Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
443,691 |
T→C |
intergenic (‑126/‑42) |
panE ← / → yajQ |
2‑dehydropantoate 2‑reductase/nucleotide binding protein YajQ |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 443,691 | 0 | T | C | 99.7%
| 2304.2
/ NA
| 661 | intergenic (‑126/‑42) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate 2‑reductase/nucleotide binding protein YajQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (417/242); minor base A (2/0); total (419/242) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.35e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 662 total aligned reads displayed.
GGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGTGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGCCGCGAAGTGGAGTCCCGTTTTGACTT > NZ_CP025268/443554‑443827
|
ggTAATTGTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCgg < 2:5111319/140‑1 (MQ=255)
tAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGt > 2:8591242/1‑140 (MQ=255)
tAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGt > 1:4293427/1‑140 (MQ=255)
tAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGt > 1:736864/1‑140 (MQ=255)
ttttCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGtatt > 1:7134044/1‑140 (MQ=255)
ttCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACCATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGtattat > 1:7624008/1‑140 (MQ=255)
ttCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGtattat > 1:2128995/1‑140 (MQ=255)
ttCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGc > 2:7569801/1‑140 (MQ=255)
cctcctCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCAt < 2:351649/140‑1 (MQ=255)
tcctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑a < 1:5760195/140‑1 (MQ=255)
tcctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑a < 1:6216581/140‑1 (MQ=255)
cAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAgg > 1:2495504/1‑140 (MQ=255)
aCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCAAAATTATGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGga > 2:5876835/1‑140 (MQ=255)
cACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGgaga < 2:3666183/140‑1 (MQ=255)
aCTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGagag > 2:291632/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTCTTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAg > 1:6926452/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAg > 2:1752539/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAg > 2:1540101/1‑140 (MQ=255)
gtTCAATAA‑GCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGc < 1:8128097/140‑1 (MQ=255)
tCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATCCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGcc < 1:8279077/140‑1 (MQ=255)
cAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCTTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCa > 1:1444893/1‑140 (MQ=255)
cAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCa < 1:11468623/140‑1 (MQ=255)
aTAAGGCTCTCCCTAATTTGTGCATGCTGTTTCGACTAGGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAATGATGCCATc < 2:9614202/140‑1 (MQ=255)
aTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATc > 1:4070671/1‑140 (MQ=255)
aTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATc < 2:9711795/140‑1 (MQ=255)
ggCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTc < 1:5336414/140‑1 (MQ=255)
ggCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTc < 2:6132282/140‑1 (MQ=255)
ggCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTGTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTc > 1:5691570/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGa > 2:4763941/1‑140 (MQ=255)
aTCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGata < 2:9049094/140‑1 (MQ=255)
tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGCGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGatat > 2:11326875/1‑140 (MQ=255)
tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGatat > 1:9631311/1‑140 (MQ=255)
tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGatat > 1:9181884/1‑140 (MQ=255)
tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGatat < 2:1991205/140‑1 (MQ=255)
tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGatat > 1:8005172/1‑140 (MQ=255)
tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGagat > 1:5454473/1‑140 (MQ=255)
tCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGagat > 1:11385568/1‑140 (MQ=255)
cccTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAtt < 1:2755707/140‑1 (MQ=255)
tAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGtct < 2:1069276/140‑1 (MQ=255)
aaTTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGtctc > 2:6324072/1‑140 (MQ=255)
aTTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTctct < 1:1961602/140‑1 (MQ=255)
gtgCATGCTGTTGCGACTATGGACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGAGTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAATTGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGaa > 1:9431662/1‑140 (MQ=255)
gtgCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGaa > 1:6813625/1‑140 (MQ=255)
gtgCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGaa > 2:10938434/1‑140 (MQ=255)
gtgCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGAGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGaa > 2:10051963/1‑140 (MQ=255)
gtgCATGCTGTTGCGACTATGCACAAGTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGaa > 1:1226824/1‑140 (MQ=255)
tgCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAg > 2:11587614/1‑140 (MQ=255)
gCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGt < 2:5425747/140‑1 (MQ=255)
gCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGt < 1:3400316/140‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGa < 2:3796712/140‑1 (MQ=255)
ttGCGACTAGGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTc < 1:1404545/140‑1 (MQ=255)
ttGCGACTAAGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTc < 1:8971905/140‑1 (MQ=255)
tGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCa > 1:362578/1‑140 (MQ=255)
tGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCa > 1:8511868/1‑140 (MQ=255)
tGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCa > 2:2433720/1‑140 (MQ=255)
cgCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCa > 2:10830685/2‑140 (MQ=255)
aCTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGaa > 1:11204202/1‑140 (MQ=255)
aCTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGaa < 2:4421579/140‑1 (MQ=255)
aCTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGaa > 1:5932411/1‑140 (MQ=255)
aTGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTCTTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AACAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGTAGCa > 1:3220653/1‑140 (MQ=255)
aTGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGtt < 2:7773353/125‑1 (MQ=255)
aTGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGtt > 1:7773353/1‑125 (MQ=255)
aTGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCa > 1:8708627/1‑140 (MQ=255)
aTGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCa > 1:5046827/1‑140 (MQ=255)
aTGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGGTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCa > 1:2636798/1‑140 (MQ=255)
ccaATTAAGGGAAACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAACCTGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTa < 1:6353255/139‑1 (MQ=255)
aTTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAAcg < 2:8988266/140‑1 (MQ=255)
ttAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAAcgc > 2:7274422/1‑140 (MQ=255)
ttAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAAcgc < 2:2707775/140‑1 (MQ=255)
tAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAAcgcg < 2:8210920/140‑1 (MQ=255)
aGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTctct > 1:10749024/1‑108 (MQ=255)
aGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCGGGAAGCACGTAACGCGGt > 2:1306223/1‑140 (MQ=255)
aGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGACGCCCGTAACGCGGt > 1:9935042/1‑140 (MQ=255)
aGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGt > 2:6686302/1‑140 (MQ=255)
aGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGt > 1:6584673/1‑140 (MQ=255)
aGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGt > 1:10537520/1‑140 (MQ=255)
tACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATGTTCAGGAAGCACGTAAAGCGGTCGATa > 2:10304927/1‑140 (MQ=255)
tACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCa > 1:10956947/1‑124 (MQ=255)
tACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATa > 2:8067319/1‑140 (MQ=255)
cGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAAATTAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTTTAACTTAAGTTGAAATTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATaa > 1:4958140/1‑140 (MQ=255)
cGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCg > 1:1605439/1‑135 (MQ=255)
tGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGTTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAg < 2:2189046/140‑1 (MQ=255)
tGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAg > 2:4999736/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAg > 2:4086582/1‑140 (MQ=255)
ggTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGc > 2:10519129/1‑140 (MQ=255)
gTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGcc > 1:7530113/1‑140 (MQ=255)
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ggACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATC‑AAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGtt < 1:9812443/95‑1 (MQ=255)
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CAATAAGGCTAACCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAAGAAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTGATGAAACTTAGCGGGTATTATGCTTCGCATCACAAATGAAGGGAGCGGACAAGATGCCTTCTTTCGttct > SRR14920161.8625706/1‑147 (MQ=60)
AATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑T > SRR14920161.10016143/1‑151 (MQ=60)
tagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGACGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCT < SRR14920161.6999781/110‑1 (MQ=60)
AGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCT > SRR14920161.5598828/1‑151 (MQ=60)
GGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTC < SRR14920161.10722013/151‑1 (MQ=60)
ATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAGTTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAA > SRR14920161.11502475/1‑151 (MQ=60)
ATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGCTGTCTCT > SRR14920161.3767925/1‑151 (MQ=60)
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ATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCT < SRR14920161.1974569/151‑1 (MQ=60)
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GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCA > SRR14920161.365141/1‑151 (MQ=60)
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TGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAG > SRR14920161.5370832/1‑151 (MQ=60)
GCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGG < SRR14920161.3423256/151‑1 (MQ=60)
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ATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAA < SRR14920161.10423671/151‑1 (MQ=60)
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GCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGC < SRR14920161.8341546/151‑1 (MQ=60)
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TTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACG < SRR14920161.11665179/151‑1 (MQ=60)
TAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGC < SRR14920161.9496866/151‑1 (MQ=60)
GGATACGTCCTGGTGCTGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGC < SRR14920161.1731546/151‑1 (MQ=60)
GGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGC > SRR14920161.9658388/1‑151 (MQ=60)
GGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGC < SRR14920161.10645545/151‑1 (MQ=60)
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GGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGC > SRR14920161.6928800/1‑151 (MQ=60)
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GATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGCC > SRR14920161.7580989/1‑151 (MQ=60)
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TTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGCCGCGAAGTGGAGTCCCGTTTTGACTTCCGTAACGTT > SRR14920161.2349437/1‑151 (MQ=60)
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TGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGCCGCGAAGTGGAGTCCCGTTTTGACTTCCGTAACGTTGA > SRR14920161.11494522/1‑151 (MQ=60)
CGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGCCGCGAAGTGGAGTCCCGTTTTGACTTCCGTAACGTTGAAG > SRR14920161.10642877/1‑151 (MQ=60)
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GCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGTGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAT‑‑‑TGTCTCTGAAGTTGATCTTCAGGAAGCACGTAACGCGGTCGATAACGCGAGCCGCGAAGTGGAGTCCCGTTTTGACTTCCGTAACGTTGAAG > NZ_CP025268/443542‑443841
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |