Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,756,930 |
A→T |
L392H (CTT→CAT) |
RPPX_16780 ← |
phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,756,930 | 0 | A | T | 99.7%
| 1228.1
/ NA
| 321 | L392H (CTT→CAT) | RPPX_16780 | phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (173/147); total (174/147) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
TTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGCACC > CP009974/3756782‑3757076
|
tCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGa > 2:1247868/1‑151 (MQ=255)
tCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGa > 2:1560729/1‑151 (MQ=255)
ggCAATTATGAATGCCACCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGata < 1:397644/151‑1 (MQ=255)
gCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGatac < 1:7237034/151‑2 (MQ=255)
cAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGatacc > 2:2003375/1‑149 (MQ=255)
cAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGatacc > 1:5943624/1‑149 (MQ=255)
aaTCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCCTCTCGATATGGATACCg > 2:6164166/1‑151 (MQ=255)
aaTCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCg > 1:2100053/1‑151 (MQ=255)
aaTCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCg < 2:1867704/151‑1 (MQ=255)
tCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGcc < 1:4130764/151‑1 (MQ=255)
tCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGcc > 2:1027182/1‑151 (MQ=255)
ggAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGc > 1:3629367/1‑151 (MQ=255)
ggAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTAGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCCATCTGGATACCGCCGGc > 2:1399986/1‑151 (MQ=255)
tGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATgg > 1:2605802/1‑151 (MQ=255)
tGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATgg > 2:5163063/1‑151 (MQ=255)
ccAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCt > 2:447612/1‑151 (MQ=255)
aaCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGCTGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGc > 2:5774006/1‑151 (MQ=255)
aaCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGc > 1:6645275/1‑151 (MQ=255)
aaCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGc < 2:4194422/151‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGcc > 1:346592/1‑151 (MQ=255)
aCTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGcc > 1:1326425/1‑151 (MQ=255)
cTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGccc < 1:3338780/151‑1 (MQ=255)
gCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGc > 1:6937440/1‑151 (MQ=255)
aCTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCAGGCATGGCTGCCCTCGGCCTg > 2:776288/1‑151 (MQ=255)
tGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgt > 1:3170534/1‑151 (MQ=255)
tGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgt > 1:5238159/1‑151 (MQ=255)
gATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtg > 1:6327885/1‑151 (MQ=255)
aTCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtgt > 1:4487732/1‑151 (MQ=255)
aTCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtgt > 2:4110093/1‑151 (MQ=255)
aTCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGgtgt > 1:6133349/1‑151 (MQ=255)
tCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTa < 1:5534682/151‑1 (MQ=255)
tCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTa > 1:153082/1‑151 (MQ=255)
cGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTAc < 2:3091177/151‑1 (MQ=255)
ggCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACt < 1:1227139/151‑1 (MQ=255)
gCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACtt < 1:2937198/151‑1 (MQ=255)
gCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTCATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGCCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACtt > 2:6982659/1‑151 (MQ=255)
cATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTg < 1:755961/151‑1 (MQ=255)
cATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCGCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGCGTACTTg > 2:6323684/1‑151 (MQ=255)
tCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGgaagaa > 1:2705954/1‑151 (MQ=255)
cgcgGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACt > 2:4873023/1‑151 (MQ=255)
cgGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGc > 2:7128617/1‑151 (MQ=255)
ggATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCt > 2:4427550/1‑151 (MQ=255)
aTCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTc > 1:68891/1‑151 (MQ=255)
tCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCa < 2:338146/151‑1 (MQ=255)
tCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCa > 1:7086008/1‑151 (MQ=255)
tCACAAGGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCa < 2:5463295/151‑1 (MQ=255)
cacaATGGGCGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCAc < 2:5695956/151‑1 (MQ=255)
acaATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCAcc < 2:3712533/151‑1 (MQ=255)
acaATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGCGTACTTGGAAGAACTGCTTCAcc > 2:3171591/1‑151 (MQ=255)
aTGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCa < 2:6709443/151‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCAt > 2:7017311/1‑151 (MQ=255)
gggTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATc < 1:6512539/151‑1 (MQ=255)
ggTGTGATACCGGTCACACTACGCACCTTAGGTGATCGGCCGGGCGCGCCCGATGGATTCGGTGACGTTATGTCCAGTCATCTCGATATGTATCCCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGATCTGCTTCACCTCATcc < 2:2641314/151‑1 (MQ=255)
tgATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGaa > 1:3580817/1‑151 (MQ=255)
tgATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGaa < 2:4702598/151‑1 (MQ=255)
gATACCGGCCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCTGGCACCGCCGATGCATTCGGTGGCGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAAt < 2:3022642/151‑1 (MQ=255)
tACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCt > 1:1337373/1‑151 (MQ=255)
ggTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTgcgc > 1:5660866/1‑151 (MQ=255)
ggTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTgcgc > 1:3205263/1‑151 (MQ=255)
gTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCa < 2:6531530/151‑1 (MQ=255)
aGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCcaaa > 2:5278553/1‑151 (MQ=255)
aGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCaaaa > 1:1000989/1‑151 (MQ=255)
aCAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATc < 2:3568287/151‑1 (MQ=255)
aaCGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATcgc > 1:3749479/1‑151 (MQ=255)
cGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCgg > 1:2804621/1‑151 (MQ=255)
gCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCggg > 2:6020855/1‑151 (MQ=255)
gCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCggg > 1:339173/1‑151 (MQ=255)
aTCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTc > 2:1934279/1‑151 (MQ=255)
tCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCt < 2:6551885/151‑1 (MQ=255)
tCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGt < 2:2076430/151‑1 (MQ=255)
ggTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGGCTTCTaa > 1:2045825/1‑151 (MQ=255)
gTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAAc < 2:53679/151‑1 (MQ=255)
gATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTACCCg > 2:6759873/1‑151 (MQ=255)
tCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCgct > 1:480285/1‑151 (MQ=255)
ggCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTGGTAACCgctgc > 2:1882896/1‑151 (MQ=255)
gCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCAGCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCgctgct > 2:5592413/1‑151 (MQ=255)
gCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCgctgct < 1:6524758/151‑1 (MQ=255)
aCCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTg < 1:4750393/151‑1 (MQ=255)
ccgccgATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGa > 1:1730695/1‑151 (MQ=255)
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gATGCATTCGGTGACGTTCTGCCCAGTCAGCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCTGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAACCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGgtg > 2:2785379/1‑151 (MQ=255)
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TTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGCACCTTGC > CP009974/3756781‑3757080
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
