Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
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|
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ATAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGNAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTG < SRR19973072.4295217/150‑1 (MQ=60)
ATAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCTATTTCTCACTG > SRR19973072.4535748/1‑150 (MQ=60)
ATAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTG > SRR19973072.1102251/1‑150 (MQ=60)
TAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGA > SRR19973072.416945/1‑150 (MQ=60)
TAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTT‑TCACTGAC > SRR19973072.2985254/1‑150 (MQ=60)
TAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTT‑TCACTGAC > SRR19973072.2985285/1‑150 (MQ=60)
TAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTT‑TCACTGAC > SRR19973072.2985244/1‑150 (MQ=60)
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AGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACA < SRR19973072.3924225/150‑1 (MQ=60)
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ATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAA > SRR19973072.1214888/1‑150 (MQ=60)
AAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAA > SRR19973072.3605731/1‑150 (MQ=60)
TCCACATACTACTTTTAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGG < SRR19973072.3081022/150‑1 (MQ=60)
TCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGG < SRR19973072.3081098/150‑1 (MQ=60)
CCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGC > SRR19973072.758399/1‑150 (MQ=60)
CACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAAATTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCA > SRR19973072.4067455/1‑150 (MQ=60)
CTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATT < SRR19973072.1768772/150‑1 (MQ=60)
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ACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAG < SRR19973072.3857418/150‑1 (MQ=60)
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CTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGT < SRR19973072.642695/150‑1 (MQ=60)
TTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTT > SRR19973072.650608/1‑150 (MQ=60)
TTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGAAAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTT > SRR19973072.651037/1‑150 (MQ=60)
TTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTTGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTC > SRR19973072.2893996/1‑150 (MQ=60)
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AGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCT < SRR19973072.2793322/150‑1 (MQ=60)
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CATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAA < SRR19973072.3435278/150‑1 (MQ=60)
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AGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGT < SRR19973072.1467128/150‑1 (MQ=60)
GGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCG < SRR19973072.4119345/150‑1 (MQ=60)
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TTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTG < SRR19973072.1186351/150‑1 (MQ=60)
CCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTTGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATACTGAATTTGTTCGTGGTTGTC > SRR19973072.2710874/1‑150 (MQ=60)
CCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTC > SRR19973072.3325696/1‑150 (MQ=60)
CCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTC > SRR19973072.3325829/1‑150 (MQ=60)
CGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCT > SRR19973072.4190519/1‑150 (MQ=60)
GTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTT < SRR19973072.1157794/150‑1 (MQ=60)
GTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTT < SRR19973072.1157873/150‑1 (MQ=60)
GTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTT < SRR19973072.1157785/150‑1 (MQ=60)
GTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTT > SRR19973072.87569/1‑150 (MQ=60)
GTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTT < SRR19973072.3074579/150‑1 (MQ=60)
GTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTT < SRR19973072.749086/150‑1 (MQ=60)
TATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTG > SRR19973072.1622769/1‑150 (MQ=60)
TATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTG < SRR19973072.752574/150‑1 (MQ=60)
AGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTG > SRR19973072.1452169/1‑150 (MQ=60)
AGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTG < SRR19973072.2908608/150‑1 (MQ=60)
GTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGT > SRR19973072.3017816/1‑150 (MQ=60)
CTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGAGTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTAGTGGTTGTCTTGCTGTAA > SRR19973072.4047587/1‑150 (MQ=60)
GCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAA < SRR19973072.2724992/150‑1 (MQ=60)
GCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAA < SRR19973072.2725000/150‑1 (MQ=60)
TTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACATATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAAT < SRR19973072.4066657/150‑1 (MQ=60)
TTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAAT < SRR19973072.426071/150‑1 (MQ=60)
TTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAAT < SRR19973072.4066959/150‑1 (MQ=60)
GAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACAT < SRR19973072.3119074/150‑1 (MQ=60)
AGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATG < SRR19973072.139315/150‑1 (MQ=60)
AGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATG < SRR19973072.2704575/150‑1 (MQ=60)
GTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGA > SRR19973072.532572/1‑150 (MQ=60)
ATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATT < SRR19973072.1886986/150‑1 (MQ=60)
ATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATT < SRR19973072.367339/150‑1 (MQ=60)
ATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATT < SRR19973072.367284/150‑1 (MQ=60)
ATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATT < SRR19973072.1480230/150‑1 (MQ=60)
TGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGA < SRR19973072.1095274/150‑1 (MQ=60)
GCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGAT > SRR19973072.147501/1‑150 (MQ=60)
CAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATA < SRR19973072.1826330/150‑1 (MQ=60)
GTTGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAATTTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATT < SRR19973072.4088004/150‑1 (MQ=60)
GATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATT < SRR19973072.4087940/150‑1 (MQ=60)
GATGCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATT < SRR19973072.4088042/150‑1 (MQ=60)
GATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATT > SRR19973072.1139388/1‑150 (MQ=60)
GATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATT > SRR19973072.2607029/1‑150 (MQ=60)
GCCCATCAAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAAT > SRR19973072.188778/1‑150 (MQ=60)
CCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAATCA < SRR19973072.1841348/150‑1 (MQ=60)
AAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAATCATGTAT < SRR19973072.599605/150‑1 (MQ=60)
AAAAATCGATTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAATCATGTAT < SRR19973072.4055793/150‑1 (MQ=60)
AATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAATCATGTATTTT < SRR19973072.544037/150‑1 (MQ=60)
TTTTTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAATCATGTATTTTACCTAA > SRR19973072.1045730/1‑150 (MQ=60)
TCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAATCATGTATTTTACCTAAGA < SRR19973072.4063365/150‑1 (MQ=60)
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TTTTGCATAAGTGATATCAAAATCCACATACTACTTTGAGGTTACGTTTTAACGTAGACTCATTGTTCATGCCTAATGGAGGGACTGACAGTGGAATTTTCCGTATAGTCTGCTTCAGAGTATTGCAGATGCCCATCAAAAATCGATTTCTCACTGACAGATAAAGAAATGGCACAAATTAGTTCGCTTGATTTGGGTTATGTTGGGGAGTCGGTAAAACATTTTAATCCTGAATTTGTTCGTGGTTGTCTTGCTGTAAAAATACATGATTGATATTAATCATGTATTTTACCTAAGA > CP009273/313006‑313303
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
