Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
5,105,372 |
A→G |
S160S (AGT→AGC) |
RPPX_22650 ← |
benzene 1,2‑dioxygenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 5,105,372 | 0 | A | G | 91.5%
| 320.2
/ 33.2
| 199 | S160S (AGT→AGC) | RPPX_22650 | benzene 1,2‑dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (10/7); new base G (92/90); total (102/97) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.15e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GTGAGCTTCCAGTTGCCTTCGTAGATGTACGAGCTGGCACCGCGCAGCACTTCCAGGCCTTCAGGCGACTGATCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATCGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAACGTCCAGCC > CP009974/5105229‑5105518
|
gtcaGCTTCCAGTTACCTTCGTAGATGTAGGAGCTAGCTCCACGCAGCACTTCCAGACCGTCCGGCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCaa > 1:5396546/4‑151 (MQ=1)
gtcaGCTTCCAGTTACCTTCGTAGATGTAGGAGCTAGCTCCACGCAGCACTTCCAGACCGTCCGGCGACTGGTCGACGATCATGTCGATCATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCCGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCac > 1:4824201/4‑150 (MQ=1)
taggAGCTAGCTCCACGCAGCACTTCCAGACCGTCCGGCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATc > 2:900989/4‑151 (MQ=1)
taggAGCTAGCTCCACGCAGCACTTCCAGACCGTCCGGCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATc > 2:2604406/4‑151 (MQ=1)
ctccacgcAGCACTTCCAGACCGTCCGGCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATCGTGCCACCtt < 2:2173939/146‑1 (MQ=1)
accgtccggCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATCGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCg > 2:1885131/8‑151 (MQ=0)
accgtccggCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATGCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATCGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCg < 2:6709857/144‑1 (MQ=0)
cgtccggCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATCGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTc < 1:524608/146‑1 (MQ=0)
gtccggCGACTGGTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATCGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCg < 2:1303925/147‑1 (MQ=1)
cTGATCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAg < 1:5874292/151‑1 (MQ=11)
cTGATCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAg < 2:5293205/151‑1 (MQ=11)
tGATCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGc < 1:6095629/151‑1 (MQ=11)
tGATCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGc < 1:4520260/151‑1 (MQ=11)
gATCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCt < 1:6536739/151‑1 (MQ=11)
aTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTg > 2:1601802/1‑151 (MQ=11)
aTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTg < 1:3479550/151‑1 (MQ=11)
aTCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACAGCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGcgg > 2:1154388/1‑149 (MQ=11)
cgacgaTCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTc > 2:2394428/1‑151 (MQ=11)
acgaTCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCgg < 1:1770882/151‑1 (MQ=11)
cgaTCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCggg > 2:3247974/1‑151 (MQ=11)
gaTCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCGCATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCgggg < 2:1505260/151‑1 (MQ=11)
gaTCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCgggg > 1:3758648/1‑151 (MQ=11)
caTCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCgggg < 1:5608362/150‑1 (MQ=11)
tCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTa < 1:6003320/151‑1 (MQ=11)
cATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAg > 2:1006868/1‑151 (MQ=11)
aTGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAACACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGc < 2:6980304/151‑1 (MQ=11)
aTGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGc > 1:6128117/1‑151 (MQ=11)
tGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGcc < 1:6720432/151‑1 (MQ=11)
tGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGcc < 1:405643/151‑1 (MQ=11)
gTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTTGGGGTAGCCg > 1:973664/1‑151 (MQ=11)
gTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCg > 1:6988615/1‑151 (MQ=11)
gTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCg < 1:416015/151‑1 (MQ=11)
tCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCgg < 1:6337498/151‑1 (MQ=11)
cGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGc > 1:5387322/1‑151 (MQ=11)
cGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGc < 1:2609056/151‑1 (MQ=11)
cGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGc > 1:1010144/1‑151 (MQ=11)
atgatCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGt > 1:6692084/1‑151 (MQ=11)
tgatCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGtt < 2:5502657/151‑1 (MQ=11)
tgatCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGtt < 1:7070374/151‑1 (MQ=11)
tgatCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGtt < 2:5900619/151‑1 (MQ=11)
atCTTGGCCGACTCGCCCGGCTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACTACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTGGCCGGCGTTGc < 2:5215283/151‑1 (MQ=11)
atCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGc < 1:924654/151‑1 (MQ=11)
tCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCt < 1:4680838/151‑1 (MQ=11)
tCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCt < 1:4905623/151‑1 (MQ=11)
gCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTggggg > 2:6650587/1‑150 (MQ=11)
gCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTggggg > 2:1707433/1‑150 (MQ=11)
ccGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTc < 1:232341/151‑1 (MQ=11)
ccGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTc > 2:2226181/1‑151 (MQ=11)
cGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCt > 1:5106529/1‑151 (MQ=11)
cGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCt > 2:5379516/1‑151 (MQ=11)
cGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCt < 2:3035357/151‑1 (MQ=11)
gACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCtt < 1:6218094/151‑1 (MQ=11)
aCTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCGGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCttt > 2:5582916/1‑151 (MQ=11)
aCTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCttt < 2:1554423/151‑1 (MQ=11)
cTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTc < 1:329340/151‑1 (MQ=11)
cTCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTc > 1:6995582/1‑151 (MQ=11)
tCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCa > 2:1230745/1‑151 (MQ=11)
tCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCa > 2:716566/1‑151 (MQ=11)
tCGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCa < 2:1146633/151‑1 (MQ=11)
cGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCAc > 2:2437466/1‑151 (MQ=11)
cGCCCAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCAc < 1:6578372/151‑1 (MQ=11)
cccAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCt > 1:2185702/1‑151 (MQ=11)
ccAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCtt > 1:1800981/1‑151 (MQ=14)
cAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTc > 2:6358574/1‑151 (MQ=11)
cAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTc > 2:3869785/1‑151 (MQ=14)
cAGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGCGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGGCTTTAACCTTc > 2:2147666/1‑151 (MQ=11)
aGGTGCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTca > 2:3163689/1‑151 (MQ=14)
gCTCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGACGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTcagcag < 1:1163881/151‑1 (MQ=14)
tCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCCGCAGtt > 2:3676521/1‑151 (MQ=14)
tCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGtt < 2:3781455/151‑1 (MQ=14)
tCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGtt < 2:3488041/151‑1 (MQ=14)
tCGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGACCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCCGGGTAGCCGGCGTTCCTGCGGTCTTTCACCTCCAGCACtt > 2:2742327/1‑151 (MQ=14)
cGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGttt > 1:1549861/1‑151 (MQ=14)
cGACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCCGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGttt < 2:2547611/151‑1 (MQ=14)
ccAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGcc > 2:3093552/1‑151 (MQ=14)
ccAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGcc < 2:1011087/151‑1 (MQ=14)
cagcggcttCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCg < 2:2302024/144‑1 (MQ=14)
cagcggcttCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCg > 2:4331385/8‑151 (MQ=14)
agcggcttCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGc > 1:6801139/7‑151 (MQ=14)
gcggcttCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCt > 1:3774529/6‑151 (MQ=14)
cggcttCGCATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCtg < 2:4460417/147‑1 (MQ=14)
cggcttCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCtg > 1:3617762/5‑151 (MQ=14)
ggcttCACATCGGCGTTCCGGCTGCCGACCAAAAGGCCCCGGTACGACTCAAACCGTGCAACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCAGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCtgt < 2:1919372/148‑1 (MQ=14)
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gcttCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCtgtt > 2:5142123/3‑151 (MQ=14)
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ACCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGC < SRR10918235.157764/151‑1 (MQ=42)
CCAGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCC > SRR10918235.3597048/1‑151 (MQ=43)
AGCGGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGC > SRR10918235.6833090/1‑151 (MQ=43)
gcggcTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCT > SRR10918235.3791317/6‑151 (MQ=45)
gcggcTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGAGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCT < SRR10918235.999459/146‑1 (MQ=44)
cggcTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTG > SRR10918235.3633902/5‑151 (MQ=45)
GGCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGT < SRR10918235.4314093/151‑1 (MQ=44)
GCTTCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTT > SRR10918235.5360948/1‑151 (MQ=44)
TCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTT > SRR10918235.3069314/1‑151 (MQ=45)
TCACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTT < SRR10918235.4388709/151‑1 (MQ=45)
ACATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGA > SRR10918235.3696804/1‑151 (MQ=45)
CATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAA > SRR10918235.2464600/1‑151 (MQ=45)
ATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAAC > SRR10918235.3959478/1‑151 (MQ=45)
ATCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAAC < SRR10918235.6124410/151‑1 (MQ=45)
TCGGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAACG > SRR10918235.1062979/1‑151 (MQ=45)
GGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAACGTC > SRR10918235.6377464/1‑151 (MQ=45)
GGCGTTCAGGCTGCCGAACAAAAAGCCCCGGTACGACTCAAAACGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAACGTC < SRR10918235.6965335/151‑1 (MQ=45)
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TCGGCGGTGAGCTTCCAGTTGCCTTCGTAGATGTACGAGCTGGCACCGCGCAGCACTTCCAGGCCTTCAGGCGACTGATCGACGATCATGTCGATGATCTTCGCCGACTCGCCCAGGTGCTCGACCAGTGGTTTCACATCGGCATTCAGACTGCCAAACAGGAAGCCCCGGTACGACTCGAATCGTGCCACCTTGGTCAGGTCGTGGGAGCCGTCGCAGTTGAAGCTGTCGGGGTAGCCGGCGTTGCTGGGGTCTTTCACCTTCAGCAGTTTGCCGCTGTTGTTGAACGTC > CP009974/5105223‑5105513
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
