Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F159 I0 R1
|
879 |
305.9 |
9588012 |
96.6% |
9262019 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
943,573 |
G→T |
92.8% |
A297S (GCC→TCC) |
ycaM → |
putative transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 943,573 | 0 | G | T | 92.8%
| 797.2
/ 47.7
| 258 | A297S (GCC→TCC) | ycaM | putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (8/11); new base T (113/126); total (121/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.12e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTAT > CP009273/943426‑943719
|
gTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTcc < 2:4064115/150‑1 (MQ=255)
tgtgCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCAtt < 1:1093599/150‑1 (MQ=255)
gtgCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTg < 2:4145327/150‑1 (MQ=255)
gCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTACTGGTGATTTACTCCATTGCg < 1:2597678/150‑1 (MQ=255)
gCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCg < 2:2296684/150‑1 (MQ=255)
gCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCg < 1:2074979/150‑1 (MQ=255)
cATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGaa < 2:542004/150‑1 (MQ=255)
ttCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATa < 1:3588181/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATAcc > 1:3654267/1‑150 (MQ=255)
gggCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCt > 2:4180771/1‑150 (MQ=255)
gCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTgg < 2:4283396/150‑1 (MQ=255)
gCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACa > 2:2690150/1‑150 (MQ=255)
gCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACa > 2:332229/1‑150 (MQ=255)
cTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACaa > 2:1368913/1‑150 (MQ=255)
gCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTa < 2:1978319/150‑1 (MQ=255)
aTGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAgcg > 1:1136448/1‑150 (MQ=255)
ggATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGgcgc > 2:1639967/1‑150 (MQ=255)
tgatgTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTgg < 2:254174/150‑1 (MQ=255)
tgatgTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTgg < 2:254264/150‑1 (MQ=255)
atgTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTa > 1:4426214/1‑150 (MQ=255)
atgTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTa < 2:763307/150‑1 (MQ=255)
tGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATtctc < 1:3080378/150‑1 (MQ=255)
tGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATtctc < 2:2798750/150‑1 (MQ=255)
aTTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGa > 2:3645358/1‑150 (MQ=255)
ttCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGAt < 1:730123/150‑1 (MQ=255)
cgcgTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTg > 2:2194118/1‑150 (MQ=255)
cgTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGAt < 2:3018954/150‑1 (MQ=255)
gTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATg < 2:118687/150‑1 (MQ=255)
tAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGc > 2:4399968/1‑150 (MQ=255)
tAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGc > 2:2843877/1‑150 (MQ=255)
atatCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATACTCGATTGATGccc > 2:1926255/1‑150 (MQ=255)
atCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCg > 1:215998/1‑150 (MQ=255)
tCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGc > 2:1204820/1‑150 (MQ=255)
cccGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCt > 1:1714286/1‑150 (MQ=255)
cccGGATGAATTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCt < 1:92798/150‑1 (MQ=255)
cGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTa < 2:1254839/150‑1 (MQ=255)
cGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTa < 2:4403060/150‑1 (MQ=255)
aTGACTTAATGACCACCGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAg < 1:1611788/150‑1 (MQ=255)
aTGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAg > 1:875178/1‑150 (MQ=255)
aTGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAg > 1:873515/1‑150 (MQ=255)
gACTTAATGACCACCGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTg < 1:33958/150‑1 (MQ=255)
gACTTAATGACCAACGGTCAGTATTCCGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTg < 2:2409057/150‑1 (MQ=255)
aaTGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTAtt < 1:2448405/150‑1 (MQ=255)
aTGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTa > 1:3514389/1‑150 (MQ=255)
aTGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTa < 1:569072/150‑1 (MQ=255)
aTGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTa > 1:395950/1‑150 (MQ=255)
gACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAgg > 1:1296143/1‑150 (MQ=255)
aCCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGt > 1:1236067/1‑150 (MQ=255)
ccAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTg > 1:517373/1‑150 (MQ=255)
ccAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTg < 1:3186233/150‑1 (MQ=255)
cAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGa < 1:3264726/150‑1 (MQ=255)
aaCGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGAt > 1:617923/1‑150 (MQ=255)
aaCGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGAt > 1:4264755/1‑150 (MQ=255)
gTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTg < 2:1092325/150‑1 (MQ=255)
cAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGAc < 1:359368/150‑1 (MQ=255)
aGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACa > 2:2749751/1‑150 (MQ=255)
aTTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCa > 2:1246844/1‑150 (MQ=255)
ttACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCaa < 2:2484464/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTTATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAat < 1:2828871/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAat < 1:209341/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAat > 1:4529892/1‑150 (MQ=255)
aCGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTAGTAGGTGATGCTGACAGCAAat > 1:3931120/1‑150 (MQ=255)
gCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGTGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAatat < 1:1695321/150‑1 (MQ=255)
ccTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAatata < 2:1008182/150‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCGAGTATTACAACCTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTccagcca < 2:3554537/150‑1 (MQ=255)
cGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATg < 2:3245579/150‑1 (MQ=255)
cGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATg > 1:3800471/1‑150 (MQ=255)
aGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTc > 2:791540/1‑150 (MQ=255)
ttACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTAc > 1:1456875/1‑150 (MQ=255)
ttACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTAc < 1:1163120/150‑1 (MQ=255)
acaacaTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCa < 2:1296143/150‑1 (MQ=255)
caacaTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCaa > 2:4671003/1‑150 (MQ=255)
caacaTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCaa > 2:3166184/1‑150 (MQ=255)
aacaTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAAc < 2:4231434/150‑1 (MQ=255)
aTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCt > 2:114957/1‑150 (MQ=255)
aTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCt > 1:3547199/1‑150 (MQ=255)
tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCtt < 1:4592162/150‑1 (MQ=255)
tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCtt < 1:1899109/150‑1 (MQ=255)
ggTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCt > 2:3795104/1‑150 (MQ=255)
gTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTg < 2:2605293/150‑1 (MQ=255)
aaTACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGt > 1:1029044/1‑150 (MQ=255)
tACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTAc < 2:2253302/150‑1 (MQ=255)
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tACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTAc > 1:3125175/1‑150 (MQ=255)
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CAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGAC < SRR19973078.361599/150‑1 (MQ=60)
CAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGAC < SRR19973078.1442538/150‑1 (MQ=60)
CAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGAC > SRR19973078.3933380/1‑150 (MQ=60)
CAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGAC < SRR19973078.361615/150‑1 (MQ=60)
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CGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATG > SRR19973078.3822287/1‑150 (MQ=60)
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GAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGGAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT < SRR19973078.81467/150‑1 (MQ=60)
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TTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTACAGCCAGTTTATGTCGTAC > SRR19973078.1465816/1‑150 (MQ=60)
TTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTAC > SRR19973078.3089361/1‑150 (MQ=60)
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ATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCT > SRR19973078.3567233/1‑150 (MQ=60)
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AATACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGT > SRR19973078.1035438/1‑150 (MQ=60)
TACTTTAATGGTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTAC > SRR19973078.3003859/1‑150 (MQ=60)
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TCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTT > SRR19973078.319305/1‑150 (MQ=60)
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TCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTT > SRR19973078.2724948/1‑150 (MQ=60)
TCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTT > SRR19973078.223900/1‑150 (MQ=60)
TCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGGTAATGGCTATTTT > SRR19973078.223735/1‑150 (MQ=60)
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TGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTT > CP009273/943429‑943722
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
