Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,661,562 |
A→G |
*187* (TAA→TAG) |
speG → |
spermidine N1‑acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,661,562 | 0 | A | G | 99.7%
| 2274.6
/ NA
| 659 | *187* (TAA→TAG) | speG | spermidine N1‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (328/327); minor base T (0/2); total (328/331) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 659 total aligned reads displayed.
GTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTAC > NZ_CP025268/1661425‑1661698
|
gTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 2:10013006/140‑1 (MQ=255)
gTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 2:8382266/140‑1 (MQ=255)
gTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 2:6650884/140‑1 (MQ=255)
gTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 1:2199075/140‑1 (MQ=255)
gTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 1:20659/140‑1 (MQ=255)
ttGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCAt < 2:7996223/140‑1 (MQ=255)
atGAAGGAGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATCTCGTAATGCCATTCGCATGTGTATAGTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCAt < 2:11169622/139‑1 (MQ=255)
tGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCAtt < 1:4302475/140‑1 (MQ=255)
aaGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATtaa < 1:10493369/140‑1 (MQ=255)
gTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATtaataa < 1:1135746/140‑1 (MQ=255)
aaTTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATtaataataa > 1:9782124/1‑140 (MQ=255)
aTTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTaataataat > 1:1885629/1‑140 (MQ=255)
tGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAatcgatc > 1:10299829/1‑140 (MQ=255)
cACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGt > 1:6902147/1‑140 (MQ=255)
cACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGt < 1:8850364/140‑1 (MQ=255)
ctaaattaATTGACACTATCGAAATGCCATTCGCATGTGTATAGACCAGCATCAGAAACTGGCAGAGCACAAAACACCGCGACAGACACTCCTGAAGCAGACCGCACAATAGAATTAATAATAATCGATCGTATTTATGa < 2:3479240/136‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:9586943/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:6597847/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:1595289/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:5070240/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:5423884/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:4440342/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:743757/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:3364495/140‑1 (MQ=255)
cTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCAATCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGAACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGATGACGACCGCACAATAGCATTAATAATAATAGATCGTATTTTTGa > 2:812381/1‑140 (MQ=255)
taATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGgtgt < 2:6940269/140‑1 (MQ=255)
aTGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTaa > 2:4810462/1‑140 (MQ=255)
tGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTAACTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTaaa > 1:5853057/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATtaa < 1:2530406/107‑1 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAcc > 1:1371121/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAcc > 1:3188547/1‑140 (MQ=255)
gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCGGAAGCCGACCGCACAATAGCCTTAATAGTAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTaaagc > 2:6182284/1‑138 (MQ=255)
cAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCg > 2:2398871/1‑140 (MQ=255)
atatCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGtt > 2:1805125/1‑140 (MQ=255)
tAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcgg > 1:2751666/1‑140 (MQ=255)
tAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcgg > 2:2173699/1‑140 (MQ=255)
tAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcgg > 1:8709007/1‑140 (MQ=255)
tAATGCCATACGCATGGGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCATTGCACAAAACACAGGGTCATACTCTCCTGAATCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGTTGGTGTAAACCCGATAGAcgg > 2:413841/1‑140 (MQ=255)
aaTGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggc < 1:10975401/140‑1 (MQ=255)
aaTGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggc > 1:10092199/1‑140 (MQ=255)
tGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggcgg > 2:5749434/1‑140 (MQ=255)
ccATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACACGTTCGACGGCGGGt > 2:10775484/1‑140 (MQ=255)
ccATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTATTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGt > 2:4003468/1‑140 (MQ=255)
aTTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGttt > 1:776022/1‑140 (MQ=255)
ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa > 2:4903978/1‑85 (MQ=255)
ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCa < 1:4903978/85‑1 (MQ=255)
ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGtttt > 1:5020339/1‑140 (MQ=255)
ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGtttt > 1:2349315/1‑140 (MQ=255)
cGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTAc > 2:3740494/1‑140 (MQ=255)
cGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTAc > 2:9514393/1‑140 (MQ=255)
gCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACt < 2:2598894/140‑1 (MQ=255)
tgtATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtc > 2:5549826/1‑140 (MQ=255)
tgtATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAANAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtc < 1:6166718/140‑1 (MQ=255)
tataTTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtcat < 1:4099043/140‑1 (MQ=255)
atTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATcaa < 2:2892688/140‑1 (MQ=255)
tCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATcaaca < 2:11535705/140‑1 (MQ=255)
cAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAt < 2:4454142/140‑1 (MQ=255)
cAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAt < 2:7714709/140‑1 (MQ=255)
cATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGAt > 2:9778114/1‑140 (MQ=255)
cATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGAt > 1:10643663/1‑140 (MQ=255)
cATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGAt > 1:7185826/1‑140 (MQ=255)
tCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTa < 1:2946069/140‑1 (MQ=255)
aGTGTCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGc < 1:1080888/140‑1 (MQ=255)
aGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGc > 1:9277330/1‑140 (MQ=255)
aTCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGa < 1:7977023/140‑1 (MQ=255)
tGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAg < 1:1228742/140‑1 (MQ=255)
cAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTcc > 1:3892382/1‑140 (MQ=255)
agagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCa < 1:8312550/140‑1 (MQ=255)
agagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCa < 2:3225725/140‑1 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 1:1485013/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 1:9388155/1‑140 (MQ=255)
agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCAcc > 2:6325867/1‑140 (MQ=255)
caAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGAt < 1:7023099/140‑1 (MQ=255)
aaCACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGGTCGACGGCGGGTTTTACGCCGTCATCAACAAGGTGTAGCTGACAGTCCACCGGATTAg > 1:8525056/1‑140 (MQ=255)
acCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGt < 2:3888974/140‑1 (MQ=255)
cGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa > 2:2769737/1‑140 (MQ=255)
cGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa > 1:7435834/1‑140 (MQ=255)
cGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGATGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa < 2:4648686/140‑1 (MQ=255)
ggTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACCGTCCACCGGATTAGCGTGACt < 1:7584612/140‑1 (MQ=255)
ggTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACt < 1:1156954/140‑1 (MQ=255)
ggTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACt < 2:5242075/140‑1 (MQ=255)
gTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTg > 2:1396401/1‑140 (MQ=255)
gACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCat > 1:3579716/1‑140 (MQ=255)
tctcCTGAAGCCGACCGCACAATAGCTTTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATAtt < 2:9010441/140‑1 (MQ=255)
tcCTGAAGCCGACCGCACACTAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTca < 2:934131/140‑1 (MQ=255)
cTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTcaca > 1:5988584/1‑140 (MQ=255)
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ATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGT > SRR14920161.3332272/1‑151 (MQ=60)
ATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCAGTAATAATAATCGGTCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGT > SRR14920161.8936508/1‑151 (MQ=60)
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AATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTC < SRR14920161.11048750/151‑1 (MQ=60)
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GTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACA > SRR14920161.6028770/1‑151 (MQ=60)
GACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTC < SRR14920161.10556739/151‑1 (MQ=60)
GACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTC < SRR14920161.5232957/151‑1 (MQ=60)
CTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTG > SRR14920161.256662/1‑151 (MQ=60)
TCTCCTGAAGCCGACCGCACAATATCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGT < SRR14920161.4595643/151‑1 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATCGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTG > SRR14920161.1096001/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAT‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCAGATTCACAGCTCTGTT > SRR14920161.6530510/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCctgtctcttat > SRR14920161.2292134/1‑140 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920161.7630559/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920161.3369520/1‑151 (MQ=60)
CTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGACGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTT > SRR14920161.5279778/1‑151 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATACTACTCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT < SRR14920161.9483821/151‑1 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT < SRR14920161.7114456/151‑1 (MQ=60)
TCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTT < SRR14920161.6982200/151‑1 (MQ=60)
CCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCTGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTT > SRR14920161.7969039/1‑151 (MQ=60)
CCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCTGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTT > SRR14920161.3150922/1‑151 (MQ=60)
CCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTT > SRR14920161.5851187/1‑151 (MQ=60)
CCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTT > SRR14920161.5656851/1‑151 (MQ=60)
TGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTAC < SRR14920161.4060587/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920161.497795/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920161.10211417/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920161.7384832/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920161.5716064/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920161.3546403/151‑1 (MQ=60)
AAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACAT < SRR14920161.382923/151‑1 (MQ=60)
aagagacagCAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTAC < SRR14920161.1122665/142‑1 (MQ=60)
ACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAA < SRR14920161.1405766/151‑1 (MQ=60)
CCGCATAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAAC > SRR14920161.8628281/1‑151 (MQ=60)
CCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAAC > SRR14920161.4783594/1‑151 (MQ=60)
CCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAAC > SRR14920161.5048644/1‑151 (MQ=60)
CCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAAC > SRR14920161.5368741/1‑151 (MQ=60)
CGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACC < SRR14920161.2450901/151‑1 (MQ=60)
CGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACC < SRR14920161.932489/151‑1 (MQ=60)
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GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920161.1472173/1‑151 (MQ=60)
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GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920161.4351194/1‑151 (MQ=60)
GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920161.1619226/1‑151 (MQ=60)
GCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCC > SRR14920161.8076669/1‑151 (MQ=60)
CACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCG > SRR14920161.11304436/1‑151 (MQ=60)
CACAAGAGCATTAATAATAATCGATCGTNTTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCG < SRR14920161.6195841/151‑1 (MQ=60)
ACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGT < SRR14920161.1940070/151‑1 (MQ=60)
CAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGT > SRR14920161.2076933/1‑151 (MQ=60)
CAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTT > SRR14920161.9355657/1‑151 (MQ=60)
CAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTT > SRR14920161.6879970/1‑151 (MQ=60)
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ATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgc > SRR14920161.219537/1‑98 (MQ=60)
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|
GCTTGGCTTTTCGGTTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAA‑CCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTACATTACCAACCCGTTGATTA > NZ_CP025268/1661412‑1661712
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
