Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
294,929 |
C→A |
87.1% |
E573* (GAA→TAA) |
paoC ← |
PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 294,929 | 0 | C | A | 87.1%
| 349.7
/ 48.7
| 147 | E573* (GAA→TAA) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/12); new base A (57/71); total (64/83) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.24e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTT > CP009273/294784‑295073
|
gTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTaaa < 1:1842495/148‑1 (MQ=255)
gTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTaaa < 2:3282959/148‑1 (MQ=255)
tttCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATg < 1:3039589/148‑1 (MQ=255)
tCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGct < 2:591421/148‑1 (MQ=255)
ggATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGctct < 1:1169011/148‑1 (MQ=255)
tCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTc < 2:1177139/148‑1 (MQ=255)
ggATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGc < 1:2495301/148‑1 (MQ=255)
gATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCt < 1:840344/148‑1 (MQ=255)
gATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCt < 1:2523770/148‑1 (MQ=255)
gATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCt > 1:1158994/1‑148 (MQ=255)
gATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCt > 2:1363031/1‑148 (MQ=255)
aTGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTg < 2:2935166/148‑1 (MQ=255)
aTGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTg > 2:1787917/1‑148 (MQ=255)
cGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCa > 1:3210770/1‑148 (MQ=255)
cGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCa < 1:559245/148‑1 (MQ=255)
cGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCa > 1:193238/1‑148 (MQ=255)
tCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGt > 1:733156/1‑148 (MQ=255)
cagcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgcc > 2:2525104/1‑148 (MQ=255)
cagcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgcc > 2:1657643/1‑148 (MQ=255)
agcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccg > 1:296083/1‑148 (MQ=255)
agcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccg > 1:296092/1‑148 (MQ=255)
gcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgc < 2:1882702/148‑1 (MQ=255)
gcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgc < 2:310520/148‑1 (MQ=255)
cacacacaGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc < 1:1354148/148‑1 (MQ=255)
acacaGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCAACAAAATGCGCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGGCTGc < 2:17815/148‑1 (MQ=255)
acaGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCgg < 1:1817244/148‑1 (MQ=255)
acaGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCgg > 2:2010494/1‑148 (MQ=255)
acaGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCgg > 2:2011396/1‑148 (MQ=255)
gCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc < 2:831705/148‑1 (MQ=255)
tACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg < 2:2059039/148‑1 (MQ=255)
tACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg < 2:2517635/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGt > 1:518925/1‑148 (MQ=255)
cGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTa < 2:3218415/148‑1 (MQ=255)
gACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTg > 2:1100800/1‑148 (MQ=255)
aCCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTgg < 2:2614048/148‑1 (MQ=255)
aCCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTgg > 2:1648410/1‑148 (MQ=255)
cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcgc < 1:27916/148‑1 (MQ=255)
cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcgc > 2:1636332/1‑148 (MQ=255)
aaCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAACTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt < 2:850484/148‑1 (MQ=255)
aaCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt > 1:560087/1‑148 (MQ=255)
aaCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt > 1:560083/1‑148 (MQ=255)
aaCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt < 2:2700928/148‑1 (MQ=255)
aaCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt < 2:2700934/148‑1 (MQ=255)
aaCGTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt < 2:3075774/148‑1 (MQ=255)
aCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc > 1:3245877/1‑148 (MQ=255)
aCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc > 2:747936/1‑148 (MQ=255)
aCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc > 1:2079617/1‑148 (MQ=255)
aCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCGTc > 2:2316723/1‑148 (MQ=255)
ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 2:2015229/148‑1 (MQ=255)
gtctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCACAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 2:1254813/147‑1 (MQ=255)
tctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg > 1:2265882/1‑148 (MQ=255)
ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGt < 1:3052138/148‑1 (MQ=255)
ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGt > 1:734099/1‑148 (MQ=255)
cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTCCCg > 2:2098912/1‑148 (MQ=255)
cgcgCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg < 2:256854/148‑1 (MQ=255)
cgcgCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg < 1:955158/148‑1 (MQ=255)
cgcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt > 1:2890256/1‑148 (MQ=255)
gcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTa < 2:312500/148‑1 (MQ=255)
tATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAAt < 1:3184230/148‑1 (MQ=255)
cACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg < 2:193238/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGc < 1:1348501/148‑1 (MQ=255)
cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGcc > 2:609234/1‑148 (MQ=255)
cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGcc > 1:1753729/1‑148 (MQ=255)
tCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCaa < 2:1093496/148‑1 (MQ=255)
ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTTCCGTCGGCaaa > 1:289122/1‑148 (MQ=255)
ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAAGGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTTCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCaaa < 2:689971/148‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc < 2:89985/148‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc < 2:90065/148‑1 (MQ=255)
aaaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCg < 1:1514671/148‑1 (MQ=255)
aaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGa < 2:2227995/148‑1 (MQ=255)
aTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGAc > 1:3133411/1‑148 (MQ=255)
aTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGAc > 1:2745199/1‑148 (MQ=255)
tGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACt > 2:1134801/1‑148 (MQ=255)
gCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTg < 2:2913805/148‑1 (MQ=255)
gCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTg > 1:819863/1‑148 (MQ=255)
cccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGc < 2:1541062/148‑1 (MQ=255)
cccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGc < 2:1541112/148‑1 (MQ=255)
cAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAgg < 1:389217/148‑1 (MQ=255)
cAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAgg < 1:2159897/148‑1 (MQ=255)
aaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGAt > 2:3290657/1‑148 (MQ=255)
aaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGAt < 2:2240922/148‑1 (MQ=255)
aaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGAt < 2:1753729/148‑1 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCaa > 1:191699/1‑148 (MQ=255)
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TGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCA < SRR19973070.1647672/150‑1 (MQ=60)
CTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTATTCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATT < SRR19973070.454508/150‑1 (MQ=60)
CAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTC > SRR19973070.1484655/1‑150 (MQ=60)
TCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAG < SRR19973070.2127030/150‑1 (MQ=60)
TCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAG < SRR19973070.2127069/150‑1 (MQ=60)
TCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAG < SRR19973070.2127100/150‑1 (MQ=60)
CGAATTATATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCT < SRR19973070.522097/150‑1 (MQ=60)
ATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTCA > SRR19973070.687620/1‑150 (MQ=60)
ATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTCA > SRR19973070.1846031/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTCATAC > SRR19973070.1014881/1‑150 (MQ=60)
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GTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTCATAC > CP009273/294784‑295078
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
