Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,623,038 |
A→G |
*397* (TAA→TAG) |
ydeA → |
L‑arabinose MFS transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,623,038 | 0 | A | G | 99.4%
| 1193.1
/ NA
| 352 | *397* (TAA→TAG) | ydeA | L‑arabinose MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (157/193); minor base T (1/1); total (158/194) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
TAGGTAATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAATTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCC > NZ_CP025268/1622902‑1623174
|
aggtaATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGATCAGACGCAATAGTTGa > 1:2968912/1‑140 (MQ=255)
aTCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGc > 1:5339562/1‑140 (MQ=255)
tCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGcc > 2:4810624/1‑140 (MQ=255)
gTGAGTTTGCACTGGTTAATGTCGATGATTGGTTATGGGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGACGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCAtt < 2:729527/140‑1 (MQ=255)
tttGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGc > 1:2275978/1‑140 (MQ=255)
ttGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGcc < 2:1508760/140‑1 (MQ=255)
ttGCACTGGTAAATGTCGATGATGGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCACTCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGcc < 1:1253551/140‑1 (MQ=255)
tGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCt > 1:1527499/1‑140 (MQ=255)
aCTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCtttt > 1:1924764/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 1:4541871/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 2:5151086/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 1:2713425/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 2:1587784/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTGTTTTa > 2:533230/1‑140 (MQ=255)
ggcAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 2:2821779/3‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 1:100873/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 2:692748/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 1:2106269/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 2:2346339/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 1:1733958/1‑140 (MQ=255)
aTGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGt < 2:2238832/140‑1 (MQ=255)
tGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTa < 1:2041688/140‑1 (MQ=255)
tGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTa < 1:714801/140‑1 (MQ=255)
tGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTa < 1:4360981/140‑1 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCTTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttg > 1:3377437/1‑139 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTGGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 1:2515058/1‑140 (MQ=255)
ttGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAAt < 2:3468836/140‑1 (MQ=255)
tGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATg > 1:4063534/1‑140 (MQ=255)
tATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGAttt > 1:1613166/1‑140 (MQ=255)
aTGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGGTTTAATGATTTc > 2:3164633/1‑140 (MQ=255)
tgGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAg > 2:4545476/1‑140 (MQ=255)
gggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAgg < 2:4870062/140‑1 (MQ=255)
gggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAgg < 1:3737626/140‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGGCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTGTTAATGATTTCCAGGATg > 1:614326/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg > 1:684918/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg > 1:420710/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg > 1:2450106/1‑140 (MQ=255)
gcgGTTCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCCCTCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATCCGGGCCTTTTTTAATGCTACGTTTTAATGCTTTCCAGGCTGc > 2:3410127/1‑140 (MQ=255)
gcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGc > 1:1687780/1‑140 (MQ=255)
cgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGcc < 1:1851346/140‑1 (MQ=255)
gTGCTTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATAGTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 2:3767169/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:2644829/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:695685/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 2:1400170/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:5297575/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 2:1667915/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:4977172/140‑1 (MQ=255)
ctGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:4728278/139‑1 (MQ=255)
ccTGCTTTTGGCGGGTTAATTTGGTCAATCATTATAGTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaa < 1:2778397/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCAAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGTATGCCGTtaata > 2:2969174/1‑140 (MQ=255)
cTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATGCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaataat < 2:4461078/140‑1 (MQ=255)
tGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAAc > 2:1811608/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 1:4587423/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTCGTCAAACATTATATTTCGCCGCGGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 2:5041189/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGGCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTGCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:4028454/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGACAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTCTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAACACTAAACTGca < 2:3338945/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAACCTGca < 1:1430125/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:895011/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:1302530/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:3881341/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:3968698/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:4492640/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACAATCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:4341464/140‑1 (MQ=255)
gccttAATTTGTTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCAAGTGACACTCGAAGAACTGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcc < 2:2711436/137‑2 (MQ=255)
gTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcaca < 1:5190798/140‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcaca < 1:1778213/140‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcaca > 2:3697270/1‑140 (MQ=255)
gTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcaca < 2:1061536/140‑1 (MQ=255)
ttAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCacac < 1:1151993/140‑1 (MQ=255)
ttAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCacac < 1:3270073/140‑1 (MQ=255)
ttAATTTGGTCAATCAGTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCacac < 1:2942978/140‑1 (MQ=255)
ttGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcata < 2:2550680/140‑1 (MQ=255)
ttGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcata < 2:1960892/140‑1 (MQ=255)
ttGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcata < 2:4608386/140‑1 (MQ=255)
ttGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcata < 1:551687/140‑1 (MQ=255)
gTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGATGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGCTAACAATAAACTGCACACCcatacat > 2:4204470/1‑140 (MQ=255)
tatTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGaa < 1:2333893/140‑1 (MQ=255)
ttCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATcc < 1:936217/140‑1 (MQ=255)
tctccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATccc > 2:4106093/4‑140 (MQ=255)
tCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATccc > 2:1124336/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCTATAGTTGAAATGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 2:5247870/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 2:212294/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa < 1:2841365/140‑1 (MQ=255)
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GGCGGGTGCGTTGGTAGGTAATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAATTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAAT‑GATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAAT > NZ_CP025268/1622888‑1623188
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |