Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,804,700 |
C→T |
K39K (AAG→AAA) |
rpmI ← |
50S ribosomal protein L35 |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,804,700 | 0 | C | T | 99.3%
| 1958.6
/ NA
| 539 | K39K (AAG→AAA) | rpmI | 50S ribosomal protein L35 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (326/208); minor base G (4/0); total (331/208) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.63e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 543 total aligned reads displayed.
CCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGCTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCACTTCG > NZ_CP025268/1804563‑1804835
|
tatGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGt < 1:10044822/140‑1 (MQ=255)
tgtgCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCg > 1:4810039/1‑140 (MQ=255)
tgtgCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCg < 1:1879557/140‑1 (MQ=255)
ctctCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCttt > 1:11334779/1‑140 (MQ=255)
ctctCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCttt > 2:4459471/1‑140 (MQ=255)
ctctCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCttt > 2:8017465/1‑140 (MQ=255)
ctctCCTGGATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTGTACGTGTGGTCGCgtt > 2:3425920/1‑140 (MQ=255)
tctcCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCtttt < 1:10908072/140‑1 (MQ=255)
tcCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCtttttt > 2:6098440/1‑140 (MQ=255)
tcCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCtttttt > 1:1777525/1‑140 (MQ=255)
ccTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTg > 2:3739231/1‑140 (MQ=255)
cTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTgg > 1:3948834/1‑140 (MQ=255)
tGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGt < 1:3881207/140‑1 (MQ=255)
tATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCa > 2:3984369/1‑140 (MQ=255)
tATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCa < 2:4121780/140‑1 (MQ=255)
tCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGa > 1:9654234/1‑140 (MQ=255)
tCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGa < 1:5881880/140‑1 (MQ=255)
atatTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAAtg > 1:237909/1‑140 (MQ=255)
atatTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAAtg > 1:6861702/1‑140 (MQ=255)
atatTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAAtg > 1:674435/1‑140 (MQ=255)
atatTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTGGTTTGGTCAGAAtg > 1:9936109/1‑140 (MQ=255)
atatTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGAACGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTATTGGTCAGAAtg > 1:5184516/1‑140 (MQ=255)
atatTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGATTATGCGTACTGAAGGCACGCGATTACCAGTCACAGATCGCATTTGGAAACAATGGCTTTCGGACGCAGGAGACGATTACGATTTGTCTCTTTTTTGGTAAGAAtg > 1:2639058/1‑140 (MQ=255)
atTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAAtgtg > 1:11525604/1‑140 (MQ=255)
atTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAAtgtg > 1:10668469/1‑140 (MQ=255)
atTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAAtgtg > 2:5239643/1‑140 (MQ=255)
tCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGAc < 2:6296486/140‑1 (MQ=255)
tCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGAc < 1:9019405/140‑1 (MQ=255)
cTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACg > 2:5966628/1‑140 (MQ=255)
tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGc < 1:4588779/140‑1 (MQ=255)
tAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGc < 1:8638618/140‑1 (MQ=255)
aaTTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCa < 2:9390052/140‑1 (MQ=255)
aTTAAATTGTTAATAACGTTAACGGCTAATGCGTACGGCAGGCACGCGCTTACCAGGGCCAGTTGGCCTTTGGAAACGATGGCTGTCGGACGCTGGTGACGTTTAAGTTGGGTCGCTTGGGGGGTAGGAATGTGACGCAg > 2:3136201/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGTTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAg > 1:3309435/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAg > 1:10313466/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAg > 2:1546034/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAg > 1:4357017/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAg > 2:9068404/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAg > 1:6411023/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAgg > 2:1288784/1‑140 (MQ=255)
aaaGTTAAAAACTTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCTCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGAAGCAGGTTAg < 2:7570799/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAg < 1:3570071/140‑1 (MQ=255)
aaaaCGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgctt < 2:9112395/140‑1 (MQ=255)
aaaCGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgcttg < 1:8410034/140‑1 (MQ=255)
aaaCGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgcttg < 2:1064550/140‑1 (MQ=255)
cGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgcttgtgc < 2:6606038/140‑1 (MQ=255)
gTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCgtgcttgtgct < 2:10384583/140‑1 (MQ=255)
cGGCTGATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTaaaa < 2:3512263/140‑1 (MQ=255)
cTTATGTGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAacca > 2:2634083/1‑140 (MQ=255)
ttATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAaccac > 1:9536837/1‑140 (MQ=255)
aCGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCg > 1:10217765/1‑140 (MQ=255)
ggcaggcaCTCGATTACCAGGACCAGATAGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTATGGACAGAATGAGACGCAGGATAGCGTGCTAGTGCTTAAAACCACCGTTACCGGt > 2:120292/1‑140 (MQ=255)
ggcaCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGttttt > 1:3692175/1‑140 (MQ=255)
ggcaCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGttttt > 1:1238220/1‑140 (MQ=255)
ggcaCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTGTACCGGttttt > 2:7390927/1‑140 (MQ=255)
gcaCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGTAACAATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGGTTTTTTGGTGAGAATGTGACGCAGGGTCGCGAGGTTTTGCTTAAAACCTCATTTTCCGGtttttg > 2:10074747/1‑139 (MQ=255)
gcaCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGCCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGtttttt > 2:10861360/1‑140 (MQ=255)
aCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTCCCGGTTTTTTTg < 1:7619130/140‑1 (MQ=255)
aCGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTg > 1:5044009/1‑140 (MQ=255)
gcgATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGaa < 2:1880360/140‑1 (MQ=255)
cgATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAg < 2:7754396/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 1:7450585/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 2:10270668/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 1:6076677/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 2:8884290/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 2:2409031/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 2:22049/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCATTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 2:4541844/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCATTACCGGTTTTTTTGAAgcg < 2:4717775/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCGTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCtt > 1:775642/1‑140 (MQ=255)
aCCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCAAGGCTTTAGGACGAAGGTGAAGTATAAGTTTGGTCTCTTTTTTGGTAAGAATGTGACGAAGTTTATCTTTATTGTGCTTAAAAACACCTTTAAAGTTTTTTTTGAAGAGCtt > 2:8243403/1‑140 (MQ=255)
ggCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTagca > 2:8285997/1‑140 (MQ=255)
ggCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTagca < 2:9630321/140‑1 (MQ=255)
cccAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTagcagc < 2:9319587/140‑1 (MQ=255)
cAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCAc < 1:8144868/140‑1 (MQ=255)
cAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCAc > 2:4999532/1‑140 (MQ=255)
gATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACcg > 2:2921538/1‑140 (MQ=255)
tCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCCGGTGACGTTTACGTGTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGTCGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTCAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCTGCACcgcg > 2:7091535/1‑140 (MQ=255)
gCCTTTGGTAACCAATGCTGTCGGACGCAGGTGCCGTTTACGTTGGGTCGCTTTTTTGGTCAGTATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTTCTTACAACCACCTTTACGGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTa < 2:8534697/140‑1 (MQ=255)
gCCTTTGGCCCCCAGGGCGATCCGCCGCAGGTGACGCTTACGTTTGGTCGCATTTTTGGTCCGAATGTGCCGCCGGTTAGCGTGCCTGCGCATACAACCACCTTTACCGGTGATTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTa < 2:5551437/140‑1 (MQ=255)
ccTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTAc < 1:2832031/140‑1 (MQ=255)
cTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACg < 2:11030413/140‑1 (MQ=255)
cTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACg > 1:1703125/1‑140 (MQ=255)
cTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACg > 1:5625659/1‑140 (MQ=255)
ggAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTNTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCt < 1:6299173/140‑1 (MQ=255)
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GCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACG > SRR14920200.1713636/1‑151 (MQ=60)
GCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACG > SRR14920200.5660929/1‑151 (MQ=60)
GCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACG > SRR14920200.11423050/1‑151 (MQ=60)
CCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGT < SRR14920200.76122/151‑1 (MQ=60)
CAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTC < SRR14920200.164766/151‑1 (MQ=60)
CAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTC > SRR14920200.2646727/1‑151 (MQ=60)
CAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTC < SRR14920200.8199928/151‑1 (MQ=60)
GCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATT < SRR14920200.9470390/151‑1 (MQ=60)
GCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATT < SRR14920200.5615934/151‑1 (MQ=60)
GCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATT < SRR14920200.498165/151‑1 (MQ=60)
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TTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTG > SRR14920200.701601/1‑151 (MQ=60)
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AAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTGTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCAT > SRR14920200.4073396/1‑151 (MQ=60)
GGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATA > SRR14920200.5671922/1‑151 (MQ=60)
GCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAA < SRR14920200.1960574/151‑1 (MQ=60)
CTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAAC < SRR14920200.5173928/151‑1 (MQ=60)
CTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAAC < SRR14920200.4561164/151‑1 (MQ=60)
TTCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTT > SRR14920200.892351/1‑151 (MQ=60)
TCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTC < SRR14920200.5586404/151‑1 (MQ=60)
TCGGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTC < SRR14920200.9389855/151‑1 (MQ=60)
GGACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCA > SRR14920200.6461466/1‑151 (MQ=60)
GACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAGTGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCAC < SRR14920200.4289971/151‑1 (MQ=60)
GACGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCAC < SRR14920200.9144531/151‑1 (MQ=60)
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CGCAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCACTT < SRR14920200.1821250/151‑1 (MQ=60)
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CAGGTGACGTTTACGTTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCGTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCACTTCG > SRR14920200.2311449/1‑151 (MQ=60)
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CGTTTTACGCGAGCCATATGTGCTCTCCTGTATCTATATTCTAATTAAAAAGTTAAAAACGTTAACGGCTTATGCGTACGGCAGGCACGCGATTACCAGGCCCAGATCGCCTTTGGAAACCATGGCTTTCGGACGCAGGTGACGTTTACGCTTGGTCGCTTTTTTGGTCAGAATGTGACGCAGGTTAGCGTGCTTGTGCTTAAAACCACCTTTACCGGTTTTTTTGAAGCGCTTAGCAGCACCGCGTACGGTCTTAATTTTTGGCATTTTAATAACTTCCACTTCGCATTGTTAATAAAC > NZ_CP025268/1804550‑1804849
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |