Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
861,926 |
C→A |
intergenic (‑106/‑98) |
moeA ← / → iaaA |
molybdopterin molybdenumtransferase; molybdopterin biosynthesis protein/Isoaspartyl peptidase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 861,926 | 0 | C | A | 99.5%
| 720.7
/ NA
| 216 | intergenic (‑106/‑98) | moeA/iaaA | molybdopterin molybdenumtransferase; molybdopterin biosynthesis protein/Isoaspartyl peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (105/110); minor base T (0/1); total (105/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
AAGCGCGGTGTCGAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGC > CP009273/861779‑862071
|
aaGCGCGGTGTCGAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAat > 2:1386999/1‑150 (MQ=255)
gcgGTGTCGAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATcc < 2:483078/150‑1 (MQ=255)
cgGTGTCGAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCa < 1:2803672/150‑1 (MQ=255)
gAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCt > 1:1072823/1‑150 (MQ=255)
gAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCt < 2:65375/150‑1 (MQ=255)
gAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCt > 1:3431169/1‑150 (MQ=255)
gAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCt > 1:613641/1‑150 (MQ=255)
aGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCta < 1:2947689/150‑1 (MQ=255)
aGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCta < 2:1026313/150‑1 (MQ=255)
cGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCtata < 1:2781484/150‑1 (MQ=255)
gACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTatat > 2:2923333/1‑150 (MQ=255)
gACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTatat > 1:827752/1‑150 (MQ=255)
aCATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATAtt < 2:741548/150‑1 (MQ=255)
aTCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCaaaaa < 1:391059/150‑1 (MQ=255)
aTCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCaaaaa < 2:164431/150‑1 (MQ=255)
cGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTg > 1:2542573/1‑150 (MQ=255)
ggtggtAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGa < 2:3736273/150‑1 (MQ=255)
ggtggtAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGa < 2:3748517/150‑1 (MQ=255)
ggtggtAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGa < 2:968509/150‑1 (MQ=255)
tggtAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAAt < 1:2261930/150‑1 (MQ=255)
ggtAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATg < 1:1103229/150‑1 (MQ=255)
gtAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGa > 2:3223286/1‑150 (MQ=255)
tAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAGACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAg > 2:3593183/1‑150 (MQ=255)
tAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAg < 1:2878920/150‑1 (MQ=255)
aaaaTTCAATTAAAACATTCTTGCGTTGGAAAAATCTATTTTGCCTATTATGTCATAAAAACGCCCAATACTGTATGCCACCTCGGGCGTTGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATAT‑CATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGt < 1:3582544/149‑1 (MQ=255)
aaaTTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGt < 2:1187160/150‑1 (MQ=255)
tGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATa < 1:44983/150‑1 (MQ=255)
aaaCACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATaaaa > 1:1550940/1‑150 (MQ=255)
aaaCACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATaaaa > 1:2001989/1‑150 (MQ=255)
acacTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAAt > 1:3623918/1‑150 (MQ=255)
cTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCt < 2:26916/150‑1 (MQ=255)
tGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGata < 2:1397361/150‑1 (MQ=255)
cGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATAtt > 2:1285681/1‑150 (MQ=255)
cGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATAtt > 2:3179752/1‑150 (MQ=255)
cGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATAtt < 2:1004678/150‑1 (MQ=255)
ggAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATAttt < 2:827752/150‑1 (MQ=255)
ggAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATAttt > 1:2331512/1‑150 (MQ=255)
ggAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATAttt > 2:2882477/1‑150 (MQ=255)
gAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTta < 2:1162520/150‑1 (MQ=255)
gCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAg < 2:2369448/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGct > 2:3035314/1‑149 (MQ=255)
aaaaTCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCa > 1:2912074/1‑150 (MQ=255)
aaaTCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCaa > 2:1561150/1‑150 (MQ=255)
aaaTCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCaa < 2:1072797/150‑1 (MQ=255)
aaaTCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCaa < 2:1072828/150‑1 (MQ=255)
aaTCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCaaa > 2:1175115/1‑150 (MQ=255)
cGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGt < 2:2237597/150‑1 (MQ=255)
aTTTGCCTTTTATGTGAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTTGCGCTGGGTCAAGACTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGc < 1:1193630/150‑1 (MQ=255)
aTTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGc < 1:1904766/150‑1 (MQ=255)
tttGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCg < 2:644146/150‑1 (MQ=255)
tttGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCg < 1:3019278/150‑1 (MQ=255)
ttGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGa < 1:1304528/150‑1 (MQ=255)
cAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATg > 1:3085488/1‑150 (MQ=255)
aGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATgg > 1:3329083/1‑150 (MQ=255)
aGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATgg > 2:2983340/1‑150 (MQ=255)
gAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGa > 2:2110289/1‑150 (MQ=255)
aaaaaCGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGAc < 2:205257/150‑1 (MQ=255)
aCGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAAt < 2:3454041/150‑1 (MQ=255)
gCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATAc < 2:3457522/150‑1 (MQ=255)
cacaGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTa < 2:3717685/150‑1 (MQ=255)
acaGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTAt < 1:3598502/150‑1 (MQ=255)
acaGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTATACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTAt > 2:340729/1‑150 (MQ=255)
caGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATg < 2:1746685/150‑1 (MQ=255)
caGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATg > 2:1783182/1‑150 (MQ=255)
gACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATggg < 2:3632440/150‑1 (MQ=255)
aCTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGc > 1:1943324/1‑150 (MQ=255)
aTGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGc < 1:1426942/150‑1 (MQ=255)
aTGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGc > 1:509185/1‑150 (MQ=255)
ccACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGt < 1:1665541/150‑1 (MQ=255)
cACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTc > 1:204103/1‑150 (MQ=255)
aCCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCa > 1:1036470/1‑150 (MQ=255)
ccTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCAt < 1:3487022/150‑1 (MQ=255)
cTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCAtt > 2:2530323/1‑150 (MQ=255)
cGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGc < 2:2797779/150‑1 (MQ=255)
aGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAt < 1:3285479/150‑1 (MQ=255)
aGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAt < 1:2087552/150‑1 (MQ=255)
cgcTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAtgg < 1:2032459/150‑1 (MQ=255)
cgcTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAtgg < 1:957911/150‑1 (MQ=255)
cTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAtggtg > 2:1110687/1‑150 (MQ=255)
tGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAtggtgg > 1:1544860/1‑150 (MQ=255)
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gTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGgcgc > 1:328730/1‑150 (MQ=255)
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AGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGG > SRR19973061.3337661/1‑150 (MQ=60)
GAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGA < SRR19973061.2671944/150‑1 (MQ=60)
AAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACG < SRR19973061.2149125/150‑1 (MQ=60)
CCACAGACTGTATGCCTCCTCGGGAGTAGCGCTGGGTTCTGCCTTTACATGCTATATCCATCTTTCTTTATTCATAAATTGAATGAGTAATTCATAATATTTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACT < SRR19973061.1671126/150‑1 (MQ=60)
ACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTAT < SRR19973061.3607724/150‑1 (MQ=60)
ACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTAT < SRR19973061.3607718/150‑1 (MQ=60)
ACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTAT < SRR19973061.1390511/150‑1 (MQ=60)
ACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGC > SRR19973061.1948166/1‑150 (MQ=60)
ATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGC < SRR19973061.1429811/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGC > SRR19973061.510544/1‑150 (MQ=60)
ATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGC > SRR19973061.510530/1‑150 (MQ=60)
ATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGC < SRR19973061.1430536/150‑1 (MQ=60)
CCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGT < SRR19973061.1669722/150‑1 (MQ=60)
CACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTC > SRR19973061.204711/1‑150 (MQ=60)
ACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCA > SRR19973061.1039125/1‑150 (MQ=60)
ACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCA > SRR19973061.1039128/1‑150 (MQ=60)
CCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCAT < SRR19973061.3495936/150‑1 (MQ=60)
TAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCA < SRR19973061.1256665/150‑1 (MQ=60)
AGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAT < SRR19973061.3294410/150‑1 (MQ=60)
AGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAT < SRR19973061.2092793/150‑1 (MQ=60)
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CGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGG < SRR19973061.960327/150‑1 (MQ=60)
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TGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGG < SRR19973061.292086/150‑1 (MQ=60)
TGGGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGG > SRR19973061.1548705/1‑150 (MQ=60)
GGTCCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCG < SRR19973061.1854318/150‑1 (MQ=60)
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CCTGCCTTTACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAG > SRR19973061.2433513/1‑150 (MQ=60)
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TACATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATT < SRR19973061.1657705/150‑1 (MQ=60)
CATGCAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAG > SRR19973061.1014284/1‑150 (MQ=60)
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CAATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGC > SRR19973061.1637495/1‑150 (MQ=60)
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CGGTGTCGAGCGACATCAATCCGGTGGTAAATTCCATGAAAACACTCCTGCGGAGGCAAAATCGAATTTGCCTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGC > CP009273/861784‑862074
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |