Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,247,370 |
G→T |
D110Y (GAT→TAT) |
lexA → |
transcriptional repressor of SOS regulon |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,247,370 | 0 | G | T | 99.5%
| 668.1
/ ‑4.6
| 200 | D110Y (GAT→TAT) | lexA | transcriptional repressor of SOS regulon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (90/109); minor base C (0/1); total (90/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
GGCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTG > CP009273/4247223‑4247516
|
ggCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTAt < 2:860440/150‑1 (MQ=255)
ggCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTAt > 1:2955113/1‑150 (MQ=255)
cgcATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTAttt < 2:3193824/150‑1 (MQ=255)
cATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTcc < 1:1003007/150‑1 (MQ=255)
cATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTcc < 1:3702893/150‑1 (MQ=255)
cATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGGTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTcc < 1:3442305/150‑1 (MQ=255)
aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCct < 2:21210/150‑1 (MQ=255)
aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCct > 1:3159606/1‑150 (MQ=255)
aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCct > 2:462095/1‑150 (MQ=255)
aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTACct > 1:1053615/1‑150 (MQ=255)
aCGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCctgct < 1:3150352/150‑1 (MQ=255)
cgGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTgcg < 2:1551819/150‑1 (MQ=255)
cgGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTgcg < 2:2845641/150‑1 (MQ=255)
gggATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTgcgc > 2:1945297/1‑150 (MQ=255)
ttCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCa < 2:260324/150‑1 (MQ=255)
ttCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTCATTTCCTGCTGCGCGTCa < 1:3775304/150‑1 (MQ=255)
cTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCggg < 1:1731591/150‑1 (MQ=255)
tGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCggg < 1:3682287/149‑1 (MQ=255)
gTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGAt > 1:3265692/1‑150 (MQ=255)
gCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTc < 1:3237444/150‑1 (MQ=255)
gCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTc < 2:601623/150‑1 (MQ=255)
gCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTc < 1:439148/150‑1 (MQ=255)
aggaagaggaagAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGa > 2:2933529/1‑150 (MQ=255)
aggaagaggaagAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGa > 1:1768168/1‑150 (MQ=255)
aagaggaagaAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGa > 1:270462/1‑150 (MQ=255)
gaggaagaAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGaaa < 1:2831701/150‑1 (MQ=255)
gaagaaGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGAGGGATGTCGATGAAAGat > 2:3692006/1‑150 (MQ=255)
gaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAGGATATc < 2:3763868/150‑1 (MQ=255)
gaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATc > 1:2266005/1‑150 (MQ=255)
gaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATc < 2:2426004/150‑1 (MQ=255)
aagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCg < 1:1091429/150‑1 (MQ=255)
aagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCg > 2:1741596/1‑150 (MQ=255)
gggTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGc < 1:2526129/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCAt > 1:843835/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCAt > 1:3510040/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCAt > 1:2044705/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCAtt > 1:642247/1‑150 (MQ=255)
ccGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGTAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTatg < 1:722478/150‑1 (MQ=255)
gTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGt < 1:821093/150‑1 (MQ=255)
tAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTg < 2:1113670/150‑1 (MQ=255)
aGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGa > 2:2011578/1‑150 (MQ=255)
cGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTg < 2:2797204/150‑1 (MQ=255)
gtgGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTg < 1:2194703/150‑1 (MQ=255)
gtgGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTg > 2:3655333/1‑150 (MQ=255)
gtgGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTg < 2:3505513/150‑1 (MQ=255)
tgGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTgg > 2:2899222/1‑150 (MQ=255)
ggCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGc > 1:1081211/1‑150 (MQ=255)
cTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAg < 1:1865864/150‑1 (MQ=255)
cGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCa > 2:1209597/1‑150 (MQ=255)
ggTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCAt > 2:3240262/1‑150 (MQ=255)
gTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATa < 2:2540717/150‑1 (MQ=255)
tGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATaa < 2:2202699/150‑1 (MQ=255)
aaCCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATaaaa < 2:411012/150‑1 (MQ=255)
aCCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAAc < 1:1630879/150‑1 (MQ=255)
aCTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCa < 2:3091025/150‑1 (MQ=255)
cTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAg > 2:1663527/1‑150 (MQ=255)
cTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAg > 2:1663845/1‑150 (MQ=255)
tCTGGCGCAACAGCATATTGAAGNTCATTANCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCNGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGNTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGa > 2:1817514/1‑150 (MQ=255)
ggCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGt < 2:2260173/150‑1 (MQ=255)
cgcAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTAc < 2:1173968/150‑1 (MQ=255)
cgcAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTAc > 1:1706127/1‑150 (MQ=255)
gcAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACg < 2:1108369/150‑1 (MQ=255)
cAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGt > 1:91263/1‑150 (MQ=255)
aaCAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTa < 2:649507/150‑1 (MQ=255)
aaCAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTa < 1:2359187/150‑1 (MQ=255)
aaCAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTa > 1:2465843/1‑150 (MQ=255)
cAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAAc > 2:1342604/1‑150 (MQ=255)
cAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAAc < 2:1289295/150‑1 (MQ=255)
gCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACgg < 2:2710507/150‑1 (MQ=255)
gCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACgg < 2:3579942/150‑1 (MQ=255)
cATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGt < 2:1401640/150‑1 (MQ=255)
tatTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCa < 2:960857/150‑1 (MQ=255)
atTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAg > 1:2777621/1‑150 (MQ=255)
atTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAg > 1:500619/1‑150 (MQ=255)
aaGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCg < 2:2500609/150‑1 (MQ=255)
aaGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCg > 2:1434333/1‑150 (MQ=255)
ggTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGtt < 1:603041/150‑1 (MQ=255)
aTTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCg < 1:2336022/150‑1 (MQ=255)
aTTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCg > 1:1222686/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCAc < 1:2933529/150‑1 (MQ=255)
cAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGt < 1:617183/150‑1 (MQ=255)
cAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGt > 2:333460/1‑150 (MQ=255)
aGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTa < 1:2760830/150‑1 (MQ=255)
tCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATtg < 1:462095/150‑1 (MQ=255)
tCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATtg > 1:666048/1‑150 (MQ=255)
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ATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAG > SRR19973061.501939/1‑150 (MQ=60)
ATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAG > SRR19973061.501941/1‑150 (MQ=60)
ATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAG > SRR19973061.2784766/1‑150 (MQ=60)
GGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTT < SRR19973061.604602/150‑1 (MQ=60)
GGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTT > SRR19973061.1027795/1‑150 (MQ=60)
GTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTG > SRR19973061.637214/1‑150 (MQ=60)
TCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGT < SRR19973061.1730130/150‑1 (MQ=60)
ATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCG > SRR19973061.1225736/1‑150 (MQ=60)
ATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCG < SRR19973061.2341952/150‑1 (MQ=60)
ATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCAC < SRR19973061.2941074/150‑1 (MQ=60)
CAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGT < SRR19973061.618765/150‑1 (MQ=60)
AGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTA > SRR19973061.3163109/1‑150 (MQ=60)
AGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTA < SRR19973061.2767939/150‑1 (MQ=60)
GGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTAT > SRR19973061.909199/1‑150 (MQ=60)
GGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTAT > SRR19973061.2819437/1‑150 (MQ=60)
TCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTG > SRR19973061.667767/1‑150 (MQ=60)
TCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTG < SRR19973061.463353/150‑1 (MQ=60)
TCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTG > SRR19973061.2858114/1‑150 (MQ=60)
ATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATG > SRR19973061.1970383/1‑150 (MQ=60)
ATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATG > SRR19973061.1970347/1‑150 (MQ=60)
ATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATG > SRR19973061.1970076/1‑150 (MQ=60)
ATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATG > SRR19973061.1970073/1‑150 (MQ=60)
CCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGAC > SRR19973061.2459096/1‑150 (MQ=60)
CCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGAC > SRR19973061.547890/1‑150 (MQ=60)
CCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGAC < SRR19973061.1850885/150‑1 (MQ=60)
CTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACG < SRR19973061.1435148/150‑1 (MQ=60)
TCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAA > SRR19973061.3081149/1‑150 (MQ=60)
TCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAA < SRR19973061.609458/150‑1 (MQ=60)
CAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGT < SRR19973061.939328/150‑1 (MQ=60)
AAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTT < SRR19973061.1745975/150‑1 (MQ=60)
AAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTT < SRR19973061.2546384/150‑1 (MQ=60)
AGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTA > SRR19973061.3748944/1‑150 (MQ=60)
GAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCG < SRR19973061.2442948/150‑1 (MQ=60)
GCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTG > SRR19973061.1770690/1‑150 (MQ=60)
GCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTG > SRR19973061.1770358/1‑150 (MQ=60)
CTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGA > SRR19973061.359051/1‑150 (MQ=60)
TTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAA > SRR19973061.2622324/1‑150 (MQ=60)
TTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTAATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAA > SRR19973061.1201192/1‑150 (MQ=60)
|
GGCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAA > CP009273/4247223‑4247518
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |