Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,791,274 |
A→G |
C244R (TGC→CGC) |
waaH ← |
UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,791,274 | 0 | A | G | 99.9%
| 2298.9
/ NA
| 658 | C244R (TGC→CGC) | waaH | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (116/541); minor base T (0/1); total (116/542) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 663 total aligned reads displayed.
CGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACAT > NZ_CP025268/3791138‑3791409
|
cGTTGGCGGGTAAGCATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:1241622/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATCTCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:6294836/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATCTCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:9386797/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGTCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:9735947/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGATATTCAGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:3807844/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:4910452/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:5047220/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:5430776/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:7219685/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:8673108/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:2707185/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 1:9273754/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:3979899/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:4068098/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:426711/140‑1 (MQ=255)
cGTTGGCGGCTAAGACTATCCGGCTCTTGGCGCACCGCAGGTCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTGGCTGATGAATTGCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGt < 2:9644417/140‑1 (MQ=255)
gCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCt < 2:2781249/140‑1 (MQ=255)
gggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTa > 1:8446720/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGAATCTCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTGGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTaa < 2:2271323/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTaa < 2:2386897/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTaa < 2:385264/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTaa < 1:7538247/140‑1 (MQ=255)
gTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAat > 1:6048224/1‑140 (MQ=255)
aaTATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGt < 2:3197528/140‑1 (MQ=255)
atatCCGGCTCTTTGCGCACCTCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTg < 2:10641075/140‑1 (MQ=255)
tCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACg < 1:10234570/140‑1 (MQ=255)
ccGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGt > 1:7785210/1‑140 (MQ=255)
cGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGtt < 2:4463201/140‑1 (MQ=255)
tGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTa > 1:10710214/1‑140 (MQ=255)
gctcACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTaa < 2:10230223/137‑1 (MQ=255)
gcgcACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGTATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTaa < 1:4650824/140‑1 (MQ=255)
gcgcACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTaa < 1:8004166/140‑1 (MQ=255)
gcgcACCGAATCTCAAAAACTCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTTCTGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGGCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTTATCTTAATATAGTTACGTTGATAATTaa < 2:6572499/140‑1 (MQ=255)
cACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGt < 2:2881984/140‑1 (MQ=255)
aCCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTCATATAGTGACGTTGATAATTAAGGtt > 1:2455170/1‑140 (MQ=255)
cGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGtttt > 2:8761659/1‑140 (MQ=255)
gCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGttttt < 1:6421554/140‑1 (MQ=255)
aTGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTAt > 1:2155066/1‑140 (MQ=255)
gCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 1:100048/140‑1 (MQ=255)
gCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 1:1980274/140‑1 (MQ=255)
gCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 1:1047342/140‑1 (MQ=255)
gCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 1:6780539/140‑1 (MQ=255)
cAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTccc < 1:4003694/140‑1 (MQ=255)
aaCACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCtt < 1:18110/140‑1 (MQ=255)
aaCACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCtt < 1:8882341/140‑1 (MQ=255)
aaCACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATATTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCtt < 2:11433787/140‑1 (MQ=255)
acacGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTg > 1:688985/1‑140 (MQ=255)
acacGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTg > 2:3475959/1‑140 (MQ=255)
acGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGt < 2:3636160/125‑1 (MQ=255)
acGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGt > 1:3636261/1‑125 (MQ=255)
gCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTa > 1:9679702/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGtt < 1:4118175/108‑1 (MQ=255)
aTGCCTCGTAAGGTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGc > 2:8575953/1‑140 (MQ=255)
tGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCACTTGTCTATgaa > 2:10990499/1‑138 (MQ=255)
gCCTCGTAAGTGCTTTGCTGATGAAATTCCGGATAACTCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGGAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTGTATTCCCTTGTCTATGCaa < 2:1047674/140‑1 (MQ=255)
ccTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAc < 1:326722/140‑1 (MQ=255)
tCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAg < 2:1837223/113‑1 (MQ=255)
tCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCg > 1:61641/1‑140 (MQ=255)
cGTTAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGTATAAATCATAATTTTGTCGGCATATTTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGa < 1:10579245/140‑1 (MQ=255)
cGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGa < 1:1661319/140‑1 (MQ=255)
tAAGTTATTTGCTGATTAATTTCCTGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 2:4901059/140‑1 (MQ=255)
tAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 2:6830169/140‑1 (MQ=255)
aGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCCGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCa < 2:5011453/140‑1 (MQ=255)
aGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCTGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCa < 1:1213776/140‑1 (MQ=255)
gTTATTAGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGACGGCATAATTTCGATTTAATATCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATTATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGAAACCGACTctc > 2:7506240/1‑138 (MQ=255)
tctttGCTGATGAAACTCCGGATAAAACATAATTTTGTCGGCATAATTACGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:8153245/138‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTaa > 2:8117323/1‑77 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:5641919/140‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:7673964/140‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:10901753/140‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:3475367/140‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:5672035/140‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGAGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTAAGCAACCGACTCACTg < 2:921973/140‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGATGAAAGTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:5393897/140‑1 (MQ=255)
tttGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGAc < 1:11108780/140‑1 (MQ=255)
tttGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGAc < 2:4561024/140‑1 (MQ=255)
atgaAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:5823325/131‑1 (MQ=255)
ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 1:1540419/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:5916725/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:61641/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:113038/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAAGTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:9397359/140‑1 (MQ=255)
gtCCGGACACCTCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATGTAATTTCCCCAGCAGGCGGGTAAACTTCCTATAGTGACGTTGATACTTAACGTTTGTATTCCCTTGTCTCTGCAACCCACTCACGGACGGATTTTGCACat < 2:4824694/139‑1 (MQ=255)
gATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAatat < 1:4370730/140‑1 (MQ=255)
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AACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAAC < SRR14920200.10891638/151‑1 (MQ=60)
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CTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAA < SRR14920200.8586134/151‑1 (MQ=60)
ATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATAT < SRR14920200.2596581/151‑1 (MQ=60)
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GAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTActgtctcttataca > SRR14920200.10732893/1‑137 (MQ=60)
GAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTT < SRR14920200.409913/151‑1 (MQ=60)
ATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATA < SRR14920200.6814216/151‑1 (MQ=60)
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AATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCctgtctcttatacacatctcagag > SRR14920200.9073011/1‑127 (MQ=60)
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ATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGG < SRR14920200.8664499/151‑1 (MQ=60)
TAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGT < SRR14920200.10339650/151‑1 (MQ=60)
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GCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCAC < SRR14920200.3367957/151‑1 (MQ=60)
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|
GCAATCATCCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCT‑TGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAACATGAATTCTGTTGTCCA > NZ_CP025268/3791129‑3791424
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
