Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
720,816 |
G→T |
I559I (ATC→ATA) |
kdpB ← |
potassium translocating ATPase, subunit B |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 720,816 | 0 | G | T | 100.0%
| 693.9
/ NA
| 211 | I559I (ATC→ATA) | kdpB | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (120/91); total (120/91) |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CATGATGTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACG > CP009273/720669‑720962
|
caTGATGTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTAt < 2:2226278/150‑1 (MQ=255)
atgatgTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATc > 1:1681589/1‑150 (MQ=255)
atgatgTTAAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATc > 1:2161383/1‑150 (MQ=255)
tgatgTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCa < 1:799949/150‑1 (MQ=255)
tgTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACt < 1:1316300/150‑1 (MQ=255)
tgTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCAGCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCACCt > 1:1333528/1‑150 (MQ=255)
gTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACtt > 2:3426265/1‑150 (MQ=255)
gTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACtt > 1:2404843/1‑150 (MQ=255)
gcgcATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCg < 2:2267210/150‑1 (MQ=255)
gcATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCggg > 2:3364561/1‑150 (MQ=255)
aTTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGtt > 2:1230569/1‑150 (MQ=255)
aTTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGtt < 1:2254719/150‑1 (MQ=255)
tttAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTa > 1:1579187/1‑150 (MQ=255)
tAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTaga > 1:3754993/1‑150 (MQ=255)
cTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTc < 2:210724/150‑1 (MQ=255)
cTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTc < 2:1108733/150‑1 (MQ=255)
gATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGAt > 2:201122/1‑150 (MQ=255)
gATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGAt > 2:1899410/1‑150 (MQ=255)
gATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGAt < 2:350384/150‑1 (MQ=255)
gATACGTTGCCGAGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGTGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGAt < 2:3733322/150‑1 (MQ=255)
aTACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATc < 1:2202013/150‑1 (MQ=255)
tACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCg > 2:2166504/1‑150 (MQ=255)
aCGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGa < 2:664181/150‑1 (MQ=255)
aCGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGa > 1:2530808/1‑150 (MQ=255)
aCGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGa > 1:2530742/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGAcc < 1:1047406/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGAcc > 2:1308387/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCa > 1:928707/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCa > 1:1185192/1‑150 (MQ=255)
tGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCat < 1:1611862/150‑1 (MQ=255)
ccGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCatat < 1:863838/150‑1 (MQ=255)
gcgAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTg > 2:1087243/1‑150 (MQ=255)
gcgAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTg < 2:1210133/150‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGcc > 2:1629722/1‑150 (MQ=255)
cgccgGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCctc < 1:1277818/150‑1 (MQ=255)
ccgGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCtt < 2:2935172/150‑1 (MQ=255)
ccgGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCtt > 2:880732/1‑150 (MQ=255)
cgGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCttt > 1:1467699/1‑150 (MQ=255)
cgGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCttt > 2:654161/1‑150 (MQ=255)
ggAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTc < 2:523114/150‑1 (MQ=255)
gAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcg > 2:3496835/1‑150 (MQ=255)
ataatGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgcc > 1:2801970/1‑150 (MQ=255)
gTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGcc > 2:3042549/1‑150 (MQ=255)
tATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCg < 1:864009/150‑1 (MQ=255)
tATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCg < 1:2187272/150‑1 (MQ=255)
tATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCg < 1:3054905/150‑1 (MQ=255)
ttCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAg > 2:1332627/1‑150 (MQ=255)
tCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGt > 2:932613/1‑150 (MQ=255)
tCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGt > 2:1614929/1‑150 (MQ=255)
cGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGtt < 2:927351/150‑1 (MQ=255)
gCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTc < 2:1185192/150‑1 (MQ=255)
acaTCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATc < 1:877363/150‑1 (MQ=255)
caTCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCg < 1:1933853/150‑1 (MQ=255)
aTCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGc > 2:1705061/1‑150 (MQ=255)
cGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCa < 1:2194565/150‑1 (MQ=255)
gTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCAc < 2:2759323/150‑1 (MQ=255)
tGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACcg < 2:3205786/150‑1 (MQ=255)
aaTGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGAc > 2:2443664/1‑150 (MQ=255)
aaTGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGAc > 2:2443375/1‑150 (MQ=255)
aaTGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGAc < 1:1863866/150‑1 (MQ=255)
cTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATct > 2:3099026/1‑150 (MQ=255)
cTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATct < 1:1019441/150‑1 (MQ=255)
gAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGATTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCTAGATCGACCATATTGACCGCCTCTATCGCCGCATGGGTGCCGGAGTTAATCGCCACCTCGACATctgc > 1:2604525/1‑150 (MQ=255)
aaGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcc > 1:14064/1‑150 (MQ=255)
aGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcct < 1:2848636/150‑1 (MQ=255)
gtggtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcctgc > 2:3677411/1‑150 (MQ=255)
cAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAg < 1:820935/150‑1 (MQ=255)
aGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCg < 2:74216/150‑1 (MQ=255)
ccACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGa < 2:3480167/150‑1 (MQ=255)
cGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCa < 1:3770095/150‑1 (MQ=255)
gTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCg > 2:3530283/1‑150 (MQ=255)
catcaGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGtt > 1:326763/1‑150 (MQ=255)
aGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTg > 2:15192/1‑150 (MQ=255)
cATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGcc > 1:1680962/1‑150 (MQ=255)
cATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGcc > 1:2966203/1‑150 (MQ=255)
aTCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCg > 2:1561337/1‑150 (MQ=255)
aTCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCg > 2:1458289/1‑150 (MQ=255)
cTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTc > 1:504422/1‑150 (MQ=255)
tttGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGATATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGcc < 1:201122/150‑1 (MQ=255)
tttGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGcc < 2:2547738/150‑1 (MQ=255)
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CTGTAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCCACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCT < SRR19973061.796046/150‑1 (MQ=60)
CTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCT < SRR19973061.1022038/150‑1 (MQ=60)
CTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCT < SRR19973061.1541544/150‑1 (MQ=60)
GAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGATTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCTAGATCGACCATATTGACCGCCTCTATCGCCGCATGGGTGCCGGAGTTAATCGCCACCTCGACATCTGC > SRR19973061.2611218/1‑150 (MQ=60)
AAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCC > SRR19973061.14123/1‑150 (MQ=60)
AAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCC > SRR19973061.14457/1‑150 (MQ=60)
AGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCT < SRR19973061.2855933/150‑1 (MQ=60)
GGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGC > SRR19973061.2443327/1‑150 (MQ=60)
GTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCC > SRR19973061.3158616/1‑150 (MQ=60)
CAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAG < SRR19973061.823072/150‑1 (MQ=60)
CAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAG < SRR19973061.823076/150‑1 (MQ=60)
CCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGA < SRR19973061.3486274/150‑1 (MQ=60)
CGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCA < SRR19973061.3779722/150‑1 (MQ=60)
GGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATC < SRR19973061.1312021/150‑1 (MQ=60)
TCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGT > SRR19973061.1039519/1‑150 (MQ=60)
CATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTT > SRR19973061.327618/1‑150 (MQ=60)
ATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTG > SRR19973061.775952/1‑150 (MQ=60)
TCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGG > SRR19973061.387554/1‑150 (MQ=60)
CAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGT < SRR19973061.1896392/150‑1 (MQ=60)
CAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGT > SRR19973061.137357/1‑150 (MQ=60)
CATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCC > SRR19973061.2973857/1‑150 (MQ=60)
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GCCAATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGT < SRR19973061.2449685/150‑1 (MQ=60)
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ATGTGCACCACCTCTATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATA < SRR19973061.2453525/150‑1 (MQ=60)
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ATGATGTTCAGCGCATTTAACTGCGGATACGTTGCCGCGAATGCCGCCGGAATAATGGCGAAGTATTTCGCCACATCGTTGGCAATGCTGAAGGTGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAC > CP009273/720670‑720964
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |