Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,957,158 |
C→G |
V197V (GTC→GTG) |
RPPX_21945 → |
ATPase AAA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,957,158 | 0 | C | G | 100.0%
| 743.6
/ NA
| 279 | V197V (GTC→GTG) | RPPX_21945 | ATPase AAA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (133/146); total (133/146) |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
ATGGCCGCTTCGCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTCACCAGCCAGATGCCGGTGGACAAATGGCATGCGCTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGACGCGATCCTCGACCGTCTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCG > CP009974/4957010‑4957305
|
ggCCGCTTCGCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGAccc > 2:6168516/1‑150 (MQ=255)
ccGCTTCGCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGAccagc > 2:2786617/1‑151 (MQ=255)
gCTTCGCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGAccagcca > 2:6022288/1‑151 (MQ=255)
gCTTCGCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGAccagcca > 2:2071732/1‑151 (MQ=255)
cTTCGCCGAACTGATGGCCGGCTATGCCAACACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGAccagccag < 2:3734686/151‑1 (MQ=255)
cGCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATg < 2:6638262/151‑1 (MQ=255)
gCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGCCCAGCCAGATGc > 2:5336719/1‑151 (MQ=255)
gCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGc < 2:4255642/151‑1 (MQ=255)
cAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCg > 1:4838590/1‑151 (MQ=255)
cAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCg > 1:2724574/1‑151 (MQ=255)
cAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCAGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCg > 2:6986339/1‑151 (MQ=255)
aaCTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCggg > 1:2808598/1‑150 (MQ=255)
aaCTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGt > 2:3301388/1‑151 (MQ=255)
cTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTgg < 2:5934335/151‑1 (MQ=255)
tGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGa > 1:1701553/1‑151 (MQ=255)
gagggCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACCACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGat < 2:3710054/148‑2 (MQ=255)
gggCCGGCTATGCCAAGACTGGCCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATaa < 2:2880641/150‑1 (MQ=255)
cagCTATGCCAAGACAGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATgg < 2:5022902/149‑1 (MQ=255)
tATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAGCTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATg > 2:2521794/1‑151 (MQ=255)
tGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATgca < 1:5706053/151‑2 (MQ=255)
tGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATgca < 1:2339712/151‑2 (MQ=255)
gCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATgcac > 1:2681297/1‑149 (MQ=255)
gCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATgcac > 1:7125665/1‑149 (MQ=255)
ccAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACt < 1:3844066/151‑1 (MQ=255)
gACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATc < 1:3963210/151‑1 (MQ=255)
aCTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCg < 1:2458917/151‑1 (MQ=255)
aCTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCg < 1:4082869/151‑1 (MQ=255)
tGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGc < 1:3090279/151‑1 (MQ=255)
gACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCg > 1:1498906/1‑151 (MQ=255)
gACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCg > 1:749277/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGCTCTTGGACGCCTGGGGACTGGGAGCGTTTACCGCAGCGGAGCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACAAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGAt < 2:3197588/151‑1 (MQ=11)
ccTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGAt > 2:1782609/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGAt < 1:4687152/151‑1 (MQ=255)
ctgctgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATc > 1:2345219/1‑151 (MQ=255)
tgctgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATcc < 1:2787576/151‑1 (MQ=255)
gctgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCg > 1:5302179/1‑151 (MQ=255)
tgATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGAc < 1:6057335/151‑1 (MQ=255)
aTCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCt < 2:4692136/151‑1 (MQ=255)
aTCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCt > 1:1181094/1‑151 (MQ=255)
ttGGACGACTGGGGCCTGTCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATACTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGCCCTTgg > 2:1691749/1‑151 (MQ=11)
ggACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGc < 1:4994569/151‑1 (MQ=255)
ggACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGc > 2:1969630/1‑151 (MQ=255)
cgacTGGTGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCACTACGGCAACCGCGCGACCCTCGTGCCCAGCCAGATGCCCGTGGATCAAAGGCATGCACTGCTCGGCGATCCGACCTTGGGCGat < 2:312278/151‑2 (MQ=11)
gacTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGatg < 1:2381414/151‑3 (MQ=255)
gacTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGatg < 1:3351385/151‑3 (MQ=255)
cTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGAtgcg < 2:2219271/151‑1 (MQ=255)
gCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCt < 1:6281240/151‑1 (MQ=11)
gCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCt < 1:106882/151‑1 (MQ=11)
cccggCACCGTTTACCGCAGCGAAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTc < 1:352982/148‑1 (MQ=11)
cTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCg < 2:5787683/151‑1 (MQ=255)
tGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGa > 2:5167723/1‑151 (MQ=255)
cACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCg < 1:5479325/151‑1 (MQ=11)
cGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTc < 1:1426982/143‑1 (MQ=11)
cGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTc > 2:1426982/1‑143 (MQ=255)
gTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCggttg > 2:522616/1‑147 (MQ=11)
tttACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCggttgg > 1:4246133/1‑146 (MQ=11)
ttACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCggttggt < 2:675687/151‑7 (MQ=11)
tACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCggttggtg > 1:163217/1‑144 (MQ=11)
aCCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGc > 2:133554/1‑151 (MQ=11)
ccGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGca < 1:4292874/151‑1 (MQ=11)
cGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAAGGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCCATCCTCGACCGGTTGGTGcac > 2:4892408/1‑151 (MQ=11)
gCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGcaca < 2:6076561/151‑1 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc > 2:6244520/1‑151 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc > 1:1268783/1‑151 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc > 2:4479285/1‑151 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc < 1:4515182/151‑1 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAAc < 1:5280770/151‑1 (MQ=11)
aGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGGTGGTGCACAAc > 2:4594805/1‑151 (MQ=11)
gcgcAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACg < 1:6254582/151‑1 (MQ=11)
cgcAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGc > 2:2421120/1‑151 (MQ=11)
gcAACGCCGCGACATGCACGAACTGCTGGACGGCCGCGACGGGAACCGCTGGACACTGCTGACCAGCCAGATGCAGGAGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCt > 2:4123626/1‑151 (MQ=11)
cAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCtt > 2:7143579/1‑151 (MQ=11)
cAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCtt < 2:2681297/151‑1 (MQ=11)
aaCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTa < 2:3838932/151‑1 (MQ=11)
aaCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTa > 1:691822/1‑151 (MQ=11)
aCGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTAt > 2:2601506/1‑151 (MQ=11)
cgccgaGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATc < 2:3024410/151‑1 (MQ=11)
gccgcGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCg > 1:3944509/1‑151 (MQ=11)
gCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCaa > 2:5153482/1‑151 (MQ=11)
gCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCaa < 2:4738731/151‑1 (MQ=11)
cTACGGCAACGGCTCAACACTGCTGACAAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGACGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAg < 1:3201142/151‑1 (MQ=11)
aCGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCg > 2:2580809/1‑151 (MQ=11)
aCGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGCGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCCTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCCGATCGAACTGAAGCGCGAATCGATGCGCCAGCg > 2:2470959/1‑151 (MQ=11)
cGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGt < 2:3974519/151‑1 (MQ=11)
aaCCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGcga > 1:4739723/1‑151 (MQ=11)
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TGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGA < SRR10918235.1627769/151‑1 (MQ=29)
GGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCC > SRR10918235.2381289/1‑151 (MQ=25)
GCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCT < SRR10918235.6309734/151‑1 (MQ=23)
GCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCT < SRR10918235.107234/151‑1 (MQ=23)
GCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCT < SRR10918235.6310402/151‑1 (MQ=23)
GCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCT < SRR10918235.1454765/151‑1 (MQ=23)
tccgatctCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTC < SRR10918235.1433141/143‑1 (MQ=20)
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CCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGgt < SRR10918235.5424140/151‑3 (MQ=19)
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GCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAA > SRR10918235.3972736/1‑151 (MQ=0)
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ACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGA > SRR10918235.2148206/1‑151 (MQ=27)
ACACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGA > SRR10918235.3953404/1‑151 (MQ=27)
CACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGAC < SRR10918235.2383225/151‑1 (MQ=27)
ACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACG < SRR10918235.4499029/151‑1 (MQ=27)
ACTGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACG > SRR10918235.1880456/1‑151 (MQ=27)
TGGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGC < SRR10918235.6735607/151‑1 (MQ=27)
GGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCG > SRR10918235.4988302/1‑151 (MQ=28)
GGTGACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCG > SRR10918235.1195089/1‑151 (MQ=28)
GACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCA < SRR10918235.7019384/151‑1 (MQ=32)
GACCAGCCAGATGCCGGTGGATAAATGGCATGCACTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGATGCGATCCTCGACCGGTTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCA > SRR10918235.772631/1‑151 (MQ=32)
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GATGGCCGCTTCGCCAAACTGATGGCCGGCTATGCCAAGACTGACCTGCTGATCTTGGACGACTGGGGCCTGGCACCGTTTACCGCAGCGCAACGCCGCGACATGCTCGAACTGCTGGACGACCGCTACGGCAACCGCTCGACACTGGTCACCAGCCAGATGCCGGTGGACAAATGGCATGCGCTGATCGGCGATCCGACCTTGGGCGACGCGATCCTCGACCGTCTGGTGCACAACGCTTATCGGATCGAACTGAAGGGCGAATCGATGCGCAAGCGTGCGACGAAATTGACGGCGGCA > CP009974/4957009‑4957308
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |