Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,431,107 |
A→G |
*67* (TAA→TAG) |
CXP41_RS07615 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,431,107 | 0 | A | G | 100.0%
| 1112.6
/ NA
| 325 | *67* (TAA→TAG) | CXP41_RS07615 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (110/215); total (110/215) |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAATTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACTTCGCGG > NZ_CP025268/1430970‑1431242
|
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tGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGt < 2:4927978/140‑1 (MQ=255)
gggTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTa < 2:2777629/140‑1 (MQ=255)
gggTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTa < 2:3266694/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAAt < 1:1022119/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAAt < 2:1581419/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAAt > 1:1218896/1‑140 (MQ=255)
gTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAAt < 2:3684108/140‑1 (MQ=255)
gTGCCGTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TGGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGAGCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAAt > 2:3474411/1‑140 (MQ=255)
gcctttgcctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTa < 1:4364967/140‑1 (MQ=255)
ctttgcctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACg > 1:2376090/1‑140 (MQ=255)
ttgcctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTa < 2:3604518/140‑1 (MQ=255)
ttgcctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTa < 1:5355957/140‑1 (MQ=255)
ttgcctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTa < 2:5202151/140‑1 (MQ=255)
ttgcatttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTa < 1:3083768/140‑1 (MQ=255)
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gcctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTaca < 1:3371442/140‑1 (MQ=255)
cctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTaca < 1:4115190/140‑1 (MQ=255)
ctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACAct < 2:4810531/140‑1 (MQ=255)
ctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACAct < 2:215493/140‑1 (MQ=255)
ctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACAct < 2:3891121/140‑1 (MQ=255)
ctttATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGACGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACAct < 2:2686045/140‑1 (MQ=255)
ctttATCTCTGACAGAGAAAAATGACTATTTAGACACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACAct < 1:2052549/140‑1 (MQ=255)
ctgtATCTCTGACTGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGGGCTTTGTACTGCATGACCAGTATTTGCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTCCGTACAct < 2:3634111/137‑1 (MQ=255)
tATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACATACACTCTg < 2:647253/140‑1 (MQ=255)
ctctGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTa < 2:3145449/140‑1 (MQ=255)
ctctGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTa < 2:1367763/140‑1 (MQ=255)
tctGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTAc < 1:4759152/140‑1 (MQ=255)
gACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACaga > 1:5125444/1‑140 (MQ=255)
gACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTCTTACaga > 2:5010398/1‑140 (MQ=255)
aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACagag < 2:32964/140‑1 (MQ=255)
gagaTAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGAtg < 2:2063086/140‑1 (MQ=255)
agaTAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGAtgt > 1:1752236/1‑140 (MQ=255)
aaaTGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATg < 2:1694095/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATg < 1:4960893/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATg < 2:72798/140‑1 (MQ=255)
atatTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCt > 1:293075/1‑140 (MQ=255)
atgtAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACGGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGGGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCGGTTACAGAGATGTGATGGTGTCttt > 2:4253344/4‑140 (MQ=255)
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aGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGt < 1:4863675/95‑1 (MQ=255)
aTCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTaca > 1:4006873/1‑99 (MQ=255)
aTCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTaca < 2:4006873/99‑1 (MQ=255)
tCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCgatg < 2:1403904/140‑1 (MQ=255)
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ttga‑ttgaGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTcc > 1:5246081/1‑140 (MQ=255)
ga‑ttgaGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACGGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTGTAATTAAATCGATGATGCTCCTg > 2:4306187/1‑140 (MQ=255)
a‑ttgaGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTgg > 2:1129642/1‑140 (MQ=255)
ttgaGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGga < 2:5352976/140‑1 (MQ=255)
aGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGaa < 2:3975974/140‑1 (MQ=255)
gcgcGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGaaa > 1:3182875/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGCAGaaa > 2:1685703/1‑140 (MQ=255)
gATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCa < 1:1059042/140‑1 (MQ=255)
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aGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGt < 1:2236473/140‑1 (MQ=255)
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aTCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATc < 2:4728304/140‑1 (MQ=255)
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tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 1:1288253/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 1:3423956/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 1:3948790/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 2:293075/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 1:2131211/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 1:1901981/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 1:4560044/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 2:1792893/140‑1 (MQ=255)
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tttGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCt < 1:1533853/140‑1 (MQ=255)
tttGCACCGGATGAGCTGTATTTTCAGGTGCACTGTGTGTCGTTGTTAATTACGTACACTCTGCTACAGAGATATGATGATGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCCTTGCGTGGCCTCGTAATCGcg < 2:4429703/140‑2 (MQ=255)
tGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCtat < 1:306904/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACCCTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 1:2886696/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACCCTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 1:3023894/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGCTGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 1:391960/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 2:5058956/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 1:165805/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 1:2572348/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 2:102621/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 1:3267621/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 2:1939733/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 1:451022/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATc < 2:2419087/140‑1 (MQ=255)
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ATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGT > SRR14920189.3411548/1‑151 (MQ=60)
CTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGA < SRR14920189.3134424/151‑1 (MQ=60)
CTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGA > SRR14920189.4176619/1‑151 (MQ=60)
CTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGA < SRR14920189.3234956/151‑1 (MQ=60)
TCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGAT < SRR14920189.4771251/151‑1 (MQ=60)
CTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATG < SRR14920189.1531651/151‑1 (MQ=60)
CTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATG < SRR14920189.5308599/151‑1 (MQ=60)
CTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGAGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATG > SRR14920189.4896787/1‑151 (MQ=60)
TGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGG < SRR14920189.3269010/151‑1 (MQ=60)
TGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGG < SRR14920189.3563887/151‑1 (MQ=60)
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GAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGGAGTTGTTAATGACGTACGCTCGGTTACGGAGATGTGATGGTGTCT > SRR14920189.2908392/1‑151 (MQ=60)
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TATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCG > SRR14920189.3406566/1‑151 (MQ=60)
TTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGctgtctcttatacacatctccgagcccacg > SRR14920189.4017186/1‑121 (MQ=60)
TTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGctgtctcttatacacatctccgagcccacg > SRR14920189.4016733/1‑121 (MQ=60)
atgcacttttttttcaagcagaagacggcatacgagattagctgcagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATG < SRR14920189.3404902/71‑1 (MQ=60)
ACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTC < SRR14920189.4149950/151‑1 (MQ=60)
CCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAG < SRR14920189.439289/151‑1 (MQ=60)
CCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAG < SRR14920189.5096118/151‑1 (MQ=60)
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CCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAG < SRR14920189.2433067/151‑1 (MQ=60)
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GGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAA > SRR14920189.2083458/1‑151 (MQ=60)
GTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAA > SRR14920189.3190426/1‑151 (MQ=60)
TATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAA > SRR14920189.2392477/1‑151 (MQ=60)
TTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGC < SRR14920189.5191738/151‑1 (MQ=60)
GA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCAT > SRR14920189.1608346/1‑151 (MQ=60)
GA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCAT > SRR14920189.1607977/1‑151 (MQ=60)
GAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCG < SRR14920189.2938601/151‑1 (MQ=60)
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GAGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGC < SRR14920189.2032693/151‑1 (MQ=60)
GATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCT < SRR14920189.1061476/151‑1 (MQ=60)
GAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGT > SRR14920189.1030093/1‑151 (MQ=60)
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TTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTGTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATC < SRR14920189.4650428/151‑1 (MQ=60)
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GAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGC < SRR14920189.4813611/151‑1 (MQ=60)
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TCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACT > SRR14920189.4561139/1‑151 (MQ=60)
TCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACT > SRR14920189.1132458/1‑151 (MQ=60)
TTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTAT < SRR14920189.1124560/151‑1 (MQ=60)
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TTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTAT < SRR14920189.1291162/151‑1 (MQ=60)
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TGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTA < SRR14920189.968794/151‑1 (MQ=60)
TGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTA < SRR14920189.307757/151‑1 (MQ=60)
TGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTA < SRR14920189.764400/151‑1 (MQ=60)
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ACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGT < SRR14920189.317449/151‑1 (MQ=60)
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TAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACTTCGCGGTGGGTTTTTTGTT > SRR14920189.3470829/1‑151 (MQ=60)
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TTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTGACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGA‑TTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAATTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACTTCGCGGTGGGTTTTTTGTT > NZ_CP025268/1430957‑1431255
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
