Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,894,373 |
A→G |
T281A (ACG→GCG) |
mdtL → |
multidrug efflux MFS transporter MdtL |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,894,373 | 0 | A | G | 99.0%
| 1020.7
/ NA
| 313 | T281A (ACG→GCG) | mdtL | multidrug efflux MFS transporter MdtL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (189/120); minor base T (2/1); total (192/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 335 total aligned reads displayed.
TTGAGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGACGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGT > NZ_CP025268/3894236‑3894509
|
ttGAGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCCGCATGACTGTTTCATTCTCCTCGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGgcggcg < 2:3872664/140‑1 (MQ=255)
tGAGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGcggcgg > 1:4577937/1‑140 (MQ=255)
aGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCgggg < 1:1947801/140‑1 (MQ=255)
cgcgGTGAATACGCGACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCCCGCAATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGAt < 2:463681/140‑1 (MQ=255)
cgGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCa > 2:2398038/1‑140 (MQ=255)
cgGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCa > 1:2383806/1‑140 (MQ=255)
gTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCAct > 1:132547/1‑140 (MQ=255)
gAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCActct < 1:3030539/140‑1 (MQ=255)
accaTTATGGCGCTGACCGGTGTCGTGAGCATGACCGTCTCATACTCCACGCCATTTGCGCGGGGAATTTTTAATCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTAGTCCTGGCGTCGGGGATCCCTCTTGCCGTTTc > 2:1820406/1‑140 (MQ=255)
accaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTc > 1:538408/1‑140 (MQ=255)
ccaTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCa < 1:3146381/140‑1 (MQ=255)
caTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCAc > 1:4032144/1‑140 (MQ=255)
caTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCAc > 1:2933125/1‑140 (MQ=255)
caTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCAc > 2:3831671/1‑140 (MQ=255)
caTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCAc > 1:2979195/1‑140 (MQ=255)
caTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTGGCGCTGGGAATTTTTAAGCCGCGTACGTTGGTGATCACCTCGCAGGTGTTATTCGTGGCGGCGGGGGTGACTCGTGCCGtggcac > 2:2933989/1‑135 (MQ=255)
caTTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCAGTCTCCACGCCCTTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGAATCACTCTTGCCGTTTGAc > 2:3684242/1‑140 (MQ=255)
tGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTcc > 2:2532490/1‑140 (MQ=255)
gcgcTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCa < 2:302436/140‑1 (MQ=255)
gcgcTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCa > 1:1858191/1‑140 (MQ=255)
gcTGACCGCTGGCTTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATg < 2:1301199/140‑1 (MQ=255)
gcTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGCTGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATg < 2:1674342/140‑1 (MQ=255)
gcTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATg < 2:2892138/140‑1 (MQ=255)
cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTGTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGc > 1:4199494/1‑140 (MQ=255)
cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGCTCACTCTTGCCGTTTGACCTTCCCATGc > 2:1366760/1‑140 (MQ=255)
cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGc > 2:1103796/1‑140 (MQ=255)
cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGc > 1:3951697/1‑140 (MQ=255)
cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGc > 1:3701129/1‑140 (MQ=255)
cTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGc > 1:3293343/1‑140 (MQ=255)
gACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCgg < 1:4453897/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGt > 2:1988031/1‑140 (MQ=255)
cGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGttt < 2:3226894/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct < 1:4160368/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCCGGCGTCGGGGCTCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTtct > 1:1222889/1‑140 (MQ=255)
ggCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTctct < 2:2707977/140‑1 (MQ=255)
ttaaGCATGACCGTTTCATTCTCCCCTCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCACCGTCCGTGCATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCGGtt < 2:4152415/137‑1 (MQ=255)
gTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGtt < 2:4387498/140‑1 (MQ=255)
tCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTGTCTCTGttt > 1:1816442/1‑140 (MQ=255)
cATTACCGTTTCATTCTCCACTCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTTATGATTGCCTGTCAGGTGTTATTCCTAACGGCGGGGATCACTCTTGTCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTa < 2:2296683/140‑1 (MQ=255)
cATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTa < 2:2336703/140‑1 (MQ=255)
gACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCa > 1:3521336/1‑140 (MQ=255)
ccGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACg < 1:284067/140‑1 (MQ=255)
ccGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACg > 1:3083648/1‑140 (MQ=255)
ccGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACg > 2:3937595/1‑140 (MQ=255)
tttCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTg > 1:3610741/1‑140 (MQ=255)
tCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGAt > 2:2565658/1‑140 (MQ=255)
tCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGGTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGAt > 2:2665662/1‑140 (MQ=255)
ttCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTg > 1:1256131/1‑140 (MQ=255)
tcCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTgcgc > 2:2064973/1‑140 (MQ=255)
tcCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTCATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATGACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTGTCACGCTGATTTgcgc > 1:2961681/1‑140 (MQ=255)
tcCACGCCAGTTGCGCTGGGAATGTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTgcgc < 2:444140/140‑1 (MQ=255)
ccACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGcc > 2:338248/1‑140 (MQ=255)
cACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCg > 1:829708/1‑140 (MQ=255)
ttGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTGGCAGGTGTTATTACTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTGTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCGGTTTGGGAGGATGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCg > 2:1018402/1‑140 (MQ=255)
ttGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCg > 1:663426/1‑140 (MQ=255)
gcgcTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGt < 1:3855209/140‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGAATTTTGAAGCCACGTACGTTGAGGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGt < 1:2687238/140‑1 (MQ=255)
gggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGtt > 2:5069853/1‑140 (MQ=255)
gggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGtt > 1:2549672/1‑140 (MQ=255)
ggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGttt < 2:3521336/140‑1 (MQ=255)
ttttAAGCCCCGTACGTTGATGATCCCCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCCCTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTCCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGgtg < 1:3217908/140‑1 (MQ=255)
aGCCACGTATGTGGATGCTCCCCCAGCGGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGGTCCCTCTTGCCGTTTCACCTTCCCGTGCGGTTTCGCTGTTTGGTATCCCGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCg < 2:1807635/140‑1 (MQ=255)
aGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCg > 2:3338327/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCg < 1:4793177/140‑1 (MQ=255)
ccACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGAt < 1:1594828/140‑1 (MQ=255)
acgtacgtTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGa > 1:2346310/1‑140 (MQ=255)
cgtacgtTGATGCTCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATTACTCTCGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGGGCCGGTTTCTGGGTAGGTTTTGGGGTGGCGATGAg > 2:5302907/1‑140 (MQ=255)
acgtTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCa < 1:4706947/140‑1 (MQ=255)
gatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAg > 2:822789/1‑140 (MQ=255)
cACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGc > 1:432996/1‑140 (MQ=255)
cACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGc > 1:3647923/1‑140 (MQ=255)
aCCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTATGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGTGTTAGGGcc > 1:2894764/1‑140 (MQ=255)
cTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGt > 2:937884/1‑140 (MQ=255)
cTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGt > 1:3272760/1‑140 (MQ=255)
cTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGt > 1:1139852/1‑140 (MQ=255)
cTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTGTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGt > 2:3122568/1‑140 (MQ=255)
tCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGtt < 1:2502313/140‑1 (MQ=255)
cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 2:4945337/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 1:1060951/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 2:22723/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 2:2549872/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 2:1890811/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 1:2776789/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCATTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCACCGGTTTCTCGGTAGTTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt > 2:5159986/1‑140 (MQ=255)
aGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCa < 1:153592/140‑1 (MQ=255)
gtgtTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCAGGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCAtt > 2:1753210/1‑140 (MQ=255)
gtgtTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCAtt > 1:5082205/1‑140 (MQ=255)
tgtTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTa > 2:4786158/1‑140 (MQ=255)
ttATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcg > 2:1198849/1‑140 (MQ=255)
ttATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAcg > 1:5305396/1‑140 (MQ=255)
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GGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGC > SRR14920189.4362294/1‑151 (MQ=60)
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GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.209700/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.445529/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.2609350/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.2609369/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.1516918/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.4780769/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.445743/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.1420453/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.380748/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCG > SRR14920189.4031075/1‑151 (MQ=60)
GTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGGATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCtgtctcttatacacatctcc > SRR14920189.1049889/1‑131 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGTGGATCACTCTTTCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTGGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACTCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.229945/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCCCGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.2944059/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC > SRR14920189.1435773/1‑151 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.2121040/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC > SRR14920189.802921/1‑151 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.2571467/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.4149327/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.1533468/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.3840839/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.3346318/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.3346821/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.4990570/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.4990556/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.3521947/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC > SRR14920189.3532925/1‑151 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.1106320/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGAGTAGCC < SRR14920189.2001241/151‑1 (MQ=60)
ATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTGCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCC < SRR14920189.2571316/151‑1 (MQ=60)
TTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTTGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCA > SRR14920189.604687/1‑151 (MQ=60)
TCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACtgtctcttatacacat > SRR14920189.1296217/1‑135 (MQ=60)
CTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCT < SRR14920189.3091893/151‑1 (MQ=60)
TGGAGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCAGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTC < SRR14920189.4478095/151‑1 (MQ=60)
GCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCGCGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCT < SRR14920189.4795537/151‑1 (MQ=60)
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ATCATGGGGTTTGAGCGCGGTGAATACGCCACCATTATGGCGCTGACCGCTGGCGTCAGCATGACCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGACGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCT > NZ_CP025268/3894226‑3894523
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |