Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F142 I0 R1
|
859 |
274.6 |
8723680 |
96.4% |
8409627 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
1,048,928 |
C→A |
90.6% |
E903* (GAA→TAA) |
torS ← |
hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 1,048,928 | 0 | C | A | 90.6%
| 664.7
/ 60.0
| 224 | E903* (GAA→TAA) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/12); new base A (113/90); total (122/102) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.58e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
GCCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTT > CP009273/1048782‑1049074
|
gccgcTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGc < 1:375985/150‑1 (MQ=255)
cgcTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCgg > 1:3971424/1‑150 (MQ=255)
cgcTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCgg > 1:3971391/1‑150 (MQ=255)
gcTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGc < 2:2591820/150‑1 (MQ=255)
gcTGCCAGCGGGTTCTTTTAGTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGc < 2:416836/150‑1 (MQ=255)
cTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCa > 2:2635426/1‑150 (MQ=255)
cTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCa > 1:935533/1‑150 (MQ=255)
ccAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAaca > 1:4130672/1‑150 (MQ=255)
gggTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCg < 1:1808734/150‑1 (MQ=255)
cTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTaa > 2:795848/1‑150 (MQ=255)
tttATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAAtt > 1:158239/1‑150 (MQ=255)
tgtATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAAtt < 1:1637312/148‑1 (MQ=255)
ttATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAAttt < 2:734960/150‑1 (MQ=255)
tATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATttc > 1:728197/1‑150 (MQ=255)
ctctGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCg > 2:3245607/1‑150 (MQ=255)
ctGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCgtg < 2:18796/150‑1 (MQ=255)
ctGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCgtg < 1:1260385/150‑1 (MQ=255)
tGCCATGATTTTGCCATTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCgtgt < 2:3896397/150‑1 (MQ=255)
ccATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTgg > 1:2743033/1‑150 (MQ=255)
ccATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCACCACTGCGTGTCATTTCTTCGTGTgg > 2:2935764/1‑150 (MQ=255)
tGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTAGTGTGGAAg > 1:2576271/1‑150 (MQ=255)
tttGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAggggg > 1:2208581/1‑150 (MQ=255)
ttGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAgggggg > 1:2638644/1‑150 (MQ=255)
ccAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAg > 1:3269180/1‑150 (MQ=255)
ccAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAg > 1:286685/1‑150 (MQ=255)
cAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGa < 1:215964/150‑1 (MQ=255)
cAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGa < 1:216350/150‑1 (MQ=255)
aGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGAt < 1:2433480/150‑1 (MQ=255)
tCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATaa > 1:3777662/1‑150 (MQ=255)
cGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATg < 1:1037247/150‑1 (MQ=255)
cGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATg < 2:1346504/150‑1 (MQ=255)
cGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATg < 1:1125791/150‑1 (MQ=255)
aaGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgctg > 2:695911/1‑150 (MQ=255)
ataCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTcc > 1:629497/1‑150 (MQ=255)
ataCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTcc > 2:4141503/1‑150 (MQ=255)
aCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAg > 2:1996368/1‑150 (MQ=255)
aCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAg > 2:1394441/1‑150 (MQ=255)
ccAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGt > 2:2114976/1‑150 (MQ=255)
ccAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGt > 2:4303259/1‑150 (MQ=255)
tGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTgc < 2:345889/150‑1 (MQ=255)
ccACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTgcgc > 1:3795802/1‑150 (MQ=255)
ccACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTgcgc > 2:2987589/1‑150 (MQ=255)
cTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATa > 2:1207709/1‑150 (MQ=255)
tATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTACTCCAGTTGTGCGCATAg > 1:1963160/1‑150 (MQ=255)
tATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTACTCCAGTTGTGCGCATAg > 1:2512620/1‑150 (MQ=255)
aTTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgc > 2:1328878/1‑150 (MQ=255)
ttCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgct < 2:4252505/150‑1 (MQ=255)
aGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctggct < 1:3023961/150‑1 (MQ=255)
aGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctggct < 1:68113/150‑1 (MQ=255)
gttgttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctggctg < 1:240802/150‑1 (MQ=255)
gttgttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctggctg < 2:1711785/150‑1 (MQ=255)
gttgttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctggctg < 1:955820/150‑1 (MQ=255)
tgttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCtggctggc > 1:1731566/1‑150 (MQ=255)
ttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGa > 2:2655008/1‑150 (MQ=255)
ttAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGatat > 2:3474524/1‑150 (MQ=255)
ttAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGatat > 2:3067841/1‑150 (MQ=255)
tAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCACCACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATg > 2:3711941/1‑150 (MQ=255)
tAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATg > 2:1661828/1‑150 (MQ=255)
aaCTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGc > 1:1613092/1‑150 (MQ=255)
aaCTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGc > 2:15993/1‑150 (MQ=255)
cTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAt > 2:2752115/1‑150 (MQ=255)
cTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAt > 1:68840/1‑150 (MQ=255)
cTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAt < 1:4019524/150‑1 (MQ=255)
tGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCa < 2:2815253/150‑1 (MQ=255)
gATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAg < 2:209468/150‑1 (MQ=255)
atatTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGa < 2:1794514/150‑1 (MQ=255)
tatTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGAc > 1:3181339/1‑150 (MQ=255)
atTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACt < 1:3137305/150‑1 (MQ=255)
atTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACt > 1:4051804/1‑150 (MQ=255)
atTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACt < 1:1192334/150‑1 (MQ=255)
taTTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGa > 1:3541267/2‑150 (MQ=255)
taTTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCATCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGa > 1:1348795/2‑150 (MQ=255)
aTTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAg > 2:1453094/1‑150 (MQ=255)
aTTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAg > 2:4322398/1‑150 (MQ=255)
aTTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAg > 2:3357289/1‑150 (MQ=255)
aTTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAg > 2:4135648/1‑150 (MQ=255)
tCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCa > 2:120067/1‑150 (MQ=255)
tCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCa > 1:3363961/1‑150 (MQ=255)
aTCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTg > 2:3723673/1‑150 (MQ=255)
cgTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCttt > 2:1087515/1‑150 (MQ=255)
tCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTa > 2:95743/1‑150 (MQ=255)
tCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTa < 2:2186940/150‑1 (MQ=255)
aGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGc < 1:795848/150‑1 (MQ=255)
aGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGc > 1:2117916/1‑150 (MQ=255)
aGGTCTTTCTTATGCAACAATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGc > 1:818862/1‑150 (MQ=255)
ggTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCt < 1:3472838/150‑1 (MQ=255)
gTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTg > 2:238767/1‑150 (MQ=255)
tctttcttATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGa > 1:2099311/1‑150 (MQ=255)
tttcttATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATg > 1:164817/1‑150 (MQ=255)
ttcttATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATgc < 1:2784822/150‑1 (MQ=255)
tcttATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATgcg > 2:4134915/1‑150 (MQ=255)
tATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCgg < 2:635997/150‑1 (MQ=255)
cAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACg < 1:1253253/150‑1 (MQ=255)
cAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACg > 1:2051318/1‑150 (MQ=255)
ccATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCtt < 1:1574966/150‑1 (MQ=255)
ccATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCtt < 1:323283/150‑1 (MQ=255)
tGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAt < 2:3943697/150‑1 (MQ=255)
tGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAt < 1:4303259/150‑1 (MQ=255)
tGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAt < 1:76237/150‑1 (MQ=255)
cTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAttt < 1:3089342/150‑1 (MQ=255)
|
GCCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTT > CP009273/1048782‑1049074
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTTCT > CP009273/1048783‑1049077
|
CCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGA < SRR19973079.1054147/150‑1 (MQ=60)
CGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAG < SRR19973079.2428839/150‑1 (MQ=60)
GCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGC < SRR19973079.378071/150‑1 (MQ=60)
GCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGC < SRR19973079.378069/150‑1 (MQ=60)
CGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGG > SRR19973079.3991362/1‑150 (MQ=60)
CGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGG > SRR19973079.3991376/1‑150 (MQ=60)
CGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGG > SRR19973079.3991395/1‑150 (MQ=60)
CTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCA > SRR19973079.940919/1‑150 (MQ=60)
TGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAA < SRR19973079.2181227/150‑1 (MQ=60)
TGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAA < SRR19973079.1318163/150‑1 (MQ=60)
CCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACA > SRR19973079.4151632/1‑150 (MQ=60)
CCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACA > SRR19973079.4151486/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACAC < SRR19973079.1977690/150‑1 (MQ=60)
CGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGC > SRR19973079.3791223/1‑150 (MQ=60)
CGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGC < SRR19973079.14092/150‑1 (MQ=60)
GGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCG < SRR19973079.1818123/150‑1 (MQ=60)
GTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTG > SRR19973079.1890794/1‑150 (MQ=60)
TTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATT > SRR19973079.159461/1‑150 (MQ=60)
TTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATT > SRR19973079.159492/1‑150 (MQ=60)
TGTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATT < SRR19973079.1646250/150‑1 (MQ=60)
TTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTT > SRR19973079.3229743/1‑150 (MQ=60)
TATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTC > SRR19973079.732050/1‑150 (MQ=60)
TATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTC > SRR19973079.2732230/1‑150 (MQ=60)
ATTCTCTGCCATTATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCT < SRR19973079.1281295/150‑1 (MQ=60)
TTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTT > SRR19973079.4015471/1‑150 (MQ=60)
TTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTT > SRR19973079.4016900/1‑150 (MQ=60)
CTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTG < SRR19973079.1267601/150‑1 (MQ=60)
TGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGT > SRR19973079.2711009/1‑150 (MQ=60)
CCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGG > SRR19973079.2757185/1‑150 (MQ=60)
CCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGG > SRR19973079.2759571/1‑150 (MQ=60)
CATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGA < SRR19973079.372772/150‑1 (MQ=60)
TGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTAGTGTGGAAG > SRR19973079.2589441/1‑150 (MQ=60)
TTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGG > SRR19973079.2219977/1‑150 (MQ=60)
TTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGG > SRR19973079.2652280/1‑150 (MQ=60)
CCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAG > SRR19973079.3285674/1‑150 (MQ=60)
CCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAG > SRR19973079.288437/1‑150 (MQ=60)
CAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGA < SRR19973079.3802178/150‑1 (MQ=60)
CAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGA < SRR19973079.217455/150‑1 (MQ=60)
CAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGA < SRR19973079.217843/150‑1 (MQ=60)
AGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGAT < SRR19973079.2446000/150‑1 (MQ=60)
AGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGAT < SRR19973079.2443928/150‑1 (MQ=60)
AGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGAT < SRR19973079.739718/150‑1 (MQ=60)
GTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATA < SRR19973079.3926853/150‑1 (MQ=60)
TCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAA > SRR19973079.3797015/1‑150 (MQ=60)
TCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAA < SRR19973079.3273502/150‑1 (MQ=60)
CGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATG < SRR19973079.3165564/150‑1 (MQ=60)
CGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATG < SRR19973079.1042996/150‑1 (MQ=60)
CGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATG < SRR19973079.1132196/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGG < SRR19973079.1138784/150‑1 (MQ=60)
GTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCT > SRR19973079.2591398/1‑150 (MQ=60)
ATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCC > SRR19973079.633108/1‑150 (MQ=60)
ATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCC > SRR19973079.633111/1‑150 (MQ=60)
ATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCC > SRR19973079.181386/1‑150 (MQ=60)
TACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCA > SRR19973079.1858606/1‑150 (MQ=60)
ACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAG > SRR19973079.2583443/1‑150 (MQ=60)
CCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGC > SRR19973079.3815238/1‑150 (MQ=60)
ACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCAT > SRR19973079.2165232/1‑150 (MQ=60)
ACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCAT > SRR19973079.2165229/1‑150 (MQ=60)
ACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCAT < SRR19973079.528135/150‑1 (MQ=60)
TATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAG > SRR19973079.1262638/1‑150 (MQ=60)
TATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTACTCCAGTTGTGCGCATAG > SRR19973079.2525344/1‑150 (MQ=60)
TATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTACTCCAGTTGTGCGCATAG > SRR19973079.1973604/1‑150 (MQ=60)
TATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTACTCCAGTTGTGCGCATAG > SRR19973079.2524065/1‑150 (MQ=60)
AGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCT < SRR19973079.3039602/150‑1 (MQ=60)
AGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCT < SRR19973079.68870/150‑1 (MQ=60)
AGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCT < SRR19973079.68770/150‑1 (MQ=60)
GTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTG < SRR19973079.961244/150‑1 (MQ=60)
GTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTG < SRR19973079.961289/150‑1 (MQ=60)
GTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTG < SRR19973079.242407/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGC > SRR19973079.1740765/1‑150 (MQ=60)
AACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGC < SRR19973079.2173970/150‑1 (MQ=60)
AACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGC > SRR19973079.1621923/1‑150 (MQ=60)
AACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGC > SRR19973079.1622470/1‑150 (MQ=60)
AACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGC > SRR19973079.1622500/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAT > SRR19973079.4058749/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAT < SRR19973079.4039792/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAT < SRR19973079.3291635/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAT > SRR19973079.69500/1‑150 (MQ=60)
ATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGA > SRR19973079.2942993/1‑150 (MQ=60)
TATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGAC > SRR19973079.3197610/1‑150 (MQ=60)
ATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACT < SRR19973079.3153446/150‑1 (MQ=60)
ATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACT < SRR19973079.1199196/150‑1 (MQ=60)
ATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACT > SRR19973079.4072308/1‑150 (MQ=60)
TGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCG < SRR19973079.3320454/150‑1 (MQ=60)
TGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCG < SRR19973079.734091/150‑1 (MQ=60)
TATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGA > SRR19973079.3559404/1‑150 (MQ=60)
TATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCATCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGA > SRR19973079.1356342/1‑150 (MQ=60)
TCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCA > SRR19973079.3381272/1‑150 (MQ=60)
CAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAA > SRR19973079.973962/1‑150 (MQ=60)
TCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGC > SRR19973079.789950/1‑150 (MQ=60)
GCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTT < SRR19973079.4166838/150‑1 (MQ=60)
CGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTT > SRR19973079.1690119/1‑150 (MQ=60)
TCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTA < SRR19973079.96596/150‑1 (MQ=60)
TCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTA < SRR19973079.3129749/150‑1 (MQ=60)
AGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGC > SRR19973079.823542/1‑150 (MQ=60)
AGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGC < SRR19973079.800374/150‑1 (MQ=60)
AGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGC > SRR19973079.2128884/1‑150 (MQ=60)
AGGTCTTTCTTATGCAACAATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGC > SRR19973079.823575/1‑150 (MQ=60)
GGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCT < SRR19973079.3490739/150‑1 (MQ=60)
GGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCT < SRR19973079.3541054/150‑1 (MQ=60)
GTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCTACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTG < SRR19973079.636947/150‑1 (MQ=60)
TCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGA > SRR19973079.2110185/1‑150 (MQ=60)
TCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGA > SRR19973079.2110225/1‑150 (MQ=60)
CTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGAT < SRR19973079.3133230/150‑1 (MQ=60)
TTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATG > SRR19973079.165724/1‑150 (MQ=60)
TTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATG > SRR19973079.166073/1‑150 (MQ=60)
TTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATG < SRR19973079.82875/150‑1 (MQ=60)
TTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGC < SRR19973079.2799122/150‑1 (MQ=60)
TGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCA < SRR19973079.713353/150‑1 (MQ=60)
CAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACG < SRR19973079.1260436/150‑1 (MQ=60)
CAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACG < SRR19973079.1260416/150‑1 (MQ=60)
CAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACG > SRR19973079.2062078/1‑150 (MQ=60)
AACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGC > SRR19973079.3451968/1‑150 (MQ=60)
CCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTT < SRR19973079.1583658/150‑1 (MQ=60)
CCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTT < SRR19973079.1583664/150‑1 (MQ=60)
CCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTT < SRR19973079.325121/150‑1 (MQ=60)
TGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAT < SRR19973079.2125932/150‑1 (MQ=60)
TGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAT < SRR19973079.4324940/150‑1 (MQ=60)
TGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAT < SRR19973079.76954/150‑1 (MQ=60)
TGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAT > SRR19973079.2809599/1‑150 (MQ=60)
CTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGTAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGAGATATGCATTCCCAGACTAGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTT < SRR19973079.3105160/150‑1 (MQ=60)
CTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTT < SRR19973079.3105318/150‑1 (MQ=60)
CTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTT < SRR19973079.2391372/150‑1 (MQ=60)
TTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTT < SRR19973079.2833539/150‑1 (MQ=60)
TTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTT < SRR19973079.4252533/150‑1 (MQ=60)
TTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTT > SRR19973079.645712/1‑150 (MQ=60)
TACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTTC > SRR19973079.2962507/1‑150 (MQ=60)
ACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTTCT > SRR19973079.898610/1‑150 (MQ=60)
ACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTTCT < SRR19973079.1840645/150‑1 (MQ=60)
|
CCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTTTCT > CP009273/1048783‑1049077
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |