Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
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Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
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150.6 |
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N/A
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BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 233 total aligned reads displayed.
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|
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GGGTGGAGATTGGCCATCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGG < SRR10918230.2233210/151‑1 (MQ=60)
GGGTGGAGATTGGCCATCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGG < SRR10918230.1656910/151‑1 (MQ=60)
GGGTGGAGATTGGCCATCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGG > SRR10918230.49950/1‑151 (MQ=60)
GTGGAGATTGGCCATCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGT < SRR10918230.652124/151‑1 (MQ=60)
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ggaacTTGGCCAGCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGGCTGTGCCCAACCACCGATGTGTGTCCATCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGG < SRR10918230.4713374/146‑1 (MQ=4)
GGAGATTGGCCATCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGGCTGTGTCCAACCTCCGAGTTTTGTCTCCCACCAAT‑CTGTGTCTGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAC‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGG > SRR10918230.807361/1‑151 (MQ=37)
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TGGCCATCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCTACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGAATGGCTGGTGGAAATTT > SRR10918230.1508673/1‑151 (MQ=60)
GGCCATGAGGGCCGGCCCATTTGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGG < SRR10918230.2698231/151‑1 (MQ=55)
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CAGGGCCGGCCCATTCGCGAGTAACCCCGCTCCTACAGTGGGCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCATCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCA < SRR10918230.1242176/151‑1 (MQ=0)
CAGAGCCGGCCCTTTCGCAGGGGAACCCGCTCCTACAGTGGGCTGTGTCCAACCACCGAGATGTGTACATCACCAGT‑CTGTGTCGGAGCGGGTTTACCCGAGAATAAGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCA < SRR10918230.1241194/151‑1 (MQ=19)
GGGCCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAATACGTTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGAATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGG > SRR10918230.3358738/1‑151 (MQ=60)
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CCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAAGAGCGGGGTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAATGGCGGGTGGAAAGTGGCCAGCAGGGGC > SRR10918230.2162989/1‑151 (MQ=60)
GGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGG < SRR10918230.4045187/151‑1 (MQ=60)
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CATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGCGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCct > SRR10918230.2947470/1‑149 (MQ=57)
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TTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCcttt < SRR10918230.3651306/151‑5 (MQ=55)
ggggggcgcgggtgaacgggagttgatggtggatggggggtatcggcggatgggtgttcgccggggggGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGTGGCAA‑‑‑CGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTT < SRR10918230.2357866/83‑1 (MQ=2)
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TCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCctttc < SRR10918230.4512328/151‑6 (MQ=53)
cgcttcgcgggtaaacccgcgcctacggtggcctggggccaaccccagatgggtgtccaccaccggggtaggcgtGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGTGGCAA‑‑‑CGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTC < SRR10918230.2072867/76‑1 (MQ=0)
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cgggtaaccccgcccctacgaccgccggtgtccaacctccatgcGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGG < SRR10918230.131318/107‑1 (MQ=5)
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GGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGT > SRR10918230.1630620/1‑151 (MQ=0)
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GTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTA > SRR10918230.2762156/1‑151 (MQ=1)
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GTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGGA > SRR10918230.3896425/1‑151 (MQ=0)
gagttcagacgtgtgctctgccgatcTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTA < SRR10918230.4220114/125‑1 (MQ=47)
TGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTA > SRR10918230.4364056/1‑151 (MQ=37)
gaaacagcttgtactGCGGTCTGTGTCCAAGCACCGAGATGTGTCGACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACGCGCGAATACGGGGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAA < SRR10918230.1573036/136‑1 (MQ=0)
GAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAA > SRR10918230.4396681/1‑151 (MQ=37)
GAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAA > SRR10918230.3142701/1‑151 (MQ=37)
AAACCCGCTCCTACGACGGCCTGTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA > SRR10918230.1477896/1‑151 (MQ=2)
AAACCCGCTCCTACAGTGGGCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCATCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAA > SRR10918230.3253102/1‑151 (MQ=0)
AAACCCGCTCCTACAGTGGGCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCATCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAA > SRR10918230.2033506/1‑151 (MQ=0)
aagcccgctcctacgacggcctgtggccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA < SRR10918230.5004695/112‑1 (MQ=7)
aacccccctcctacgacggcctgtgtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA < SRR10918230.3065453/112‑1 (MQ=7)
CCCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAAC < SRR10918230.1314502/151‑1 (MQ=39)
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CCCGCTCCTACGACGGCCTGTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC < SRR10918230.1727972/151‑1 (MQ=2)
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CCCGCTCCTACAGCTGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACC < SRR10918230.2474165/151‑1 (MQ=38)
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ccgctcctccgacggcctgcgtcaaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTCACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCG < SRR10918230.4494012/116‑1 (MQ=6)
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gctcttccgatctccGTGTCCCACCCCCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCT < SRR10918230.2067557/136‑1 (MQ=14)
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CTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCT < SRR10918230.1544061/151‑1 (MQ=43)
CTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGGAAACCCGCT > SRR10918230.344149/1‑151 (MQ=40)
CTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGCGCACGGCGGGCGGCAACTGGCCAGCAGCGCCGGCCcccccgcccccccccccccc > SRR10918230.2879371/1‑131 (MQ=23)
TCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTC < SRR10918230.1022923/151‑1 (MQ=43)
TCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCGC > SRR10918230.2434520/1‑151 (MQ=35)
ctacgacggcctgtgtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA > SRR10918230.740929/30‑151 (MQ=7)
aaagacgggacacgtccaacctacggcgTGTGTCCACAACCAAT‑CTGCGCAGGAGCGGGTTCACCAGAGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑AGGTGAACAGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < SRR10918230.1470812/123‑1 (MQ=2)
ACAGCGGTCTGGGGCCAACCCCCGAGATGTGGCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < SRR10918230.1170504/151‑1 (MQ=28)
tacggtggcctgtgtccaaccccagatgtgtgtccaccaccggggtaggcgtGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGTGGCAA‑‑‑CGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGG > SRR10918230.4052051/53‑151 (MQ=0)
tacggtggcctgtgtccaaccccagatgtgtgtccaccaccggggtaggcgtGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGTGGCAA‑‑‑CGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGG > SRR10918230.4053780/53‑151 (MQ=0)
acggcctgtgtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGag < SRR10918230.3970438/127‑3 (MQ=19)
acggcctgtctccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGag < SRR10918230.3970154/127‑3 (MQ=19)
GGTCTGTGTCCAACCCCCGGGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGtgg < SRR10918230.4599798/151‑4 (MQ=30)
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GCTGTGTCCAACCCCCGATGTGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGC < SRR10918230.3884907/151‑1 (MQ=21)
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cctgtgtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatg > SRR10918230.3131129/21‑145 (MQ=19)
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CTGTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatgg > SRR10918230.5136887/1‑144 (MQ=16)
gggtgtccaaccgtgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatgg < SRR10918230.5256739/132‑8 (MQ=26)
TGTGTCC‑ACCCTCGATACGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatggt < SRR10918230.657073/151‑9 (MQ=17)
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gtgactggagttcagacgtgcgctcttccgAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGTCAA‑‑‑CGGTGAACGGCGGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAcgacggcctg < SRR10918230.4121141/121‑11 (MQ=0)
tgtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatggtgc > SRR10918230.2703331/17‑141 (MQ=19)
tgtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatggtgc < SRR10918230.1028055/135‑11 (MQ=19)
tgtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGagatcggaag > SRR10918230.543113/17‑141 (MQ=19)
gtccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGGTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatggtgcg > SRR10918230.4677018/16‑140 (MQ=17)
TCCAACCCCCGGTGTGTGTCCATCACCAGT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCA < SRR10918230.3389951/151‑1 (MQ=31)
tccaccctcgatacGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTATGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑TGGTGAACGGCAGGTGGGGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGaggatggtgcga > SRR10918230.2423051/15‑139 (MQ=15)
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ccaccgatgTGTGTCCATCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCT < SRR10918230.4471106/142‑1 (MQ=46)
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CCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGGGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGCATGGCGGGTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGtgggctgtgtccaacca < SRR10918230.3570923/151‑18 (MQ=14)
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accccagatgtgtgtccaccaccggggtaggcgtGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGTGGCAA‑‑‑CGGTGAACAGCGGGTGGAAATTAGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGagatcggaagagcacacgtctgaactcc > SRR10918230.3803713/35‑123 (MQ=6)
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ACCAAT‑GTGTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGAC < SRR10918230.2450448/151‑1 (MQ=60)
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ctgcttgtgtgaGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CAGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAG < SRR10918230.54505/139‑1 (MQ=60)
acgtcttcgcatccgctcGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGCAGCTCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAG < SRR10918230.1974464/133‑1 (MQ=60)
AAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGATGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGAATGGCTGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGGCTGCGtccagcgaccgagggttgtgcatgagcaa > SRR10918230.3522888/1‑122 (MQ=0)
gtaTGTGTAGGAGCGGGTAGACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTT < SRR10918230.3693261/148‑1 (MQ=60)
T‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTG < SRR10918230.1499196/151‑1 (MQ=60)
tgtgtaggcttcggatctCCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGAC < SRR10918230.4605983/133‑1 (MQ=60)
GTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACC > SRR10918230.2015545/1‑151 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCA > SRR10918230.1242562/1‑151 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCA > SRR10918230.723767/1‑151 (MQ=60)
TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAG > SRR10918230.897575/1‑151 (MQ=60)
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AGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGC > SRR10918230.1092816/1‑151 (MQ=60)
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TTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAG > SRR10918230.5242519/1‑151 (MQ=60)
tagccgtggatactGTGGCGGAGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTCGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCT < SRR10918230.3111907/137‑1 (MQ=60)
gtgctcttccgatctcgcgggcggctgcgatGGTGAGCGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTA < SRR10918230.762903/120‑1 (MQ=60)
ACCCGCGAATACGGTGGCGGCAGCAA‑‑‑CGGTGAATGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTC < SRR10918230.191083/151‑1 (MQ=60)
CCCGCGAATACGATGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGAATGGCTGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCA < SRR10918230.852008/151‑1 (MQ=60)
AATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCG > SRR10918230.4356386/1‑151 (MQ=60)
AATACGATGGCGGCAGCAA‑‑‑CAGTGAATGGCTGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGggcctggctttcgatgtgtggccaagacagttctctgccggctcgtttgtacggatgaa > SRR10918230.4688935/1‑92 (MQ=0)
ATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGG < SRR10918230.2781210/151‑1 (MQ=60)
ATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGG > SRR10918230.4232844/1‑151 (MQ=60)
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TGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCC < SRR10918230.903139/151‑1 (MQ=60)
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GGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCA > SRR10918230.3535657/1‑151 (MQ=60)
GGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCA > SRR10918230.2210458/1‑151 (MQ=60)
GGCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCA < SRR10918230.1859546/151‑1 (MQ=60)
GCAA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCAC > SRR10918230.5105598/1‑151 (MQ=60)
AA‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGC > SRR10918230.3483819/1‑151 (MQ=60)
A‑‑‑CGGTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCC < SRR10918230.4259665/151‑1 (MQ=60)
GTGAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAAT > SRR10918230.3822588/1‑151 (MQ=60)
TGAAGGGCGGGTGGAACTTGGCCAGCAGGGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATC < SRR10918230.1626288/151‑1 (MQ=60)
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GAAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATCA < SRR10918230.4263816/151‑1 (MQ=60)
AAGGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATCAA > SRR10918230.5392171/1‑151 (MQ=60)
GGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATCAACA > SRR10918230.3618956/1‑151 (MQ=60)
GGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATCAACA > SRR10918230.3505467/1‑151 (MQ=60)
GGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATCAACA < SRR10918230.1691052/151‑1 (MQ=60)
GGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATCAACA < SRR10918230.140073/151‑1 (MQ=60)
|
CGGCGGGTGGAGATTGGCCATCAGGGCCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGTCTGTGTCCAACCCCCGAGATGTGTCCACCACCAAT‑CTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAA‑‑‑CGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGGCTGCGCAGGTCTTTCAAATGTTGAGCAAGACAGTTGACCCAGGGGCCATTAGCTCAGCCGCGGCGATCCGCCACCACGCCAATCAACA > CP009974/2452142‑2452441
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |