Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,957,233 |
2 bp→GT |
coding (666‑667/756 nt) |
RPPX_21945 → |
ATPase AAA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,957,233 | 0 | T | G | 99.5%
| 495.0
/ NA
| 205 | R222R (CGT→CGG) | RPPX_21945 | ATPase AAA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (101/103); total (102/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP009974 | 4,957,234 | 0 | C | T | 99.5%
| 503.8
/ NA
| 205 | L223L (CTG→TTG) | RPPX_21945 | ATPase AAA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (102/102); minor base G (0/1); total (102/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTCACCAGCCAGATGCCGGTGGACAAATGGCATGCGCTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGACGCGATCCTCGACCGTCTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTGCGCTCCGACTGCCTGTCCAAGTGGACGTGGA > CP009974/4957089‑4957375
||
tACCGCAGCGCAACGCCGCGAGATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAGCCGCTCGACACGGGTGACCAGCTAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCGCTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGGCCGGTTGGTg < 2:4392034/151‑1 (MQ=11)
aCCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGTTTGGTGc > 1:246630/1‑151 (MQ=11)
aCCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGc < 1:1522477/151‑1 (MQ=11)
ccGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGca > 1:1748512/1‑151 (MQ=11)
cGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcac > 2:5376444/1‑151 (MQ=11)
cGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcac < 1:2594287/151‑1 (MQ=11)
cGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcac > 1:969431/1‑151 (MQ=11)
gCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaca > 1:3171524/1‑151 (MQ=11)
gCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaca > 1:3005618/1‑151 (MQ=11)
gCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaca > 1:1781870/1‑151 (MQ=11)
cggcggAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACaa < 2:1925814/149‑1 (MQ=11)
aGCGCGCCGCCGGGAGATGCGCGAACTGCTGGACGCCCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc < 2:2723143/151‑1 (MQ=11)
gcgcAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACg < 1:2945499/151‑1 (MQ=11)
aCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTac > 2:679263/1‑150 (MQ=11)
aCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTAt < 2:3562897/151‑1 (MQ=11)
aCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTAt < 1:1575432/151‑1 (MQ=11)
cgccgcGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATc < 1:1778899/151‑1 (MQ=11)
gccgcGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCg < 1:2050262/151‑1 (MQ=11)
gCTACGGGAACCGCGGGACAGTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCaa < 2:3618643/151‑1 (MQ=11)
gCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCaa < 1:5078944/151‑1 (MQ=11)
tACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGc > 2:4637018/1‑151 (MQ=11)
aCGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCg > 1:1223379/1‑151 (MQ=11)
cGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGt > 1:3375107/1‑151 (MQ=11)
cGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGt < 1:2832001/151‑1 (MQ=11)
ggCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTg < 1:1348072/151‑1 (MQ=11)
gCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGc > 2:4549912/1‑151 (MQ=11)
gCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGc > 2:4799528/1‑151 (MQ=11)
gCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGc < 1:4717109/151‑1 (MQ=11)
gCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGc > 2:3486355/1‑151 (MQ=11)
caCCGCTGGACACTGGTGACCAGCGAGATGCCGGTGGATAAATGGAATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATACTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcga < 2:2309267/150‑1 (MQ=11)
aaCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcga > 1:4556800/1‑151 (MQ=11)
aaCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcga > 1:2440923/1‑151 (MQ=11)
aCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcgac < 2:1757485/151‑1 (MQ=11)
aCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcgac < 1:2915411/151‑1 (MQ=11)
aCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcgac > 1:3567928/1‑151 (MQ=11)
gCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaa < 2:1200151/151‑1 (MQ=11)
gCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaa < 2:4966805/151‑1 (MQ=14)
cTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaaa > 2:2957711/1‑151 (MQ=11)
cTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaaa > 1:3755854/1‑151 (MQ=14)
cTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGaaa > 1:4108282/1‑151 (MQ=14)
gACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTg > 1:1672887/1‑151 (MQ=11)
acacTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGa > 1:1174772/1‑151 (MQ=11)
acTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAcg > 1:1011018/1‑151 (MQ=11)
ggtgaCCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAcggcg < 2:789084/147‑1 (MQ=14)
tgaCCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACggcggc > 1:1764369/3‑151 (MQ=14)
ccagccagATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAgg < 1:3437614/151‑1 (MQ=14)
ccagccagATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAgg < 1:5259944/151‑1 (MQ=14)
cagccagATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAggg > 2:516987/1‑151 (MQ=14)
gccagATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGAc < 1:1669684/151‑1 (MQ=14)
ccagATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGAcg > 2:2097484/1‑150 (MQ=14)
agATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTc < 1:1912427/151‑1 (MQ=14)
gATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCa > 1:2647206/1‑151 (MQ=14)
ggTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTaa < 2:168090/151‑1 (MQ=14)
gTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAAc < 1:4643308/151‑1 (MQ=14)
gTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAAc > 1:3539128/1‑151 (MQ=14)
tGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACa < 1:2402768/151‑1 (MQ=14)
tGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACa < 1:2187479/151‑1 (MQ=14)
tGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACa < 2:1119484/151‑1 (MQ=14)
tGGATAAATGGCATGCACTGACCGGCGATCCGACCTTGTGCGATGTGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCCAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTacaa > 2:5294264/1‑148 (MQ=14)
ggATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACaa > 1:4939937/1‑151 (MQ=14)
ataaaTGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATg > 1:3033622/3‑151 (MQ=14)
taaaTGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGc < 2:3758411/150‑1 (MQ=255)
aagtGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCa < 2:4205772/148‑1 (MQ=14)
aaaTGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCa < 2:1535545/151‑1 (MQ=14)
aaaTGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCa > 1:4568834/1‑151 (MQ=14)
aaTGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCaa < 1:5118845/151‑1 (MQ=14)
aaTGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCaa < 2:1748512/151‑1 (MQ=14)
tGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAAcc < 2:676415/151‑1 (MQ=255)
ggCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAAccc > 1:1571131/1‑151 (MQ=14)
cacTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTc < 1:3260497/149‑1 (MQ=255)
acTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCg < 1:127683/150‑1 (MQ=255)
acTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCg > 1:3954123/2‑151 (MQ=255)
acTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCg < 1:1309492/150‑1 (MQ=255)
tGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCt < 2:2469334/151‑1 (MQ=255)
tGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCt < 2:1599354/151‑1 (MQ=255)
gATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCTCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTg < 1:252702/151‑1 (MQ=255)
gATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTg > 1:3583038/1‑151 (MQ=255)
aTCGGCGATCCGACCGTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTgc < 1:5011631/151‑1 (MQ=255)
tCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTgcg > 1:3276447/1‑151 (MQ=255)
cGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTgcgc > 1:3781537/1‑151 (MQ=255)
ggCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTgcgcc > 2:253039/1‑150 (MQ=255)
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ACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGAC < SRR10918230.3057026/151‑1 (MQ=18)
CTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAA > SRR10918230.3772172/1‑151 (MQ=26)
CTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAA > SRR10918230.4126594/1‑151 (MQ=26)
TCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAAT < SRR10918230.1774019/151‑1 (MQ=27)
GACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTG > SRR10918230.1680218/1‑151 (MQ=27)
ACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGA > SRR10918230.1179827/1‑151 (MQ=27)
CACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAC > SRR10918230.1337609/1‑151 (MQ=27)
ACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACG > SRR10918230.1015163/1‑151 (MQ=27)
GGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGATCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGTTCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTCCGACGAAATTGACGctg > SRR10918230.1195046/1‑148 (MQ=25)
GGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCG < SRR10918230.242631/151‑1 (MQ=28)
TGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGC > SRR10918230.1772004/1‑151 (MQ=30)
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CCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGG < SRR10918230.5284335/151‑1 (MQ=36)
GCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGAC > SRR10918230.2949119/1‑151 (MQ=41)
GCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGAC < SRR10918230.1676996/151‑1 (MQ=41)
GCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGAC < SRR10918230.2000760/151‑1 (MQ=41)
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GATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCA > SRR10918230.4585998/1‑151 (MQ=47)
GATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCA > SRR10918230.2658744/1‑151 (MQ=47)
ATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAG > SRR10918230.4060474/1‑151 (MQ=47)
TGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGA > SRR10918230.5076422/1‑151 (MQ=47)
GCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTTACGGCGGCAGGGACTTCAGAC > SRR10918230.33795/1‑151 (MQ=46)
CCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACT < SRR10918230.4691154/151‑1 (MQ=47)
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GGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAA > SRR10918230.4962394/1‑151 (MQ=47)
GGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAA < SRR10918230.3481887/151‑1 (MQ=47)
GATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAAT > SRR10918230.1735267/1‑151 (MQ=48)
GATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAAT > SRR10918230.4478093/1‑151 (MQ=48)
ATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATG > SRR10918230.3046825/1‑151 (MQ=48)
AAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCA < SRR10918230.1846928/151‑1 (MQ=48)
AAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCA > SRR10918230.4589479/1‑151 (MQ=48)
AATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAA < SRR10918230.5142349/151‑1 (MQ=48)
GGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCC > SRR10918230.1578027/1‑151 (MQ=54)
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ACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTCACCAGCCAGATGCCGGTGGACAAATGGCATGCGCTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGACGCGATCCTCGACCGTCTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCAGGGACTTCAGACTAACAATGCAACCCTGCGTCGCTGCGCTCCGACTGCCTGTCCAAGTGGACGTGGATCAG > CP009974/4957083‑4957379
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |