Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F86 I0 R1
|
593 |
297.4 |
9515568 |
94.4% |
8982696 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
327,515 |
G→T |
19.2% |
intergenic (+308/‑567) |
betT → / → yahA |
choline transporter of high affinity/c‑di‑GMP‑specific phosphodiesterase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 327,515 | 0 | G | T | 19.2%
| 231.4
/ 36.7
| 82 | intergenic (+308/‑567) | betT/yahA | choline transporter of high affinity/c‑di‑GMP‑specific phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/27); new base T (10/6); total (49/33) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATAACCAACATCT > CP009273/327366‑327661
|
ttGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCtgtg < 2:1321853/150‑1 (MQ=255)
tGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGat > 2:4353064/1‑150 (MQ=255)
aaTGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTAt < 1:1351541/150‑1 (MQ=255)
aaTGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTAt < 2:4522330/150‑1 (MQ=255)
aTGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTAtt > 2:1158003/1‑150 (MQ=255)
ttCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGaa < 1:3858811/150‑1 (MQ=255)
tCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAAt < 1:452271/150‑1 (MQ=255)
aaTAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGt < 1:78315/150‑1 (MQ=255)
tAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGttt < 1:133946/150‑1 (MQ=255)
tAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGttt > 1:2338099/1‑150 (MQ=255)
aGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTa < 2:3301390/150‑1 (MQ=255)
gTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTaa < 1:1206496/150‑1 (MQ=255)
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ttAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAat > 2:2548122/1‑150 (MQ=255)
tATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGttt < 1:2889020/150‑1 (MQ=255)
tATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGttt < 1:514415/150‑1 (MQ=255)
tAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTAt > 1:410340/1‑150 (MQ=255)
aaTGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTAtt > 1:397239/1‑150 (MQ=255)
aaaTATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCAt > 1:4381963/1‑150 (MQ=255)
aaaTATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCAt > 1:4381114/1‑150 (MQ=255)
atatTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTg < 1:3375045/150‑1 (MQ=255)
atatTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTg < 1:2711437/150‑1 (MQ=255)
atTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCt > 1:3700982/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGATCTTTTTAAATGACGATTTATTCATGATAATTGTGTATCGTAAATCATCTGTATTTAACGTATCCATTTTTTATTTATGGTTTATTTTTCTGTGTGTGATATTTTATTTAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCta < 1:3412753/150‑1 (MQ=255)
tGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCtat > 1:1158015/1‑150 (MQ=255)
gCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCtata > 2:1002859/1‑150 (MQ=255)
tGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTataat < 1:2525136/150‑1 (MQ=255)
aTCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAatat < 1:4108284/150‑1 (MQ=255)
tCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATAtt < 1:3942064/150‑1 (MQ=255)
aTTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTgg > 1:979358/1‑150 (MQ=255)
aTTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTgg > 1:979035/1‑150 (MQ=255)
aTTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTgg > 1:518847/1‑150 (MQ=255)
aTTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTgg > 1:446177/1‑150 (MQ=255)
aaTGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCa > 1:2422422/1‑150 (MQ=255)
tGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCAtt < 1:2954836/150‑1 (MQ=255)
tGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCAtt < 1:2956886/150‑1 (MQ=255)
ttattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGaa < 1:2673104/150‑1 (MQ=255)
ttattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGaa < 1:3441888/150‑1 (MQ=255)
ttattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGaa > 2:2259982/1‑150 (MQ=255)
ttattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGaa < 1:3441922/150‑1 (MQ=255)
tattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAAt < 1:3134611/150‑1 (MQ=255)
tattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAAt < 1:2244127/150‑1 (MQ=255)
tattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAAt < 1:4622153/150‑1 (MQ=255)
cATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGAt > 1:3132606/1‑150 (MQ=255)
cATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGAt > 1:3132472/1‑150 (MQ=255)
gagaAATGTGTATCGTAAATCACCTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCa < 1:2330184/150‑1 (MQ=255)
agaAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAg > 1:4364300/1‑150 (MQ=255)
agaAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAg > 1:1094362/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTc > 1:2916913/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTc > 2:2376096/1‑150 (MQ=255)
aTGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCtt > 2:276190/1‑150 (MQ=255)
tgtgTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTa > 1:556959/1‑150 (MQ=255)
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aaTTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGAc < 1:3385249/150‑1 (MQ=255)
aaTTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGAc < 1:3676011/150‑1 (MQ=255)
aTTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACa > 1:4499329/1‑150 (MQ=255)
aCGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCa > 2:1938520/1‑150 (MQ=255)
gCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATa < 1:2882272/150‑1 (MQ=255)
aTTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTaa < 2:2909967/150‑1 (MQ=255)
ttGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATg > 2:511032/1‑150 (MQ=255)
ttGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATg > 2:511040/1‑150 (MQ=255)
tGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGa > 2:431562/1‑150 (MQ=255)
tGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGa < 1:3754877/150‑1 (MQ=255)
gTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGAt < 2:410340/150‑1 (MQ=255)
tATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATAc > 2:2505885/1‑150 (MQ=255)
tATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATAc > 2:2505894/1‑150 (MQ=255)
tATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGATGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATAc > 2:2583523/1‑150 (MQ=255)
tATTTAAGGTTTAATTATCTGTTTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATAGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATAc > 2:129408/1‑150 (MQ=255)
tATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATAc > 1:4266740/1‑150 (MQ=255)
aTTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACg > 2:1466613/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTAt > 2:1956110/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTAt > 2:3666365/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTAt > 2:3663507/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTAt > 2:3663487/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTAt > 2:1956019/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTAt > 2:1955810/1‑150 (MQ=255)
gTTTAATTATCTGCGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCAt > 2:3117836/1‑150 (MQ=255)
tttAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTACTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATa > 1:655757/1‑150 (MQ=255)
ttAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATaa > 1:3108346/1‑150 (MQ=255)
ttAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATaa > 1:3108322/1‑150 (MQ=255)
aTCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATAACCAACa > 1:2373689/1‑150 (MQ=255)
tCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATAACCAACAt < 2:3700982/150‑1 (MQ=255)
tgtgtgtgATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATAACCAACATCt > 1:4156195/1‑150 (MQ=255)
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TTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATGATACGTATGCATAACCAACATCT > CP009273/327366‑327661
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
