Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,907,837 |
C→T |
intergenic (‑114/‑25) |
queE ← / → CXP41_RS15220 |
7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE/cell envelope stress response protein YqcG |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,907,837 | 0 | C | T | 99.6%
| 989.9
/ NA
| 260 | intergenic (‑114/‑25) | queE/CXP41_RS15220 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE/cell envelope stress response protein YqcG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (60/199); minor base A (1/0); total (61/199) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.35e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATT > NZ_CP025268/2907700‑2907966
|
cATCTCGTTAATCTGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:2759039/140‑1 (MQ=255)
cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 1:7705709/140‑1 (MQ=255)
cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:100937/140‑1 (MQ=255)
cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 1:5626369/140‑1 (MQ=255)
cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:2569038/140‑1 (MQ=255)
cATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATGGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:1079271/140‑1 (MQ=255)
ctcGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTtaataa > 2:3300769/1‑140 (MQ=255)
ctcGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTtaataa < 1:6485628/140‑1 (MQ=255)
ctcGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTtaataa > 2:8567760/1‑140 (MQ=255)
ctcGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTtaataa > 1:4420651/1‑140 (MQ=255)
cGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCATGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAAtt < 1:1222573/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAAtt < 1:9250437/140‑1 (MQ=255)
gTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTa < 2:11391935/140‑1 (MQ=255)
ttAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATTCGAAACATATCTTTAATAATTaa < 2:5017879/140‑1 (MQ=255)
ttAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaa < 1:1859945/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAACTGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 2:3273598/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:9962649/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:8567760/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:9474714/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:3638455/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 2:765512/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 2:918683/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:10100789/140‑1 (MQ=255)
aTCGTGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACATGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAgg < 2:4725631/140‑1 (MQ=255)
aTCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAgg < 1:9584359/140‑1 (MQ=255)
aTCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAgg < 2:7943505/140‑1 (MQ=255)
aTCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAgg < 1:6807882/140‑1 (MQ=255)
cGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAACAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGa < 2:902889/140‑1 (MQ=255)
cGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGa < 2:5709623/140‑1 (MQ=255)
cGGGTACGTCATAGCAAGCTCTGTGAAGTGTATTATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCAGGTCTTCTTAACATTCTGTGACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGa < 2:9328638/140‑1 (MQ=255)
ggTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTACTTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt < 1:10354738/140‑1 (MQ=255)
ggTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt < 1:9178261/140‑1 (MQ=255)
ggTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt < 1:1122744/140‑1 (MQ=255)
ggTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt < 1:7422246/140‑1 (MQ=255)
gTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTTATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTa < 1:11122410/140‑1 (MQ=255)
gTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTa < 2:11190958/140‑1 (MQ=255)
gTACTGCATAGCAGTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACACTCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTa < 1:8519288/140‑1 (MQ=255)
gTACTGCATAGCAGTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTa < 2:8332964/140‑1 (MQ=255)
tACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 2:384599/140‑1 (MQ=255)
tACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 2:7131804/140‑1 (MQ=255)
tACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 1:9096715/140‑1 (MQ=255)
tACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa > 1:3282390/1‑140 (MQ=255)
tACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 2:6016704/140‑1 (MQ=255)
tACTGCATAGCATTCTATGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 1:3965110/140‑1 (MQ=255)
cATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGtat < 2:560733/140‑1 (MQ=255)
cATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:7844606/114‑1 (MQ=255)
cATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAgg > 2:3464760/1‑124 (MQ=255)
cATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGt < 2:6943721/140‑1 (MQ=255)
tctcTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt > 1:5067674/1‑125 (MQ=255)
tctcTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt < 2:5067674/125‑1 (MQ=255)
tctcTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 2:8489822/127‑1 (MQ=255)
tctcTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGtat > 1:7296371/1‑132 (MQ=255)
ctctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCaga < 2:4798268/140‑1 (MQ=255)
ctctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCaga < 2:9825224/140‑1 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:788820/117‑1 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa > 2:1430371/1‑117 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa > 2:1795158/1‑117 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:1430371/117‑1 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa > 1:700290/1‑125 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTa < 1:10054777/124‑1 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCagaa > 1:1930153/1‑140 (MQ=255)
tctGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATACTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:1795158/117‑1 (MQ=255)
tgtgAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 2:6615261/123‑1 (MQ=255)
gTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCAAAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATaa < 2:1114995/140‑1 (MQ=255)
aTAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGtat > 2:11587988/1‑118 (MQ=255)
aTAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGaa > 2:7358270/1‑140 (MQ=255)
tAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGaaa < 1:5957872/140‑1 (MQ=255)
ttGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa > 2:2385242/1‑101 (MQ=255)
ttGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:2385242/101‑1 (MQ=255)
ttGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa < 2:5954708/109‑1 (MQ=255)
ttAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCaga > 1:4319183/1‑120 (MQ=255)
ttAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCaga < 2:4319183/120‑1 (MQ=255)
ttAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGAt < 2:10547543/140‑1 (MQ=255)
aaTTATTGCAGATCCTTCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATTCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 1:11334715/96‑1 (MQ=255)
aaTTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa > 1:11607678/1‑104 (MQ=255)
tattGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAAt < 1:3048228/140‑1 (MQ=255)
tattGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATGAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAAt < 2:314073/140‑1 (MQ=255)
ttGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTaa > 1:2673040/1‑99 (MQ=255)
ttGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCa > 2:9083753/1‑140 (MQ=255)
tGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt < 2:766526/96‑1 (MQ=255)
gATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCa < 1:3003876/140‑1 (MQ=255)
aTCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGATACATATCGTTAATAATTAAAGGTAGTAACGTATTATGTAAGAAGAAATTAAAGACAATGGATTTAATCATGTCaa < 2:1105863/140‑1 (MQ=255)
ccTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaa < 1:2540082/82‑1 (MQ=255)
tGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACa < 1:8130381/140‑1 (MQ=255)
caaTCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa > 1:7937880/1‑73 (MQ=255)
aTCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTATTCATGTCAAAACATTCACCaata > 2:9607960/1‑138 (MQ=255)
aTCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCaaaa < 2:4138348/140‑1 (MQ=255)
tCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTaa < 2:2728294/57‑1 (MQ=255)
ttattaACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAgg > 1:349215/1‑65 (MQ=255)
ttaACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGt < 1:3341138/78‑1 (MQ=255)
aaCATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTAtttt < 2:7551071/140‑1 (MQ=255)
tGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaa > 1:7636608/1‑50 (MQ=255)
gTTACAGGCATGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTAt < 2:10645413/140‑1 (MQ=255)
gTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa > 1:6298447/1‑39 (MQ=255)
gTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTaaa < 2:6298447/39‑1 (MQ=255)
gTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTa < 2:1303650/46‑1 (MQ=255)
gTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTa > 1:1303650/1‑46 (MQ=255)
aaaTGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt < 1:8364329/35‑1 (MQ=255)
aaaTGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGt > 2:8364329/1‑35 (MQ=255)
aaCATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTATGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAAtt > 2:2536646/1‑140 (MQ=255)
|
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATT > NZ_CP025268/2907700‑2907966
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCAGGGTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATT > NZ_CP025268/2907687‑2907966
|
gacaGGTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTT < SRR14920161.11344534/147‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAAT < SRR14920161.525401/151‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAAT < SRR14920161.3844780/151‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAAT < SRR14920161.5798778/151‑1 (MQ=60)
GTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAA < SRR14920161.7378460/151‑1 (MQ=60)
GTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAA > SRR14920161.4450326/1‑151 (MQ=60)
GTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAA < SRR14920161.10950109/151‑1 (MQ=60)
cgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGATACTTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAAT < SRR14920161.1513327/103‑1 (MQ=60)
tctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.2126739/118‑1 (MQ=60)
cggagatgtgtataagagacagGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.2167145/129‑1 (MQ=60)
ccccttttcaagcagaagacggcatacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.4774075/77‑1 (MQ=60)
ccccccccccccccccccccccccccccccttttcaagcagaagacggcatacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.3593111/51‑1 (MQ=60)
cccccccccccccccccccccccccccccattttcaagcagaagacggcatacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.9423693/51‑1 (MQ=60)
atgtgtataagagacaGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.11564755/135‑1 (MQ=60)
accatcgcgttacgCGGGTACTGCATAGCATGCTCTGTGAAGTGGATAATGGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.11217846/137‑1 (MQ=60)
AACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCTGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.10555342/151‑1 (MQ=60)
AACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.11520045/151‑1 (MQ=60)
AACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.121399/151‑1 (MQ=60)
AACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.1666433/151‑1 (MQ=60)
AACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.9557586/151‑1 (MQ=60)
AACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAG < SRR14920161.7099777/151‑1 (MQ=60)
ctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.912152/119‑1 (MQ=60)
cccccccccccccccccttttcaagcagaagacggcatacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.3870037/64‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTACTCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.10179833/151‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCTTTCTCTGTGTAGTGGATAATTGTTTATTATTGCAGATCCTGCAACAACAATCATGTCTTTTTAACATTCTGTTACAGGCATGTTTAAAGAAAAATGAGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.5575012/151‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.7757794/151‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.5664054/151‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.2004742/151‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.2455491/151‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.2945151/151‑1 (MQ=60)
CATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGG < SRR14920161.3544725/151‑1 (MQ=60)
CTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGT < SRR14920161.6529465/151‑1 (MQ=60)
CTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGT < SRR14920161.1305159/151‑1 (MQ=60)
CGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCATGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAA < SRR14920161.1230826/151‑1 (MQ=60)
CGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAA > SRR14920161.3304553/1‑151 (MQ=60)
CGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAA < SRR14920161.9312613/151‑1 (MQ=60)
GTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTTACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAAC < SRR14920161.11720050/151‑1 (MQ=60)
cagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagTTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACG < SRR14920161.2557126/104‑1 (MQ=60)
TTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACG < SRR14920161.1872239/151‑1 (MQ=60)
TTAATCGGGTACTGCATAGCATCCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACG < SRR14920161.488297/151‑1 (MQ=60)
tgggctcggagatgtgtataagagacaggcAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.2401252/121‑1 (MQ=60)
tctcgtgggctcggagatgtgtataagagacaggtATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTTCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAATAATTCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGTGAGTAACGT < SRR14920161.11410566/116‑1 (MQ=60)
tctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.11410441/118‑1 (MQ=60)
tataagagacagGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTTATTATTGCAGATACTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.1807046/139‑1 (MQ=60)
tataagagacagGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.794161/139‑1 (MQ=60)
tataagagacagGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.564631/139‑1 (MQ=60)
tataagagacagGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.1439938/139‑1 (MQ=60)
cccccccccccccccccccccccccccccattttcaagcagaagacggcatacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.6114499/51‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.4286866/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.6748173/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.6441005/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.3323041/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.3663003/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.3663032/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.4390521/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.9538348/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.10168443/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.1942890/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.10029449/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.1242154/151‑1 (MQ=60)
TAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGT < SRR14920161.8625494/151‑1 (MQ=60)
gacaGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTAT < SRR14920161.3488137/147‑1 (MQ=60)
ATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCCTGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTAT < SRR14920161.7110692/151‑1 (MQ=60)
ATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTCT > SRR14920161.4179934/1‑151 (MQ=60)
ATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTAT < SRR14920161.8180113/151‑1 (MQ=60)
ATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTAT < SRR14920161.9648692/151‑1 (MQ=60)
ATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTAT < SRR14920161.6853816/151‑1 (MQ=60)
TCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATT < SRR14920161.9459839/151‑1 (MQ=60)
CGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTA < SRR14920161.8023319/151‑1 (MQ=60)
CGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTA < SRR14920161.9277496/151‑1 (MQ=60)
CGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTA < SRR14920161.219306/151‑1 (MQ=60)
cccccccccccccccccccccccattttcaagcagaagacggcatacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATG < SRR14920161.8420743/57‑1 (MQ=60)
GGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTACTTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATG < SRR14920161.10424068/151‑1 (MQ=60)
GGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATG < SRR14920161.9239972/151‑1 (MQ=60)
GGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATG < SRR14920161.11287937/151‑1 (MQ=60)
GGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATG < SRR14920161.1130341/151‑1 (MQ=60)
GGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATG < SRR14920161.7472386/151‑1 (MQ=60)
GGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATG < SRR14920161.7471999/151‑1 (MQ=60)
GGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCtgtctcttatacacatctccgagccca > SRR14920161.1489664/1‑124 (MQ=60)
gacagGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.10122137/146‑1 (MQ=60)
cccccccccccccttttcaagcagaagacggcatacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.845721/68‑1 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTTATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.11196762/151‑1 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCCTGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.10133797/151‑1 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGctgtctcttatacac > SRR14920161.7897578/1‑136 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGctgtctcttatacac > SRR14920161.7897178/1‑136 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.3376583/151‑1 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.8411014/151‑1 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.1366905/151‑1 (MQ=60)
GTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.323318/151‑1 (MQ=60)
GTACTGCATAGCAGTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACACTCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGT < SRR14920161.8576703/151‑1 (MQ=60)
TACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTC < SRR14920161.9157902/151‑1 (MQ=60)
TACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTC < SRR14920161.954302/151‑1 (MQ=60)
TACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTC < SRR14920161.7969821/151‑1 (MQ=60)
TACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTC < SRR14920161.6257834/151‑1 (MQ=60)
TACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTAGGTC < SRR14920161.701283/151‑1 (MQ=60)
TACTGCATAGCATTCTATGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTC < SRR14920161.3991723/151‑1 (MQ=60)
CTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGctgt > SRR14920161.5101501/1‑147 (MQ=60)
CTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCct > SRR14920161.8547055/1‑149 (MQ=60)
CTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAG > SRR14920161.7345634/1‑151 (MQ=60)
GCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGctgtctcttatacacatctc > SRR14920161.1162982/1‑131 (MQ=60)
GCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCctgt > SRR14920161.705081/1‑147 (MQ=60)
GCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAA > SRR14920161.1942917/1‑151 (MQ=60)
GCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAA > SRR14920161.9106587/1‑151 (MQ=60)
GCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAA > SRR14920161.161358/1‑151 (MQ=60)
ataagagacagCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAG < SRR14920161.11665557/140‑1 (MQ=60)
CATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAG < SRR14920161.11370120/151‑1 (MQ=60)
CATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAG < SRR14920161.10223072/151‑1 (MQ=60)
CATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAG < SRR14920161.5414469/151‑1 (MQ=60)
ATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGTCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCctgtct > SRR14920161.6659952/1‑145 (MQ=60)
atacgcgatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAAT < SRR14920161.3363427/100‑1 (MQ=60)
atacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATCATGTCTTATTATCATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAAT < SRR14920161.3363684/100‑1 (MQ=60)
CATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAAT < SRR14920161.6367170/151‑1 (MQ=60)
CTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagac > SRR14920161.3023955/1‑117 (MQ=60)
GAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCctgtctcttatacacatctc > SRR14920161.5994627/1‑131 (MQ=60)
GTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGctgtctctt > SRR14920161.4348216/1‑142 (MQ=60)
GGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCctgtctcttatacacatctccgagc > SRR14920161.11685353/1‑126 (MQ=60)
GGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCActgtctcttatacacatctccgag > SRR14920161.3271841/1‑127 (MQ=60)
TAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAAT < SRR14920161.5997817/151‑1 (MQ=60)
TAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAAT < SRR14920161.920287/151‑1 (MQ=60)
AATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATC < SRR14920161.10797460/151‑1 (MQ=60)
ATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCctgtctcttatacacatctccgagcccacg > SRR14920161.2690972/1‑121 (MQ=60)
TTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGctgtctcttatacacatctccgagcccacgaga > SRR14920161.771733/1‑118 (MQ=60)
GTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgc > SRR14920161.34173/1‑89 (MQ=60)
GTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttcggc > SRR14920161.27825/1‑89 (MQ=60)
TATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAAC < SRR14920161.7173378/151‑1 (MQ=60)
TATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAAC < SRR14920161.826158/151‑1 (MQ=60)
TATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAAC < SRR14920161.2560174/151‑1 (MQ=60)
TATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAAC < SRR14920161.1689916/151‑1 (MQ=60)
TATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAAC < SRR14920161.3068629/151‑1 (MQ=60)
TATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAAC < SRR14920161.1840264/151‑1 (MQ=60)
ATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACA < SRR14920161.1898428/151‑1 (MQ=60)
ATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACA < SRR14920161.8580990/151‑1 (MQ=60)
ATTGCAGATCCTGCCACAACAATCAGGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACA < SRR14920161.10630313/151‑1 (MQ=60)
gtgtataagagacagCAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACAT < SRR14920161.4869184/136‑1 (MQ=60)
TTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACAT > SRR14920161.6100910/1‑151 (MQ=60)
GATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACC < SRR14920161.9610214/151‑1 (MQ=60)
GATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACC < SRR14920161.3023972/151‑1 (MQ=60)
GATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACC < SRR14920161.3025387/151‑1 (MQ=60)
TCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgt > SRR14920161.7991440/1‑95 (MQ=60)
TGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAAT < SRR14920161.8185243/151‑1 (MQ=60)
CAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgcgtgaaaagg > SRR14920161.2746604/1‑79 (MQ=60)
ACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgct > SRR14920161.351704/1‑87 (MQ=60)
AATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAATGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTAT > SRR14920161.2668775/1‑151 (MQ=60)
GTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTC < SRR14920161.7407963/151‑1 (MQ=60)
TATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaggggggggg > SRR14920161.7688214/1‑72 (MQ=60)
ATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTAT > SRR14920161.7734443/1‑151 (MQ=60)
CATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAATAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTT < SRR14920161.9200723/151‑1 (MQ=60)
CATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTT < SRR14920161.7591927/151‑1 (MQ=60)
GTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaagggggggggggggggggggg > SRR14920161.6340952/1‑61 (MQ=60)
GTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaatgggggggggggggggg > SRR14920161.9949900/1‑63 (MQ=60)
GTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtattccgtcttctgcttgaaaatgggggggggggg > SRR14920161.1312498/1‑69 (MQ=60)
GTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaggggggggggggg > SRR14920161.1312440/1‑69 (MQ=60)
GAAAAATGCGAAACATATCGTTAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATT < SRR14920161.9485500/151‑1 (MQ=60)
|
GCAGGGTCTGGAACATCTCGTTAATCGGGTACTGCATAGCATTCTCTGTGAAGTGGATAATTGTTAATTATTGCAGATCCTGCCACAACAATCATGTCTTATTAACATTCTGTTACAGGCAGGTTTAAAGAAAAATGCGAAACATATCGTCAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATT > NZ_CP025268/2907687‑2907966
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
