Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
1,503,262 |
G→T |
L20L (CTC→CTA) |
yncJ ← |
uncharacterized protein |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 1,503,262 | 0 | G | T | 100.0%
| 913.4
/ NA
| 275 | L20L (CTC→CTA) | yncJ | uncharacterized protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (118/157); total (118/157) |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GCGCGATTTTTGCCAGTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATGAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAA > CP009273/1503115‑1503408
|
gATTTGTGCCAGTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGt < 1:2863788/150‑1 (MQ=255)
tttttGCCAGTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTcc < 1:942690/150‑1 (MQ=255)
ttttGCCAGTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCt > 2:46282/1‑150 (MQ=255)
aGTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACa < 2:1242654/150‑1 (MQ=255)
aGTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACa < 1:2498207/150‑1 (MQ=255)
gTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACag > 2:115780/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACagag < 1:919533/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACagag > 1:1606218/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGc < 2:620249/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGca > 2:247108/1‑150 (MQ=255)
aaaTGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGca > 1:3494299/1‑150 (MQ=255)
aTGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGcaca < 1:513508/150‑1 (MQ=255)
aTGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGcaca > 2:510085/1‑150 (MQ=255)
gCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACg < 1:980228/150‑1 (MQ=255)
gCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACg > 2:148895/1‑150 (MQ=255)
gCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAAGTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACg > 2:174671/1‑150 (MQ=255)
cTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGt < 1:3694868/150‑1 (MQ=255)
cTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGt < 1:3694269/150‑1 (MQ=255)
cgcgCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTta < 1:3615591/150‑1 (MQ=255)
cgcgCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTta < 1:1675178/150‑1 (MQ=255)
aaaCCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAg > 2:1452230/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGAc > 2:2690510/1‑150 (MQ=255)
cTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACaa > 1:1324303/1‑150 (MQ=255)
tCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACACATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCCTTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGATAATAAGACAAcc > 1:2214031/1‑150 (MQ=255)
tCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAAcc < 1:508099/150‑1 (MQ=255)
cgccgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGa > 1:2419443/1‑150 (MQ=255)
gccgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACATATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGAt < 1:3209975/150‑1 (MQ=255)
gccgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGAt < 1:709578/150‑1 (MQ=255)
gccgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGAt < 2:3631268/150‑1 (MQ=255)
gacgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGAt < 1:1823573/148‑1 (MQ=255)
ccgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATa < 1:1797430/150‑1 (MQ=255)
cgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATaa < 2:1050092/150‑1 (MQ=255)
cgACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATaa > 1:217483/1‑150 (MQ=255)
gACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAAc < 2:1577355/150‑1 (MQ=255)
gACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGACCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAAc > 1:627265/1‑150 (MQ=255)
aCTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACg < 1:1408487/150‑1 (MQ=255)
ctTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCt < 1:1175988/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCtt < 2:260054/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCtt < 2:2339620/150‑1 (MQ=255)
gCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTa < 2:1705442/150‑1 (MQ=255)
ccACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTaa < 2:2808821/150‑1 (MQ=255)
cacaGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTaaa < 1:2348301/150‑1 (MQ=255)
cacaGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTaaa > 1:2256069/1‑150 (MQ=255)
acaGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAAc < 2:3387855/150‑1 (MQ=255)
aGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACAt > 2:892831/1‑150 (MQ=255)
cGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTg < 2:3494299/150‑1 (MQ=255)
cAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGcc > 1:775073/1‑150 (MQ=255)
tCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCt > 1:1924730/1‑150 (MQ=255)
cATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCtt > 2:768954/1‑150 (MQ=255)
cATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCtt < 2:1786588/150‑1 (MQ=255)
cATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCtt > 1:292360/1‑150 (MQ=255)
aTCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCttt > 1:3004717/1‑150 (MQ=255)
tCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCtttt > 1:3569718/1‑150 (MQ=255)
cGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCttttt < 1:3402314/150‑1 (MQ=255)
gTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTa > 2:3101550/1‑150 (MQ=255)
cTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCttt > 1:3585462/1‑150 (MQ=255)
cATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGc > 1:2593811/1‑150 (MQ=255)
tGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCg > 1:100350/1‑150 (MQ=255)
tGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCg > 2:74335/1‑150 (MQ=255)
tGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCg < 1:165393/150‑1 (MQ=255)
aCGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCt < 2:3336737/150‑1 (MQ=255)
aCGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCt < 1:612675/150‑1 (MQ=255)
gCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTatgat > 2:2254946/1‑150 (MQ=255)
cTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTatgatg < 2:3157498/150‑1 (MQ=255)
gatgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGcc < 2:3192302/150‑1 (MQ=255)
gatgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGcc < 2:2687973/150‑1 (MQ=255)
gatgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGcc < 1:2568926/150‑1 (MQ=255)
atgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCg > 1:373565/1‑150 (MQ=255)
atgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCg > 1:2052340/1‑150 (MQ=255)
tgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGa > 2:3230978/1‑150 (MQ=255)
tgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGa < 2:2467642/150‑1 (MQ=255)
tgatCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGa < 2:669456/150‑1 (MQ=255)
atCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAGACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATc < 2:2259043/150‑1 (MQ=255)
atCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATc < 2:239649/150‑1 (MQ=255)
atCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATc < 1:571803/150‑1 (MQ=255)
atCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATc < 1:3350311/150‑1 (MQ=255)
acaTTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGttt < 1:2693915/150‑1 (MQ=255)
ttCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCtt > 2:2572106/1‑150 (MQ=255)
ttCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCtt > 2:3030436/1‑150 (MQ=255)
tttACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAg < 1:562156/150‑1 (MQ=255)
aCCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGtt < 2:1919605/150‑1 (MQ=255)
aCCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGtt < 1:1033178/150‑1 (MQ=255)
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aaaTTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCa < 2:1839254/150‑1 (MQ=255)
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CTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCT < SRR19973061.1178967/150‑1 (MQ=60)
TTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTT < SRR19973061.935375/150‑1 (MQ=60)
CNCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGT > SRR19973061.3036753/1‑150 (MQ=60)
CCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAA > SRR19973061.1566477/1‑150 (MQ=60)
CACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAA > SRR19973061.2261746/1‑150 (MQ=60)
CACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAA < SRR19973061.2354265/150‑1 (MQ=60)
ACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAAC > SRR19973061.3215709/1‑150 (MQ=60)
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TTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATT < SRR19973061.3117875/150‑1 (MQ=60)
TTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATT < SRR19973061.3255152/150‑1 (MQ=60)
TTTGTGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATT < SRR19973061.3274950/150‑1 (MQ=60)
TGCCCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCG > SRR19973061.2840951/1‑150 (MQ=60)
CCTGCCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAA < SRR19973061.1533995/150‑1 (MQ=60)
CCATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAA < SRR19973061.2469406/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCATTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAAT < SRR19973061.2571053/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCATTCTTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCATTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGATGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAAT < SRR19973061.3166549/150‑1 (MQ=60)
TTAGTTGTCCTGAAAACATATCACAAGTTAATAAGACAACCGATAACGTATTCGTAAACATCCTGCCACATTTTTATTATCTTTTGCAGCTATGATGCCTATCTTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTTCAAATTAGCGCAAAGAAATT < SRR19973061.2444724/150‑1 (MQ=60)
TTAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATT < SRR19973061.673350/150‑1 (MQ=60)
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TTGCGCGATTTTTGCCAGTAAAAATGCTCGCGCAAACCTTCCGCCGACTCTTCCGCCACAGCACGCAATTCATCGCTGTCCGCTTCATGACGCAGCTGATGATCCACATTCTTTACCCACACAAATTCATGTCCTTTGTGCCCTGCCATGAGTTGTCCTGAAAACAGAGCACACGTTAATAAGACAACCGATAACGCCTTCGTAAACATCCTGCCACCTTTTTCTTACCTTTTGCCGCTATGATGCCGATCGTTTCTTGAGGTTATTATTCAGTTTTGCAAATTAGCGCAAAGAAATT > CP009273/1503113‑1503410
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |