Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP043523 |
1,884,753 |
A→G |
L145L (CTA→CTG) |
FTN78_chr1930 → |
Putative UV‑damage repair protein UvrX |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP043523 | 1,884,753 | 0 | A | G | 99.6%
| 739.2
/ ‑4.9
| 226 | L145L (CTA→CTG) | FTN78_chr1930 | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (105/119); total (107/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
AACACATACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTCATTGAATCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCACAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATAGAAGTTACGGATATTCTAACCAATTATACATCAATTGATGAAATTCATTCTTACTCGATTGATGAGTCGTTTCTTGACGTAACAGAATCACTCAATTTCTTTTATCCTGAGATTAAAAATCGTTATGAACAAATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGC > CP043523/1884609‑1884892
|
cacaTACAGACATTCATGTACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCaa > 1:2764066/1‑148 (MQ=25)
cacaTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCaa > 1:2933532/1‑148 (MQ=25)
cacaTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCaa < 2:325200/148‑1 (MQ=25)
cacaTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCaa < 1:2521774/148‑1 (MQ=25)
acaTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCGAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAAt < 2:2655712/148‑1 (MQ=255)
acaTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATATTCACCAAt > 1:3006814/1‑148 (MQ=21)
acaTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAAt > 1:355817/1‑148 (MQ=25)
caTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAAtt < 2:4364444/148‑1 (MQ=255)
caTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAAtt > 2:2529486/1‑148 (MQ=255)
aTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATta > 1:4026196/1‑148 (MQ=255)
aTACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATta < 2:1368591/148‑1 (MQ=21)
tACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATtat > 2:1918298/1‑148 (MQ=25)
tACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATtat < 1:1769617/148‑1 (MQ=25)
aCAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATttta > 1:1551598/1‑148 (MQ=21)
aCAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATtata > 1:1880191/1‑148 (MQ=25)
aCAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATtata > 1:2303522/1‑148 (MQ=25)
cAGACATTCATGGACAGCGACCTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATAc < 2:3934946/148‑1 (MQ=255)
cAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATAc < 2:4644469/148‑1 (MQ=255)
cAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATAc > 2:950521/1‑148 (MQ=255)
aCATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTGTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTc < 1:2181804/148‑1 (MQ=255)
aTTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCaa > 1:3379394/1‑148 (MQ=255)
aTTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTAGACGTCaa > 1:1261243/1‑148 (MQ=255)
ttCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAAt < 1:100146/148‑1 (MQ=25)
ttCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAAt > 1:2825880/1‑148 (MQ=25)
ttCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAAt < 2:3243045/148‑1 (MQ=21)
cATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAGTATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATtg < 2:4157352/148‑1 (MQ=255)
cATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATtg > 2:2339625/1‑148 (MQ=255)
gACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATtgatga < 2:2201402/148‑1 (MQ=255)
aCAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATtgatgag > 2:182310/1‑147 (MQ=255)
cAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATtgatgaga > 2:2875047/1‑146 (MQ=21)
cAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATtgatgaga < 1:1632465/148‑3 (MQ=21)
aGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGat > 2:2076130/1‑148 (MQ=21)
gCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGatt > 1:3182883/1‑148 (MQ=255)
gCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCGCAAATGCTGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGatt < 2:4320341/148‑1 (MQ=255)
cGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattc < 2:195178/148‑1 (MQ=21)
gAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattca < 1:643073/148‑1 (MQ=21)
aaCTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcac < 1:1494127/148‑2 (MQ=255)
aCTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcact < 2:1154205/148‑3 (MQ=255)
aCTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcact < 1:3725076/148‑3 (MQ=255)
cTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcactc > 2:2563819/1‑145 (MQ=255)
gAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcactcct > 2:451733/1‑146 (MQ=18)
gAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcactcct < 1:3238946/148‑6 (MQ=255)
aaCCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcactccta > 1:3328448/1‑142 (MQ=255)
aaCCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcactccta < 2:2380993/148‑7 (MQ=255)
aCCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcactcctac < 2:851170/148‑8 (MQ=18)
aCCAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGattcactcctac < 2:4475529/148‑8 (MQ=18)
ccAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACt > 2:3924376/1‑148 (MQ=18)
cAACTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTCGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTc < 2:1352649/148‑1 (MQ=255)
aaCTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCg < 2:2162723/148‑1 (MQ=255)
aaCTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCg > 1:2956407/1‑148 (MQ=255)
aCTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGa < 1:2041871/148‑1 (MQ=18)
aCTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGa < 2:2425656/148‑1 (MQ=18)
aCTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGa > 1:3784785/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGAt < 2:1418178/148‑1 (MQ=21)
tttGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGAtt < 1:816461/148‑1 (MQ=255)
tGCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtga < 2:3196615/148‑1 (MQ=18)
gCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgat > 2:903158/1‑148 (MQ=18)
gCAATATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgat > 2:820427/1‑148 (MQ=18)
aaTATGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatga < 2:3046106/148‑1 (MQ=255)
tatGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaat < 2:1650282/148‑3 (MQ=18)
tatGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaat > 1:1449622/1‑146 (MQ=18)
tGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaatct < 2:2991213/148‑5 (MQ=255)
gTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaatctt > 1:143053/1‑143 (MQ=255)
gTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaatctt > 1:450560/1‑143 (MQ=255)
tCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaatcttt > 2:4526353/1‑142 (MQ=16)
tCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaatcttt < 1:2128727/148‑7 (MQ=16)
cGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaatctttt < 2:1204957/148‑8 (MQ=255)
cGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATtgatgaatctttt < 2:1593264/148‑8 (MQ=255)
ttaTTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCttttttgga > 1:3639408/3‑143 (MQ=255)
tGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCGCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAAt > 2:4605150/1‑148 (MQ=2)
cGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCACATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCatt < 2:3156053/148‑3 (MQ=255)
cGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGCGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCatt < 2:859046/148‑3 (MQ=255)
cGAAACGCACGTGGATGGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCatt < 1:1318763/148‑3 (MQ=255)
aaaCGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCattga > 2:4315882/1‑144 (MQ=255)
ctcctcAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGAt < 1:2470668/148‑1 (MQ=255)
ctcctcAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGAt < 1:3746448/148‑1 (MQ=255)
tcctcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGAtt > 1:3874180/5‑148 (MQ=255)
ctcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaa < 2:2454851/146‑1 (MQ=255)
tcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaa > 1:4431491/2‑148 (MQ=255)
tcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaa > 1:864836/2‑148 (MQ=255)
caAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaa > 1:2116565/1‑148 (MQ=255)
aaaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaaa < 2:1290075/148‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTTGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAAt > 2:4088565/1‑148 (MQ=255)
aaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAAt > 1:557343/1‑148 (MQ=255)
aTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATc > 2:655588/1‑148 (MQ=255)
aTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATc > 1:84921/1‑148 (MQ=255)
aTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATc < 1:2910449/148‑1 (MQ=255)
tGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCg > 1:1965368/1‑148 (MQ=255)
cAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCgat > 1:4225715/1‑146 (MQ=255)
gCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGatat < 2:3574404/148‑1 (MQ=255)
gCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGatat > 2:3339149/1‑148 (MQ=255)
gtgacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAg < 1:336947/142‑1 (MQ=255)
tgacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGa < 1:2563819/143‑1 (MQ=255)
tgacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGa < 1:4576388/143‑1 (MQ=255)
tgacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGa < 1:4574188/143‑1 (MQ=255)
gacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGAc < 1:3847872/144‑1 (MQ=255)
acagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACt > 1:4398392/4‑148 (MQ=255)
agATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTg < 1:4500251/147‑1 (MQ=255)
agATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTg > 2:3034639/2‑148 (MQ=255)
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|
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CTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttgg < SRR13214404.4124994/150‑12 (MQ=59)
TTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttgga > SRR13214404.3662506/1‑138 (MQ=59)
TTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttgga > SRR13214404.1863319/1‑138 (MQ=59)
TTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttgga > SRR13214404.1863408/1‑138 (MQ=59)
TATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatat < SRR13214404.3932149/150‑16 (MQ=59)
ATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatc > SRR13214404.2646744/1‑134 (MQ=57)
ATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatc < SRR13214404.3531910/150‑17 (MQ=57)
TTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatca < SRR13214404.3162589/150‑18 (MQ=54)
TTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatca > SRR13214404.833618/1‑133 (MQ=54)
AGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacag > SRR13214404.117161/1‑130 (MQ=51)
GTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacaga < SRR13214404.1809112/150‑22 (MQ=49)
GTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacaga > SRR13214404.4659631/1‑129 (MQ=49)
GTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacaga < SRR13214404.3885925/150‑22 (MQ=49)
TTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatc < SRR13214404.92682/150‑25 (MQ=42)
TTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatc > SRR13214404.1580448/1‑126 (MQ=42)
TTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatc < SRR13214404.4168752/150‑25 (MQ=42)
TGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatca < SRR13214404.2982126/150‑26 (MQ=40)
TGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatca < SRR13214404.2694375/150‑26 (MQ=40)
GGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcat < SRR13214404.85712/150‑27 (MQ=39)
GGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcatt < SRR13214404.3996772/150‑28 (MQ=37)
GGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcatt < SRR13214404.3787874/150‑28 (MQ=37)
CGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattga < SRR13214404.2158482/150‑30 (MQ=34)
CGAAACGCACGTGGATGGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattga < SRR13214404.1328060/150‑30 (MQ=28)
GAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaa < SRR13214404.4553486/150‑31 (MQ=32)
GAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaa > SRR13214404.626388/1‑120 (MQ=32)
AAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaac < SRR13214404.4030853/150‑32 (MQ=31)
AAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaac > SRR13214404.1935212/1‑119 (MQ=31)
AAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaac < SRR13214404.569668/150‑32 (MQ=31)
AAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaac < SRR13214404.569944/150‑32 (MQ=31)
AACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaact < SRR13214404.490859/150‑33 (MQ=29)
ACGTGGATTGTTCCTCCGCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttc < SRR13214404.4524388/150‑38 (MQ=60)
CGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttct < SRR13214404.2719791/150‑39 (MQ=19)
CGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttct < SRR13214404.2090122/150‑39 (MQ=19)
CGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttct > SRR13214404.1351462/1‑112 (MQ=19)
CGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttct > SRR13214404.1043034/1‑112 (MQ=19)
CGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttct > SRR13214404.1043402/1‑112 (MQ=19)
GTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttcta > SRR13214404.2759406/1‑111 (MQ=18)
GTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttcta > SRR13214404.2758128/1‑111 (MQ=18)
TGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctac < SRR13214404.2206842/150‑41 (MQ=16)
TGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctac > SRR13214404.3759863/1‑110 (MQ=16)
TGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctac < SRR13214404.2207930/150‑41 (MQ=16)
TGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctac < SRR13214404.2208153/150‑41 (MQ=16)
GGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctacc < SRR13214404.3558369/150‑42 (MQ=14)
GGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctacc < SRR13214404.2849514/150‑42 (MQ=14)
GGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctacc < SRR13214404.283766/150‑42 (MQ=14)
GGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctacc > SRR13214404.4255615/1‑109 (MQ=14)
GGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctacc < SRR13214404.2849590/150‑42 (MQ=14)
GGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctacc > SRR13214404.2986410/1‑109 (MQ=14)
GGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctacc < SRR13214404.282886/150‑42 (MQ=14)
GATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccc > SRR13214404.1084614/1‑108 (MQ=13)
GATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccc < SRR13214404.3294759/150‑43 (MQ=13)
GATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccc > SRR13214404.1084576/1‑108 (MQ=13)
GATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccc > SRR13214404.918213/1‑108 (MQ=13)
GATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccc < SRR13214404.1790118/150‑43 (MQ=13)
ATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccct < SRR13214404.126032/150‑44 (MQ=8)
TTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctg < SRR13214404.10362/150‑45 (MQ=7)
TGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctga < SRR13214404.3164699/150‑46 (MQ=5)
GTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgag < SRR13214404.2281356/150‑47 (MQ=5)
GTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgag < SRR13214404.3827143/150‑47 (MQ=5)
TCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagat < SRR13214404.1299142/150‑49 (MQ=3)
CCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagatt > SRR13214404.3898717/1‑101 (MQ=2)
CTCCTCAAATTCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagatta < SRR13214404.3768649/150‑51 (MQ=32)
CTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagatta < SRR13214404.3770217/150‑51 (MQ=0)
CTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagatta < SRR13214404.2486840/150‑51 (MQ=0)
CCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaa > SRR13214404.870826/1‑98 (MQ=0)
CCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaa > SRR13214404.870867/1‑98 (MQ=0)
CCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaa > SRR13214404.871621/1‑98 (MQ=0)
CCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaa > SRR13214404.4459198/1‑98 (MQ=0)
CTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaa > SRR13214404.2131169/1‑97 (MQ=2)
CTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaa > SRR13214404.145499/1‑97 (MQ=2)
CTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaa > SRR13214404.145588/1‑97 (MQ=2)
CTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaa < SRR13214404.3635879/150‑54 (MQ=2)
CTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaa < SRR13214404.3641490/150‑54 (MQ=2)
CTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaa > SRR13214404.2130802/1‑97 (MQ=2)
CAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaaat < SRR13214404.571428/150‑56 (MQ=44)
CAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaaat > SRR13214404.561319/1‑95 (MQ=44)
AAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATC > SRR13214404.85555/1‑150 (MQ=29)
AATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCG > SRR13214404.1978727/1‑150 (MQ=28)
ATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaaatcga < SRR13214404.2929110/150‑59 (MQ=38)
TGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaaatcgat > SRR13214404.4252255/1‑91 (MQ=37)
GCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAatcttttttggatatcacagaatcattgaacttcttctaccctgagattaaaaatcgata > SRR13214404.4456895/1‑90 (MQ=35)
CAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATAT > SRR13214404.2154098/1‑150 (MQ=23)
AGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATG < SRR13214404.3338621/150‑1 (MQ=21)
GCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGA < SRR13214404.148713/150‑1 (MQ=20)
GCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGA > SRR13214404.3003527/1‑150 (MQ=20)
CTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAA < SRR13214404.3854113/150‑1 (MQ=19)
CTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAA < SRR13214404.2589513/150‑1 (MQ=19)
TCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAAC < SRR13214404.2879299/150‑1 (MQ=18)
TCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAAC > SRR13214404.2028030/1‑150 (MQ=18)
TCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAAC > SRR13214404.2069682/1‑150 (MQ=18)
TCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAAC > SRR13214404.2070312/1‑150 (MQ=18)
TCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAAC > SRR13214404.2149108/1‑150 (MQ=18)
AAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAG < SRR13214404.395765/150‑1 (MQ=28)
ATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAAC < SRR13214404.1432841/150‑1 (MQ=41)
ATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAAC > SRR13214404.1493490/1‑150 (MQ=41)
TATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACG < SRR13214404.106199/150‑1 (MQ=42)
TATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACG > SRR13214404.3855537/1‑150 (MQ=42)
TATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACG < SRR13214404.2155668/150‑1 (MQ=42)
TATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACG > SRR13214404.22363/1‑150 (MQ=42)
TATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACG > SRR13214404.22451/1‑150 (MQ=42)
ATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGT > SRR13214404.4107206/1‑150 (MQ=44)
ATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGT < SRR13214404.1021168/150‑1 (MQ=44)
CTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAG > SRR13214404.1073492/1‑150 (MQ=48)
TGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGA > SRR13214404.1682083/1‑150 (MQ=50)
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CACATACAGACATTCATGGACAGCGAACTGAACCAACTTTGCAATATGTCGCTTTCATTGAATCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCACAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATAGAAGTTACGGATATTCTAACCAATTATACATCAATTGATGAAATTCATTCTTACTCGATTGATGAGTCGTTTCTTGACGTAACAGAATCACTCAATTTCTTTTATCCTGAGATTAAAAATCGTTATGAACAAATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGA > CP043523/1884611‑1884901
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |