Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,518,287 |
C→T |
P218S (CCC→TCC) |
ydcT → |
ABC transporter ATP‑binding protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,518,287 | 0 | C | T | 99.7%
| 2841.5
/ NA
| 740 | P218S (CCC→TCC) | ydcT | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (394/342); minor base A (1/1); total (395/345) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 747 total aligned reads displayed.
GATGCAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATCCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATAT > NZ_CP025268/1518151‑1518423
|
gATGCAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATtccc < 2:6655766/140‑1 (MQ=255)
gATGCAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATtccc < 2:10565782/140‑1 (MQ=255)
cAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcg < 1:5381880/140‑1 (MQ=255)
cAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcg < 2:474210/140‑1 (MQ=255)
cAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcg < 2:1425057/140‑1 (MQ=255)
cAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcg < 1:1607812/140‑1 (MQ=255)
gCTGGAACTGAATAAACTGCAACAGTCTCGCGGGATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGAGTCCCcgcgcg < 2:7898904/140‑1 (MQ=255)
gCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcgcg < 1:835779/140‑1 (MQ=255)
gCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcgcg < 1:3446817/140‑1 (MQ=255)
gCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcgcg < 2:11255508/140‑1 (MQ=255)
gCTGGAACTGAAAAAACAGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGAATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcgcg < 1:1116748/140‑1 (MQ=255)
gCTGGAACGGAAACAACTGCAACAGACTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcgcg < 2:7621702/140‑1 (MQ=255)
cTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTTTCAGTTTTATCTTCGTTACCAACGTTCAGTGAGTAGCGTTCGCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCATTGTTGGACGCTTTGAGCAGGTCGATTCGCcgcgcgc > 2:4006480/1‑139 (MQ=255)
cTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCAGTTGTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGGTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTGTCAATAATGGACGCGGGGAGCCGGTCGATTCCCCGCGCGa > 2:9196922/1‑140 (MQ=255)
cTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGa < 2:3618477/140‑1 (MQ=255)
cTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGa > 1:5586324/1‑140 (MQ=255)
tgtaaCTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAt < 2:6844196/137‑1 (MQ=255)
tGGCACTGAAAAACCTGCACCAGTCGCTCGGTATCACTTTTAACTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGGTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATTATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAt < 2:6963280/140‑1 (MQ=255)
tGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCCCGATCAGGGCGAAGCGTTAGCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAt < 2:4467313/140‑1 (MQ=255)
tGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAt < 2:9599497/140‑1 (MQ=255)
tGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAt < 1:4192780/140‑1 (MQ=255)
gAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAtct < 1:7701272/140‑1 (MQ=255)
gAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAtct < 1:7915211/140‑1 (MQ=255)
aaCTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAtctc > 1:3955051/1‑140 (MQ=255)
aaCTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAtctc > 1:10726014/1‑140 (MQ=255)
aaCTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGAtctc > 1:5219001/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaCTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTatat > 2:8938238/1‑140 (MQ=255)
aCTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATACTGGACGCATTGAGCAGGTCGAGTCCCCGCGCGATCTCTAGATGCGcc > 2:7196409/1‑140 (MQ=255)
cAACACTCTCACGGTCTCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCcgcg < 1:10931163/140‑1 (MQ=255)
aaCAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCgcgc > 1:5664333/1‑140 (MQ=255)
aaCAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCgcgc > 2:5148425/1‑140 (MQ=255)
aGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACg < 1:9057537/140‑1 (MQ=255)
gTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGc > 2:10461232/1‑140 (MQ=255)
cGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACg < 1:6518730/133‑1 (MQ=255)
tATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTttgttg > 2:5904005/1‑140 (MQ=255)
tATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTttgttg < 2:10262190/140‑1 (MQ=255)
aTCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGc < 1:3759722/140‑1 (MQ=255)
cTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCggg < 2:376786/140‑1 (MQ=255)
cTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCggg < 2:206566/140‑1 (MQ=255)
cTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCggg < 2:5535431/140‑1 (MQ=255)
tttATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGtt < 1:2682301/140‑1 (MQ=255)
aTCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGAAGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGAAGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCgg > 2:10950369/1‑139 (MQ=255)
gTTACCCACGATCTGGGCGAAGCGTTATCGATGTCGGTTGGTGGGGCGGTTTTGATGTTTGGAGGCTTTGTGCAGGTCGATTCCCCGGGGGATCTGTCTATGGGCCCGCGCACGCGGGTGGTTGCCGGGTGCgggggggg > 2:7397161/1‑133 (MQ=255)
gTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCcgcgc < 1:8840249/90‑1 (MQ=255)
gTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTAc > 2:1065673/1‑140 (MQ=255)
gTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTAc > 1:6998777/1‑140 (MQ=255)
ttACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACa < 1:3215635/140‑1 (MQ=255)
ccACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGAGGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGa < 2:3216429/140‑1 (MQ=255)
cGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATg > 1:6644045/1‑140 (MQ=255)
gATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTCTCTGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGt < 1:9918343/140‑1 (MQ=255)
gATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGt > 1:252142/1‑140 (MQ=255)
gATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGt > 1:3631602/1‑140 (MQ=255)
gATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGt > 1:4528901/1‑140 (MQ=255)
gggCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTg > 1:2322356/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGa < 2:2965517/140‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGa > 1:10027314/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTGTGa > 1:2201410/1‑140 (MQ=255)
gCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGAt < 1:10461232/140‑1 (MQ=255)
gCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGAt < 1:7576434/140‑1 (MQ=255)
aGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGAc < 1:1356390/140‑1 (MQ=255)
cGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCGATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTGTTGATGGACTg > 2:8412144/1‑140 (MQ=255)
ttATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGGTGCCGGGGTCGGTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGAt < 2:2312775/140‑1 (MQ=255)
tATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATg > 1:4866335/1‑140 (MQ=255)
tATCGATGTCCGATCGGGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCCTTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTGTTTGATGGACTGATg > 2:6308350/1‑140 (MQ=255)
aTCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTCTATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTCCATCGAATGGTTTTGATGGACTGATgg > 2:5282669/1‑140 (MQ=255)
aTCGAGGTCCGATCGTGGGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATgg < 1:7288210/140‑1 (MQ=255)
aTGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCaga > 2:4273892/1‑140 (MQ=255)
gTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGAt > 2:9324360/1‑124 (MQ=255)
aTCGTGTGGCGGTTTTCAATACTGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACtt > 2:1699006/1‑140 (MQ=255)
aTCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGTATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAAcgt > 1:1217338/1‑138 (MQ=255)
aTCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACtt > 1:8474710/1‑140 (MQ=255)
aTCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACtt > 2:8180550/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTtg < 2:8025807/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTtgtg > 1:6822216/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTtgtg > 1:9319556/1‑140 (MQ=255)
ggCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTGGCCGGGTTCGTTGGTACATCGCATGTTTTTGATGGACTGATTGCAGCGAAACTTTGTTGCa < 2:1853649/140‑1 (MQ=255)
ttCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACggg < 1:2926395/140‑1 (MQ=255)
tGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCg > 1:7165816/1‑140 (MQ=255)
tGGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCg < 2:6409591/140‑1 (MQ=255)
cGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCt < 1:6063531/140‑1 (MQ=255)
cGCAGTGCGCAGGTCGAGTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTGGGGGCCGGGTTCGTTGGTACATCGACTGTTTTTGCTGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCt < 2:2563866/140‑1 (MQ=255)
gCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTg < 1:621679/140‑1 (MQ=255)
aTTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCg > 2:8764260/1‑140 (MQ=255)
aTTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTGTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCg > 2:11640789/1‑140 (MQ=255)
tGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTCTATGCGCCCGCGCACGCCGTTAGTTGCCGTGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGAAGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCAAGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGAc < 2:6192709/140‑1 (MQ=255)
tGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGAc < 1:1023481/140‑1 (MQ=255)
tGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGAc < 1:9396263/140‑1 (MQ=255)
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GGACGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGG > SRR14920161.9504146/1‑151 (MQ=60)
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CGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAAC < SRR14920161.3045120/151‑1 (MQ=60)
CGCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAAC < SRR14920161.3073809/151‑1 (MQ=60)
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GCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACA > SRR14920161.2035301/1‑151 (MQ=60)
GCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACA < SRR14920161.4597055/151‑1 (MQ=60)
GCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACA < SRR14920161.4596978/151‑1 (MQ=60)
GCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACA > SRR14920161.9575608/1‑151 (MQ=60)
GCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACA > SRR14920161.10723251/1‑151 (MQ=60)
GCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACA > SRR14920161.5412560/1‑151 (MQ=60)
GCATTGAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACA > SRR14920161.9912998/1‑151 (MQ=60)
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GAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTNCATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCC > SRR14920161.6208976/1‑151 (MQ=60)
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GAGCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTGGGTACATCGAATGTTTGTGTTGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCC > SRR14920161.2226697/1‑151 (MQ=60)
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GCAGGTCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGC < SRR14920161.2414907/151‑1 (MQ=60)
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TCGATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAA > SRR14920161.328794/1‑151 (MQ=60)
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ATTCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACAC < SRR14920161.10094790/151‑1 (MQ=60)
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AATTGCGTGAGCAGATGCAGCTGGAACTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTCGGTATCACTTTTATCTTCGTTACCCACGATCAGGGCGAAGCGTTATCGATGTCCGATCGTGTGGCGGTTTTCAATAATGGACGCATTGAGCAGGTCGATCCCCCGCGCGATCTCTATATGCGCCCGCGCACGCCGTTTGTTGCCGGGTTCGTTGGTACATCGAATGTTTTTGATGGACTGATGGCAGAGAAACTTTGTGGCATGACGGGAAGCTTCGCCCTGCGACCGGAACATATCCGCCTCAACACCC > NZ_CP025268/1518138‑1518437
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |