Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,037,850 |
C→T |
A246T (GCG→ACG) |
prfB ← |
peptide chain release factor 2 |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,037,850 | 0 | C | T | 99.4%
| 1235.8
/ NA
| 338 | A246T (GCG→ACG) | prfB | peptide chain release factor 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (210/124); minor base G (1/1); total (213/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
CTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGCGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACC > NZ_CP025268/3037719‑3037983
|
cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATaaa > 2:2353284/1‑140 (MQ=255)
cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATaaa > 2:4319064/1‑140 (MQ=255)
cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATaaa < 2:3496435/140‑1 (MQ=255)
cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATaaa > 1:2931708/1‑140 (MQ=255)
cTTCATGGCCTGAAGTTTGTTCTTGTGCTGAGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGACACGATCCCGGTCGGGAGGTGGGTAATACGCACCGCAGACTCGGTACGGTTAGCGTGCTTACCGCCCGCGCCGGACGTGGGATaaa > 2:4154517/1‑140 (MQ=255)
ttgCCTGATCTGTGTTCTCGTGCTGGGCACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATCCGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCa < 2:3744102/138‑1 (MQ=255)
tGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCa < 2:521781/140‑1 (MQ=255)
tGGCCTGATCGTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCa < 1:3763427/140‑1 (MQ=255)
gggCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTGCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGGACGGTTAACGTGCTGACCGTCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCa < 2:784567/139‑1 (MQ=255)
ccTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATg < 2:4943308/140‑1 (MQ=255)
tGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCGCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATgcg > 2:1182183/1‑140 (MQ=255)
tGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATgcg > 1:2825936/1‑140 (MQ=255)
gATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGCCGTTCTGGCCCGGGGTCACGATCCCGGTCGGGATCTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTACCGTGCTGACCACCCGCGCCGGCCGTGCGACAAGCGTCAATgcgc > 2:4913538/1‑140 (MQ=255)
tGTTCTTGTGCTGGGAACAGTCATTCTGGCACTGGGTCACGCTCCAGGTCGGGATGTGTGTAATACGCACCGCGGAGACGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCTGGCCGGACGTGCGATAAACGACAATGCGCAGATcc > 2:2083843/1‑140 (MQ=255)
gTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGTTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAACCGTCAATGCGCAGATccg > 2:3815428/1‑140 (MQ=255)
tgtgCTGGGAACGGTAGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGACGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTGCGGTTAACGTGCTCACTGCCCGCGCCGGACATGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCggg > 2:4722458/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGt > 2:3915878/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGt > 1:44447/1‑140 (MQ=255)
gtgCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACATCAATGCGCAGATCCGCCGGGt > 2:2947387/1‑140 (MQ=255)
gggAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGAtt > 1:5186064/1‑140 (MQ=255)
ggAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGAttt > 2:2736039/1‑140 (MQ=255)
gAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTAAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTc < 1:1554023/140‑1 (MQ=255)
cGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATCCGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGat < 2:3392140/140‑1 (MQ=255)
cGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGat < 1:1075771/140‑1 (MQ=255)
cGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGat < 1:1491725/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGata > 1:2036399/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGatatca < 1:309574/140‑1 (MQ=255)
ttCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACGGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGatataaat > 2:4190722/1‑140 (MQ=255)
cTGGCACTGGGTCACGAGCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGatatcaatat > 1:2754594/1‑140 (MQ=255)
gCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATatcat > 1:4381202/1‑140 (MQ=255)
aCTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGGTGATTTCGATATCAATatcatca > 1:4278786/1‑140 (MQ=255)
cTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATatcatcat < 1:2238944/140‑1 (MQ=255)
cTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATatcatcat < 2:5249183/140‑1 (MQ=255)
tGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATatcatcatc < 1:3956758/140‑1 (MQ=255)
tGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATatcatcatc < 2:4553105/140‑1 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa > 1:936682/1‑140 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa > 2:877037/1‑140 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa > 1:2723256/1‑140 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa > 1:371654/1‑140 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa > 1:4066950/1‑140 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa > 1:4667078/1‑140 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATAGCATCATCaa > 1:487450/1‑140 (MQ=255)
ggTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGAGAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCaa > 2:2493635/1‑140 (MQ=255)
cACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACtt < 2:4887077/140‑1 (MQ=255)
cGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTcc < 1:1211116/140‑1 (MQ=255)
cGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTcc > 1:558565/1‑140 (MQ=255)
ccGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATa > 1:600481/1‑140 (MQ=255)
cGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaa > 2:1401641/1‑140 (MQ=255)
ggTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaa > 2:2172038/1‑140 (MQ=255)
gTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaac < 2:3568018/140‑1 (MQ=255)
tCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATaaaca > 1:2342007/1‑140 (MQ=255)
gATGTGGGTAATCCGCACCGCAGATTCGGTACGGTTACCGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAAcg < 1:2056400/140‑1 (MQ=255)
gATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAAcg < 1:5326576/140‑1 (MQ=255)
gATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAAcg < 1:5075798/140‑1 (MQ=255)
tgtgGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAAcgcg < 1:3283724/140‑1 (MQ=255)
tgtgGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAAcgcg < 1:3646865/140‑1 (MQ=255)
tgtgGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAAcgcg < 1:4986160/140‑1 (MQ=255)
tgtgGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAAcgcg < 1:3912198/140‑1 (MQ=255)
tgGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGa > 1:4178165/1‑140 (MQ=255)
ggTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGc > 1:1885317/1‑140 (MQ=255)
aTACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGaa > 1:2639329/1‑140 (MQ=255)
aTACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGaa > 1:1759290/1‑140 (MQ=255)
aTACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGaa > 2:3171650/1‑140 (MQ=255)
aTACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGaa < 2:5105704/140‑1 (MQ=255)
aTACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGaa > 2:1345547/1‑140 (MQ=255)
ccGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAacg < 2:827763/139‑1 (MQ=255)
aCGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAacg < 2:1527346/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACgt > 1:4762137/1‑140 (MQ=255)
ccGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACgtg > 2:2804678/1‑140 (MQ=255)
ccGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACgtg > 1:982758/1‑140 (MQ=255)
cGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACgtgt > 2:61041/1‑140 (MQ=255)
cAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTgg > 1:868081/1‑140 (MQ=255)
gccgcaCGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGCCGTGAGGcgacg < 2:3033891/135‑1 (MQ=255)
gTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACCACGTGTGGCGACGAcc > 1:2967101/1‑140 (MQ=255)
gTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCgg < 2:2895536/140‑1 (MQ=255)
gTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCgg > 1:4596202/1‑140 (MQ=255)
gTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCgg > 1:1221145/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCa > 2:4418622/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCa > 2:3964053/1‑140 (MQ=255)
gTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCaa > 2:1995560/1‑140 (MQ=255)
gTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGGGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCaa > 2:2221833/1‑140 (MQ=255)
tGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCaaa < 2:3667198/140‑1 (MQ=255)
tGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCaaa < 2:558872/140‑1 (MQ=255)
tGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCaaa < 2:2516229/140‑1 (MQ=255)
cTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACg < 2:1643884/140‑1 (MQ=255)
gACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACtgg > 2:1884273/1‑140 (MQ=255)
gACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACggg < 1:3184200/140‑1 (MQ=255)
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GTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGG > SRR14920189.2779056/1‑151 (MQ=60)
GTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGG > SRR14920189.1663294/1‑151 (MQ=60)
GTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTACCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACAGCCGGAGTCAAACGGG > SRR14920189.2974137/1‑151 (MQ=60)
CGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCGATGAGCAGATCCGCCGGGTTGATTACGATATCAATATCATCATCAGCTGCCGGATAAACAAACGCGAAGCAGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTT > SRR14920189.3206805/1‑151 (MQ=60)
CGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTTATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGGGTCAAACGGGCTTTT > SRR14920189.415800/1‑151 (MQ=60)
CGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTT > SRR14920189.897983/1‑151 (MQ=60)
GCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACG > SRR14920189.1614429/1‑151 (MQ=60)
GCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACG < SRR14920189.5076507/151‑1 (MQ=60)
CTGGCCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGC < SRR14920189.2399413/151‑1 (MQ=60)
CTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGC > SRR14920189.4526556/1‑151 (MQ=60)
CTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGC > SRR14920189.719299/1‑151 (MQ=60)
CTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGC < SRR14920189.3292815/151‑1 (MQ=60)
CTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGC > SRR14920189.3617026/1‑151 (MQ=60)
CTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGAGATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTGACGC < SRR14920189.5275841/151‑1 (MQ=60)
TACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATCAACGTCCATGCGCATATCCGCCGGGTTCATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAATCGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGTCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCAC < SRR14920189.3882380/151‑1 (MQ=60)
GACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCAC < SRR14920189.334712/151‑1 (MQ=60)
GACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCAC < SRR14920189.3256140/151‑1 (MQ=60)
GACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCAC > SRR14920189.1079688/1‑151 (MQ=60)
GACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCAC < SRR14920189.3191753/151‑1 (MQ=60)
GACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCAC < SRR14920189.3190446/151‑1 (MQ=60)
GCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGG > SRR14920189.2123453/1‑151 (MQ=60)
CCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCG < SRR14920189.4635669/151‑1 (MQ=60)
CGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCGG < SRR14920189.2272984/151‑1 (MQ=60)
CGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCGG < SRR14920189.3965909/151‑1 (MQ=60)
CGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCGG < SRR14920189.2624974/151‑1 (MQ=60)
CGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCGGTG > SRR14920189.3147147/1‑151 (MQ=60)
GGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCGGTGAACG > SRR14920189.1075577/1‑151 (MQ=60)
GTGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCGGTGAACGCCGG > SRR14920189.150624/1‑151 (MQ=60)
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AAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGCGCGATAAACGTCAATGCGCAGATCCGCCGGGTTGATTTCGATATCAATATCATCATCAACTTCCGGATAAACAAACGCGGAGCTGAACGACGTGTGGCGACGACCGCCGGAGTCAAACGGGCTTTTACGCACCAGGCGGTGAACGCCGG > NZ_CP025268/3037701‑3037999
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |