Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,293,952 |
G→A |
intergenic (‑375/‑102) |
adhE ← / → ychE |
fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase/UPF0056 family inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,293,952 | 0 | G | A | 100.0%
| 701.3
/ NA
| 213 | intergenic (‑375/‑102) | adhE/ychE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase/UPF0056 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (93/120); total (93/120) |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAGTAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTTTT > CP009273/1293807‑1294097
|
caaatcaaatTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAaatagt > 2:3669211/1‑150 (MQ=255)
atcaaatTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTag < 2:3653813/150‑1 (MQ=255)
aaatTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTaggag > 1:3078402/1‑150 (MQ=255)
atTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGt < 2:1638243/150‑1 (MQ=255)
tttGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGaa < 1:3303310/150‑1 (MQ=255)
tttGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGaa < 2:3546227/150‑1 (MQ=255)
ttGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGaaa < 2:793498/150‑1 (MQ=255)
gCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGaaaaa > 1:2681285/1‑150 (MQ=255)
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aGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCt > 1:50728/1‑150 (MQ=255)
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cTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGt > 1:182650/1‑150 (MQ=255)
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gACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCa < 1:2601843/150‑1 (MQ=255)
cacCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGATTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCaaa > 2:2729410/1‑150 (MQ=255)
ccTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAg > 2:3172516/1‑150 (MQ=255)
cTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAgg > 2:218556/1‑150 (MQ=255)
tttCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGc < 1:3439695/150‑1 (MQ=255)
tCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGt > 2:2223768/1‑150 (MQ=255)
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aGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTAt > 2:2237455/1‑150 (MQ=255)
aGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTAt > 1:3593165/1‑150 (MQ=255)
gCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTAtt > 2:949670/1‑150 (MQ=255)
gCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTAtt < 2:358167/150‑1 (MQ=255)
cATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTg > 2:3521874/1‑150 (MQ=255)
aTCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGt < 2:1853184/150‑1 (MQ=255)
cGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCa > 2:1727832/1‑150 (MQ=255)
cGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCa > 2:3401306/1‑150 (MQ=255)
gCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAg > 1:284926/1‑150 (MQ=255)
cGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTc > 2:607953/1‑150 (MQ=255)
cATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCttt > 2:581110/1‑150 (MQ=255)
aTTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCtttt < 2:2835581/150‑1 (MQ=255)
taGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAAc > 1:524202/1‑150 (MQ=255)
aGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAAcc > 2:1270012/1‑150 (MQ=255)
gCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCt < 2:1530791/150‑1 (MQ=255)
aaCAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCttat > 1:2752417/1‑150 (MQ=255)
aCAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCttatt < 2:1565068/150‑1 (MQ=255)
aCAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCttatt > 1:3010739/1‑150 (MQ=255)
cAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCttattt > 1:2055283/1‑150 (MQ=255)
ttAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATg < 1:2558510/150‑1 (MQ=255)
taataaATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATgg < 2:226160/150‑1 (MQ=255)
taataaATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATgg > 2:3617425/1‑150 (MQ=255)
aataaATTGTAGTATGATTTGGTGGATACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGc > 2:3717924/1‑150 (MQ=255)
ataaATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCt < 2:267773/150‑1 (MQ=255)
ataaATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCt < 2:1189766/150‑1 (MQ=255)
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aaTTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAAc > 1:2134998/1‑150 (MQ=255)
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tGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACAtt < 2:3290153/150‑1 (MQ=255)
gtagtaTGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTa > 1:842856/1‑150 (MQ=255)
gATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCt < 2:2992546/150‑1 (MQ=255)
gATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCt < 1:1722413/150‑1 (MQ=255)
tttGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCttt < 2:50728/150‑1 (MQ=255)
tttGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCttt < 1:3669211/150‑1 (MQ=255)
tttGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCttt < 1:3534426/150‑1 (MQ=255)
ttGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGATTGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCtttt < 1:321147/150‑1 (MQ=255)
tggtgtCTACATTAGCATGTTTTTCACAAATAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGATGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCTGCTTTTg < 2:1645162/150‑1 (MQ=255)
tggCTTCATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCtt < 2:88327/150‑1 (MQ=255)
ggCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTc > 1:760977/1‑150 (MQ=255)
gCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCg < 1:3191437/150‑1 (MQ=255)
tACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGa < 1:3625804/150‑1 (MQ=255)
aGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAAc > 1:683736/1‑150 (MQ=255)
gCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAAcc < 2:1876955/150‑1 (MQ=255)
aTGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGt > 1:486513/1‑150 (MQ=255)
tGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTg > 1:721054/1‑150 (MQ=255)
tGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTg < 1:1350204/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGa < 2:2977407/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGa > 1:2103876/1‑150 (MQ=255)
tttGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGAtt < 1:224067/150‑1 (MQ=255)
ttGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTc < 2:372058/150‑1 (MQ=255)
acaACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGAc > 2:2368947/1‑150 (MQ=255)
aCTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCtt < 2:3078402/150‑1 (MQ=255)
aGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCttttt < 2:524202/150‑1 (MQ=255)
aTAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTg > 2:227161/1‑150 (MQ=255)
aTAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTg < 2:2146900/150‑1 (MQ=255)
aTAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTg > 1:2353803/1‑150 (MQ=255)
cAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGAttt < 2:3727633/150‑1 (MQ=255)
cAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGAttt < 1:1064388/150‑1 (MQ=255)
cAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGAttt > 1:2169796/1‑150 (MQ=255)
cAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGAttt > 1:1581449/1‑150 (MQ=255)
cAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGAttt > 1:1388909/1‑150 (MQ=255)
tAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTcc > 1:1757860/1‑150 (MQ=255)
aaCGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTccc < 2:512496/150‑1 (MQ=255)
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GCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCG < SRR19973061.3199627/150‑1 (MQ=60)
TACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGA < SRR19973061.3635077/150‑1 (MQ=60)
CATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGC > SRR19973061.565894/1‑150 (MQ=60)
TTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTA > SRR19973061.1754047/1‑150 (MQ=60)
AGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAAC > SRR19973061.685509/1‑150 (MQ=60)
AGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAAC > SRR19973061.2597706/1‑150 (MQ=60)
ATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGT > SRR19973061.487811/1‑150 (MQ=60)
TGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTG < SRR19973061.1353600/150‑1 (MQ=60)
TGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTG > SRR19973061.722935/1‑150 (MQ=60)
GTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGA > SRR19973061.2109158/1‑150 (MQ=60)
TTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATT < SRR19973061.224723/150‑1 (MQ=60)
TTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATT < SRR19973061.133257/150‑1 (MQ=60)
GCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAG < SRR19973061.299777/150‑1 (MQ=60)
TAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTT > SRR19973061.3517029/1‑150 (MQ=60)
AGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTT > SRR19973061.1828752/1‑150 (MQ=60)
ATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTG < SRR19973061.193356/150‑1 (MQ=60)
ATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTG > SRR19973061.2359786/1‑150 (MQ=60)
ATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTG < SRR19973061.2229346/150‑1 (MQ=60)
CAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTT < SRR19973061.1067124/150‑1 (MQ=60)
CAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTT > SRR19973061.1585375/1‑150 (MQ=60)
CAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTT > SRR19973061.1392424/1‑150 (MQ=60)
CAATAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTT > SRR19973061.2175244/1‑150 (MQ=60)
TAACGAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCC > SRR19973061.1762263/1‑150 (MQ=60)
GAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTT > SRR19973061.1622950/1‑150 (MQ=60)
GAATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTT > SRR19973061.367914/1‑150 (MQ=60)
AATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTT < SRR19973061.2736427/150‑1 (MQ=60)
AATGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTT < SRR19973061.1788381/150‑1 (MQ=60)
TGATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTAC > SRR19973061.3564559/1‑150 (MQ=60)
GATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACT < SRR19973061.3470741/150‑1 (MQ=60)
GATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACT < SRR19973061.2482120/150‑1 (MQ=60)
GATAGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACT < SRR19973061.2482121/150‑1 (MQ=60)
AGCAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGAGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCA < SRR19973061.2567408/150‑1 (MQ=60)
CAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAA < SRR19973061.3180657/150‑1 (MQ=60)
CAATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAA < SRR19973061.3180637/150‑1 (MQ=60)
AATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGTGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAAT < SRR19973061.3530893/150‑1 (MQ=60)
AATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAAT > SRR19973061.151661/1‑150 (MQ=60)
AATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAAT > SRR19973061.3389940/1‑150 (MQ=60)
ATTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATT > SRR19973061.3769053/1‑150 (MQ=60)
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TTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTT < SRR19973061.2192261/150‑1 (MQ=60)
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TTTTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTT > SRR19973061.1249035/1‑150 (MQ=60)
TTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTTTT < SRR19973061.2190543/150‑1 (MQ=60)
TTAAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTTTT < SRR19973061.952299/150‑1 (MQ=60)
AAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTTTTCA < SRR19973061.3364925/150‑1 (MQ=60)
AAATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTTTTCA < SRR19973061.3152806/150‑1 (MQ=60)
ATAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTTTTCATC > SRR19973061.1986773/1‑150 (MQ=60)
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GATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATTATAGCTAACAGTTAATAAATTGTAGTATGATTTGGTGGCTACATTAGCATGTTTTGCACAACTAGATAACAATAACGAATGATAGCAATTTTAAGTAGTTAGGAGGTGAAAAATGCTGTCAAAAGGCGTATTGTCAGCGCGTCTTTTCAACCTTATTTATGGCTAACATTATCCGGCTTTTGCTTCGGAGCTAACCGTGATTCAGACCTTTTTTGATTTTCCCGTTTACTTCAAATTTTTCATC > CP009273/1293803‑1294101
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
