Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,057,226 |
G→T |
E839* (GAA→TAA) |
torA → |
trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,057,226 | 0 | G | T | 100.0%
| 605.2
/ NA
| 182 | E839* (GAA→TAA) | torA | trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (100/82); total (100/82) |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CCAACGTGTTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCGAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAAT > CP009273/1057080‑1057372
|
ccAACGTGTTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAat < 1:1092294/150‑1 (MQ=255)
aaCGTGTTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAatat > 2:2741545/1‑150 (MQ=255)
aaCGTGTTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAatat > 1:1538279/1‑150 (MQ=255)
aaCGTGTTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAatat < 2:451626/150‑1 (MQ=255)
aaCGTGTTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAatat > 2:50882/1‑150 (MQ=255)
tgtTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTc < 1:1394082/150‑1 (MQ=255)
gtTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTcc > 2:2225412/1‑150 (MQ=255)
gtTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTcc > 2:2224145/1‑150 (MQ=255)
aCCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCcgcg > 2:44136/1‑150 (MQ=255)
aCCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCcgcg < 1:771453/150‑1 (MQ=255)
cATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTc > 1:506161/1‑150 (MQ=255)
cATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGt > 1:1838155/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTCATATGTTCCCGCGTCGCAGGTg > 2:1672564/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTg > 1:3554537/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTGTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTg > 2:1801647/1‑150 (MQ=255)
tCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGa > 2:3713415/1‑150 (MQ=255)
cGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGaa < 1:3669225/150‑1 (MQ=255)
gTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAAt < 2:13716/150‑1 (MQ=255)
tACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCCGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGACCAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATc > 1:3031673/1‑150 (MQ=255)
cATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCAt > 2:1084231/1‑150 (MQ=255)
cATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCAt > 2:1082460/1‑150 (MQ=255)
cATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCAt > 2:477423/1‑150 (MQ=255)
cATCGCAGCTGGCGCAGGAGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCAt > 2:3395141/1‑150 (MQ=255)
cGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGAc < 1:1661853/150‑1 (MQ=255)
cAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCa > 1:3151187/1‑150 (MQ=255)
gCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACg < 2:795219/150‑1 (MQ=255)
gCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGcac < 2:2795256/150‑1 (MQ=255)
gCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGcac < 2:3333543/150‑1 (MQ=255)
cGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGcaca > 1:2274664/1‑150 (MQ=255)
cGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGcaca > 2:1538712/1‑150 (MQ=255)
aCCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCacaac > 2:2048343/1‑150 (MQ=255)
cAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAg > 2:2481571/1‑150 (MQ=255)
gcgcACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTg < 2:3181433/150‑1 (MQ=255)
cacaCTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCt < 2:1592924/150‑1 (MQ=255)
acacTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCtg < 1:3673220/150‑1 (MQ=255)
acTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCtgtg > 2:3770526/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTa > 1:849304/1‑150 (MQ=255)
gCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTAc > 2:2628944/1‑150 (MQ=255)
gCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTAc < 1:568494/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAAACATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTAc < 2:946124/150‑1 (MQ=255)
tggtggAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGc > 1:1008833/1‑150 (MQ=255)
gtggAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCt < 2:2724250/150‑1 (MQ=255)
tggAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGGAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTg > 2:432857/1‑150 (MQ=255)
ggAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTgg > 2:2564196/1‑150 (MQ=255)
aaTTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTa > 2:810224/1‑150 (MQ=255)
aaTTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTa > 1:852531/1‑150 (MQ=255)
aTTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAg > 2:661884/1‑150 (MQ=255)
aTTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAg > 1:976620/1‑150 (MQ=255)
tGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAgcg < 1:1082460/150‑1 (MQ=255)
tGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAgcg > 2:1216203/1‑150 (MQ=255)
agaAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCa > 1:686863/1‑150 (MQ=255)
aaGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAgt > 1:327385/1‑150 (MQ=255)
aaGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAgt > 2:888577/1‑150 (MQ=255)
aaGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAgt > 1:212019/1‑150 (MQ=255)
aGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAgtt > 2:3637392/1‑150 (MQ=255)
tACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAgttgt > 2:3528947/1‑150 (MQ=255)
aaCGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTtct > 1:2874498/1‑150 (MQ=255)
aaCGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTtct > 1:2369002/1‑150 (MQ=255)
aaCGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTtca < 1:2337545/150‑2 (MQ=255)
aCGGACCAGTGTAGAAGCAGACTGCGTTTAACGCCCCCGTGTAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGACGCAGGAGAAATCATGACCACGCAGACAGCACAACAGATTGCCTGAGTTTACGCCTGGCAAGCGCAGTTGTtctc > 2:2962559/1‑150 (MQ=255)
cGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTcc > 1:2996410/1‑150 (MQ=255)
cGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTcc < 1:2850265/150‑1 (MQ=255)
gAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCg > 1:2678307/1‑150 (MQ=255)
cAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGa < 1:2481312/150‑1 (MQ=255)
aGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAg > 2:643829/1‑150 (MQ=255)
aGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAg > 2:2647338/1‑150 (MQ=255)
gTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGc > 2:3543879/1‑150 (MQ=255)
gTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGc < 1:3221840/150‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTg < 2:2274664/150‑1 (MQ=255)
aGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGa > 1:2761631/1‑150 (MQ=255)
cAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACg < 2:87021/150‑1 (MQ=255)
ggTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGAt < 1:1360551/150‑1 (MQ=255)
tGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGa > 1:2737561/1‑150 (MQ=255)
cGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGaaca < 1:1987452/150‑1 (MQ=255)
cGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGaaca < 1:219345/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGaacaa > 2:1013585/1‑150 (MQ=255)
gCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGaacaac > 2:837541/1‑150 (MQ=255)
gTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTg < 1:365304/150‑1 (MQ=255)
aaCGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGc > 2:2401690/1‑150 (MQ=255)
ccccGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATc < 1:420835/150‑1 (MQ=255)
ccccGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATc < 1:1955526/150‑1 (MQ=255)
cccGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCg < 1:843982/150‑1 (MQ=255)
tGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAg < 1:1200471/150‑1 (MQ=255)
ggAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCAGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGt > 1:1479546/1‑150 (MQ=255)
gagaTGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTg > 2:2426945/1‑150 (MQ=255)
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CGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGGTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACA < SRR19973061.75051/150‑1 (MQ=60)
GGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAA > SRR19973061.281086/1‑150 (MQ=60)
GTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTG < SRR19973061.366294/150‑1 (MQ=60)
TTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGAC < SRR19973061.1264887/150‑1 (MQ=60)
CCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCTCAGTTGTTCTACAGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATC < SRR19973061.3274302/150‑1 (MQ=60)
CCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATC < SRR19973061.1960409/150‑1 (MQ=60)
CCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATC < SRR19973061.421975/150‑1 (MQ=60)
CCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCG < SRR19973061.846185/150‑1 (MQ=60)
CCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCG < SRR19973061.846821/150‑1 (MQ=60)
TGGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAG < SRR19973061.1203488/150‑1 (MQ=60)
GGAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCAGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGT > SRR19973061.1483259/1‑150 (MQ=60)
GAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTG > SRR19973061.867517/1‑150 (MQ=60)
GAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTG > SRR19973061.866931/1‑150 (MQ=60)
GAGATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTG < SRR19973061.2635701/150‑1 (MQ=60)
GATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCG > SRR19973061.2640002/1‑150 (MQ=60)
GATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCG > SRR19973061.2640003/1‑150 (MQ=60)
GATGGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCG > SRR19973061.2640075/1‑150 (MQ=60)
GGTGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAG > SRR19973061.3783749/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGAT > SRR19973061.1404699/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGAT > SRR19973061.912365/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGAT > SRR19973061.910828/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGAT > SRR19973061.3682162/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGAT < SRR19973061.3776360/150‑1 (MQ=60)
TGGCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGAT < SRR19973061.51080/150‑1 (MQ=60)
GCGCAGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGG < SRR19973061.44303/150‑1 (MQ=60)
AGTGCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGA > SRR19973061.310867/1‑150 (MQ=60)
GCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATG < SRR19973061.2230993/150‑1 (MQ=60)
GCTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATG < SRR19973061.2229724/150‑1 (MQ=60)
CTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATGG < SRR19973061.3199400/150‑1 (MQ=60)
CTAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATGG < SRR19973061.3780154/150‑1 (MQ=60)
TAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATGGT > SRR19973061.1594982/1‑150 (MQ=60)
TAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATGGT > SRR19973061.2124325/1‑150 (MQ=60)
TAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATGGT > SRR19973061.2125834/1‑150 (MQ=60)
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CCCCAACGTGTTGACCATCGACATCGGTACATCGCAGCTGGCGCAGGCGACCAGTGCGCACACTACGCTGGTGGAAATTGAGAAGTACAACGGAACAGTGGAGCAGGTGACGGCGTTTAACGGCCCCGTGGAGATGGTGGCGCAGTGCGAATATGTTCCCGCGTCGCAGGTGAAATCATGACCACGCTGACAGCACAACAGATTGCCTGTGTTTACGCCTGGCTAGCGCAGTTGTTCTCCCGTGAGCTGGACGATGAACAACTGACGCAAATCGCCAGTGCGCAGATGGCTGAATGGT > CP009273/1057078‑1057375
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
