| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A0 F0 I1 R1 | 336 | 367.5 | 14491858 | 96.8% | 14028118 | 150.7 |
GGCCAGATCAGTCTGGGCATCACGTCCGCTGTGGATATAGACGGTCACACCTTTGAGAACCTGGAACTGGGTGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTCCTGGTAG > CP009974/1897814‑1898113 | GGCCAGATCAGTCTGGGCATCACGTCCGCTGTGGATGTAGACGGTCACACCTTCGAGAACCTGGAACTGGGCGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAG < SRR10918235.4782540/151‑1 (MQ=1) ATCAGTCTGGGCATCACGTCCGCTGTGGATGTAGACGGTCACACCTTCGAGAACCTGGAACTGGGCGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGGCGGTG < SRR10918235.3619727/151‑1 (MQ=2) agccttggtatcaattcggcggtagacgccaccggcgcaacgttcgagaacctgcaactgggcggcaacGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTCACCGAAGGcggcgaga > SRR10918235.1333402/70‑143 (MQ=3) gccttggtatcaattcggcggtagacgccaccggcgcaacgttcgagaacctgcaactgggcggcaacGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACTACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGCCGGGCACCGAAGGcggcgagat > SRR10918235.3414045/69‑142 (MQ=0) GGGCATCACGTCCGCTGTGGATGTAGACGGTCACACCTTCGAGAACCTGGAACTGGGCGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGGcggtgagatcacc > SRR10918235.6756195/1‑138 (MQ=2) CCGCTGTGGATGTAGACGGTCACACCTTCGAGAACCTGGAACTGGGCGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGGcggtgagatcacctacaccatcac > SRR10918235.2059887/1‑127 (MQ=1) GCTGTGGATGTAGACGGTCACACCTTCGAGAACCTGGAACTGGGCGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGGcggtgagatcacctacaccatcacgc < SRR10918235.2881889/151‑27 (MQ=1) CTGTGGATGTAGACGGTCACACCTTCGAGAACCTGGAACTGGGCGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGGcggtgagatcacctacaccatcacgct < SRR10918235.1267452/151‑28 (MQ=0) CTGTGGATGTAGACGGTCACACCTTCGAGAACCTGGAACTGGGCGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGGcggtgagatcacctacaccatcacgct < SRR10918235.4512663/151‑28 (MQ=0) ggttgttgatcggcagaccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAG > SRR10918235.5929027/63‑151 (MQ=60) agaccgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGT > SRR10918235.7057053/49‑151 (MQ=0) gaccgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTG < SRR10918235.66878/104‑1 (MQ=0) accgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGA > SRR10918235.6468223/47‑151 (MQ=0) GACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGG < SRR10918235.2354694/60‑1 (MQ=0) ccgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGAC > SRR10918235.6491109/46‑151 (MQ=0) ccgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGAC > SRR10918235.3321807/46‑151 (MQ=0) ccgtctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGAC < SRR10918235.6730172/106‑1 (MQ=60) cgtctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACC > SRR10918235.3280808/45‑151 (MQ=0) tctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGT < SRR10918235.882997/109‑1 (MQ=1) tctttgttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGT < SRR10918235.7123707/109‑1 (MQ=1) GACACCCTCGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.205045/1‑56 (MQ=0) GACACCCTCGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.5875575/1‑56 (MQ=0) GACACCCTCGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.2904590/1‑56 (MQ=0) ACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.2287494/1‑55 (MQ=8) CACCCTCGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG < SRR10918235.7083731/54‑1 (MQ=2) ttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTA < SRR10918235.5640052/112‑1 (MQ=60) tgttgctcaaggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTAT < SRR10918235.5138093/113‑1 (MQ=1) agagtggagttcagtcgtgtgctcttccgatctgcctTCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGTgacatccactttcgcggcaccgcccaactcgaggttctcgaacgcagcaccagtggcg < SRR10918235.1502945/114‑59 (MQ=12) ttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATAT > SRR10918235.3254519/37‑151 (MQ=1) ttggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATAT < SRR10918235.924172/115‑1 (MQ=1) tggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCTAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATC > SRR10918235.3807577/36‑151 (MQ=1) tggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATC > SRR10918235.5778549/36‑151 (MQ=1) TCGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.5710270/1‑49 (MQ=4) ggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTagatcggaagagcacacgtctgaac > SRR10918235.4673364/35‑126 (MQ=0) ggtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCC > SRR10918235.65729/35‑151 (MQ=1) CGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTCACCGAAGG < SRR10918235.6439870/48‑1 (MQ=8) CGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.4179887/1‑48 (MQ=4) CGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG < SRR10918235.4270076/48‑1 (MQ=4) gtcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCA > SRR10918235.5263005/34‑151 (MQ=1) gtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCA > SRR10918235.6181601/34‑151 (MQ=60) gtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgcctTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCA > SRR10918235.1450516/34‑151 (MQ=60) GACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.1410524/1‑47 (MQ=7) GACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACCGCCACCCCGTCGGTCACCGAAGG > SRR10918235.4053319/1‑47 (MQ=7) tcagggtgatggtgtaagtgatctcgccgcctTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCAC > SRR10918235.3746345/33‑151 (MQ=1) 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cgcctTCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGatcggaagatcacacgtctgcactccagtcaccttcggctacctcgtattccgtcttctgcttgaaaaaaagacaaacgccgatttgaggctcggactgatcga > SRR10918235.6325843/6‑47 (MQ=0) gcctTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGG > SRR10918235.1002867/5‑151 (MQ=60) gcctTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGG < SRR10918235.4389951/147‑1 (MQ=60) CCTTCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGACTTGAACCGAAGCgttgccgcccaattccaggttctcgaacgcagcgccggtggcgtctactgccgagttgatgcccagactgatctggc > SRR10918235.2575450/1‑74 (MQ=60) TTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCT < SRR10918235.1217120/151‑1 (MQ=5) TTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCT > SRR10918235.7140876/1‑151 (MQ=5) TTCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCT < SRR10918235.198924/151‑1 (MQ=5) TTCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT < SRR10918235.863403/57‑1 (MQ=25) TTCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT < SRR10918235.3166754/57‑1 (MQ=25) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTG > SRR10918235.5391633/1‑151 (MQ=7) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTG > SRR10918235.5598137/1‑151 (MQ=7) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTC < SRR10918235.2489041/57‑1 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGT < SRR10918235.2075920/56‑1 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGT < SRR10918235.3072131/56‑1 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.2964344/1‑56 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGG < SRR10918235.5003413/55‑1 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGG > SRR10918235.522125/1‑55 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCG > SRR10918235.3607405/1‑54 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTC < SRR10918235.2149090/53‑1 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGGGGCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAG > SRR10918235.397368/1‑83 (MQ=0) TCGGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGG < SRR10918235.3544935/48‑1 (MQ=5) TCGGTGACCGAAGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAA > SRR10918235.1182558/1‑64 (MQ=0) 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SRR10918235.3509235/56‑1 (MQ=29) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT < SRR10918235.3721019/56‑1 (MQ=4) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGG < SRR10918235.2793780/55‑1 (MQ=6) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGG > SRR10918235.5688515/1‑55 (MQ=6) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCG < SRR10918235.6362909/54‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTC < SRR10918235.6014241/53‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTC < SRR10918235.5740197/53‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGG < SRR10918235.2542483/48‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCG > SRR10918235.4569699/1‑45 (MQ=9) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCG < SRR10918235.5584162/45‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACG < SRR10918235.2522414/36‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCAC < SRR10918235.7008945/35‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCAC < SRR10918235.5715853/35‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCAC > SRR10918235.1376023/1‑35 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCAC > SRR10918235.4715631/1‑35 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGACTTGA < SRR10918235.2697094/63‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGAC > SRR10918235.170626/1‑59 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGA > SRR10918235.5173912/1‑58 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTG < SRR10918235.4532980/57‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.4124655/1‑56 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGG < SRR10918235.6628716/55‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTC < SRR10918235.193551/44‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTT < SRR10918235.1835970/40‑1 (MQ=7) TCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCGGTCGGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGG > SRR10918235.2932751/1‑55 (MQ=9) 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SRR10918235.4898719/1‑61 (MQ=9) TCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTC > SRR10918235.6086626/1‑57 (MQ=9) TCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCG < SRR10918235.3028428/54‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGG < SRR10918235.4733176/48‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTC < SRR10918235.5554643/41‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCC > SRR10918235.5935669/1‑33 (MQ=8) TCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGG < SRR10918235.6924585/31‑1 (MQ=8) TCGGTCACCGAAGG‑GGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGACT > SRR10918235.6264516/1‑60 (MQ=9) TCGGTCACCGAAGG‑GGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGA < SRR10918235.2825489/63‑1 (MQ=7) TCGGTCACCGAAGG‑GGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACT > SRR10918235.6213102/1‑60 (MQ=9) TCGGTCACCGAAGG‑GGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTC < SRR10918235.197548/57‑1 (MQ=9) TCGGTCACCGAAGG‑GGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.7170068/1‑56 (MQ=9) 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SRR10918235.4080120/1‑151 (MQ=9) GGTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGAGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTCCG > SRR10918235.6849030/1‑151 (MQ=8) GGTGACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.4308651/1‑54 (MQ=0) GGTCACCGACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGACTTGAACCGAAGCgttgccgcccaattccaggttctcgaacgcagcgccggtggcgtctactgccgagttgatgcccagactgatctggcccgca > SRR10918235.4212850/1‑69 (MQ=60) GTGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGT < SRR10918235.3530970/151‑1 (MQ=11) GTCACCGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT < SRR10918235.3781490/53‑1 (MQ=24) TGACCGACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTC > SRR10918235.6512752/1‑151 (MQ=16) 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SRR10918235.1887743/151‑1 (MQ=23) CGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.3364552/1‑48 (MQ=26) CGACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT < SRR10918235.2103691/48‑1 (MQ=26) GACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTCCTGGT > SRR10918235.2401762/1‑151 (MQ=25) GACGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTCCTGGT > SRR10918235.7098852/1‑151 (MQ=25) GACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.1239318/1‑47 (MQ=32) GACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.5851052/1‑47 (MQ=32) GACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.5153831/1‑47 (MQ=32) GACGG‑GGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGACTTGAACCGAAGCgttgccgcccaattccaggttctcgaacgcagcgccggtggcgtctactgccgagttgatgcccagactgatctggcccgcatcctggt > SRR10918235.5064521/1‑62 (MQ=60) GAAGG‑GGTCGCGGTCAGCTTGGCCACCACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCGCCCAGTTCCAGGTTCTCGAAGGTGTGACCGTCTACATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCAGCGTCCTGGT < SRR10918235.1848487/151‑1 (MQ=2) ACGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGT > SRR10918235.4407700/1‑46 (MQ=43) CGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTCCTGGTAG > SRR10918235.2558587/1‑151 (MQ=29) CGG‑GGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTCCTGGTAG < SRR10918235.4919252/151‑1 (MQ=29) AGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTCCTGGTAG < SRR10918235.3860398/151‑1 (MQ=54) | GGCCAGATCAGTCTGGGCATCACGTCCGCTGTGGATATAGACGGTCACACCTTTGAGAACCTGGAACTGGGTGGTGCTGCTTCGGTTCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTCACCGAAGG‑GGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTCCTGGTAG > CP009974/1897814‑1898113 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |