Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
193,157 |
T→C |
I42T (ATA→ACA) |
rseP → |
inner membrane zinc RIP metalloprotease; RpoE activator, by degrading RseA; cleaved signal peptide endoprotease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 193,157 | 0 | T | C | 99.5%
| 811.3
/ NA
| 206 | I42T (ATA→ACA) | rseP | inner membrane zinc RIP metalloprotease; RpoE activator, by degrading RseA; cleaved signal peptide endoprotease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (84/121); minor base G (0/1); total (84/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
AGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAATAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCTTCAATA > CP009273/193010‑193303
|
aGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAg > 2:3687707/1‑150 (MQ=255)
aCGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGt < 2:1939790/150‑1 (MQ=255)
cGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGtt > 1:2394172/1‑150 (MQ=255)
cGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGtt < 2:361794/150‑1 (MQ=255)
gCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGttt < 1:1769955/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCATCAGGGTTTg > 1:1021482/1‑150 (MQ=255)
ttAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGt < 1:3483430/150‑1 (MQ=255)
aCGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAg > 1:634059/1‑150 (MQ=255)
cGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAgg > 1:2703423/1‑150 (MQ=255)
cGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAgg < 1:2681980/150‑1 (MQ=255)
cGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAgg < 1:1638382/150‑1 (MQ=255)
cGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAgg > 1:2334728/1‑150 (MQ=255)
ggAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGgc > 1:438561/1‑150 (MQ=255)
ggAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGgc > 2:1953341/1‑150 (MQ=255)
gAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGgcg < 2:2232493/150‑1 (MQ=255)
aaGGTAATATGATGAGTTTTCTCTGGGATTTGTATTCGTTCATCGATGCACTGGGAGTACTTATCACCGTGCAAGAATTTGGTCATTACTGGGTTGCCCGGCGTTGTGTTGTTCGCGTTTAGAGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGtcgc > 2:1401618/1‑150 (MQ=255)
gTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGctct > 2:1032552/1‑150 (MQ=255)
gTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGctct < 1:2777363/150‑1 (MQ=255)
tAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAAGAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTg < 2:2723835/150‑1 (MQ=255)
tAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTg > 2:1796586/1‑150 (MQ=255)
tAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTg > 2:2025071/1‑150 (MQ=255)
aaTATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTgg < 1:519223/150‑1 (MQ=255)
tatGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTggcg < 2:3724710/150‑1 (MQ=255)
gCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGgcggcg < 1:3026784/150‑1 (MQ=255)
gTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTg > 2:1268576/1‑150 (MQ=255)
ttttCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGa < 1:2015194/150‑1 (MQ=255)
tttCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGAt < 2:3131343/150‑1 (MQ=255)
tttCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGAt < 1:868215/150‑1 (MQ=255)
tttCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGAt < 2:3131020/150‑1 (MQ=255)
ttCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATa < 2:2842819/150‑1 (MQ=255)
ctctGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAg < 1:731174/150‑1 (MQ=255)
tGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTc > 1:3784280/1‑150 (MQ=255)
ggATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCgg > 1:685609/1‑150 (MQ=255)
ggATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCgg < 1:2502661/150‑1 (MQ=255)
ggCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGa > 1:2846701/1‑150 (MQ=255)
cTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAat < 1:2936852/150‑1 (MQ=255)
tCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAatat < 2:2069675/150‑1 (MQ=255)
tCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAatat < 1:1996339/150‑1 (MQ=255)
gTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGt > 1:1885707/1‑150 (MQ=255)
ttCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGtt > 2:3290716/1‑150 (MQ=255)
cATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCTTGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTAt < 2:229626/150‑1 (MQ=255)
cATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTAt > 2:1215553/1‑150 (MQ=255)
aTCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATc < 1:425392/150‑1 (MQ=255)
aTCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATc < 1:3538356/150‑1 (MQ=255)
tCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCg < 1:2082267/150‑1 (MQ=255)
gTTGCACTGGGCGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGcc > 2:1809550/1‑150 (MQ=255)
tGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCNt < 1:2028973/150‑1 (MQ=255)
tGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCt < 2:3440769/150‑1 (MQ=255)
cTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATc < 2:2510374/150‑1 (MQ=255)
tGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATcc > 2:278700/1‑150 (MQ=255)
gggTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATccc > 1:566437/1‑150 (MQ=255)
gggTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATccc < 1:3343241/150‑1 (MQ=255)
gggTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATccc < 2:872024/150‑1 (MQ=255)
ggTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCg > 2:940517/1‑150 (MQ=255)
gtACTTATCACCGTGAATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTg < 1:53507/150‑1 (MQ=255)
cTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGc > 1:804683/1‑150 (MQ=255)
tCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGtt > 2:1116632/1‑150 (MQ=255)
tCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGtt < 1:3405430/150‑1 (MQ=255)
aCCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTAt > 2:3531736/1‑150 (MQ=255)
ccGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATg > 1:2624208/1‑150 (MQ=255)
gTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTc < 2:1505490/150‑1 (MQ=255)
gCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCaa > 1:1941539/1‑150 (MQ=255)
gCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTAGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACATGGTTTGGTAAGTCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGACACCGAATAAGTTATCGCCCAGATCCCGTTGAGCGGTTATGTCaa > 1:3736909/1‑150 (MQ=255)
tGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAAt < 2:477694/150‑1 (MQ=255)
aTTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCt < 2:3551683/150‑1 (MQ=255)
tttGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTg < 2:919609/150‑1 (MQ=255)
tttGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTg < 2:2304748/150‑1 (MQ=255)
ggTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGAt < 2:685609/150‑1 (MQ=255)
gTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATg < 1:1751823/150‑1 (MQ=255)
gTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATg > 2:587972/1‑150 (MQ=255)
tCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGa > 1:2808476/1‑150 (MQ=255)
cATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAg < 1:2946218/150‑1 (MQ=255)
aTTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAgc < 2:2699230/150‑1 (MQ=255)
aTTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAgc < 1:1586081/150‑1 (MQ=255)
gggTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAg < 2:1743206/150‑1 (MQ=255)
tGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAAcc < 1:1268576/150‑1 (MQ=255)
gCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCg < 1:2855142/150‑1 (MQ=255)
ccGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGt > 1:3089175/1‑150 (MQ=255)
cGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTc < 1:2921796/150‑1 (MQ=255)
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ggCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCg > 1:988880/1‑150 (MQ=255)
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TATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGG < SRR19973061.724736/150‑1 (MQ=60)
TCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTT < SRR19973061.2514904/150‑1 (MQ=60)
TCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTT < SRR19973061.3414176/150‑1 (MQ=60)
ACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTAT < SRR19973061.421573/150‑1 (MQ=60)
ACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTAT < SRR19973061.290784/150‑1 (MQ=60)
CCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATG > SRR19973061.2630950/1‑150 (MQ=60)
GTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTC > SRR19973061.1936147/1‑150 (MQ=60)
GCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAA > SRR19973061.1946371/1‑150 (MQ=60)
GCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTAGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACATGGTTTGGTAAGTCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGACACCGAATAAGTTATCGCCCAGATCCCGTTGAGCGGTTATGTCAA > SRR19973061.3746469/1‑150 (MQ=60)
GAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATG < SRR19973061.3018692/150‑1 (MQ=60)
AATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGC > SRR19973061.126457/1‑150 (MQ=60)
GTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATG < SRR19973061.497282/150‑1 (MQ=60)
GTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATG < SRR19973061.1756219/150‑1 (MQ=60)
GTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATG < SRR19973061.2030157/150‑1 (MQ=60)
TCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGA > SRR19973061.2815688/1‑150 (MQ=60)
TCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGA < SRR19973061.2277188/150‑1 (MQ=60)
CATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAG < SRR19973061.2953804/150‑1 (MQ=60)
ATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGC < SRR19973061.1590018/150‑1 (MQ=60)
TCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCG < SRR19973061.2953162/150‑1 (MQ=60)
CTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGC > SRR19973061.3130572/1‑150 (MQ=60)
CTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGC > SRR19973061.911668/1‑150 (MQ=60)
TGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCA > SRR19973061.438621/1‑150 (MQ=60)
TTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAAC < SRR19973061.747411/150‑1 (MQ=60)
TGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACC > SRR19973061.2225965/1‑150 (MQ=60)
TGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACC < SRR19973061.1271707/150‑1 (MQ=60)
GCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCG < SRR19973061.2862450/150‑1 (MQ=60)
GCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCG < SRR19973061.2862270/150‑1 (MQ=60)
CCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGT > SRR19973061.3097140/1‑150 (MQ=60)
CGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTC < SRR19973061.2929304/150‑1 (MQ=60)
CGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTC < SRR19973061.1803331/150‑1 (MQ=60)
CGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTC < SRR19973061.2937890/150‑1 (MQ=60)
GGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCG > SRR19973061.991404/1‑150 (MQ=60)
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GTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTC > SRR19973061.1261023/1‑150 (MQ=60)
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GTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCAC > SRR19973061.2911830/1‑150 (MQ=60)
GTTGAGCGTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCAC > SRR19973061.2911834/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTCAACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCT < SRR19973061.808164/150‑1 (MQ=60)
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ACAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCTTCAATAAT > SRR19973061.3329663/1‑150 (MQ=60)
|
CAGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAATAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCTTCAATAAT > CP009273/193009‑193305
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
