Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
257,734 |
A→T |
Q174L (CAG→CTG) |
proA → |
gamma‑glutamylphosphate reductase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 257,734 | 0 | A | T | 100.0%
| 637.2
/ NA
| 190 | Q174L (CAG→CTG) | proA | gamma‑glutamylphosphate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (89/101); total (89/101) |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
TGACGGTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCAGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCGACAATCCCGGTGATCACAGGTGGTATA > CP009273/257587‑257879
|
tGACGGTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTgg < 1:3191614/150‑1 (MQ=255)
tGACGGTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTgg > 1:3592532/1‑150 (MQ=255)
gACGGTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGc > 1:3682375/1‑150 (MQ=255)
ggTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGAt < 1:2806869/150‑1 (MQ=255)
ggTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGAt > 2:3756731/1‑150 (MQ=255)
ggTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGAt > 2:3000454/1‑150 (MQ=255)
gTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGAtt < 1:1274121/150‑1 (MQ=255)
tGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGa < 1:2062085/150‑1 (MQ=255)
tGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATaa < 2:3159775/150‑1 (MQ=255)
cgcttcgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATcc > 2:1764622/1‑150 (MQ=255)
cgcttcgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATcc > 1:169114/1‑150 (MQ=255)
gcttcgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCt < 2:3795782/150‑1 (MQ=255)
ttcgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGa < 2:2906330/150‑1 (MQ=255)
tcgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGAc < 1:1331980/150‑1 (MQ=255)
cgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGAcc < 1:1006701/150‑1 (MQ=255)
cgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGAcc < 2:6552/150‑1 (MQ=255)
cgctGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGAcc > 1:618595/1‑150 (MQ=255)
tgtgCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTg > 2:3068400/1‑150 (MQ=255)
tgtgCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTg > 2:468421/1‑150 (MQ=255)
tgtgCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTg > 2:1167175/1‑150 (MQ=255)
tgtgCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTg > 2:1743350/1‑150 (MQ=255)
gtgCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTgc < 1:1643764/150‑1 (MQ=255)
tgCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTgcg < 2:157460/150‑1 (MQ=255)
cTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTg < 1:1795363/150‑1 (MQ=255)
aaaCCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCATCGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCa < 1:2151956/150‑1 (MQ=255)
aaaCCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCa < 1:1003645/150‑1 (MQ=255)
aaCCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAg > 2:2088881/1‑150 (MQ=255)
aCCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGt < 2:1461079/150‑1 (MQ=255)
cGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGa > 1:474317/1‑150 (MQ=255)
gTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGaaa < 2:3164216/150‑1 (MQ=255)
gATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTAt > 2:99241/1‑150 (MQ=255)
aTCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATg < 2:2734734/150‑1 (MQ=255)
tCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATgg > 2:740405/1‑150 (MQ=255)
gcgGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAAt > 1:767775/1‑150 (MQ=255)
tGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACAt < 1:2645325/150‑1 (MQ=255)
tGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACAt < 1:2396459/150‑1 (MQ=255)
tGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACAt < 1:2644738/150‑1 (MQ=255)
ggCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATc < 1:3446624/150‑1 (MQ=255)
gCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCg < 2:1062203/150‑1 (MQ=255)
cAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGa > 1:1213760/1‑150 (MQ=255)
aaaGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGAc > 2:2284841/1‑150 (MQ=255)
aaaGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGAc > 1:295167/1‑150 (MQ=255)
aGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACAt < 1:582866/150‑1 (MQ=255)
gAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCTGGACGCCCTGAAATCCTGCTGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTCTGGATAAATACATCGACATg < 2:2157014/150‑1 (MQ=255)
gAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATg < 1:3469677/150‑1 (MQ=255)
aaaCGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGc > 1:2862001/1‑150 (MQ=255)
aaaCGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGc > 1:1281575/1‑150 (MQ=255)
aaCGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCt > 2:408296/1‑150 (MQ=255)
ccgggtCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTg < 2:3723494/146‑1 (MQ=255)
aCGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTg < 2:2684643/150‑1 (MQ=255)
gtgtCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGAt < 1:3209028/150‑1 (MQ=255)
tgtCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATc > 1:1730363/1‑150 (MQ=255)
tgtCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATc < 1:1202685/150‑1 (MQ=255)
tCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATccc < 1:194559/150‑1 (MQ=255)
cTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCgtg < 1:977970/150‑1 (MQ=255)
tAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCgtgg > 2:617667/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGtggtgg > 1:533997/1‑150 (MQ=255)
gCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGgc < 2:51041/150‑1 (MQ=255)
cTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGgcg > 1:1155711/1‑150 (MQ=255)
gCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCt > 2:2654557/1‑150 (MQ=255)
cAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTg < 2:1699592/150‑1 (MQ=255)
aaCGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTgg > 1:1022011/1‑150 (MQ=255)
aaCGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTgg < 1:2489465/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGt < 2:334215/150‑1 (MQ=255)
ggTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGttt < 2:3591542/150‑1 (MQ=255)
tGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGc > 2:32895/1‑150 (MQ=255)
gATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACt < 2:3592532/150‑1 (MQ=255)
ttCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACtgt < 1:518997/150‑1 (MQ=255)
tCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACtgtg < 1:793265/150‑1 (MQ=255)
aGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGcc < 1:2699194/150‑1 (MQ=255)
ggACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCg > 1:1520062/1‑150 (MQ=255)
gACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGt < 2:2382564/150‑1 (MQ=255)
gCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGaa > 2:1952817/1‑150 (MQ=255)
gCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGaa > 1:2357173/1‑150 (MQ=255)
gCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGaa > 1:2623044/1‑150 (MQ=255)
cccTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAAc < 1:2054749/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACa < 2:2005007/150‑1 (MQ=255)
cTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAg > 1:913845/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCg < 2:2918706/150‑1 (MQ=255)
aaaTCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCg > 1:1126193/1‑150 (MQ=255)
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GTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTatcca > SRR19973061.2563749/1‑145 (MQ=60)
TCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCC < SRR19973061.195140/150‑1 (MQ=60)
GCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGC > SRR19973061.499265/1‑150 (MQ=60)
CTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTG < SRR19973061.980458/150‑1 (MQ=60)
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CGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGG > SRR19973061.2446532/1‑150 (MQ=60)
GCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGC > SRR19973061.2162246/1‑150 (MQ=60)
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TGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAAC > SRR19973061.3594551/1‑150 (MQ=60)
GATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACT < SRR19973061.1711801/150‑1 (MQ=60)
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TCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTG < SRR19973061.795347/150‑1 (MQ=60)
AGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCC < SRR19973061.2706135/150‑1 (MQ=60)
GGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCG > SRR19973061.1523859/1‑150 (MQ=60)
GGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCG < SRR19973061.2661377/150‑1 (MQ=60)
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GCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAA > SRR19973061.2629783/1‑150 (MQ=60)
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CCGGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCGACAATCCCGGTGATC > SRR19973061.3271133/1‑150 (MQ=60)
GGCGGGTGCCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCGACAATCCCGGTGATCAC < SRR19973061.2290619/150‑1 (MQ=60)
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CCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCGACAATCCCGGTGATCACAGGTGGTA > SRR19973061.1219057/1‑150 (MQ=60)
CCGTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCGACAATCCCGGTGATCACAGGTGGTA < SRR19973061.1018538/150‑1 (MQ=60)
GTGCTGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCGACAATCCCGGTGATCACAGGTGGTATA < SRR19973061.2399862/150‑1 (MQ=60)
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TGACGGTTGATGTCGCTTCGCTGTGCCTGAAAACCGGTAATGCGGTGATCCTGCGCGGTGGCAAAGAAACGTGTCGCACTAACGCTGCAACGGTGGCGGTGATTCAGGACGCCCTGAAATCCTGCGGCTTACCGGCGGGTGCCGTGCAGGCGATTGATAATCCTGACCGTGCGCTGGTCAGTGAAATGCTGCGTATGGATAAATACATCGACATGCTGATCCCGCGTGGTGGCGCTGGTTTGCATAAACTGTGCCGTGAACAGTCGACAATCCCGGTGATCACAGGTGGTATA > CP009273/257587‑257879
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |