Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
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393 |
530.9 |
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91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 571 total aligned reads displayed.
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|
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CAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTT > SRR13214404.3348249/1‑150 (MQ=60)
CAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTT < SRR13214404.440414/150‑1 (MQ=60)
AATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTG > SRR13214404.4368136/1‑150 (MQ=60)
AATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTG > SRR13214404.4611597/1‑150 (MQ=60)
AATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTG < SRR13214404.1577098/150‑1 (MQ=60)
TCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAG > SRR13214404.787300/1‑150 (MQ=60)
CAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGT < SRR13214404.839539/150‑1 (MQ=60)
AAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTA > SRR13214404.4741568/1‑150 (MQ=60)
AACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTAT < SRR13214404.1782283/150‑1 (MQ=60)
AACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTAT > SRR13214404.4431784/1‑150 (MQ=60)
ACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATT > SRR13214404.3978685/1‑150 (MQ=60)
ACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATT > SRR13214404.212623/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA > SRR13214404.4547594/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA > SRR13214404.1010220/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA > SRR13214404.2971562/1‑150 (MQ=60)
ACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAA > SRR13214404.2865425/1‑150 (MQ=60)
ACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAA < SRR13214404.2380288/150‑1 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC < SRR13214404.1015883/150‑1 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.1674874/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.991166/1‑150 (MQ=60)
AGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTT < SRR13214404.1663612/150‑1 (MQ=60)
GCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTA < SRR13214404.2895344/150‑1 (MQ=60)
CATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAACCCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGA < SRR13214404.1339531/150‑1 (MQ=60)
CATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGA < SRR13214404.1816329/150‑1 (MQ=60)
ATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAG > SRR13214404.4042956/1‑150 (MQ=60)
ATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAG < SRR13214404.2244138/150‑1 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTC > SRR13214404.459798/1‑150 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATC > SRR13214404.450162/1‑150 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATC < SRR13214404.1939885/150‑1 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATC < SRR13214404.4654048/150‑1 (MQ=60)
TAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTT < SRR13214404.3517496/150‑1 (MQ=60)
TAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTT > SRR13214404.3747450/1‑150 (MQ=60)
TAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTT > SRR13214404.3745950/1‑150 (MQ=60)
AGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTT > SRR13214404.2730963/1‑150 (MQ=60)
AGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTT < SRR13214404.2100549/150‑1 (MQ=60)
AGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTT < SRR13214404.3852807/150‑1 (MQ=60)
TAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGAGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTAT < SRR13214404.1004544/150‑1 (MQ=60)
AAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATT < SRR13214404.442324/150‑1 (MQ=60)
AAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATT > SRR13214404.1267686/1‑150 (MQ=60)
AATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTG < SRR13214404.908651/150‑1 (MQ=60)
ATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGG < SRR13214404.3120997/150‑1 (MQ=60)
ATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGG > SRR13214404.3062407/1‑150 (MQ=60)
ATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGG < SRR13214404.2398669/150‑1 (MQ=60)
GGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCA > SRR13214404.486574/1‑150 (MQ=60)
GACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCAT > SRR13214404.1701203/1‑150 (MQ=60)
CTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTT > SRR13214404.2296015/1‑150 (MQ=60)
CTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTT < SRR13214404.2783113/150‑1 (MQ=60)
ATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTC > SRR13214404.4009087/1‑150 (MQ=60)
ATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTC > SRR13214404.4625195/1‑150 (MQ=60)
ATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTC < SRR13214404.710114/150‑1 (MQ=60)
ATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTC < SRR13214404.623270/150‑1 (MQ=60)
AATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCAT > SRR13214404.1750328/1‑150 (MQ=60)
AATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCAT > SRR13214404.1411031/1‑150 (MQ=60)
TCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTA < SRR13214404.969632/150‑1 (MQ=60)
TCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTA < SRR13214404.446696/150‑1 (MQ=60)
AAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAAC < SRR13214404.4152143/150‑1 (MQ=60)
AAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAAC > SRR13214404.1133948/1‑150 (MQ=60)
AAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAAC < SRR13214404.2223935/150‑1 (MQ=60)
AAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAAC < SRR13214404.2759342/150‑1 (MQ=60)
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AGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACG > SRR13214404.936982/1‑150 (MQ=60)
AGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACG > SRR13214404.468909/1‑150 (MQ=60)
AGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACG < SRR13214404.3380592/150‑1 (MQ=60)
GGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGA < SRR13214404.4128735/150‑1 (MQ=60)
GGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGA > SRR13214404.2447387/1‑150 (MQ=60)
GTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGAC > SRR13214404.2865984/1‑150 (MQ=60)
TCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACA < SRR13214404.3754096/150‑1 (MQ=60)
CATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAG > SRR13214404.251046/1‑150 (MQ=60)
CATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAG < SRR13214404.3520280/150‑1 (MQ=60)
ATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGT > SRR13214404.3387263/1‑150 (MQ=60)
TGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTT < SRR13214404.1519687/150‑1 (MQ=60)
TGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTT > SRR13214404.2144792/1‑150 (MQ=60)
ATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTG < SRR13214404.1900247/150‑1 (MQ=60)
ATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTG > SRR13214404.3260796/1‑150 (MQ=60)
ATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTG > SRR13214404.2535714/1‑150 (MQ=60)
TAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGG < SRR13214404.1603544/150‑1 (MQ=60)
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TAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGG > SRR13214404.2769871/1‑150 (MQ=60)
TAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGG > SRR13214404.583962/1‑150 (MQ=60)
AATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCATTGTAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTATCATTTTCATTAACGACAGGTTGGT > SRR13214404.3839590/1‑150 (MQ=60)
TGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCG < SRR13214404.3466492/150‑1 (MQ=60)
GAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGC > SRR13214404.3421530/1‑150 (MQ=60)
GAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGC > SRR13214404.1195481/1‑150 (MQ=60)
AATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCG < SRR13214404.1222352/150‑1 (MQ=60)
ATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.848598/150‑1 (MQ=60)
ATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.3485915/150‑1 (MQ=60)
CACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGTAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAA > SRR13214404.566420/1‑150 (MQ=60)
CACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAA > SRR13214404.2423551/1‑150 (MQ=60)
ACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT > SRR13214404.110598/1‑150 (MQ=60)
ACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT > SRR13214404.2572745/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATT > SRR13214404.2799039/1‑150 (MQ=60)
CCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTA > SRR13214404.3161361/1‑150 (MQ=60)
TTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA < SRR13214404.1928638/150‑1 (MQ=60)
TTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA < SRR13214404.2345605/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATT < SRR13214404.4086136/150‑1 (MQ=60)
TTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTT < SRR13214404.3925948/150‑1 (MQ=60)
TGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTT < SRR13214404.1361197/150‑1 (MQ=60)
GTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTC < SRR13214404.3632022/150‑1 (MQ=60)
GTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTC > SRR13214404.86986/1‑150 (MQ=60)
TGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCA < SRR13214404.1625905/150‑1 (MQ=60)
TGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCA < SRR13214404.4355923/150‑1 (MQ=60)
TGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCA > SRR13214404.544970/1‑150 (MQ=60)
TGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCA > SRR13214404.380244/1‑150 (MQ=60)
GCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATC < SRR13214404.527775/150‑1 (MQ=60)
GCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTCTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATC < SRR13214404.681012/150‑1 (MQ=60)
GCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATC < SRR13214404.793060/150‑1 (MQ=60)
CATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCG < SRR13214404.2854767/150‑1 (MQ=60)
ATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGT > SRR13214404.3592403/1‑150 (MQ=60)
TTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTA < SRR13214404.3742980/150‑1 (MQ=60)
TTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTAA > SRR13214404.1932519/1‑150 (MQ=60)
TTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTGA < SRR13214404.3881127/150‑1 (MQ=60)
TGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTAAA < SRR13214404.4508440/150‑1 (MQ=60)
TGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTGAA < SRR13214404.3689046/150‑1 (MQ=60)
GCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTAAAA < SRR13214404.2464473/150‑1 (MQ=60)
GCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTGAAA < SRR13214404.1314306/150‑1 (MQ=60)
CACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTAAAATT < SRR13214404.2363885/150‑1 (MQ=60)
CACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTGAAATT < SRR13214404.503668/150‑1 (MQ=60)
CTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGGAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTAAAATTGA > SRR13214404.1547935/1‑150 (MQ=60)
CTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTAAAATTGA < SRR13214404.653009/150‑1 (MQ=60)
ATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTGAAATTGAT > SRR13214404.1426300/1‑150 (MQ=60)
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TTTGGCGAATCTACTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGTGAAATTGAT > CP043523/1706982‑1707280
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |