Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 302 total aligned reads displayed.
TTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATTAATAATACCATATACCCGAATTGCTAGTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTATTAATATATCT > CP043523/1848473‑1848771
|
TTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGG < SRR13214404.4275981/150‑1 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCA > SRR13214404.3640290/1‑150 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCA > SRR13214404.306613/1‑150 (MQ=60)
ATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAC > SRR13214404.2300726/1‑150 (MQ=60)
ATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAC < SRR13214404.444727/150‑1 (MQ=60)
ATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAC > SRR13214404.3625822/1‑150 (MQ=60)
TATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACT > SRR13214404.3771312/1‑150 (MQ=60)
TATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACT > SRR13214404.11779/1‑150 (MQ=60)
ATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTT > SRR13214404.3107037/1‑150 (MQ=60)
TCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTT > SRR13214404.2859358/1‑150 (MQ=60)
CACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTA < SRR13214404.2896837/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAT > SRR13214404.1307795/1‑150 (MQ=60)
CAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAT < SRR13214404.1596717/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAT < SRR13214404.1596273/150‑1 (MQ=60)
AAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATA < SRR13214404.266570/150‑1 (MQ=60)
AAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATA < SRR13214404.2086297/150‑1 (MQ=60)
AAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATA < SRR13214404.1797142/150‑1 (MQ=60)
GCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGA < SRR13214404.576328/150‑1 (MQ=60)
GCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGA < SRR13214404.4034584/150‑1 (MQ=60)
GCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGA > SRR13214404.1434112/1‑150 (MQ=60)
CATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTGAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAG < SRR13214404.3865227/150‑1 (MQ=60)
CATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGTTATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACACACACTTCCCTTTGCGTAAATTAGGGCCACTCTTTTATAGA < SRR13214404.1092827/150‑1 (MQ=52)
CATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAG < SRR13214404.2350984/150‑1 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGT > SRR13214404.3002503/1‑150 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGT < SRR13214404.2924622/150‑1 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGT < SRR13214404.5697/150‑1 (MQ=60)
TAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTG > SRR13214404.3110089/1‑150 (MQ=60)
TAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTG < SRR13214404.3389099/150‑1 (MQ=60)
TAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTGAATATAGAGTG > SRR13214404.4033694/1‑150 (MQ=60)
AATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGG < SRR13214404.3533535/150‑1 (MQ=60)
AATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGG > SRR13214404.1351859/1‑150 (MQ=60)
ATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGT < SRR13214404.3859622/150‑1 (MQ=60)
ATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGT < SRR13214404.3860790/150‑1 (MQ=60)
TGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTT > SRR13214404.1694640/1‑150 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTT > SRR13214404.3607911/1‑150 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTT > SRR13214404.4648311/1‑150 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTT < SRR13214404.2575695/150‑1 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTT > SRR13214404.3547503/1‑150 (MQ=60)
TATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTT < SRR13214404.2464649/150‑1 (MQ=60)
TCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTT > SRR13214404.4576783/1‑150 (MQ=60)
TCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTT < SRR13214404.1026206/150‑1 (MQ=60)
CTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTA > SRR13214404.3487698/1‑150 (MQ=60)
TGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAA < SRR13214404.2634780/150‑1 (MQ=60)
AAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATG < SRR13214404.2856164/150‑1 (MQ=60)
AAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGT < SRR13214404.529537/150‑1 (MQ=60)
AAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGT < SRR13214404.529772/150‑1 (MQ=60)
AATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTT < SRR13214404.4451266/150‑1 (MQ=60)
ATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTT > SRR13214404.2952641/1‑150 (MQ=60)
ATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTT < SRR13214404.4129011/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGCGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTA < SRR13214404.1038088/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTA < SRR13214404.4680046/150‑1 (MQ=60)
CGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAT < SRR13214404.2531094/150‑1 (MQ=60)
CGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAT > SRR13214404.3704394/1‑150 (MQ=60)
GTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATT < SRR13214404.908830/150‑1 (MQ=60)
GTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATT < SRR13214404.907956/150‑1 (MQ=60)
GTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATT < SRR13214404.2265167/150‑1 (MQ=60)
TGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTA < SRR13214404.4057598/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAA < SRR13214404.2481811/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAA > SRR13214404.3345153/1‑150 (MQ=60)
AAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATT < SRR13214404.4174146/150‑1 (MQ=60)
AAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATT > SRR13214404.763461/1‑150 (MQ=60)
AAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTA > SRR13214404.2040769/1‑150 (MQ=60)
AAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTA > SRR13214404.3547628/1‑150 (MQ=60)
AACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAA < SRR13214404.637370/150‑1 (MQ=60)
CTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAAT > SRR13214404.2066972/1‑150 (MQ=60)
TGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATT < SRR13214404.687566/150‑1 (MQ=60)
GGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTA < SRR13214404.561134/150‑1 (MQ=60)
GGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTA < SRR13214404.1994711/150‑1 (MQ=60)
GAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAA > SRR13214404.463940/1‑150 (MQ=60)
AGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAAT > SRR13214404.853647/1‑150 (MQ=60)
AGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAAT > SRR13214404.532769/1‑150 (MQ=60)
GTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATA > SRR13214404.298388/1‑150 (MQ=60)
GTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATA < SRR13214404.4641172/150‑1 (MQ=60)
CATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATT < SRR13214404.15845/150‑1 (MQ=60)
ATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTT < SRR13214404.2270325/150‑1 (MQ=60)
ATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTT > SRR13214404.38423/1‑150 (MQ=60)
ATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTT > SRR13214404.2441562/1‑150 (MQ=60)
ATGACTACATTTTTTTTATAGTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACCCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGTGCACTTTATTATATAGTGGTTTGTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTT < SRR13214404.670962/150‑1 (MQ=60)
TGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTA > SRR13214404.3783037/1‑150 (MQ=60)
TGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTA > SRR13214404.3782768/1‑150 (MQ=60)
ACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAA > SRR13214404.4436182/1‑150 (MQ=60)
ACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAA > SRR13214404.4436033/1‑150 (MQ=60)
CTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAA > SRR13214404.1836102/1‑150 (MQ=60)
CTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTGTAATGTTTTTTAAATTACATTAATATTTATAA > SRR13214404.1234999/1‑150 (MQ=60)
TTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAG > SRR13214404.1722490/1‑150 (MQ=60)
TCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAGA < SRR13214404.2797777/150‑1 (MQ=60)
TCAGTTGTTTTATAATCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATAATTAACCAGCAAGAGGAAACTCACACTACCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAGA < SRR13214404.4478645/150‑1 (MQ=60)
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CAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAGAT > SRR13214404.1961257/1‑150 (MQ=60)
GTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgattt < SRR13214404.1428262/150‑6 (MQ=60)
TTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgattta > SRR13214404.4268609/1‑144 (MQ=60)
TTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgattta > SRR13214404.1614051/1‑144 (MQ=60)
TTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgattta > SRR13214404.4269482/1‑144 (MQ=60)
TTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTACTAATTAAAATTAATATTTAAAAgattta > SRR13214404.1616595/1‑144 (MQ=60)
TTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttata > SRR13214404.2114925/1‑142 (MQ=60)
TTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatat < SRR13214404.1291429/150‑10 (MQ=60)
TTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatata < SRR13214404.1775604/150‑11 (MQ=60)
TTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataa < SRR13214404.2449873/150‑12 (MQ=60)
TTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataa > SRR13214404.1545878/1‑139 (MQ=60)
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TTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataa < SRR13214404.2606528/150‑12 (MQ=60)
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ATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaa < SRR13214404.314857/150‑14 (MQ=60)
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ATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaa < SRR13214404.4200881/150‑14 (MQ=60)
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AGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatg < SRR13214404.3465964/150‑59 (MQ=60)
AGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatg < SRR13214404.1070818/150‑59 (MQ=60)
GAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgt < SRR13214404.2383863/150‑60 (MQ=60)
GAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttca < SRR13214404.825547/150‑63 (MQ=60)
AAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcat < SRR13214404.1171620/150‑64 (MQ=60)
ACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatag > SRR13214404.3031577/1‑85 (MQ=60)
ACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatag > SRR13214404.3036928/1‑85 (MQ=60)
TCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagat < SRR13214404.2301973/150‑68 (MQ=60)
CACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagatt > SRR13214404.2342789/1‑82 (MQ=60)
CACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagatt < SRR13214404.1752177/150‑69 (MQ=60)
ACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaag > SRR13214404.3514714/1‑79 (MQ=60)
CTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaaga > SRR13214404.2425371/1‑78 (MQ=60)
TTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaa < SRR13214404.2993594/150‑74 (MQ=60)
TCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagctgtttttggtgcatgttcatagattaagaag < SRR13214404.4712187/150‑75 (MQ=60)
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TCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaag < SRR13214404.825341/150‑75 (MQ=60)
TCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaag < SRR13214404.3755520/150‑75 (MQ=60)
CCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagt < SRR13214404.1000636/150‑76 (MQ=60)
CCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagt > SRR13214404.3154283/1‑75 (MQ=60)
CC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagtt > SRR13214404.1851155/1‑74 (MQ=60)
ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaa > SRR13214404.1665508/1‑72 (MQ=60)
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TTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaat > SRR13214404.2761973/1‑71 (MQ=60)
TCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaata < SRR13214404.2865076/150‑81 (MQ=60)
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AATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaatat > SRR13214404.4306693/1‑69 (MQ=60)
ATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaatatt < SRR13214404.286438/150‑83 (MQ=60)
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GGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaatatttaaaacata > SRR13214404.3274221/1‑59 (MQ=60)
GGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaatatttaaaacatac < SRR13214404.4021195/150‑93 (MQ=60)
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GGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaatatttaaaacatac > SRR13214404.53821/1‑58 (MQ=60)
GCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTGTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaatatttaaaacataca < SRR13214404.2014028/150‑94 (MQ=60)
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TTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATTAATAATACCATATACCCGAATTGCTAGTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTATTAATATATCT > CP043523/1848473‑1848771
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |