Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R1
|
782 |
634.5 |
21863942 |
98.1% |
21448527 |
138.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
857,496 |
C→T |
P20S (CCC→TCC) |
CXP41_RS24120 → |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 857,496 | 0 | C | T | 100.0%
| 1098.8
/ NA
| 287 | P20S (CCC→TCC) | CXP41_RS24120 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (155/132); total (155/132) |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
GATGAATGACAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTCCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTT > NZ_CP025268/857360‑857632
|
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aatgaCAGGGAAAACATGCTTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTa < 1:5308411/140‑1 (MQ=255)
tgaCAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAAt > 2:306386/1‑140 (MQ=255)
tgaCAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAAt < 1:1919115/140‑1 (MQ=255)
gggAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTg > 2:2070676/1‑140 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:6383534/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:4008943/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:223921/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:3697317/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:2501383/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:2709424/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:2070676/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:83562/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:10346356/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 1:9593609/140‑1 (MQ=255)
gAAAACATGAGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGat < 2:9348220/140‑1 (MQ=255)
aaaaCATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGata > 1:1334044/1‑140 (MQ=255)
tGCTTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTa < 2:8020765/140‑1 (MQ=255)
tGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTa < 1:4584202/140‑1 (MQ=255)
aCGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCAAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACt > 2:948058/1‑140 (MQ=255)
cGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACtt > 2:5002123/1‑140 (MQ=255)
ttCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTATTTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTg > 2:8266683/1‑140 (MQ=255)
ttCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTg < 2:4335028/140‑1 (MQ=255)
ctctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGaa > 1:8621684/1‑140 (MQ=255)
ctctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTCTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGaa < 1:6209840/140‑1 (MQ=255)
ctctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATATTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGaa < 2:2649849/140‑1 (MQ=255)
tctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAAt < 1:5535331/140‑1 (MQ=255)
tctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAAt < 1:6679683/140‑1 (MQ=255)
tctGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAAt < 1:1395640/140‑1 (MQ=255)
gAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATcac < 2:5402442/140‑1 (MQ=255)
aaGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACAttt > 1:2329242/1‑140 (MQ=255)
aTTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTa > 1:946433/1‑107 (MQ=255)
aGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAATACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGaaa > 2:3290756/1‑140 (MQ=255)
aTAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAAtt > 1:6999223/1‑140 (MQ=255)
gCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCa < 2:8829608/140‑1 (MQ=255)
gCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCa < 1:6884665/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATGGAATCGTTCTGTTACATGAAATGGACCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 2:6108739/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 1:4309777/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 2:7378653/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 2:2127160/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATGGAAACGATCTCCAACATGAAACGTCCAGTTAGCCATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATATTTGATAGATTTAAAACTTACGACTTAATTGAATCACAATTGCGGGGGTTATGAAAAAAATGGCATg < 2:4040351/140‑1 (MQ=255)
ggTCTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATAATTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 2:9328666/140‑1 (MQ=255)
taaggAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATATGAGGAGGATAAGAAAAAAATAGCATGTCtt > 2:8137141/4‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 1:7486579/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt > 2:9832129/1‑140 (MQ=255)
tATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCtt < 2:8650297/140‑1 (MQ=255)
aTGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTTCATGTCttt > 1:1266577/1‑140 (MQ=255)
tGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTc > 2:3537294/1‑140 (MQ=255)
aaaCGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGc > 1:9327395/1‑140 (MQ=255)
aaaCGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGc > 2:465160/1‑140 (MQ=255)
aaaCGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGc > 2:2966157/1‑140 (MQ=255)
aaaCGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGAGATATTTAAAACTTAGGCCTTATTTGAATCAAATGTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGGCTTTCAGc > 2:10684186/1‑140 (MQ=255)
aaCGTTCTGTTACATGATATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGTACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCa < 1:1647492/140‑1 (MQ=255)
aaCGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCa < 1:10810175/140‑1 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATCTATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGACAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 2:6947119/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 1:8904012/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt > 2:1350980/1‑140 (MQ=255)
cGTTCTGTTACATGAAATGGCACGTTAGAAATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTTATTTTTTATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTTAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACt < 2:1009072/140‑1 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCAtt > 2:9601631/1‑55 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATg < 2:10845226/126‑1 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 2:10479913/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 2:7778882/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 1:7971592/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 1:4876455/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTgg > 2:8553881/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAAATTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTAAGCACTgg > 2:1054502/1‑140 (MQ=255)
cTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGcc > 2:1732108/1‑140 (MQ=255)
gTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGc < 1:10033138/140‑1 (MQ=255)
ttACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCa > 2:8760342/1‑140 (MQ=255)
tACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAg < 1:3746502/140‑1 (MQ=255)
cATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGtt < 2:10086901/140‑1 (MQ=255)
aTGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTc > 1:1550808/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGACTCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCt < 2:9054793/140‑1 (MQ=255)
tGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCt > 1:2821323/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCt > 1:4378639/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGc > 1:9791418/1‑140 (MQ=255)
ggCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCttt < 1:10256480/140‑1 (MQ=255)
cccGTTAGACATCACAAATCNCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCNTGTCTTTNAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCa > 1:5840997/1‑140 (MQ=255)
cccGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCa > 1:8079926/1‑140 (MQ=255)
ccGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCAc > 2:519403/1‑140 (MQ=255)
ccGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCAc > 1:6370124/1‑140 (MQ=255)
cGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCAcc < 1:5202259/140‑1 (MQ=255)
ttAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGc > 2:5829657/1‑140 (MQ=255)
tAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCa > 1:10059431/1‑140 (MQ=255)
aCATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGt < 1:8244123/140‑1 (MQ=255)
cATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTa > 2:4551489/1‑140 (MQ=255)
cacaAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACtt > 1:8258388/1‑140 (MQ=255)
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ATCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTG > SRR14920162.160587/1‑151 (MQ=60)
TCACAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGC > SRR14920162.7143641/1‑151 (MQ=60)
CAAATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGAC > SRR14920162.7139383/1‑151 (MQ=60)
AAATCTCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGATGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACT < SRR14920162.1219616/151‑1 (MQ=60)
ATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTC > SRR14920162.8504698/1‑151 (MQ=60)
ATCGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTC > SRR14920162.2710890/1‑151 (MQ=60)
CGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTA > SRR14920162.4011961/1‑151 (MQ=60)
CGCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTA > SRR14920162.1463531/1‑151 (MQ=60)
GCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaatctcgtgttgagtcatcgtgttgtaatagtgggggggggggggggggggggggggggggggggggggggg > SRR14920162.5105428/1‑38 (MQ=60)
GCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTAC < SRR14920162.2212499/151‑1 (MQ=60)
GCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTAC < SRR14920162.4197811/151‑1 (MQ=60)
GCGAAGAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTAC < SRR14920162.3135702/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA > SRR14920162.3294495/1‑151 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA < SRR14920162.6969616/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA < SRR14920162.6969672/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA < SRR14920162.8813661/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAA > SRR14920162.7381614/1‑151 (MQ=60)
GTTTCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACT < SRR14920162.1835831/151‑1 (MQ=60)
TCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACTGGC < SRR14920162.4727425/151‑1 (MQ=60)
TCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACTGGC < SRR14920162.6149755/151‑1 (MQ=60)
TCCCATTAAATTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACTGGC < SRR14920162.10682494/151‑1 (MQ=60)
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GGAATAATCTGGATGAATGACAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATGGCCCGTTAGACATCACAAATCGCGAAGAGTTCCCCATTAATTTTTGATATATTTAAAACTTAGGACTTATTTGAATCACATTTGAGGTGGTTATGAAAAAAATTGCATGTCTTTCAGCACTGGCCGCAGTTCTGGCTTTCACCGCAGGTACTTCCGTAGCTGCGACTTCTACTGTAACTGGC > NZ_CP025268/857349‑857646
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |