Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAAGCGCTTCGAAGCGGCTGATGCGGCGTATCACGCCGACAAGTAACATCCGTTGAATTGGCGGCGCCT > CP009974/2654902‑2655202
|
ATGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTG > SRR10918230.5069469/1‑151 (MQ=60)
ATGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTA > SRR10918230.3749855/1‑151 (MQ=60)
ATGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTA < SRR10918230.2464440/151‑1 (MQ=60)
ATGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTA < SRR10918230.2464314/151‑1 (MQ=60)
TGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGC > SRR10918230.638317/1‑151 (MQ=60)
TGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTAC < SRR10918230.1442503/151‑1 (MQ=60)
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TGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAA < SRR10918230.1631677/151‑1 (MQ=60)
GGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAAT > SRR10918230.3505415/1‑151 (MQ=60)
GGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAAT < SRR10918230.1797550/151‑1 (MQ=60)
GGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAAT > SRR10918230.3389762/1‑151 (MQ=60)
GGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAAT < SRR10918230.281509/151‑1 (MQ=60)
GGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATC > SRR10918230.5191562/1‑151 (MQ=60)
GCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCA < SRR10918230.709528/151‑1 (MQ=60)
TGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATC < SRR10918230.287760/151‑1 (MQ=60)
GGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCC > SRR10918230.4589061/1‑151 (MQ=60)
CTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCG > SRR10918230.661671/1‑151 (MQ=60)
GGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCT > SRR10918230.3330919/1‑151 (MQ=60)
GGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCT < SRR10918230.3908699/151‑1 (MQ=60)
GGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCT > SRR10918230.3332608/1‑151 (MQ=60)
GTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTT > SRR10918230.3468585/1‑151 (MQ=60)
CGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTG > SRR10918230.3906799/1‑151 (MQ=60)
CGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTG > SRR10918230.2617889/1‑151 (MQ=60)
CGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTG < SRR10918230.4075324/151‑1 (MQ=60)
CCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTT > SRR10918230.3137835/1‑151 (MQ=60)
TTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGGGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCG > SRR10918230.2151252/1‑151 (MQ=60)
GGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCA < SRR10918230.428555/151‑1 (MQ=60)
GCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAG > SRR10918230.5004858/1‑151 (MQ=60)
CGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCAT > SRR10918230.2046761/1‑151 (MQ=60)
CGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCAT > SRR10918230.2046363/1‑151 (MQ=60)
GGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATC > SRR10918230.1111368/1‑151 (MQ=60)
GTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCG < SRR10918230.1288020/151‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCG < SRR10918230.3157081/151‑1 (MQ=60)
TGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCAT > SRR10918230.2540848/1‑151 (MQ=60)
TGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCAT > SRR10918230.5431323/1‑151 (MQ=60)
TGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCAT > SRR10918230.5429791/1‑151 (MQ=60)
TGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCAT > SRR10918230.5199553/1‑151 (MQ=60)
GCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATT < SRR10918230.1272065/151‑1 (MQ=60)
GATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTT > SRR10918230.286332/1‑151 (MQ=60)
TTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTG < SRR10918230.2033324/151‑1 (MQ=60)
GTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGA > SRR10918230.5351694/1‑151 (MQ=60)
TGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAG > SRR10918230.3151073/1‑151 (MQ=60)
CTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCA > SRR10918230.1718090/1‑151 (MQ=60)
TGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAA > SRR10918230.395319/1‑151 (MQ=60)
TGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAA > SRR10918230.395333/1‑151 (MQ=60)
TGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAA < SRR10918230.4003528/151‑1 (MQ=60)
GTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAG > SRR10918230.4896397/1‑151 (MQ=60)
GTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCCTTGTTCTGGTGAGCACG > SRR10918230.4579693/1‑151 (MQ=60)
TGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGC > SRR10918230.2646964/1‑151 (MQ=60)
GGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACGTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATGGTTCTGGTGAGCAAGCT > SRR10918230.547101/1‑151 (MQ=60)
AAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGG < SRR10918230.1156499/151‑1 (MQ=60)
AGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGC < SRR10918230.640712/151‑1 (MQ=60)
GGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCA < SRR10918230.2470067/151‑1 (MQ=60)
ccatcacccctaacggttccCTGGCCGGTATCGTGATGGGTGCTCTGACCATGATCCTCTGGAACAACTTCGACACCCTCCGATTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAG < SRR10918230.3017598/131‑1 (MQ=60)
ATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCC < SRR10918230.3712746/151‑1 (MQ=60)
ATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCC > SRR10918230.2228739/1‑151 (MQ=60)
ATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCC > SRR10918230.3561642/1‑151 (MQ=60)
ATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCC > SRR10918230.3562019/1‑151 (MQ=60)
TGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCC < SRR10918230.5156549/151‑1 (MQ=60)
CCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTC > SRR10918230.2809848/1‑151 (MQ=60)
CCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTTCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGTTGAGCACGCTGGGCAGCCCTTCG > SRR10918230.2543323/1‑151 (MQ=60)
CCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCG > SRR10918230.2543031/1‑151 (MQ=60)
CCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCG > SRR10918230.2542703/1‑151 (MQ=60)
CCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCG < SRR10918230.5160653/151‑1 (MQ=60)
GTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCA > SRR10918230.1092614/1‑151 (MQ=60)
GTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCA > SRR10918230.1092190/1‑151 (MQ=60)
AACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGA < SRR10918230.769751/151‑1 (MQ=60)
CGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACG > SRR10918230.1459299/1‑151 (MQ=60)
GTGCGCTGGGCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGAT < SRR10918230.4485898/151‑1 (MQ=60)
GTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGAT < SRR10918230.2956222/151‑1 (MQ=60)
TGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATG < SRR10918230.2780165/151‑1 (MQ=60)
GCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTC < SRR10918230.4169952/151‑1 (MQ=60)
TTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCA < SRR10918230.4150878/151‑1 (MQ=60)
GGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAA < SRR10918230.3043659/151‑1 (MQ=60)
GGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAAG > SRR10918230.2030160/1‑151 (MQ=60)
GCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAAGC > SRR10918230.3464030/1‑151 (MQ=60)
GTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAAGCGCTT > SRR10918230.3438700/1‑151 (MQ=60)
GTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAAGCGCTT < SRR10918230.446252/151‑1 (MQ=60)
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atctGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTGCGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAAGCGCTTCGAAGCGGCTGATGCGGCGTATCACGCCGACAA < SRR10918230.1348906/147‑1 (MQ=60)
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|
ATGCCTGGGCTGGCTTCGGTGCCGCCTTCGGCCCGGTGGTGCTGATTTCGGTGCTGTGGAAAGGCATGACCCGTAACGGTGCGCTGGCCGGTATCGTGGTGGGTGCGCTGACGGTGATCCTGTGGAAGAACTTCGACACCCTCGGGTTGTACGAAATCATCCCGGGCTTCCTGTTCGCCAGCATCGCCATTGTTCTGGTGAGCAAGCTGGGCAGCCCTTCGCAGACGATGGTCAAGCGCTTCGAAGCGGCTGATGCGGCGTATCACGCCGACAAGTAACATCCGTTGAATTGGCGGCGCCT > CP009974/2654902‑2655202
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
