Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,081,156 |
C→T |
S3N (AGC→AAC) |
cmtA ← |
PTS mannitol transporter subunit IICB |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,081,156 | 0 | C | T | 99.0%
| 2218.7
/ NA
| 603 | S3N (AGC→AAC) | cmtA | PTS mannitol transporter subunit IICB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (238/356); minor base A (0/6); total (238/365) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.61e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 603 total aligned reads displayed.
TGTTCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGCTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAA > NZ_CP025268/3081021‑3081291
|
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAACACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAATAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 1:5464273/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAACAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 2:3428774/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 1:1507844/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 1:359893/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 2:6107772/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 1:2019751/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 1:7643668/140‑1 (MQ=255)
ttCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCa < 2:1487350/140‑1 (MQ=255)
cGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCata < 1:929507/140‑1 (MQ=255)
tAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATGGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCataata < 2:6289246/140‑1 (MQ=255)
aGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAatat > 2:5223042/1‑140 (MQ=255)
gcaccacaCCGGCGGCAATCAATACCGCAGTAATAATACCCCAGCCAATAACACCACCCAAAGTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCACAAGCCAGGACCATTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAAtatta < 2:10017388/133‑1 (MQ=255)
gCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAAtatta < 1:8059436/140‑1 (MQ=255)
gCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAAtatta < 2:2967478/140‑1 (MQ=255)
gCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAAtatta < 2:5438335/140‑1 (MQ=255)
aGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATc < 1:1128461/140‑1 (MQ=255)
aGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATc > 1:7876933/1‑140 (MQ=255)
aGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATc > 1:8559765/1‑140 (MQ=255)
aGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATc < 2:4038119/140‑1 (MQ=255)
aGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATc < 1:2673196/140‑1 (MQ=255)
aGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATc < 2:6760178/140‑1 (MQ=255)
ccAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCt > 1:5247038/1‑140 (MQ=255)
aCCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTa < 2:3858998/140‑1 (MQ=255)
ggtggtAAAAAAAAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTagag < 2:8441286/140‑1 (MQ=255)
ggTGGGAATACCTAACGCAGTAATAACTCCCCAGGCAAGAATATCACCACTTTTGGGGATGACCATTTCAGTCTAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTGTGCACGAGCTGTCTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTagag < 2:4453420/140‑1 (MQ=255)
ggTGGGAATAAATAACGCAGTAATACAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAACGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTagag < 2:7426196/140‑1 (MQ=255)
ggTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTagag < 2:4872873/140‑1 (MQ=255)
ggTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTagag < 1:5680666/140‑1 (MQ=255)
tGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAgagga < 1:3528737/140‑1 (MQ=255)
tGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAgagga < 2:1743655/140‑1 (MQ=255)
tGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAgagga < 2:2698621/140‑1 (MQ=255)
tGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGGAgagga < 1:2958884/140‑1 (MQ=255)
aataaataACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGgagaga > 1:5156186/1‑140 (MQ=255)
aataaataACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGgagaga < 2:8291758/140‑1 (MQ=255)
ataaCGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAAt > 2:2468473/1‑140 (MQ=255)
cGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTGCATCATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATc > 2:8017287/1‑140 (MQ=255)
gCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATcc > 2:1198094/1‑140 (MQ=255)
cAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCcg < 1:11473795/140‑1 (MQ=255)
aGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATACTATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCcgc < 1:2268766/140‑1 (MQ=255)
aGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCcgc < 1:6848593/140‑1 (MQ=255)
taataaCACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCgg < 2:11084380/140‑1 (MQ=255)
taataaAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCgg > 1:8788318/1‑140 (MQ=255)
taataaAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCgg > 1:7294661/1‑140 (MQ=255)
taataaAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCgg < 1:8433599/140‑1 (MQ=255)
taataaAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCgg > 1:1343346/1‑140 (MQ=255)
taaAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTg < 1:6420490/140‑1 (MQ=255)
ccAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGt > 1:2431749/1‑140 (MQ=255)
cAGGCAATAACAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCACAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTc < 2:8613203/140‑1 (MQ=255)
aGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTcc > 1:1192540/1‑140 (MQ=255)
aGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCATGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTcc > 1:489436/1‑140 (MQ=255)
ggCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCg > 2:7125137/1‑140 (MQ=255)
cAATAACAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCt < 2:8854092/140‑1 (MQ=255)
cACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATc < 2:11427050/88‑1 (MQ=255)
cACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGtttt > 1:2862603/1‑140 (MQ=255)
ccAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTc > 2:9305848/1‑140 (MQ=255)
atatTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCtga < 1:5811239/140‑1 (MQ=255)
ggggATGACCATTGCAGTCAAACAGCCCCCACAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCAGAATAGTAGCCGGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCGGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGatgatg < 2:10844591/140‑1 (MQ=255)
ggggATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGatgatg < 2:2275286/140‑1 (MQ=255)
ggggATGACCAGTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGatgatg < 1:10168512/140‑1 (MQ=255)
ggggATGACCAGTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCATGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAAGATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGatgatg < 2:6643353/140‑1 (MQ=255)
gggATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGc > 2:6848931/1‑140 (MQ=255)
gATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTg > 2:9226710/1‑140 (MQ=255)
aTGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGt < 1:1003111/140‑1 (MQ=255)
tGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGtt < 1:4433574/140‑1 (MQ=255)
gaacATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTATACATAATATTATCCTGAAGAGTAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGAAAATGTCCGCAAATTGATTTTCTGATGATGCTGTTa > 2:5564297/4‑140 (MQ=255)
gACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTa < 1:10677446/140‑1 (MQ=255)
gACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTa > 1:6521275/1‑140 (MQ=255)
gACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTACATAATATTATCCTGTAGACGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCTCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTa > 2:1855388/1‑140 (MQ=255)
aCCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCGCGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCGAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTaa > 1:6633973/1‑140 (MQ=255)
aCCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTaa > 2:1062814/1‑140 (MQ=255)
aTTGCAGTCAAAAAGCCAACAATAGCCTTGACCTTTGCACGATAAGACTTGTTTTCAATAATATTATAATGTAGAGGAGAGAGTAATTATACGCTGCTTATAATTTAAGATAATTTTTTTTATGATGATGATGTTAagat < 2:9566495/140‑2 (MQ=255)
ttGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAgt > 2:982556/1‑140 (MQ=255)
gCAGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATAATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAgttt > 2:8142533/1‑139 (MQ=255)
aGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAgttgtt > 2:10333740/1‑140 (MQ=255)
aGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAgttgtt < 1:1602218/140‑1 (MQ=255)
aGTCAAAAAGCCCCCAAAACCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAgttgtt < 2:6561425/140‑1 (MQ=255)
gTCAAAAAGCCCCCAAAAGCATGGACCTATGCACGAGCATACTATTTTACCATAATATAATCCTGTAGAGGAGACAGAAATAAACCGCGGCTGATAATGACCGCTAATAGATTTTCTGATGATGCATTTAAGAgttgtac > 2:4358433/1‑138 (MQ=255)
tCAAAAAGCCCCCACACGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCAGAATATTAGCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAAGTGTTTTTCTGATGAGGCTGTTAAGAGTTGTTCg < 2:3731306/140‑1 (MQ=255)
tCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCg < 1:5962439/140‑1 (MQ=255)
tCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCg > 2:7869469/1‑140 (MQ=255)
cccAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttctt > 2:7634385/1‑140 (MQ=255)
aaaaGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttctt < 1:4252593/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGca < 1:6194613/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGca < 1:3239086/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGca < 1:10960345/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGca < 1:1769318/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGca < 2:4207746/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGATTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGca < 2:1619694/140‑1 (MQ=255)
cTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGcaca < 1:4745204/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAAtt < 1:7156922/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAAtt < 1:10847628/140‑1 (MQ=255)
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GTCAAAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTT > SRR14920200.1086649/1‑151 (MQ=60)
GTCAAAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTT > SRR14920200.6171253/1‑151 (MQ=60)
TCAAAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTC < SRR14920200.5999893/151‑1 (MQ=60)
AAAAAGCCCCCAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATAGTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATNCGCGGCTGAGAATGTCCGCTTATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAATAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTT < SRR14920200.6341156/151‑1 (MQ=60)
AAAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTT < SRR14920200.2255805/151‑1 (MQ=60)
AAAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTT < SRR14920200.5788158/151‑1 (MQ=60)
AAAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTT < SRR14920200.5762654/151‑1 (MQ=60)
AAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAGTATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTC < SRR14920200.6472439/151‑1 (MQ=60)
AAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTC > SRR14920200.363315/1‑151 (MQ=60)
GCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCAC < SRR14920200.4045659/151‑1 (MQ=60)
CCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAG > SRR14920200.4962969/1‑151 (MQ=60)
CCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGT < SRR14920200.2540447/151‑1 (MQ=60)
CAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAA < SRR14920200.11675702/151‑1 (MQ=60)
AAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAAT < SRR14920200.1076159/151‑1 (MQ=60)
AA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTC < SRR14920200.995231/151‑1 (MQ=60)
A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacaggcagaaatctc > SRR14920200.3013062/1‑104 (MQ=60)
A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTAGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATAATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATAGTTATTCTGAAGAAGCTGTTAAGAGATGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCA > SRR14920200.1698745/1‑151 (MQ=60)
GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCAC < SRR14920200.5592980/151‑1 (MQ=60)
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CTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCC < SRR14920200.1174359/151‑1 (MQ=60)
CTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCC < SRR14920200.600410/151‑1 (MQ=60)
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AGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCG > SRR14920200.8423255/1‑151 (MQ=60)
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|
CAATTTTGGCGAAATGTTCGTTAGGCAGCCAACCGGTGGGAATAAATAACGCAGTAATAAAACCCCAGGCAATAAAAGCACCAATATTGGGGATGACCATTGCAGTCAAAAAGCCCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGCTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGC > NZ_CP025268/3081007‑3081305
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |