Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,308,725 |
T→C |
*295* (TAA→TAG) |
nlpI ← |
lipoprotein NlpI |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,308,725 | 0 | T | C | 99.9%
| 2275.3
/ NA
| 651 | *295* (TAA→TAG) | nlpI | lipoprotein NlpI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (327/323); minor base A (1/0); total (328/323) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 651 total aligned reads displayed.
ACTCATCATGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGTTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCA > NZ_CP025268/3308588‑3308861
|
aCTCATCATGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTa > 1:9341049/1‑140 (MQ=255)
cTCATCATGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAt > 2:6905335/1‑140 (MQ=255)
tcatcaTGAAATTNATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAtt > 1:10004066/1‑140 (MQ=255)
tcatcaTGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAtt > 1:5752939/1‑140 (MQ=255)
tcatcaTGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAtt > 1:10720602/1‑140 (MQ=255)
tcatcaTGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAtt > 2:9514557/1‑140 (MQ=255)
tcatcaTGAAATTGATCAGCAATATTCAGTGAAAAGTGTGACCCGGCTCAAAGTCGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCACTCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGGACGTCAGCTagt > 2:6171581/1‑138 (MQ=255)
atcatGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAGCAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc > 1:6575959/1‑140 (MQ=255)
atcatGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc > 2:5939254/1‑140 (MQ=255)
atcatGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc > 1:5550603/1‑140 (MQ=255)
atcatGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc > 1:3240043/1‑140 (MQ=255)
atcatGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc < 2:2789394/140‑1 (MQ=255)
atcatGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc > 1:130997/1‑140 (MQ=255)
atcatGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc > 2:256691/1‑140 (MQ=255)
aacatGAAATTGCTCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAACAGAGTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGc < 2:8592076/138‑1 (MQ=255)
catGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTCCGTCAGCTATTGCTg > 2:4846028/1‑140 (MQ=255)
catGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTg > 1:252223/1‑140 (MQ=255)
catGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTg > 1:6107688/1‑140 (MQ=255)
catGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTg > 1:8452454/1‑140 (MQ=255)
tGAACTTGATCGGCACTTTTCATGGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTCAGGTGATGGCACTCAAAAATGATTACGGGCTGATGTGGACGTCAGCTAGTGCTGGt > 2:1511188/1‑140 (MQ=255)
tGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGt < 2:11376788/140‑1 (MQ=255)
aTTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAATGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCTGCTATTGCTGGTCCGa > 2:8182835/1‑140 (MQ=255)
ttGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGAt < 2:3858067/140‑1 (MQ=255)
gATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTc > 1:8817645/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTg < 2:8431093/140‑1 (MQ=255)
atgttCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAACAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGt < 2:11559641/137‑1 (MQ=255)
aTTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAAAAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAATATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTGCGATTCTGCCAGGt > 2:11019077/1‑140 (MQ=255)
aTTTACATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGt < 1:10216933/140‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTcc < 1:9906952/140‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTcc < 2:7950790/140‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTcc < 1:5118199/140‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTcc < 1:1571004/140‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACACGTTAAGGTGATAGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTcc > 2:9300397/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAgg < 1:5471388/140‑1 (MQ=255)
aCCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAgg < 1:8084082/140‑1 (MQ=255)
gCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCg < 1:62907/140‑1 (MQ=255)
gCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCg > 2:4340104/1‑140 (MQ=255)
tCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGAt < 1:10395948/140‑1 (MQ=255)
tCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGAt < 1:8143190/140‑1 (MQ=255)
tCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGAt < 2:417978/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaa < 2:514149/140‑1 (MQ=255)
ggTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaa > 2:10832237/1‑140 (MQ=255)
ggTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaa > 1:3874378/1‑140 (MQ=255)
gtgtATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaac > 2:10514178/1‑140 (MQ=255)
tgtATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaaca < 1:9024961/140‑1 (MQ=255)
tgtATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaaca < 1:10581951/140‑1 (MQ=255)
tgtATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaaca < 1:4516552/140‑1 (MQ=255)
tgtATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaaca < 2:1280297/140‑1 (MQ=255)
tgtATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaaca < 1:1741958/140‑1 (MQ=255)
tgtATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCcaaca < 2:10081972/140‑1 (MQ=255)
aTTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATg < 1:5904481/140‑1 (MQ=255)
ttAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGc > 2:5018191/1‑140 (MQ=255)
ttAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGc > 1:5304146/1‑140 (MQ=255)
cGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTAt < 1:6456518/140‑1 (MQ=255)
cGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTAt < 1:2605542/140‑1 (MQ=255)
cGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTAt < 1:2387021/140‑1 (MQ=255)
cGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTAt < 1:2187510/140‑1 (MQ=255)
cGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTAt < 2:2295884/140‑1 (MQ=255)
aacaacaacGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCg < 1:7828999/140‑1 (MQ=255)
aacaacaacGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCg > 1:2900954/1‑140 (MQ=255)
caacaacGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGt > 2:3485882/1‑140 (MQ=255)
caacaacGCCCACACCCGTTAAGGTGAGGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAGTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGt < 2:7321402/140‑1 (MQ=255)
ccacGCCCTCACACGTTAAGCGGATGGCAATCAACAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTCTTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCt < 2:7606405/138‑1 (MQ=255)
caacGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCt < 2:559011/140‑1 (MQ=255)
caacGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCt < 1:3620929/140‑1 (MQ=255)
cGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTcaa < 2:7753091/140‑1 (MQ=255)
cGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGAGTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTcaa > 2:8905652/1‑140 (MQ=255)
cccTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTcaaca < 1:4314280/140‑1 (MQ=255)
ccTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAACAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAGTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTcaacaa < 2:10629276/140‑1 (MQ=255)
aCCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGtt > 2:2133137/1‑140 (MQ=255)
ttAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGaa > 2:5795980/1‑140 (MQ=255)
ttAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGaa > 1:8581577/1‑140 (MQ=255)
ttAAGGTGAGGGCAATCAAAAAAGATGCCGGGCAGATGTGTACTTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACCATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGac < 2:3305210/140‑2 (MQ=255)
aGGTGTTGGCAGTCAAAAAAGATGCCGGTCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATGCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCGCAGGAGCGTGAATGCCAACAATGGGTATCGGTGCTCCACCAAGTTATGAACgt > 2:8346157/1‑140 (MQ=255)
gTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACgttg > 2:5291360/1‑140 (MQ=255)
gTGATGGCAAGCAAGATAGATTACGGGCTGATGTGTGCGGCAGCTAGTGCTGGGCCGATTCTGCCCGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGTTTATGCCAACAATGCGTCTCGGAGCTCCACAAAGTTAGGAAAgttg > 2:6467265/1‑140 (MQ=255)
tGATGGCAATCAAAACAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACgttgt < 2:4521109/140‑1 (MQ=255)
gATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACgttgtt > 1:11434198/1‑140 (MQ=255)
gATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACgttgtt > 2:3652157/1‑140 (MQ=255)
tGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTgg > 2:3098120/1‑140 (MQ=255)
ggCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGc > 1:11578112/1‑140 (MQ=255)
tCACAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCg < 1:9520629/140‑1 (MQ=255)
tCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCg < 2:977331/140‑1 (MQ=255)
tCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCg < 2:1033519/140‑1 (MQ=255)
tCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCg < 1:9571230/140‑1 (MQ=255)
aaaGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGt < 1:7526417/140‑1 (MQ=255)
gATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTg < 1:11137084/140‑1 (MQ=255)
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ttACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACCATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGaa < 2:4707555/140‑1 (MQ=255)
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tcaacaccGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTAGTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.101752/143‑1 (MQ=60)
TCAAACCAGAGTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.11390392/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.3745658/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.4629368/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.5139590/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.4491383/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.1671560/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.1662792/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.9189222/151‑1 (MQ=60)
TCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAAC < SRR14920200.1394820/151‑1 (MQ=60)
AAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAG < SRR14920200.3386363/151‑1 (MQ=60)
AAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGC < SRR14920200.7576313/151‑1 (MQ=60)
AAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGC < SRR14920200.6372736/151‑1 (MQ=60)
TTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGG < SRR14920200.1252174/151‑1 (MQ=60)
TTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGG < SRR14920200.8452169/151‑1 (MQ=60)
TTACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGG < SRR14920200.9327898/151‑1 (MQ=60)
ACGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCG < SRR14920200.2028889/151‑1 (MQ=60)
CGGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGC < SRR14920200.5965137/151‑1 (MQ=60)
GGGCTGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGGTTGAACAGTGCCGTGGCGCT > SRR14920200.8556721/1‑151 (MQ=60)
TGATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCC < SRR14920200.10358042/151‑1 (MQ=60)
GATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCA > SRR14920200.4811516/1‑151 (MQ=60)
GATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCA > SRR14920200.1721439/1‑151 (MQ=60)
ATGTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAA > SRR14920200.4145332/1‑151 (MQ=60)
GTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAAT > SRR14920200.11609058/1‑151 (MQ=60)
GTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAAT > SRR14920200.7284596/1‑151 (MQ=60)
GTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAAT > SRR14920200.713381/1‑151 (MQ=60)
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GTGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGATATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAAT > SRR14920200.10223280/1‑151 (MQ=60)
TGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATC < SRR14920200.5069637/151‑1 (MQ=60)
TGTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATC < SRR14920200.4367399/151‑1 (MQ=60)
GTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAACGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCC < SRR14920200.3881985/151‑1 (MQ=60)
GTACGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCAGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCC > SRR14920200.2236517/1‑151 (MQ=60)
CGTCAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCC > SRR14920200.6869981/1‑151 (MQ=60)
CAGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGA > SRR14920200.9269339/1‑151 (MQ=60)
AGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGAC > SRR14920200.4169113/1‑151 (MQ=60)
AGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGAC > SRR14920200.8250285/1‑151 (MQ=60)
AGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGAC < SRR14920200.9691561/151‑1 (MQ=60)
AGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGAC < SRR14920200.10149568/151‑1 (MQ=60)
AGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGAC > SRR14920200.3564360/1‑151 (MQ=60)
AGCTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGAC > SRR14920200.10619786/1‑151 (MQ=60)
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|
GCCAGTCTACATAACTCATCATGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAGTTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGACTT > NZ_CP025268/3308575‑3308875
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |