Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,207,552 |
G→T |
100% |
M172I (ATG→ATT) |
aceA → |
isocitrate lyase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,207,552 | 0 | G | T | 97.4%
| 725.7
/ 9.0
| 228 | M172I (ATG→ATT) | aceA | isocitrate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/5); new base T (109/113); total (110/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.14e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
ATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCT > CP009273/4207406‑4207696
|
aTCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTaa > 2:1955740/1‑149 (MQ=255)
tCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATGACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTaaa < 2:2296928/149‑1 (MQ=255)
caacaaCACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAg > 1:3333423/1‑149 (MQ=255)
aacaacACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGc > 2:13112/1‑149 (MQ=255)
aacaacACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGGTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGc > 1:3716206/1‑149 (MQ=255)
acaacaCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCg > 1:641764/1‑149 (MQ=255)
acaacaCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCg > 2:3446358/1‑149 (MQ=255)
caacaCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCga > 1:2477314/1‑149 (MQ=255)
acCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCgatgat < 2:3209074/149‑1 (MQ=255)
ccTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGAtt < 1:1087023/149‑1 (MQ=255)
cTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTg > 1:3116619/1‑149 (MQ=255)
tCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGaa < 2:4019354/149‑1 (MQ=255)
ccGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAg < 1:4037281/149‑1 (MQ=255)
gtcgtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGcc > 2:2570972/1‑149 (MQ=255)
gtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGt > 1:1066602/1‑149 (MQ=255)
gtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGt > 2:1587481/1‑149 (MQ=255)
gATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGc > 1:1939372/1‑149 (MQ=255)
aTCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCg > 2:180757/1‑149 (MQ=255)
cAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGc < 2:3716206/149‑1 (MQ=255)
aGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCa > 2:1753625/1‑149 (MQ=255)
aTCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGt < 1:1151753/149‑1 (MQ=255)
cAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCa < 1:1997742/149‑1 (MQ=255)
aaTGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCAc < 1:512745/149‑1 (MQ=255)
aTGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACt < 1:1770892/149‑1 (MQ=255)
aTGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACt > 1:2092134/1‑149 (MQ=255)
tGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACtt > 2:3028299/1‑149 (MQ=255)
tGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAGTACTTCCTGCCGAGCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGGGGTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGAGGAGTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCAcgt > 2:3296289/1‑147 (MQ=255)
ggTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTc > 1:4098497/1‑149 (MQ=255)
gTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCg < 2:647299/149‑1 (MQ=255)
tCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGa < 1:2758503/149‑1 (MQ=255)
ccGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGaa > 2:1782393/1‑149 (MQ=255)
gcgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGa > 2:822145/1‑149 (MQ=255)
ggCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCa > 2:796219/1‑149 (MQ=255)
gCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAg > 2:2131527/1‑149 (MQ=255)
cATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGc < 1:2177407/149‑1 (MQ=255)
cATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGc > 2:1480314/1‑149 (MQ=255)
aTTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCt < 1:791076/149‑1 (MQ=255)
aTTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCt < 1:3601706/149‑1 (MQ=255)
ttGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTg < 2:1968226/149‑1 (MQ=255)
ttGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTg < 2:1967024/149‑1 (MQ=255)
gCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGt < 1:3466411/149‑1 (MQ=255)
gCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGt > 2:2236359/1‑149 (MQ=255)
ggCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGt > 1:3843412/1‑149 (MQ=255)
ggCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGt > 1:2662831/1‑149 (MQ=255)
gATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTgaa < 2:408437/149‑1 (MQ=255)
tCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTgaaga > 1:3448173/1‑149 (MQ=255)
gcgcTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAAt > 2:661893/1‑149 (MQ=255)
gcTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGc > 2:3443770/1‑149 (MQ=255)
cTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCg < 2:30800/149‑1 (MQ=255)
tATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCgg < 1:2379800/149‑1 (MQ=255)
aTGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGt > 1:2723987/1‑149 (MQ=255)
tGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTc < 1:1855541/149‑1 (MQ=255)
cGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTcaca < 2:1866427/149‑1 (MQ=255)
aTTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATg < 1:1962696/149‑1 (MQ=255)
aTTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATg < 1:2682253/149‑1 (MQ=255)
ttACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATgg < 2:297596/149‑1 (MQ=255)
ttACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATgg < 1:455861/149‑1 (MQ=255)
tACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATggg < 2:3911380/149‑1 (MQ=255)
tACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATggg > 2:2089032/1‑149 (MQ=255)
tGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCaaa > 2:2408491/1‑149 (MQ=255)
tGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCaaa > 1:3352924/1‑149 (MQ=255)
gCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAg > 2:3738112/1‑149 (MQ=255)
ccGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGt < 2:1449521/149‑1 (MQ=255)
cGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtt < 2:3645608/149‑1 (MQ=255)
cGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtt > 2:3184712/1‑149 (MQ=255)
aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt > 1:2913801/1‑149 (MQ=255)
aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt < 2:3397814/149‑1 (MQ=255)
aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt > 2:3270131/1‑149 (MQ=255)
aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt > 1:2529082/1‑149 (MQ=255)
aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt < 2:1049898/149‑1 (MQ=255)
aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt > 1:539916/1‑149 (MQ=255)
cGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAg < 1:3801845/149‑1 (MQ=255)
gTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGt < 2:1425592/149‑1 (MQ=255)
gTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGt < 2:3185731/149‑1 (MQ=255)
gCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGTCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGACATGCTGTCACATGTGCGGCAAAGTTTTAGTGcc < 2:774316/149‑1 (MQ=255)
gCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCTATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGcc < 1:2600482/149‑1 (MQ=255)
cGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCaa < 1:3965496/149‑1 (MQ=255)
gATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAAc > 2:773047/1‑149 (MQ=255)
ggAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAgg > 1:2434258/1‑149 (MQ=255)
gCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGc > 2:1594525/1‑149 (MQ=255)
gCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGc > 1:161861/1‑149 (MQ=255)
ccGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCt < 1:1542567/149‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTa < 2:1061534/149‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTa > 2:2460502/1‑149 (MQ=255)
cGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTa < 1:2570972/149‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTa < 2:1657113/149‑1 (MQ=255)
ggTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTAt < 2:4098499/149‑1 (MQ=255)
tGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAGGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGa < 2:318917/149‑1 (MQ=255)
gCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGaaa < 1:1042158/149‑1 (MQ=255)
gCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGaaa > 1:3823234/1‑149 (MQ=255)
tgtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTgg < 1:2807817/149‑1 (MQ=255)
gtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGt < 1:417326/149‑1 (MQ=255)
gtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGt > 1:2075631/1‑149 (MQ=255)
gtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGt > 2:853422/1‑149 (MQ=255)
tGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTcgcg > 1:1664968/1‑149 (MQ=255)
gAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCgcgg > 2:1840766/1‑149 (MQ=255)
cTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTc < 1:661893/149‑1 (MQ=255)
gAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGc > 2:520807/1‑149 (MQ=255)
aaCTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCa > 1:3799822/1‑149 (MQ=255)
tgattaAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCt > 1:3575374/1‑149 (MQ=255)
|
ATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCT > CP009273/4207406‑4207696
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCTGACGT > CP009273/4207404‑4207701
|
GGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTA > SRR19973068.245379/1‑150 (MQ=60)
GGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTA > SRR19973068.4125321/1‑150 (MQ=60)
GGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTA > SRR19973068.299588/1‑150 (MQ=60)
GATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAA < SRR19973068.369271/150‑1 (MQ=60)
ATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAA < SRR19973068.1129389/150‑1 (MQ=60)
ATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTAGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAA > SRR19973068.2694588/1‑150 (MQ=60)
TCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAG > SRR19973068.3353762/1‑150 (MQ=60)
TCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAG > SRR19973068.3353780/1‑150 (MQ=60)
CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGC > SRR19973068.2513200/1‑150 (MQ=60)
CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGGTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGC > SRR19973068.3738536/1‑150 (MQ=60)
AACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCG > SRR19973068.645973/1‑150 (MQ=60)
ACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGA > SRR19973068.2493115/1‑150 (MQ=60)
ACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGA < SRR19973068.2784560/150‑1 (MQ=60)
ACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATT < SRR19973068.1642449/150‑1 (MQ=60)
ACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATT < SRR19973068.3891435/150‑1 (MQ=60)
CCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTG < SRR19973068.231334/150‑1 (MQ=60)
CCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTG > SRR19973068.1068470/1‑150 (MQ=60)
CCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTG > SRR19973068.3135666/1‑150 (MQ=60)
CCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTG < SRR19973068.1094229/150‑1 (MQ=60)
CTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGA > SRR19973068.1878768/1‑150 (MQ=60)
TCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAG > SRR19973068.996921/1‑150 (MQ=60)
CCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGC > SRR19973068.3485297/1‑150 (MQ=60)
CCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGC < SRR19973068.4061617/150‑1 (MQ=60)
CCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGC < SRR19973068.3527801/150‑1 (MQ=60)
GTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCG < SRR19973068.3814871/150‑1 (MQ=60)
CGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGT > SRR19973068.1073663/1‑150 (MQ=60)
CGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGT > SRR19973068.1073600/1‑150 (MQ=60)
GCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGATATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCA < SRR19973068.3794383/150‑1 (MQ=60)
CGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGC < SRR19973068.3414036/150‑1 (MQ=60)
CGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGC > SRR19973068.1952264/1‑150 (MQ=60)
ATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTT < SRR19973068.1159463/150‑1 (MQ=60)
CAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCAC < SRR19973068.2011492/150‑1 (MQ=60)
CAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCAC < SRR19973068.2010909/150‑1 (MQ=60)
AATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACT > SRR19973068.2105789/1‑150 (MQ=60)
AATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACT > SRR19973068.2105744/1‑150 (MQ=60)
AATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACT < SRR19973068.2601337/150‑1 (MQ=60)
AATGGGCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACT < SRR19973068.516307/150‑1 (MQ=60)
ATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTT < SRR19973068.1782370/150‑1 (MQ=60)
TGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTC > SRR19973068.4123056/1‑150 (MQ=60)
TGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTC > SRR19973068.4123054/1‑150 (MQ=60)
TCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAA < SRR19973068.2775457/150‑1 (MQ=60)
GGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCA > SRR19973068.531571/1‑150 (MQ=60)
GGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCATGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCA < SRR19973068.4113129/150‑1 (MQ=60)
GGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCATGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCA < SRR19973068.674721/150‑1 (MQ=60)
GCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGGTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGC < SRR19973068.49710/150‑1 (MQ=60)
CATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCT < SRR19973068.2191664/150‑1 (MQ=60)
ATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTG < SRR19973068.796453/150‑1 (MQ=60)
ATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTG < SRR19973068.3623579/150‑1 (MQ=60)
ATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTG < SRR19973068.3826450/150‑1 (MQ=60)
GAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCG > SRR19973068.117523/1‑150 (MQ=60)
GCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTC < SRR19973068.3487412/150‑1 (MQ=60)
GGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGT > SRR19973068.2930374/1‑150 (MQ=60)
GGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGT > SRR19973068.2679474/1‑150 (MQ=60)
GGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGT > SRR19973068.1818153/1‑150 (MQ=60)
GGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGT > SRR19973068.3866138/1‑150 (MQ=60)
GGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGT > SRR19973068.3866597/1‑150 (MQ=60)
GGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTG > SRR19973068.2503301/1‑150 (MQ=60)
ATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGA > SRR19973068.3468984/1‑150 (MQ=60)
ATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGA > SRR19973068.3205342/1‑150 (MQ=60)
TATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGT > SRR19973068.2741114/1‑150 (MQ=60)
TATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGT > SRR19973068.2740813/1‑150 (MQ=60)
TATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGT < SRR19973068.2394992/150‑1 (MQ=60)
TGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCA < SRR19973068.1867799/150‑1 (MQ=60)
TCTATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACA > SRR19973068.2561781/1‑150 (MQ=60)
CGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACAT > SRR19973068.1742436/1‑150 (MQ=60)
ATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGG < SRR19973068.1975714/150‑1 (MQ=60)
ATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGG < SRR19973068.1975663/150‑1 (MQ=60)
ATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGG < SRR19973068.1989224/150‑1 (MQ=60)
ATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGG < SRR19973068.1990959/150‑1 (MQ=60)
ATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGG < SRR19973068.2816462/150‑1 (MQ=60)
ATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGG < SRR19973068.2698960/150‑1 (MQ=60)
TTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGG < SRR19973068.648711/150‑1 (MQ=60)
TTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGG < SRR19973068.459089/150‑1 (MQ=60)
CTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAA > SRR19973068.3373343/1‑150 (MQ=60)
CGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTT < SRR19973068.1616257/150‑1 (MQ=60)
GATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTT > SRR19973068.2545159/1‑150 (MQ=60)
GATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTT > SRR19973068.543647/1‑150 (MQ=60)
GATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTT > SRR19973068.2931931/1‑150 (MQ=60)
GATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGAGTCAGTGAAGAAATTCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTT > SRR19973068.544508/1‑150 (MQ=60)
CGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGT < SRR19973068.3824649/150‑1 (MQ=60)
CGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGT < SRR19973068.3824026/150‑1 (MQ=60)
GCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCTATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCA < SRR19973068.532810/150‑1 (MQ=60)
GCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCTATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCA < SRR19973068.2616900/150‑1 (MQ=60)
GCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCTATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCA < SRR19973068.2616892/150‑1 (MQ=60)
CGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAAC < SRR19973068.3556116/150‑1 (MQ=60)
CGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAAC < SRR19973068.3990102/150‑1 (MQ=60)
CGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAAC < SRR19973068.3989483/150‑1 (MQ=60)
CGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGG > SRR19973068.2449730/1‑150 (MQ=60)
CGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGG > SRR19973068.2449552/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAG < SRR19973068.3095165/150‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAG > SRR19973068.3639213/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAG > SRR19973068.324611/1‑150 (MQ=60)
AGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGC > SRR19973068.163207/1‑150 (MQ=60)
CCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTA < SRR19973068.1552727/150‑1 (MQ=60)
CCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTA < SRR19973068.3611224/150‑1 (MQ=60)
CGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTAT < SRR19973068.2587243/150‑1 (MQ=60)
TTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAG > SRR19973068.173005/1‑150 (MQ=60)
TTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCTATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAG < SRR19973068.13315/150‑1 (MQ=60)
TTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGA < SRR19973068.2705052/150‑1 (MQ=60)
GGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAA > SRR19973068.3846248/1‑150 (MQ=60)
GGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAA > SRR19973068.3846299/1‑150 (MQ=60)
GCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAAC < SRR19973068.1048838/150‑1 (MQ=60)
GGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTG < SRR19973068.264920/150‑1 (MQ=60)
GGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTG > SRR19973068.2154177/1‑150 (MQ=60)
TGTCCTGACTGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGT < SRR19973068.2455163/150‑1 (MQ=60)
TGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGT > SRR19973068.2089070/1‑150 (MQ=60)
TGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGT < SRR19973068.2825267/150‑1 (MQ=60)
GTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTC < SRR19973068.420264/150‑1 (MQ=60)
GTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTC < SRR19973068.420267/150‑1 (MQ=60)
GTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTC < SRR19973068.419317/150‑1 (MQ=60)
TCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCTGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGNCGTCAGTGAAGAAATGCTGTCACATGGGCGGCTAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCG < SRR19973068.2096228/150‑1 (MQ=60)
CTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCG > SRR19973068.1675728/1‑150 (MQ=60)
CTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCT < SRR19973068.666147/150‑1 (MQ=60)
GAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCA > SRR19973068.3822612/1‑150 (MQ=60)
CTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCT > SRR19973068.3597090/1‑150 (MQ=60)
ATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCTGAC > SRR19973068.2481902/1‑150 (MQ=60)
ATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCTGAC > SRR19973068.2482352/1‑150 (MQ=60)
TAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCTGACGT > SRR19973068.2143308/1‑150 (MQ=60)
|
GGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCTGACGT > CP009273/4207404‑4207701
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |