Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
942,724 |
A→T |
N14Y (AAC→TAC) |
ycaM → |
putative transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 942,724 | 0 | A | T | 100.0%
| 787.7
/ NA
| 237 | N14Y (AAC→TAC) | ycaM | putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (134/103); total (134/103) |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
TGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTA > CP009273/942577‑942870
|
gtgCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTactaca > 2:1722526/1‑150 (MQ=255)
gcagcaGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACAtt > 2:2774553/1‑150 (MQ=255)
cagcagGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTg > 2:591047/1‑150 (MQ=255)
agcagGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTgc > 1:89150/1‑150 (MQ=255)
gcagGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTgcg < 2:258668/150‑1 (MQ=255)
agGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCt < 2:2360641/150‑1 (MQ=255)
agGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCt > 2:1374007/1‑150 (MQ=255)
ggTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTCCTACATTGCGCTg > 1:1832551/1‑150 (MQ=255)
ggTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTg > 1:3215616/1‑150 (MQ=255)
ggTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTg > 2:3195453/1‑150 (MQ=255)
tataATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATg > 2:36764/1‑150 (MQ=255)
ataATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGt > 1:1470873/1‑150 (MQ=255)
tttGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCtttt < 2:3785391/150‑1 (MQ=255)
cATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCa > 1:3474767/1‑150 (MQ=255)
cATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCa > 2:3404066/1‑150 (MQ=255)
tttCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACt > 1:3693982/1‑150 (MQ=255)
cGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTc < 2:1079879/150‑1 (MQ=255)
tCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGtt < 1:3754584/150‑1 (MQ=255)
cGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGtttt > 1:2851006/1‑150 (MQ=255)
cGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGtttt > 1:623584/1‑150 (MQ=255)
gCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTg > 1:875376/1‑150 (MQ=255)
cACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTgg > 2:1727328/1‑150 (MQ=255)
cttcttATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCa < 2:3705130/150‑1 (MQ=255)
ttATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACgt > 2:1587947/1‑150 (MQ=255)
tATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACgtt > 1:2703944/1‑150 (MQ=255)
tttGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACgttgt < 2:324292/150‑1 (MQ=255)
ttGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACgttgtt > 1:2064744/1‑150 (MQ=255)
tGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTta > 1:1425035/1‑150 (MQ=255)
ccGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTtaat > 2:2255649/1‑150 (MQ=255)
aTAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTAt < 2:1029371/150‑1 (MQ=255)
tAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATg < 2:3428749/150‑1 (MQ=255)
aaTCCCTCGTTTTACCGATGCCTCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATTTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGc < 1:3592734/150‑1 (MQ=255)
tCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCa > 2:2516999/1‑150 (MQ=255)
cccTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCaa < 1:1915975/150‑1 (MQ=255)
ccTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAAc > 1:3140153/1‑150 (MQ=255)
ccTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAAc > 1:3192733/1‑150 (MQ=255)
cTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAAcc < 1:2307236/150‑1 (MQ=255)
tttACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAgggg < 1:444425/150‑1 (MQ=255)
tttACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAgggg < 1:1587947/150‑1 (MQ=255)
ccGATGCCCCTTTAATTTAGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTGAATAACTATGCCAACCAGGGGCtgg > 2:2643953/1‑150 (MQ=255)
tGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTggtggt > 1:2174922/1‑150 (MQ=255)
tGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTggtggt > 1:1781306/1‑150 (MQ=255)
tGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTggtggt < 1:167803/150‑1 (MQ=255)
cccTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGgttgt < 2:3530783/150‑1 (MQ=255)
cccTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGgttgt < 1:1533237/150‑1 (MQ=255)
ccTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGgttgtt < 1:2395192/150‑1 (MQ=255)
tttAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGtttt < 1:2745338/150‑1 (MQ=255)
tttAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGtttt > 1:3541599/1‑150 (MQ=255)
tttAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGtttt > 1:1351004/1‑150 (MQ=255)
ttAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCTCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGTGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATTCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGttttt > 1:2691028/1‑150 (MQ=255)
tAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGtttttt > 2:1519648/1‑150 (MQ=255)
aaTTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTc > 1:673452/1‑150 (MQ=255)
ttGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATgg > 1:2051427/1‑150 (MQ=255)
gCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGgtg < 1:2106692/150‑1 (MQ=255)
gAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCTCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGtt > 1:2010998/1‑150 (MQ=255)
gAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGtt > 2:3791101/1‑150 (MQ=255)
aaGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGttt < 1:1012925/150‑1 (MQ=255)
aaGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGttt < 1:2262576/150‑1 (MQ=255)
ggATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAt > 2:165565/1‑150 (MQ=255)
ggATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAt > 2:2074781/1‑150 (MQ=255)
tttGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCtt > 1:2623917/1‑150 (MQ=255)
ttGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCttt > 2:3088783/1‑150 (MQ=255)
tGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTg < 2:1267576/150‑1 (MQ=255)
gTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGc > 1:3395728/1‑150 (MQ=255)
cTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAc > 1:1458803/1‑150 (MQ=255)
cTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAc > 2:3611097/1‑150 (MQ=255)
cTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAc > 1:527898/1‑150 (MQ=255)
tATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAct < 2:1514005/150‑1 (MQ=255)
tATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAct < 2:2882718/150‑1 (MQ=255)
tGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCActct > 2:3190053/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTa < 1:2933259/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTa > 2:426673/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTa > 2:730362/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTa < 2:1420746/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTa < 2:1561538/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTa > 2:3495798/1‑150 (MQ=255)
gCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTAt < 2:2471157/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTAt < 1:1722526/150‑1 (MQ=255)
tGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTAttt < 2:307055/150‑1 (MQ=255)
gggAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTc < 1:3002889/150‑1 (MQ=255)
ggAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTca > 2:2037912/1‑150 (MQ=255)
aaTGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTcaca > 1:1324381/1‑150 (MQ=255)
aTGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCacac < 2:1957359/150‑1 (MQ=255)
tGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACAcc < 1:1242773/150‑1 (MQ=255)
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tCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTa > 1:2019181/1‑150 (MQ=255)
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GCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTT > SRR19973061.1463494/1‑150 (MQ=60)
GCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTT > SRR19973061.1463515/1‑150 (MQ=60)
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CCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTACGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGT < SRR19973061.2095569/150‑1 (MQ=60)
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ATGGTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCA < SRR19973061.2066940/150‑1 (MQ=60)
GTACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTT < SRR19973061.3744718/150‑1 (MQ=60)
ACTACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR19973061.2794135/150‑1 (MQ=60)
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AATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG > CP009273/942575‑942871
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
