Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,386,607 |
A→G |
pseudogene (969/1082 nt) |
CXP41_RS07340 → |
ABC transporter ATP‑binding protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,386,607 | 0 | A | G | 99.6%
| 864.5
/ ‑5.8
| 257 | pseudogene (969/1082 nt) | CXP41_RS07340 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (126/129); minor base T (0/1); total (126/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
CATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAATGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCC > NZ_CP025268/1386472‑1386742
|
cATCGTGATGGGCATACGACCGGAAGATATTCATCAGGACGCGCAAGAGGAAACTAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAGCCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 2:2865133/140‑1 (MQ=255)
cATCGTGATGGGAATGCGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 1:1930158/140‑1 (MQ=255)
cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAACATAACATTTCCGCCGAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 2:2480136/140‑1 (MQ=255)
cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 2:837317/140‑1 (MQ=255)
cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 1:3556169/140‑1 (MQ=255)
cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 2:114735/140‑1 (MQ=255)
cATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 1:481456/140‑1 (MQ=255)
tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTCGTGGTcc > 2:219732/1‑140 (MQ=255)
tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 1:1292546/1‑140 (MQ=255)
tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 1:2308426/1‑140 (MQ=255)
tCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTcc > 2:5050455/1‑140 (MQ=255)
aTGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCt > 1:421469/1‑140 (MQ=255)
gggAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTgg < 2:3703847/140‑1 (MQ=255)
tACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGt > 2:5265340/1‑140 (MQ=255)
tACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGt > 2:5266239/1‑140 (MQ=255)
tACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGt > 1:4624005/1‑140 (MQ=255)
cGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTa < 1:2397787/140‑1 (MQ=255)
gACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTaa > 1:2578133/1‑140 (MQ=255)
ccGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAAt < 1:66914/140‑1 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGTTGCGTTAAATGAt > 1:182750/1‑140 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 2:1357820/1‑140 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 1:4083938/1‑140 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 2:2754796/1‑140 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 1:4848563/1‑140 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 1:3191166/1‑140 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAt > 1:3084223/1‑140 (MQ=255)
gAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGGTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTGAAATGAt > 1:1267307/1‑140 (MQ=255)
ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg < 2:4176305/140‑1 (MQ=255)
ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg < 1:3654561/140‑1 (MQ=255)
ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg < 1:1901986/140‑1 (MQ=255)
ttCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATg < 1:4025033/140‑1 (MQ=255)
ccGGAGGCGCAAGAGGAAAATACCATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAAGTTATGCTCTACACCCCGGTTGGGGGCACGAGATAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGTTTATCATGCAGga < 2:794574/140‑1 (MQ=255)
ccGGACGCGCAAGAGGAACATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGCATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTTGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 2:4815323/140‑1 (MQ=255)
ccGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 1:523333/140‑1 (MQ=255)
ccGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 1:2941601/140‑1 (MQ=255)
ccGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGga < 2:500217/140‑1 (MQ=255)
gACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt > 2:225216/1‑103 (MQ=255)
gACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGt < 1:225258/103‑1 (MQ=255)
gACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGaa > 1:4470340/1‑140 (MQ=255)
caCGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCCCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTAAACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTCAGCTAAATGATTATCATGCAGGAGaa > 2:170956/2‑140 (MQ=255)
cAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCATAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATCTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATc < 2:3530018/140‑1 (MQ=255)
cAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTTGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATc < 2:759562/140‑1 (MQ=255)
cAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATc < 1:5009727/140‑1 (MQ=255)
ggAAACTAACATTTCCGCCCAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTCATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTACTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTAt < 2:4691344/140‑1 (MQ=255)
gAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTAtt < 2:3959839/140‑1 (MQ=255)
aaTAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGGTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCAt > 1:121326/1‑140 (MQ=255)
cATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGa > 1:3320979/1‑140 (MQ=255)
tttCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGata > 2:4118763/1‑140 (MQ=255)
tttCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGata > 1:3402186/1‑140 (MQ=255)
gCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCttt > 1:453519/1‑140 (MQ=255)
aCCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGaa > 2:1178982/1‑140 (MQ=255)
cGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAAc > 1:813026/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGa > 2:525446/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGa > 2:36489/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGa < 1:4653359/140‑1 (MQ=255)
tGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGa > 1:3419617/1‑140 (MQ=255)
tATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAAt < 1:2864816/140‑1 (MQ=255)
tATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAAt < 1:565170/140‑1 (MQ=255)
aTGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAAtt > 1:211086/1‑140 (MQ=255)
gCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCg < 2:381735/140‑1 (MQ=255)
tctACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCGCTATTCATTTTGATATGACGAAATGTGATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCt < 2:3627304/140‑1 (MQ=255)
ctACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTa > 2:691064/1‑140 (MQ=255)
ctACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTa < 2:2807732/140‑1 (MQ=255)
acacCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTaaa < 1:4385796/140‑1 (MQ=255)
acacCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTaaa < 1:2070840/140‑1 (MQ=255)
ccacGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATAc < 1:4976842/140‑1 (MQ=255)
caacGGTTGGGGGAACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATAATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATAc < 2:4317989/138‑1 (MQ=255)
cacGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGAGTAGCATGCAGGAGAAAATATCACGATTCATGTTGATATGACGAAATTTAATTTCTTTGATGCAAAAACGGAAATAGCAATTCGCAAAATACa > 2:4457526/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAgg > 1:4441546/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCGGGTGCGTCAAAGGATTATCATGCAGGAGACAATATCTCTATTCAGTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAAGAGCAATTGGCTAAATACAgg > 2:3248449/1‑140 (MQ=255)
ggTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggg > 1:3008729/1‑140 (MQ=255)
ggTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggg > 2:1102699/1‑140 (MQ=255)
ttGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggggg > 2:2386493/1‑140 (MQ=255)
ttGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggggg > 2:497885/1‑140 (MQ=255)
ttGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggggg > 1:3784417/1‑140 (MQ=255)
ttGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggggg > 1:944655/1‑140 (MQ=255)
ttGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAggggg > 1:1356181/1‑140 (MQ=255)
tGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGa < 1:1032808/140‑1 (MQ=255)
gggggCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGaa > 2:254017/1‑140 (MQ=255)
gggggCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGaa > 1:3968708/1‑140 (MQ=255)
gggggCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGaa < 1:2650800/140‑1 (MQ=255)
ccgggCACGACCCAGTGGTCCGTGCTGGTGCCTTCAATGACTATCATGCAGGTCCACATATCACTATTCATTTTGATATGACCAAATGCCATTTCTCTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGaa < 2:4392369/138‑1 (MQ=255)
ggCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGc < 2:1292546/140‑1 (MQ=255)
gCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCa < 1:2721472/140‑1 (MQ=255)
cACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCAt < 1:5267737/140‑1 (MQ=255)
cACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCAt < 1:787613/140‑1 (MQ=255)
cACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCACGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCAt < 1:219732/140‑1 (MQ=255)
aCGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCAtt > 1:15085/1‑140 (MQ=255)
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GCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATT < SRR14920189.527296/151‑1 (MQ=60)
CAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTT < SRR14920189.5022283/151‑1 (MQ=60)
CAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTT < SRR14920189.5022203/151‑1 (MQ=60)
GAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGA > SRR14920189.3328944/1‑151 (MQ=60)
GGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATA < SRR14920189.3926489/151‑1 (MQ=60)
GGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATA > SRR14920189.3410317/1‑151 (MQ=60)
GGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATA > SRR14920189.3410686/1‑151 (MQ=60)
AAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGA > SRR14920189.3325692/1‑151 (MQ=60)
CCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTC < SRR14920189.1917253/151‑1 (MQ=60)
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AAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTT > SRR14920189.454697/1‑151 (MQ=60)
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AATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTG > SRR14920189.2325178/1‑151 (MQ=60)
AATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTG > SRR14920189.1286178/1‑151 (MQ=60)
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GCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAAC > SRR14920189.814936/1‑151 (MQ=60)
GCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAAC > SRR14920189.815008/1‑151 (MQ=60)
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AATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAA > SRR14920189.4218279/1‑151 (MQ=60)
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GAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTA > SRR14920189.2641952/1‑151 (MQ=60)
GAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTA > SRR14920189.3014396/1‑151 (MQ=60)
TTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGCTATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAAT > SRR14920189.4801447/1‑151 (MQ=60)
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TATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATAC < SRR14920189.3916892/151‑1 (MQ=60)
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GCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGG > SRR14920189.4452530/1‑151 (MQ=60)
GCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGAGATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGG > SRR14920189.4452758/1‑151 (MQ=60)
CTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGG > SRR14920189.3015854/1‑151 (MQ=60)
TCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGG < SRR14920189.64825/151‑1 (MQ=60)
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CACGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCACGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGAT < SRR14920189.220351/151‑1 (MQ=60)
CGAGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAA > SRR14920189.4638704/1‑151 (MQ=60)
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AGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATA > SRR14920189.875243/1‑151 (MQ=60)
AGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATA > SRR14920189.4612988/1‑151 (MQ=60)
AGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATA > SRR14920189.4613090/1‑151 (MQ=60)
AGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATA > SRR14920189.242844/1‑151 (MQ=60)
AGTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATA > SRR14920189.4623893/1‑151 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC < SRR14920189.2675248/151‑1 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC < SRR14920189.816347/151‑1 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC > SRR14920189.4376887/1‑151 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC < SRR14920189.1404342/151‑1 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC < SRR14920189.4138615/151‑1 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC < SRR14920189.3882271/151‑1 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC < SRR14920189.522449/151‑1 (MQ=60)
GTTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATAC < SRR14920189.5104573/151‑1 (MQ=60)
TTAGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATACA > SRR14920189.2845887/1‑151 (MQ=60)
AGTGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATACAAG > SRR14920189.3524209/1‑151 (MQ=60)
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AGTTTGCATAAGCCCATCGTGATGGGAATACGACCGGAAGATATTCATCCGGACGCGCAAGAGGAAAATAACATTTCCGCCAAAATTAGCGTGGCAGAATTAACCGGTGCGGAATTTATGCTCTACACCACGGTTGGGGGCACGAGTTAATGGTCCGTGCTGGTGCGTTAAATGATTATCATGCAGGAGAAAATATCACTATTCATTTTGATATGACGAAATGTCATTTCTTTGATGCAGAAACGGAAATAGCAATTCGCTAAATACAGGGGGAAGGCATTCCCCCAGGATAATACAAG > NZ_CP025268/1386458‑1386756
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |