Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,721,374 |
A→G |
intergenic (+316/+51) |
RPPX_16570 → / ← RPPX_16575 |
glutathione S‑transferase/glutaredoxin |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,721,374 | 0 | A | G | 86.4%
| 226.5
/ 26.0
| 104 | intergenic (+316/+51) | RPPX_16570/RPPX_16575 | glutathione S‑transferase/glutaredoxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/5); new base G (54/35); total (63/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GGTTAGGGCCTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATG > CP009974/3721226‑3721519
|
ggtTAGGGCCTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGt > 1:1625443/1‑151 (MQ=21)
aGGGCCTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGccc > 2:1087010/1‑150 (MQ=14)
gCCTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCt > 1:3449226/1‑151 (MQ=17)
ccTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCtt < 1:3763065/151‑1 (MQ=14)
cTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTc > 1:2438506/1‑151 (MQ=17)
cTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTc > 2:5157913/1‑151 (MQ=17)
gggttGAGGGGGGCAGCAGCCACCCGCGGCAGGTGCCGATGGTGGGCTGAAAAGCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAAGCCTTGTGGGAGCGGGCGTGGCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTcgc < 2:3741258/148‑1 (MQ=11)
ggCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTcgc < 1:5157913/151‑1 (MQ=17)
tGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGc > 1:3404896/1‑151 (MQ=11)
gTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCAt < 2:5101732/151‑1 (MQ=14)
ttttCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATc < 1:2822015/151‑1 (MQ=17)
ttttCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATc > 2:242800/1‑151 (MQ=32)
tttCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATcc < 1:775485/151‑1 (MQ=18)
tCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAg > 2:2015983/1‑151 (MQ=21)
tCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAg < 1:4956872/151‑1 (MQ=21)
ccAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAgg < 1:1951321/151‑1 (MQ=25)
ccAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATATGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAACCCGCTCATCCAgg > 2:2977401/1‑151 (MQ=255)
ccAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGACCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCCAACCGCGCATCCAgg > 2:4170136/1‑151 (MQ=255)
cgcTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCCAACCGCTCATCCAGGTAAGc > 1:781537/1‑151 (MQ=255)
gcTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCg < 2:4268336/151‑1 (MQ=255)
cTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCga > 1:2886531/1‑151 (MQ=255)
ttGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTaa < 1:3841328/146‑1 (MQ=255)
ttGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTaa > 2:3841328/1‑146 (MQ=38)
tGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCgatg < 1:242800/151‑1 (MQ=255)
gcgcAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCgatga < 2:5207132/151‑1 (MQ=255)
gcAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATc > 1:2959617/1‑151 (MQ=255)
gcAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCCTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCGGATGGCGGCAAACCGCCCCTCCAGGTAAGCgatggtg > 1:749259/1‑148 (MQ=14)
cAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCg < 2:2058127/151‑1 (MQ=255)
cAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCg < 2:2058243/151‑1 (MQ=255)
aaTCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGc > 1:907914/1‑151 (MQ=255)
ccTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCtt > 2:3726999/1‑151 (MQ=255)
cTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTg > 1:3331260/1‑151 (MQ=255)
cTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTg > 1:5172434/1‑151 (MQ=255)
tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGa < 1:4111888/151‑1 (MQ=255)
gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGAc > 1:2824495/1‑151 (MQ=255)
gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGAc < 2:1236684/151‑1 (MQ=255)
tgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACt < 2:1671480/151‑1 (MQ=255)
ggAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCa > 1:1449794/1‑151 (MQ=255)
gAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCAt > 1:190083/1‑151 (MQ=255)
aGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATa > 2:2339391/1‑151 (MQ=255)
aGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATa > 2:2462602/1‑151 (MQ=255)
gcgcgcGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATAc < 1:4552012/151‑1 (MQ=255)
gCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATAc > 1:2255151/1‑151 (MQ=255)
cGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCCGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCACGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGGCAGTGAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCCATGCTCCCCTTTCACTCATACa > 2:2871345/1‑151 (MQ=14)
cGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACa < 1:3199552/151‑1 (MQ=255)
gggCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCa < 1:5025687/120‑1 (MQ=25)
gggCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACAt > 1:1976404/1‑151 (MQ=255)
gggCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGAGCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACAt > 2:3231051/1‑151 (MQ=255)
gggCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCa > 2:5025687/1‑120 (MQ=35)
gCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATcc < 1:4171764/151‑1 (MQ=255)
gTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACCAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTCGACTCATACATCCAg > 1:2245848/1‑151 (MQ=255)
gTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCCGATGGCGGCAAACCCCTCATCCAGGTCAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATcccc > 2:5173523/1‑149 (MQ=255)
gTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCCTACATcccg > 2:213078/1‑149 (MQ=255)
gTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAg > 2:1126544/1‑151 (MQ=255)
gTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAg < 1:4517693/151‑1 (MQ=255)
gTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAg > 1:4494742/1‑151 (MQ=255)
gTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAAGGGACCTGCAGCGTCCGTGAGATGGCGGCAAACCGCTCACCCAGGCAAGCGACGACCCCCTCGGCCTCCCACATCCac > 2:5173600/1‑150 (MQ=14)
tGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAgg > 2:1070442/1‑151 (MQ=255)
gCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCCGATGGCGGCAAACCCCTCATCCAGGTAACCGCTCACCGCCTTGGACTCATACATCCacgc > 2:4589443/1‑148 (MQ=17)
gCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTACACGGTGATCGCCTTGCACTCATCCacaccgac > 2:2019618/1‑144 (MQ=14)
ccGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCa > 1:2078082/1‑151 (MQ=255)
ccGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCa > 1:353000/1‑151 (MQ=255)
ccGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCa > 1:4269428/1‑151 (MQ=255)
cgcgAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCAc < 2:207445/151‑1 (MQ=255)
gAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCtt < 1:1638455/151‑1 (MQ=255)
gAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCtt > 1:1290706/1‑151 (MQ=255)
gAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTc > 2:421025/1‑133 (MQ=255)
gAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTc < 1:421025/133‑1 (MQ=255)
gAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCtt < 1:2465478/151‑1 (MQ=255)
aaCACGGGCGCGCCCCGTGCCAACCACTGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCAGCTCCCACAAGGGGTCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTg < 2:643558/151‑1 (MQ=21)
aaCACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTg > 2:3322834/1‑151 (MQ=255)
aaCACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTg > 1:430137/1‑151 (MQ=255)
acacGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACCCATACATCCAGGTCACCTTGc > 2:1406503/1‑151 (MQ=255)
cacGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGcc > 2:2813882/1‑151 (MQ=255)
cacGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGcc > 2:2612787/1‑151 (MQ=255)
acGGGCGCAGCACGTGCCAACCCCCGCGGTGCGTGCTTCGCGGGCTCGCGCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGACTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCg < 2:1213958/151‑1 (MQ=21)
gggCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTCCCGGc > 1:5278627/1‑151 (MQ=255)
gggCGCAGCCCGTGCCAACCAACGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGc < 1:1387319/151‑1 (MQ=255)
gggCGCAGCACGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGc > 1:3245936/1‑151 (MQ=255)
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cgcAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGcttc < 2:2928134/151‑1 (MQ=255)
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GTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAG > SRR10918230.4515071/1‑151 (MQ=60)
GTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAG < SRR10918230.4538112/151‑1 (MQ=60)
GCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGAGATCGGCAGCGcacacgacataacggcagtcaccgtcttccagcgcgtatgccgtggcctgctcgagacagcaaacaa > SRR10918230.4613510/1‑84 (MQ=0)
CCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCA > SRR10918230.4288626/1‑151 (MQ=60)
CCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCA > SRR10918230.354196/1‑151 (MQ=60)
CCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCA > SRR10918230.2086856/1‑151 (MQ=60)
GCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACC < SRR10918230.5233881/151‑1 (MQ=60)
GAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTT > SRR10918230.1296496/1‑151 (MQ=60)
GAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTT < SRR10918230.1645650/151‑1 (MQ=60)
GAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTT < SRR10918230.2476068/151‑1 (MQ=60)
AACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTG > SRR10918230.431627/1‑151 (MQ=60)
ACACGGGCGCAGCCCGTGCCAGCCATCGAGGTGCGTGCTTGGCGGGCAGGCCCGTGCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGC < SRR10918230.4993928/151‑1 (MQ=60)
GGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTCCCGGC > SRR10918230.5303134/1‑151 (MQ=60)
GGGCGCAGCCCGTGCCAACCAACGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGC < SRR10918230.1393570/151‑1 (MQ=60)
GGGCGCAGCACGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGC > SRR10918230.3260047/1‑151 (MQ=60)
GCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTT < SRR10918230.2353819/151‑1 (MQ=60)
CGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTC > SRR10918230.2629372/1‑151 (MQ=60)
GCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCACGCTCCCACACGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGCTGGCGGCAAACCGCgcattctggtgcgaaaggaccgccttgaactcgtatgtaaaggtcaccgccccgtgggca > SRR10918230.1345488/1‑91 (MQ=0)
CAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTT > SRR10918230.3531395/1‑151 (MQ=60)
CAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGAACTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCACACCGCTCATCCAGGTCAGCGATGATCGCCCTGGCCCCATACAGCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTT > SRR10918230.1060245/1‑151 (MQ=60)
CGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCcggtgggcgatgcctggcttgagcggataagcccccacccccgtgctgtctccttcaagg > SRR10918230.2813732/1‑91 (MQ=8)
GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGC < SRR10918230.2128339/151‑1 (MQ=60)
GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGC > SRR10918230.3636989/1‑151 (MQ=60)
CTGCCAACCACCGCCGGGCCTTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCACCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGC < SRR10918230.362409/151‑1 (MQ=60)
TGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCG < SRR10918230.3040791/151‑1 (MQ=60)
TGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCtttcttttttcaagcagaggccggcatacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctctgccgatctcagcagccacccgcggcatgtgccgatggtgggc < SRR10918230.4963255/151‑111 (MQ=0)
CAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCcggtgagcggtgattggcttggacggatccgtccacatccccgggccgtcccgttcatggggcgg > SRR10918230.30941/1‑86 (MQ=11)
AACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGG > SRR10918230.5419718/1‑151 (MQ=60)
AACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGG > SRR10918230.2921929/1‑151 (MQ=60)
ACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATG < SRR10918230.2024492/151‑1 (MQ=60)
GCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCA < SRR10918230.934456/151‑1 (MQ=60)
GGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGTCATGGCACT > SRR10918230.1488066/1‑151 (MQ=60)
|
GGTTAGGGCCTGGCTTGAGCGGGTCAGCAGCCACCCGCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCAGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATCGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACT > CP009974/3721226‑3721524
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
