Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,128,764 |
C→A |
I245I (ATC→ATA) |
flgE → |
flagellar hook protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,128,764 | 0 | C | A | 100.0%
| 659.1
/ NA
| 198 | I245I (ATC→ATA) | flgE | flagellar hook protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (105/93); total (105/93) |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
CGTCTACTTTGTGAAGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATCGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATCAAATCA > CP009273/1128620‑1128909
|
cGTCTACTTTGTGAAGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAAc < 1:3268699/150‑1 (MQ=255)
tCTACTTTGTGAAGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCg > 1:564186/1‑150 (MQ=255)
cTTTGTGAAGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGgcgc > 1:1302784/1‑150 (MQ=255)
gAAGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTaa < 2:345823/150‑1 (MQ=255)
aaGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAAc > 2:3093394/1‑150 (MQ=255)
aaGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAAc < 2:198546/150‑1 (MQ=255)
aaGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAAc < 2:1548784/150‑1 (MQ=255)
gACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACgg < 1:2754312/150‑1 (MQ=255)
gACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACgg > 2:275915/1‑150 (MQ=255)
ccGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTg < 2:2992849/150‑1 (MQ=255)
cGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGc < 2:584181/150‑1 (MQ=255)
cGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGc < 1:2975557/150‑1 (MQ=255)
taataaCTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAAcc < 1:3198206/150‑1 (MQ=255)
taataaCTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAAcc < 2:2571013/150‑1 (MQ=255)
ataaCTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCg > 2:676114/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCAc < 2:358659/150‑1 (MQ=255)
cTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACAGTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCAc > 2:412438/1‑150 (MQ=255)
tGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACg > 2:3578348/1‑150 (MQ=255)
tACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTg > 2:3750743/1‑150 (MQ=255)
acacCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGa < 1:831658/150‑1 (MQ=255)
acacCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGa < 1:3497566/150‑1 (MQ=255)
acCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGc > 2:1382079/1‑150 (MQ=255)
acCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGAAAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATGAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCACCCGGAGCAATTAACGGTTCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGc > 2:1033726/1‑150 (MQ=255)
tcAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCtt > 1:2780129/2‑150 (MQ=255)
ccAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCtt > 2:132997/1‑150 (MQ=255)
aGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTcc > 1:323292/1‑150 (MQ=255)
aTAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCa < 1:2891848/150‑1 (MQ=255)
aGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAAc < 1:98710/150‑1 (MQ=255)
aGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTcc > 2:1147697/1‑150 (MQ=255)
gTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCa < 1:3705233/150‑1 (MQ=255)
gATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATg < 2:3255762/150‑1 (MQ=255)
ccAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATgcag > 2:3310503/1‑150 (MQ=255)
cAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATgcagc > 1:3693903/1‑150 (MQ=255)
aaaCAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATgcagca < 2:2948084/150‑1 (MQ=255)
aaaCAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATgcagca > 2:3708225/1‑150 (MQ=255)
aaCAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCaa < 1:3093394/150‑1 (MQ=255)
aCAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCaaa > 2:2628971/1‑150 (MQ=255)
aCAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCaaa < 1:468220/150‑1 (MQ=255)
gCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATa < 2:1719691/150‑1 (MQ=255)
cATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATAc < 2:2260316/150‑1 (MQ=255)
cATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATAc > 2:2907746/1‑150 (MQ=255)
cATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATAc > 2:2354346/1‑150 (MQ=255)
aTTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATAcc > 2:1153106/1‑150 (MQ=255)
tGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCgg < 1:1704183/150‑1 (MQ=255)
cGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGgcg > 2:3663357/1‑150 (MQ=255)
gAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGgcgc > 1:1786949/1‑150 (MQ=255)
gAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGgcgc > 1:2676360/1‑150 (MQ=255)
aaGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCt < 2:3247933/150‑1 (MQ=255)
aaGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCt > 1:1225961/1‑150 (MQ=255)
aaGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCt < 1:1006395/150‑1 (MQ=255)
aCAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAAc > 1:1494884/1‑150 (MQ=255)
aCAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAAc < 2:194152/150‑1 (MQ=255)
cAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACa < 1:1347119/150‑1 (MQ=255)
cAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCACAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACa > 2:1258086/1‑150 (MQ=255)
aGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACaa < 2:1079784/150‑1 (MQ=255)
gACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAatat > 2:2097893/1‑150 (MQ=255)
acaacaCTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATAtt < 1:2628971/150‑1 (MQ=255)
acaacaCTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATAtt < 2:3488602/150‑1 (MQ=255)
cTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCa > 1:1865959/1‑150 (MQ=255)
cTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCa < 2:311922/150‑1 (MQ=255)
gAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAacc > 1:3388668/1‑150 (MQ=255)
aTTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAaccac > 1:189356/1‑150 (MQ=255)
aTTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAaccac > 1:2100530/1‑150 (MQ=255)
ttAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCAccc < 2:2165995/150‑1 (MQ=255)
tAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCa > 1:11623/1‑150 (MQ=255)
aaTGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAg > 2:962240/1‑150 (MQ=255)
gCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAAc < 2:2446215/150‑1 (MQ=255)
gCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAAc > 2:1181990/1‑150 (MQ=255)
tAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACgg > 1:2954421/1‑150 (MQ=255)
tAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACgg > 2:3371122/1‑150 (MQ=255)
aaTGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGc > 2:86424/1‑150 (MQ=255)
aaTGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGc > 2:749747/1‑150 (MQ=255)
aTGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCt > 1:723698/1‑150 (MQ=255)
tGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTa > 2:466437/1‑150 (MQ=255)
tGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCGTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTa < 1:3750743/150‑1 (MQ=255)
ggCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTAc < 2:1795923/150‑1 (MQ=255)
ggCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTAc < 2:3104904/150‑1 (MQ=255)
gCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACa < 2:2006557/150‑1 (MQ=255)
caTTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAAc > 1:174730/1‑150 (MQ=255)
aTTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAAcc > 2:2363162/1‑150 (MQ=255)
ttAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCg < 1:676114/150‑1 (MQ=255)
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gTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACACACCGGGc > 1:3568835/1‑150 (MQ=255)
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TAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCA > SRR19973061.11667/1‑150 (MQ=60)
GCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAAC > SRR19973061.2852053/1‑150 (MQ=60)
TAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGG > SRR19973061.2962043/1‑150 (MQ=60)
ATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCT > SRR19973061.725643/1‑150 (MQ=60)
ATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCT > SRR19973061.725589/1‑150 (MQ=60)
ATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCT > SRR19973061.725516/1‑150 (MQ=60)
TGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCGTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTA < SRR19973061.3760342/150‑1 (MQ=60)
CATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAAC > SRR19973061.175266/1‑150 (MQ=60)
atgtGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAAACGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGATCGGCTACAAACC < SRR19973061.3319037/146‑1 (MQ=60)
ATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACC > SRR19973061.1728539/1‑150 (MQ=60)
TTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCG < SRR19973061.1185994/150‑1 (MQ=60)
TTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCG < SRR19973061.677867/150‑1 (MQ=60)
GTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAGATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGC < SRR19973061.2194929/150‑1 (MQ=60)
GTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACACACCGGGC > SRR19973061.3577979/1‑150 (MQ=60)
GTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGC < SRR19973061.2194943/150‑1 (MQ=60)
GTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGC > SRR19973061.2332816/1‑150 (MQ=60)
GTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGC > SRR19973061.950794/1‑150 (MQ=60)
TGGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCG < SRR19973061.1064751/150‑1 (MQ=60)
GGATGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGA > SRR19973061.2674037/1‑150 (MQ=60)
TGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCT < SRR19973061.1385575/150‑1 (MQ=60)
TGGTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCT < SRR19973061.523777/150‑1 (MQ=60)
GTGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGG < SRR19973061.3465713/150‑1 (MQ=60)
TGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGT < SRR19973061.2838696/150‑1 (MQ=60)
TGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGT > SRR19973061.193055/1‑150 (MQ=60)
TGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGT > SRR19973061.806998/1‑150 (MQ=60)
TGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGT > SRR19973061.192647/1‑150 (MQ=60)
TGCGATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGT < SRR19973061.907690/150‑1 (MQ=60)
GATGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAG < SRR19973061.1782866/150‑1 (MQ=60)
TGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTT > SRR19973061.3170214/1‑150 (MQ=60)
TGGCGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTT < SRR19973061.2315316/150‑1 (MQ=60)
CGAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATC > SRR19973061.2266899/1‑150 (MQ=60)
GAATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATCA > SRR19973061.2497001/1‑150 (MQ=60)
ATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATCAAA > SRR19973061.257122/1‑150 (MQ=60)
ATAATATAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATCAAA < SRR19973061.2368982/150‑1 (MQ=60)
TAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATCAAATCAATG < SRR19973061.696029/150‑1 (MQ=60)
TAGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATCAAATCAATG > SRR19973061.3156135/1‑150 (MQ=60)
|
ATGAGCGTCTACTTTGTGAAGACCGGGGATAATAACTGGCAGGTCTACACCCAGGATAGCAGTGATCCAAACAGCATTGCGAAGACAGCGACAACACTGGAATTTAATGCTAATGGCACATTAGTGGATGGTGCGATGGCGAATAATATCGCAACCGGCGCAATTAACGGTGCAGAACCCGCCACGTTTAGTCTGAGCTTCCTCAACTCCATGCAGCAAAATACCGGCGCTAACAATATTGTGGCAACCACCCAGAACGGCTACAAACCGGGCGATCTGGTGAGTTATCAAATCAATG > CP009273/1128615‑1128912
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
