Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
147,501 |
A→T |
Y196N (TAC→AAC) |
yadK ← |
putative fimbrial‑like adhesin protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 147,501 | 0 | A | T | 100.0%
| 615.5
/ NA
| 184 | Y196N (TAC→AAC) | yadK | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (114/70); total (114/70) |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGATAAACGGAACGAGATCCGC > CP009273/147354‑147641
|
tCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTtaa < 1:1632411/150‑1 (MQ=255)
tCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTtaa < 1:1632769/150‑1 (MQ=255)
cacaATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAatat > 2:704688/1‑150 (MQ=255)
aaTAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCa > 2:1491906/1‑150 (MQ=255)
aaTAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCa > 1:3049703/1‑150 (MQ=255)
tAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACt > 2:2542696/1‑150 (MQ=255)
aaaCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTaa > 1:2700256/1‑150 (MQ=255)
aaaCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTaa > 2:1747349/1‑150 (MQ=255)
aaaCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTaa > 2:1997195/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAac > 1:3390395/1‑150 (MQ=255)
aCTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAaca > 2:2571617/1‑150 (MQ=255)
cTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAacac > 2:556575/1‑150 (MQ=255)
gTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATg > 2:790731/1‑150 (MQ=255)
tatGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCt > 2:1520998/1‑150 (MQ=255)
tatGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCt < 2:2710580/150‑1 (MQ=255)
gCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCAt < 2:1887964/150‑1 (MQ=255)
tgactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGt > 1:1163029/1‑150 (MQ=255)
gactgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGtt > 2:796570/1‑150 (MQ=255)
actgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATCTCCACTCACACATGGCTCATAAGTTg > 1:361182/1‑150 (MQ=255)
actgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTg > 2:90617/1‑150 (MQ=255)
tgTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAc > 1:1713538/1‑150 (MQ=255)
gTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcc > 2:1099514/1‑150 (MQ=255)
gTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcc > 2:1099437/1‑150 (MQ=255)
gTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGAcc < 1:3298604/150‑1 (MQ=255)
tATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCa < 2:2626982/150‑1 (MQ=255)
aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAg < 2:321057/150‑1 (MQ=255)
aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAg < 1:1491906/150‑1 (MQ=255)
aTTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAg < 1:3442310/150‑1 (MQ=255)
aacaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTa > 2:3121498/1‑150 (MQ=255)
aacaaGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTa > 1:1222171/1‑150 (MQ=255)
aGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATTGCTCATAAGTTGACCAGATGTAacac > 1:2522923/1‑150 (MQ=255)
aTACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCa > 2:2090612/1‑150 (MQ=255)
aTACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCa < 1:976140/150‑1 (MQ=255)
aCAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAAt < 2:655212/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATg < 2:2423159/150‑1 (MQ=255)
aGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGc > 2:3045800/1‑150 (MQ=255)
gTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCa < 2:1524112/150‑1 (MQ=255)
cTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGa > 2:2633742/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaaGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATc > 2:1303924/1‑150 (MQ=255)
aaaaGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAt > 1:80311/1‑150 (MQ=255)
aaaGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAtt > 2:3001638/1‑150 (MQ=255)
aaaGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAtt > 2:1526981/1‑150 (MQ=255)
aaGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAttt < 2:3260429/150‑1 (MQ=255)
aaGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAttt < 2:3259909/150‑1 (MQ=255)
gAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAttttt > 1:3527579/1‑150 (MQ=255)
aaTGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGAtttttt > 2:2413800/1‑150 (MQ=255)
aaTGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAAAACTCAATGCAGGATCGAtttttt > 1:3667884/1‑150 (MQ=255)
aTGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTg > 2:2260826/1‑150 (MQ=255)
aTGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTg < 1:1115808/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTc < 1:87706/150‑1 (MQ=255)
cTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCg > 1:1319087/1‑150 (MQ=255)
cTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCg > 1:1681753/1‑150 (MQ=255)
aaGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGt > 2:407044/1‑150 (MQ=255)
aaGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGt > 2:1242738/1‑150 (MQ=255)
aaGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGt > 2:851309/1‑150 (MQ=255)
aGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTg > 2:427283/1‑150 (MQ=255)
aTAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCt < 2:3409505/150‑1 (MQ=255)
tAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTa > 2:2087696/1‑150 (MQ=255)
ttCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCTGGTGCTAAAttt > 1:2237672/1‑150 (MQ=255)
cATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTcc > 1:3765377/1‑150 (MQ=255)
tCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAAc < 1:1997195/150‑1 (MQ=255)
tGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTc < 2:2485451/150‑1 (MQ=255)
tttCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCAt > 1:2462041/1‑150 (MQ=255)
tttATTGATATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATTTCTCATAAGTTGAACATATGTAACACTCAATGCAGGATCAATTTTTTGCATTCGGGTTCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATATCa > 1:2370087/1‑150 (MQ=255)
ttATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCAt < 2:1713538/150‑1 (MQ=255)
ttATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCAt < 2:3204957/150‑1 (MQ=255)
tATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATc > 1:297441/1‑150 (MQ=255)
aTTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATcc < 1:284405/150‑1 (MQ=255)
ttGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCg < 2:3049703/150‑1 (MQ=255)
gTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGAc < 1:1755125/150‑1 (MQ=255)
gTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGAc > 1:996676/1‑150 (MQ=255)
ttATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACa > 1:722789/1‑150 (MQ=255)
ttATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACa < 2:3775414/150‑1 (MQ=255)
tATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACAt < 2:2594810/150‑1 (MQ=255)
aTGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACAtt > 2:900131/1‑150 (MQ=255)
aTGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACAtt < 2:1840026/150‑1 (MQ=255)
ggTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTAc > 2:1401849/1‑150 (MQ=255)
ggTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTAc > 2:3299360/1‑150 (MQ=255)
tGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGa > 1:2539640/1‑150 (MQ=255)
tGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGa > 1:1832567/1‑150 (MQ=255)
tGCGCTGTTTTAGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGa > 1:487009/1‑150 (MQ=255)
gcgcTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGAt < 1:642100/150‑1 (MQ=255)
cTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGATaaa > 2:1182981/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGATAAACg > 1:775943/1‑150 (MQ=255)
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ttttGTTTGTTATTCGTAGTTAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGATAAACGGa > 1:509262/1‑150 (MQ=255)
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TAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGATAAACGGAACGAGATCCGCCTGAAGCAT < SRR19973061.902546/150‑1 (MQ=60)
TAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGATAAACGGAACGAGATCCGCCTGAAGCAT < SRR19973061.902449/150‑1 (MQ=60)
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TTCCCACAATAAAACTTGTATATGCACTGACTGTATTACAACAAGAATACAGTGCTAAAAAAAGAATGTACCTGAAGATAGTCTTCATTTTTACTCCAATGTTTCTTTATTGTTATGGTTTGCGCTGTTTTTGTTTGTTATTCGTAGTAAATATCCACTAACACATGGCTCATAAGTTGACCAGATGTAACACTCAATGCAGGATCGATTTTTTGCATTCGGGTGCTAAATTTCCAGGATGAACCATTCATGTCATCCGACATTACTGGATAAACGGAACGAGATCCGCCTGAAGCAT > CP009273/147353‑147650
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
