Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,230,049 |
G→T |
intergenic (‑66/‑204) |
yjbT ← / → psiE |
putative periplasmic protein/phosphate starvation inducible protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,230,049 | 0 | G | T | 100.0%
| 956.2
/ NA
| 286 | intergenic (‑66/‑204) | yjbT/psiE | putative periplasmic protein/phosphate starvation inducible protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (161/125); total (161/125) |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
AAGCAGGAAGAACAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGA > CP009273/4229902‑4230195
|
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aGCAGGAAGAACAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTAtt < 1:2530790/150‑1 (MQ=255)
gCAGGAAGAACAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTAttt < 1:1310696/150‑1 (MQ=255)
gCAGGAAGAACAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTAttt < 2:1112155/150‑1 (MQ=255)
cAGGAAGAACAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTAtttt < 2:2679663/150‑1 (MQ=255)
ggAAGAACAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTg > 2:3222892/1‑150 (MQ=255)
aagaaCAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGaa > 2:1176276/1‑150 (MQ=255)
cAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTAcc > 2:2968935/1‑150 (MQ=255)
agagACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCg > 2:551440/1‑150 (MQ=255)
agaCTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGc > 2:2409578/1‑150 (MQ=255)
aCTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCtt > 1:3275672/1‑150 (MQ=255)
aTAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGt > 2:2844885/1‑150 (MQ=255)
tAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTg > 1:2887417/1‑150 (MQ=255)
tAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTg < 1:817728/150‑1 (MQ=255)
aaCATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGc < 2:2558984/150‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGt > 2:1838480/1‑150 (MQ=255)
tCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGtt < 1:3185944/150‑1 (MQ=255)
cAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGttt > 1:655107/1‑150 (MQ=255)
cAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGttt < 2:429148/150‑1 (MQ=255)
cagcaAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGTAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCtt > 1:86026/1‑150 (MQ=255)
cagcaAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCtt > 1:2514112/1‑150 (MQ=255)
agcaAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTg < 2:705879/150‑1 (MQ=255)
gcaAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTga < 1:3463057/150‑2 (MQ=255)
aaGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATgc > 1:1916384/1‑150 (MQ=255)
gCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGcgcc > 1:258766/1‑150 (MQ=255)
cTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGcgccg < 1:540279/150‑1 (MQ=255)
cATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCa > 1:2989467/1‑150 (MQ=255)
tACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGcgcg < 1:375066/150‑1 (MQ=255)
tACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGcgcg > 1:1730107/1‑150 (MQ=255)
tACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGcgcg < 1:3111367/150‑1 (MQ=255)
accaccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCgg > 2:1230832/1‑150 (MQ=255)
accaccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCgg > 2:3208787/1‑150 (MQ=255)
accaccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCgg > 1:2650722/1‑150 (MQ=255)
ccaccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGc > 2:2775596/1‑150 (MQ=255)
caccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCt < 1:2362931/150‑1 (MQ=255)
caccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCt > 2:2365339/1‑150 (MQ=255)
accTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCtt < 2:1627109/150‑1 (MQ=255)
cTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTAt > 2:3805693/1‑150 (MQ=255)
tATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCg < 1:2866258/150‑1 (MQ=255)
tATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCg > 1:3435084/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCgg > 2:3343627/1‑150 (MQ=255)
aGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCt < 2:1793678/150‑1 (MQ=255)
aGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCt > 1:254155/1‑150 (MQ=255)
gTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGGATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTAc > 1:1057768/1‑150 (MQ=255)
ttACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACg > 2:3571337/1‑150 (MQ=255)
gTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggta > 1:1587373/1‑150 (MQ=255)
tttCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag > 1:489334/1‑150 (MQ=255)
ttCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg > 1:3335509/1‑150 (MQ=255)
ttCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg > 1:3311359/1‑150 (MQ=255)
gTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATcc < 2:912592/150‑1 (MQ=255)
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cAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCt < 2:577436/150‑1 (MQ=255)
cAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCt < 2:2348533/150‑1 (MQ=255)
agagGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCtt > 1:3637452/1‑150 (MQ=255)
agagGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCtt < 2:3491526/150‑1 (MQ=255)
agGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg > 1:1481512/1‑150 (MQ=255)
agGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg > 2:2221991/1‑150 (MQ=255)
aaCATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg < 1:3604379/150‑1 (MQ=255)
aaCATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg < 1:1159988/150‑1 (MQ=255)
cATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa > 1:114101/1‑150 (MQ=255)
cATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa > 2:191368/1‑150 (MQ=255)
cATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa < 1:3105268/150‑1 (MQ=255)
ttGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 1:351809/150‑1 (MQ=255)
tCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcgc > 1:2938861/1‑150 (MQ=255)
aTTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt > 2:789871/1‑150 (MQ=255)
ttttCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTcc < 1:2014411/150‑1 (MQ=255)
tttCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCa < 2:86026/150‑1 (MQ=255)
tCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaaa < 2:2911357/150‑1 (MQ=255)
cgcgCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt < 1:3393198/150‑1 (MQ=255)
gcgcATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATc < 2:3359357/150‑1 (MQ=255)
cgcATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATcc < 2:1535971/150‑1 (MQ=255)
gcATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCa < 2:3682598/150‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg < 2:422593/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGt < 2:1391186/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGt < 2:1310557/150‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt > 1:2408455/1‑150 (MQ=255)
tGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 1:2770967/150‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt > 2:3628457/1‑150 (MQ=255)
ggtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAAc < 1:759180/150‑1 (MQ=255)
ggtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAAc > 2:2735751/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGGAATCACCTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaa < 2:3061198/150‑1 (MQ=255)
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CTGAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAA > SRR19973061.1789186/1‑150 (MQ=60)
GAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAT < SRR19973061.1153967/150‑1 (MQ=60)
GAATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAT < SRR19973061.1153976/150‑1 (MQ=60)
AATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATA > SRR19973061.1813897/1‑150 (MQ=60)
ATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATAT < SRR19973061.3681682/150‑1 (MQ=60)
ATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATAT < SRR19973061.3254432/150‑1 (MQ=60)
ATGGGTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATAT < SRR19973061.3680852/150‑1 (MQ=60)
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GTTATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAT < SRR19973061.325052/150‑1 (MQ=60)
TATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCT < SRR19973061.995117/150‑1 (MQ=60)
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AAGCAGGAAGAACAGAGACTGATAACATCAAAGCAGCAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCT > CP009273/4229902‑4230198
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |