCt < 2:990068/93‑1 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCt < 2:1176655/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCtt > 2:1234695/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGATGCTCGGTAGCCTTg > 2:2631687/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGc < 2:3146517/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGc > 1:2568519/1‑93 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCt > 1:6145588/1‑93 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCt < 1:1982322/93‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:6050876/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:6391831/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTg < 2:2722308/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGa > 1:4500436/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc < 2:429641/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc > 1:1422522/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc > 2:1568719/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc > 2:2963480/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATct > 2:3692683/1‑92 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:1364412/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa > 2:1327937/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 1:4133975/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 2:22570/1‑93 (MQ=255)
gTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg < 1:3960345/93‑1 (MQ=255)
gTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg < 2:4155502/93‑1 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg < 2:2458899/93‑1 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg < 1:4954845/93‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGt < 1:4276255/93‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGt > 2:5524799/1‑93 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGt < 1:5958219/93‑1 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtt > 2:1143453/1‑93 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtt > 2:5061425/1‑93 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtt < 2:3405919/93‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 1:1549352/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 1:4902173/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGgttt > 1:245279/1‑93 (MQ=255)
tAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTg > 1:2643464/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc < 1:5196773/93‑1 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcg > 1:1134039/1‑93 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa < 2:446941/93‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 2:4019118/93‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 1:2051785/93‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt > 2:3328427/1‑93 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 2:5571123/93‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 1:67665/93‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc > 2:5942645/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg > 2:5301526/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 1:4404572/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 1:6258505/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:5417538/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGCGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 1:5639240/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg < 1:6452548/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTggg > 1:3533903/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc > 1:5310863/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc < 1:5564505/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCa < 1:5820960/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 2:3255430/1‑93 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa < 1:3309386/93‑1 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 2:3471556/1‑93 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa > 2:4090987/1‑93 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa > 1:1900557/1‑93 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGGCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt > 1:631741/1‑93 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTTGGCAAAAt < 1:6502106/93‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 2:6471741/93‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt > 1:1158355/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 2:5715382/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt > 1:5894980/1‑93 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 1:4595026/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg > 2:1384112/1‑93 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 2:2414102/93‑1 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 2:193902/1‑93 (MQ=255)
aGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc < 1:761220/93‑1 (MQ=255)
aGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc < 2:3853344/93‑1 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGcg > 2:6380640/1‑92 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 2:1773733/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTTATCATGGGTTTGGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGa < 1:3026918/93‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGa > 2:832099/1‑93 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAc < 2:5323470/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAc < 1:2490911/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAc < 2:1666485/93‑1 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt < 1:5092165/93‑1 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt < 2:1017110/93‑1 (MQ=255)
tGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg > 2:1897430/1‑93 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCg > 2:5006057/1‑93 (MQ=255)
cTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCgg < 1:167480/93‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt > 1:5508448/1‑93 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt > 1:2573785/1‑93 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:3127504/93‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg < 1:4385345/93‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTC‑GGAG‑GGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg < 2:5179049/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc < 2:1636767/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc < 2:6640734/93‑1 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg < 1:2906419/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGca > 1:1469318/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGca > 1:1332448/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcac > 1:2680876/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTAGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGCGgcgccc > 2:6296775/1‑91 (MQ=255)
gCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa < 2:4732363/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa < 2:6019347/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTGTCGG‑‑CGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa < 2:1744600/93‑1 (MQ=255)
|
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑GGACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544283‑3544437
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑CGGACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC > NC_000913/3544268‑3544435
|
TCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGG > SRR4302547.1063592/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTG > SRR4302547.5769199/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTG > SRR4302547.4945322/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTG < SRR4302547.2049196/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGC > SRR4302547.2620393/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCT > SRR4302547.6273097/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302547.6525191/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302547.6176402/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302547.2021684/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGA > SRR4302547.4593395/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302547.5468541/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATC > SRR4302547.1451007/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCA > SRR4302547.458837/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGACTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302547.6576568/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302547.4218083/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG < SRR4302547.4040907/94‑1 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302547.5253576/94‑1 (MQ=60)
TGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT < SRR4302547.5057403/94‑1 (MQ=60)
TGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302547.4377487/1‑94 (MQ=60)
GGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTT < SRR4302547.6081763/94‑1 (MQ=60)
GGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTT < SRR4302547.4364077/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302547.5679891/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302547.1580193/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTT > SRR4302547.249859/1‑94 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302547.5003684/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302547.727688/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTG > SRR4302547.2696664/1‑94 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG < SRR4302547.1632161/94‑1 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC > SRR4302547.5191862/1‑94 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC < SRR4302547.4554120/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG < SRR4302547.5303720/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG > SRR4302547.1156943/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG < SRR4302547.2479410/94‑1 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC < SRR4302547.6183263/94‑1 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGTTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA < SRR4302547.1219469/94‑1 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302547.2573233/1‑94 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG > SRR4302547.2984115/1‑94 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302547.2092706/94‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302547.68931/94‑1 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT < SRR4302547.6728916/94‑1 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT < SRR4302547.1474841/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302547.6388517/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302547.3110006/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302547.4495307/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGCGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302547.5755643/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302547.6586965/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302547.3238172/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG > SRR4302547.3606063/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302547.1775600/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302547.6496218/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC > SRR4302547.5420391/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302547.5679268/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA > SRR4302547.1424701/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA < SRR4302547.5941386/94‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA < SRR4302547.3376115/94‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA > SRR4302547.1938160/1‑94 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGGCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT > SRR4302547.643410/1‑94 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302547.5645213/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT > SRR4302547.1181784/1‑94 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTTGGCAAAATG < SRR4302547.6637448/94‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG > SRR4302547.5973551/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCTAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302547.6592458/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302547.6132591/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302547.6017042/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302547.4690105/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGGCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > SRR4302547.3391771/1‑94 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA < SRR4302547.775574/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA < SRR4302547.2017098/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > SRR4302547.1565576/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG > SRR4302547.6350601/1‑94 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA > SRR4302547.4023640/1‑94 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTTATCATGGGTTTGGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC < SRR4302547.3087103/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC < SRR4302547.2650169/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302547.2541227/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302547.272625/94‑1 (MQ=60)
TTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG < SRR4302547.5197193/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG < SRR4302547.4300204/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG > SRR4302547.5332847/1‑94 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT > SRR4302547.942921/1‑94 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302547.170557/94‑1 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT > SRR4302547.5622181/1‑94 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302547.1830452/94‑1 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT > SRR4302547.2625741/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG > SRR4302547.6059037/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG < SRR4302547.3189562/94‑1 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGC > SRR4302547.503519/1‑94 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGC < SRR4302547.4475564/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302547.2748307/1‑94 (MQ=60)
TCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGC > SRR4302547.640028/1‑94 (MQ=60)
TCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGC < SRR4302547.2964369/94‑1 (MQ=60)
CAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302547.1498675/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302547.1359233/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC < SRR4302547.4062840/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC > SRR4302547.2734710/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC > SRR4302547.2623850/1‑94 (MQ=60)
|
TCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑CGGACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC > NC_000913/3544268‑3544435
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
