Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R1
|
782 |
634.5 |
21863942 |
98.1% |
21448527 |
138.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,717,337 |
(C)7→6 |
intergenic (+361/‑251) |
nth → / → dtpA |
endonuclease III/dipeptide/tripeptide permease DtpA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,717,331 | 0 | C | . | 99.8%
| 5877.3
/ ‑1.7
| 1216 | intergenic (+355/‑257) | nth/dtpA | endonuclease III/dipeptide/tripeptide permease DtpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base . (643/570); minor base T (0/2); total (644/572) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.21e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1322 total aligned reads displayed.
GAATCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAA > NZ_CP025268/1717192‑1717466
|
gAATCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAc < 2:4251712/140‑1 (MQ=255)
gAATCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAc < 1:1517797/140‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACTCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcc < 2:7798230/140‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcc < 2:414098/140‑1 (MQ=255)
aTCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccc > 1:8338784/1‑140 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc < 2:1118177/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc > 1:4144524/1‑140 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc < 1:3370646/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc < 1:3081552/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc < 1:10504847/140‑1 (MQ=255)
aGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccc > 2:2619464/1‑140 (MQ=255)
gTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctc > 1:1264043/1‑138 (MQ=255)
gTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGACATCAcccccctc > 2:6275694/1‑138 (MQ=255)
ttAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctct < 2:9533838/140‑4 (MQ=255)
ttAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctct < 2:8213589/140‑4 (MQ=255)
aaaTCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcag < 1:8173174/140‑1 (MQ=255)
tCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcagtgc < 2:10591027/140‑1 (MQ=255)
cATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcagtgca < 1:2716162/140‑1 (MQ=255)
cATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcagtgca < 1:6407564/140‑1 (MQ=255)
tttAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcagtgcagt > 1:9456555/1‑140 (MQ=255)
tttAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcagtgcagt > 2:7549583/1‑140 (MQ=255)
tAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGa < 2:3661380/140‑1 (MQ=255)
cacacGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCt > 2:3426068/1‑140 (MQ=255)
gCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGt > 2:7450335/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 2:5961428/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 2:5031645/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 2:2185043/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 1:4389064/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 1:5103691/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 2:3206794/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 2:9746568/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 2:8534668/1‑140 (MQ=255)
aCAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaa < 1:6874221/136‑1 (MQ=255)
aCAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAt > 1:486515/1‑140 (MQ=255)
cAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAtt > 2:8395548/1‑140 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAACCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACg < 2:1805076/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACg < 1:9137804/140‑1 (MQ=255)
tACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTg > 1:3221717/1‑140 (MQ=255)
tACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTg > 2:9051943/1‑140 (MQ=255)
tACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTg > 2:4869505/1‑140 (MQ=255)
ggCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAAc < 2:1997676/140‑1 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCCGTGAAAAGATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGAGAACa > 2:2442571/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 2:5646864/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 2:6425570/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:10009799/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:8937071/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:7994125/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:1095848/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:7764363/1‑140 (MQ=255)
aTTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAttt > 1:1859458/1‑140 (MQ=255)
ttttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTcc < 2:1247734/140‑1 (MQ=255)
tCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCgg < 1:7464562/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGCTAACATTTCCCGGaa > 2:4548395/1‑140 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 1:9853111/140‑1 (MQ=255)
aaaCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATg > 2:396503/1‑140 (MQ=255)
tGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg < 1:6128241/140‑1 (MQ=255)
aTCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTcc > 1:5329778/1‑140 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGTACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTTAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTGTGACAATTTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTGGAATTccc > 2:8732195/1‑140 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc > 2:2951181/1‑140 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGAGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc > 1:7241164/1‑140 (MQ=255)
tcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCg < 1:4577562/140‑1 (MQ=255)
cACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGc > 2:10163799/1‑140 (MQ=255)
cACTAGTAAAAACGCTAAAGAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGATTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGc < 2:6837529/140‑1 (MQ=255)
aCTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGcc < 1:5549430/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:3538109/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:10351532/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:2808225/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt > 1:2131214/1‑140 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt > 2:725508/1‑140 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTAAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCGGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:6653176/140‑1 (MQ=255)
ttAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑ACCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 2:3788866/139‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 2:5417838/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 2:7989594/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 1:10146222/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 1:8684088/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGtt > 1:3616402/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTtat < 1:7608196/140‑1 (MQ=255)
gCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGt < 1:7085949/140‑1 (MQ=255)
tAAATATCAGAAAATATCGCCGTTTAGCCATCA‑CCCCCCAATCAGTTCATTGTAAAAATATGCCGTTACGTTTTTTTAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 1:2366279/140‑1 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACCTTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa > 1:5726646/1‑140 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 1:2880884/140‑1 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 2:3315485/140‑1 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 1:3778247/140‑1 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa > 2:10387786/1‑140 (MQ=255)
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tAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CACCCCTCTCAGTGCAGTGAAAATATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAATTTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCTGTTATATGTAACAGa < 2:10730663/140‑1 (MQ=255)
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AAGAATCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGATAGTGAACATTAC > NZ_CP025268/1717190‑1717487
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |