Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,860,653 |
C→A |
89.3% |
E44* (GAA→TAA) |
ibpA ← |
heat shock chaperone |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,860,653 | 0 | C | A | 89.3%
| 485.5
/ 54.1
| 193 | E44* (GAA→TAA) | ibpA | heat shock chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (10/11); new base A (81/91); total (91/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TCAGCGATGCCCTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCTG > CP009273/3860508‑3860797
|
tCAGCGATGCCCTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGt < 2:1563802/148‑1 (MQ=255)
aGCGATGCCCTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCt < 1:2609134/148‑1 (MQ=255)
gCGATGCCCTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTa < 2:2810598/148‑1 (MQ=255)
cGATGCCCTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTAc > 1:1496215/1‑148 (MQ=255)
gATGCCCTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTAcc < 1:819637/148‑1 (MQ=255)
cTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCa < 1:2963873/148‑1 (MQ=255)
tGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCaa < 2:3247991/148‑1 (MQ=255)
gTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACg < 1:2320948/148‑1 (MQ=255)
aCAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGtt < 1:668663/148‑1 (MQ=255)
aCAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGtt < 2:3122918/148‑1 (MQ=255)
aCAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGtt < 1:245506/148‑1 (MQ=255)
gATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTtata < 2:2741123/148‑1 (MQ=255)
aTAGGTGCGCTCTTTTTGTTCTTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATAc > 2:983067/1‑148 (MQ=255)
aTAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATAc > 1:192236/1‑148 (MQ=255)
aTAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATAc > 1:1384539/1‑148 (MQ=255)
aGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACgg < 1:2432884/148‑1 (MQ=255)
ggTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGa < 1:804494/148‑1 (MQ=255)
gTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAg < 1:1654180/148‑1 (MQ=255)
gTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAg > 2:2881464/1‑148 (MQ=255)
gcgcTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAggg < 2:1223575/148‑1 (MQ=255)
gcgcTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAggg > 2:1373359/1‑148 (MQ=255)
ctctTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAg > 1:842942/1‑148 (MQ=255)
tctTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAgc > 1:1009969/1‑148 (MQ=255)
tctTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAgc < 1:2083803/148‑1 (MQ=255)
tctTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAgc < 1:262180/148‑1 (MQ=255)
ttttGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAgccgc > 2:611167/1‑148 (MQ=255)
tttGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAgccgcc > 1:305113/1‑148 (MQ=255)
gTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCAtt < 2:912472/148‑1 (MQ=255)
cgtcgGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTAct < 2:1012590/148‑1 (MQ=255)
gtcgGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActc < 2:1100833/148‑1 (MQ=255)
gtcgGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActc > 2:2680359/1‑148 (MQ=255)
tcgGCGTGAGCACCTGTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActct < 2:2452541/148‑1 (MQ=255)
cgGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActctg < 1:2219106/148‑1 (MQ=255)
ggCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActctgg > 1:1940594/1‑148 (MQ=255)
ggCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActctgg > 1:1940619/1‑148 (MQ=255)
aGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActctggctctgg < 2:599138/148‑1 (MQ=255)
aGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActctggctctgg < 1:2880447/148‑1 (MQ=255)
aGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActctggctctgg > 2:2086375/1‑148 (MQ=255)
aGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTActctggctctgg < 2:1883939/148‑1 (MQ=255)
gCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGgt < 1:2921751/148‑1 (MQ=255)
ccTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGgttgt < 1:1805782/148‑1 (MQ=255)
tttCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGttt > 1:2889081/1‑148 (MQ=255)
ttCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGtttt < 2:2643284/148‑1 (MQ=255)
ccaccaGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTaa > 1:942872/1‑148 (MQ=255)
caccaGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAg < 1:1013266/148‑1 (MQ=255)
accaGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGt > 1:1295425/1‑148 (MQ=255)
accaGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGt > 1:2366426/1‑148 (MQ=255)
accaGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGt > 2:1340999/1‑148 (MQ=255)
agcagATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGt < 1:2542411/148‑1 (MQ=255)
gATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaaa > 2:2954832/1‑148 (MQ=255)
gATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaaa > 1:968327/1‑148 (MQ=255)
ttATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaaaca > 1:1345602/1‑148 (MQ=255)
ttATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaaaca > 2:2447333/1‑148 (MQ=255)
ttATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaaaca > 2:2021553/1‑148 (MQ=255)
tATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGAAAAACCATCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGTTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaaacaa < 1:555219/148‑1 (MQ=255)
gaTCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaaacaa < 2:2344219/147‑1 (MQ=255)
tCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTaa < 2:2362440/142‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACg > 2:3082721/1‑148 (MQ=255)
ccTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACg > 2:3082819/1‑148 (MQ=255)
ccTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACg > 2:3160353/1‑148 (MQ=255)
cTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGTTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACgg < 1:2225710/148‑1 (MQ=255)
gggCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAATCAAACGGTc > 2:528236/1‑148 (MQ=255)
gTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACACACGGTCAAATc > 2:1306778/1‑148 (MQ=255)
gTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATc > 2:1618594/1‑148 (MQ=255)
gTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATc > 2:747940/1‑148 (MQ=255)
aaTTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCa > 2:2433563/1‑148 (MQ=255)
tttCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAAt < 1:2946328/148‑1 (MQ=255)
tttCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAAt < 2:3002982/148‑1 (MQ=255)
tCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGATCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAg > 2:219685/1‑148 (MQ=255)
tCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAAc > 2:3109762/1‑148 (MQ=255)
tCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAAc > 1:1227085/1‑148 (MQ=255)
cGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACg < 1:3007143/148‑1 (MQ=255)
gCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACgg > 1:502433/1‑148 (MQ=255)
ctctCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGt > 2:1589789/1‑148 (MQ=255)
ctctCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGt > 1:1544709/1‑148 (MQ=255)
gCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCg < 2:148818/148‑1 (MQ=255)
cAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCgg < 1:371800/148‑1 (MQ=255)
cAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGAGGTAATGTTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATAACTCTGCCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGAAAAGCgg > 1:2829960/1‑148 (MQ=255)
aaaCCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCgggg < 2:2018178/148‑1 (MQ=255)
aaCCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGa > 2:1147747/1‑148 (MQ=255)
aCCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGAt > 1:318295/1‑148 (MQ=255)
gCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAAt < 1:2183945/148‑1 (MQ=255)
ccACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATc > 2:450648/1‑148 (MQ=255)
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AATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAAT > SRR19973070.1949572/1‑150 (MQ=60)
AATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAAT < SRR19973070.962391/150‑1 (MQ=60)
TTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAG < SRR19973070.2965299/150‑1 (MQ=60)
TTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAG < SRR19973070.2965319/150‑1 (MQ=60)
GTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAAC > SRR19973070.1235673/1‑150 (MQ=60)
TCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGG > SRR19973070.505920/1‑150 (MQ=60)
CGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGT > SRR19973070.149144/1‑150 (MQ=60)
CGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGT < SRR19973070.3026351/150‑1 (MQ=60)
CGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGT > SRR19973070.1555564/1‑150 (MQ=60)
CGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGT < SRR19973070.567631/150‑1 (MQ=60)
CGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGT > SRR19973070.1555614/1‑150 (MQ=60)
CTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAA > SRR19973070.83849/1‑150 (MQ=60)
AGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGAGGTAATGTTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATAACTCTGCCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGAAAAGCGG > SRR19973070.2848274/1‑150 (MQ=60)
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CAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGG < SRR19973070.374526/150‑1 (MQ=60)
AAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGA > SRR19973070.2565976/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGAT > SRR19973070.320604/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGAT > SRR19973070.2938379/1‑150 (MQ=60)
CAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAAT < SRR19973070.2219360/150‑1 (MQ=60)
CAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAAT < SRR19973070.545596/150‑1 (MQ=60)
GCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCA < SRR19973070.2198389/150‑1 (MQ=60)
AGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTT > SRR19973070.2511197/1‑150 (MQ=60)
AGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTT < SRR19973070.446400/150‑1 (MQ=60)
TAGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGCTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCA > SRR19973070.2104656/1‑150 (MQ=60)
AGCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCAT < SRR19973070.1160538/150‑1 (MQ=60)
GCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTAGACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACACATA < SRR19973070.871551/150‑1 (MQ=60)
GCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATA < SRR19973070.2900119/150‑1 (MQ=60)
GCAATGCGGTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATA < SRR19973070.2824790/150‑1 (MQ=60)
GTAATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAG < SRR19973070.1340037/150‑1 (MQ=60)
AATGGTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCT > SRR19973070.768223/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGAGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCT < SRR19973070.157755/150‑1 (MQ=60)
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GGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGAGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCT < SRR19973070.157813/150‑1 (MQ=60)
GTTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCTG > SRR19973070.1647119/1‑150 (MQ=60)
TTTTAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCTGA > SRR19973070.2324365/1‑150 (MQ=60)
TAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCTGAAAT < SRR19973070.936139/150‑1 (MQ=60)
TAGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCTGAAAT < SRR19973070.1019779/150‑1 (MQ=60)
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GCGTTCAGCGATGCCCTGGTACAGATAGGTGCGCTCTTTTTGTTCGTCGGCGTGAGCACCTTTCACCACCAGCAGATTATCCTGGGCGGTAATTTCCAGTTCGCTCTCAGCAAAACCAGCCACAGCGATAGCAATGCGGTAATGGTTTTCGTCTACCAGTTCAACGTTATACGGAGGGTAGCCGCCATTACTCTGGCTCTGGTTGTTTTCTAAGTGGTTAAACAAACGGTCAAATCCAATAGCAGAACGGTAAAGCGGGGATAAATCAAAGTTACGCATAATCAATAGCTCCTGAAAT > CP009273/3860504‑3860801
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
