Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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mutation |
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| RA |
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25.0% |
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arnA → |
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|
| |
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position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,363,066 | 0 | C | A | 25.0%
| 745.1
/ 198.7
| 320 | L517I (CTC→ATC) | arnA | fused UDP‑L‑Ara4N formyltransferase/UDP‑GlcA C‑4'‑decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (109/131); new base A (43/37); total (152/168) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 |
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
ACAATTACTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCGGGAAATCGCTGCGACGGTGAAATTATCAACATTGG > CP009273/2362918‑2363214
|
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cAATTACTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATtct < 2:3032069/149‑1 (MQ=255)
aaTTACTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATtctc < 1:4604810/149‑1 (MQ=255)
aaTTACTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATtctc > 2:3534524/1‑149 (MQ=255)
ttACTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCaa > 2:2177582/1‑149 (MQ=255)
tACTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAAt > 2:4719084/1‑149 (MQ=255)
cTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCt < 1:2260283/149‑1 (MQ=255)
tGATCGTGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTgg < 2:3315092/149‑1 (MQ=255)
aTCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTa > 2:2076783/1‑149 (MQ=255)
aTCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTa > 2:2148226/1‑149 (MQ=255)
aTCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTa > 1:1213093/1‑149 (MQ=255)
aTCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCAGTCTCAATCTGGTa > 2:3808442/1‑149 (MQ=255)
aTCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTc < 1:2687084/149‑1 (MQ=255)
tCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCa < 2:1385621/149‑1 (MQ=255)
cTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCAc < 1:3965187/149‑1 (MQ=255)
gggCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCg > 1:250229/1‑149 (MQ=255)
gggCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCg > 1:4498312/1‑149 (MQ=255)
ggCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGa < 1:1672540/149‑1 (MQ=255)
gCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGAt < 2:3749916/149‑1 (MQ=255)
gCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGAt > 1:194280/1‑149 (MQ=255)
gCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGAt < 2:1737483/149‑1 (MQ=255)
gCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGAt > 1:334804/1‑149 (MQ=255)
tATGGCGAAAAAGAGGGTTTACATTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTAAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTaa < 1:622534/149‑1 (MQ=255)
ggCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCt < 1:2982922/149‑1 (MQ=255)
gAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCtgat > 1:3842189/1‑149 (MQ=255)
aaaaaGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCtgatt > 1:2102054/1‑149 (MQ=255)
aaaaaGAGGGTTTACAGTTCACCCTCGTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCtgatt < 2:4333444/149‑1 (MQ=255)
aaaGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCtgattga > 1:3934504/1‑149 (MQ=255)
aaaGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCtgattga < 1:4227673/149‑1 (MQ=255)
agagGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATg < 1:4388955/149‑1 (MQ=255)
agagGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATg > 2:443652/1‑149 (MQ=255)
gagGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATgg > 1:1440286/1‑149 (MQ=255)
agGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGc > 1:876799/1‑149 (MQ=255)
agGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGc > 2:790669/1‑149 (MQ=255)
tttACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGaa > 2:1800061/1‑149 (MQ=255)
tttACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGaa > 2:3791587/1‑149 (MQ=255)
tACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGaaaa < 2:9824/149‑1 (MQ=255)
aCAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAAc < 1:2530282/149‑1 (MQ=255)
aCAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAAc > 2:4166270/1‑149 (MQ=255)
aCAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAAc < 2:1056758/149‑1 (MQ=255)
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aCCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACg > 1:372603/1‑149 (MQ=255)
cccTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACgc < 1:106661/149‑1 (MQ=255)
ctTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCTGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACgctgct < 2:2737432/149‑1 (MQ=255)
ctTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACgctgct < 2:566002/149‑1 (MQ=255)
gCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACt < 2:1015392/149‑1 (MQ=255)
gCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACt > 1:1663717/1‑149 (MQ=255)
ccGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGAGTAAGCTGATTGATGGCGGAAATCAAAAACGCTGCTTTACTGa > 2:4470193/1‑149 (MQ=255)
tttAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGatat < 2:3417376/149‑1 (MQ=255)
tAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTc < 1:281006/149‑1 (MQ=255)
tAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTc < 2:1811198/149‑1 (MQ=255)
aCTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTcgc < 1:1860515/149‑1 (MQ=255)
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tGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGa > 2:4692285/1‑149 (MQ=255)
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aCCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCg > 2:2650536/1‑149 (MQ=255)
ccACGACTGGATAACCTTACTGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGa < 1:3574471/149‑1 (MQ=255)
ccACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGa > 2:829861/1‑149 (MQ=255)
aCGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAgg > 2:508270/1‑149 (MQ=255)
aCTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGt > 1:199251/1‑149 (MQ=255)
cTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGtt > 1:3292911/1‑149 (MQ=255)
tGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTta < 2:2916314/149‑1 (MQ=255)
tGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTta < 1:1185243/149‑1 (MQ=255)
tGGATAACCTTAAGGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTta < 2:2560765/149‑1 (MQ=255)
ggATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTtat < 1:82652/149‑1 (MQ=255)
ggATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTtat < 1:723739/149‑1 (MQ=255)
cTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCAt < 2:4629367/149‑1 (MQ=255)
ttAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCAtt > 2:1064044/1‑149 (MQ=255)
aaggCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTAGTACGCAACTCAGTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTAt < 2:497746/146‑1 (MQ=255)
aGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGaaa > 1:1677361/1‑149 (MQ=255)
gcgcGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGaaaa < 1:2177460/149‑1 (MQ=255)
cgcgAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAAt < 1:3534524/149‑1 (MQ=255)
gcgAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATg < 1:3791587/149‑1 (MQ=255)
cgAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGc < 1:1526476/149‑1 (MQ=255)
gAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCg > 1:1334199/1‑149 (MQ=255)
gAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGAGGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCg > 1:288514/1‑149 (MQ=255)
aaTTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCgg > 2:1840923/1‑149 (MQ=255)
aaTTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCgg < 2:701804/149‑1 (MQ=255)
aTTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCggg > 2:2408092/1‑149 (MQ=255)
ggCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCGGGaaa < 2:3857460/149‑1 (MQ=255)
gCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCGGGAAAt < 1:945076/149‑1 (MQ=255)
cAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTATCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAACACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCGGGAAATc < 1:410283/149‑1 (MQ=255)
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tCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCGGGAAATCGCTg > 2:1624778/1‑149 (MQ=255)
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ACAATTACTTGATCGGGTGATCTGGGCCTATGGCGAAAAAGAGGGTTTACAGTTCACCCTCTTCCGCCCGTTTAACTGGATGGGACCACGACTGGATAACCTTAATGCAGCGCGAATTGGCAGCTCCCGCGCTATTACGCAACTCATTCTCAATCTGGTAGAAGGTTCACCGATTAAGCTGATTGATGGCGGAAAACAAAAACGCTGCTTTACTGATATTCGCGATGGTATCGAGGCGTTATACCGCATTATCGAAAATGCGGGAAATCGCTGCGACGGTGAAATTATCAACATTGG > CP009273/2362918‑2363214
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
