Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,220,876 |
A→G |
T233A (ACT→GCT) |
ygjG → |
putrescine aminotransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,220,876 | 0 | A | G | 99.2%
| 2200.4
/ NA
| 636 | T233A (ACT→GCT) | ygjG | putrescine aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (291/340); minor base T (0/5); total (291/345) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 636 total aligned reads displayed.
CGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGACTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGG > NZ_CP025268/3220739‑3221012
|
cgcTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGCGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCt > 1:9162310/1‑140 (MQ=255)
tCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGt < 1:10084621/140‑1 (MQ=255)
tCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACAGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGt < 1:1140604/140‑1 (MQ=255)
cGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTg < 2:11331085/140‑1 (MQ=255)
cGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTg < 2:5770170/140‑1 (MQ=255)
gCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGAt > 2:1303631/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCg > 2:11143715/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCg > 2:2560831/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCg > 2:5292146/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCg > 2:554488/1‑140 (MQ=255)
cGAATTCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGaa < 2:8593759/140‑1 (MQ=255)
cGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGaa > 2:10531405/1‑140 (MQ=255)
cGAAATCGACCTTCCGAAAACCGTTTATTCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTTGCAATATCGAAGCCATGCGCACGTCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCTaa < 2:8184976/140‑1 (MQ=255)
agAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGACGGGCTTCCGTCATTTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑ACAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGTTCCTCGaa > 2:8724965/2‑140 (MQ=255)
gAACTCGACCTTCCGCAAACCGTGTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATCTCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAAc < 2:6438596/140‑1 (MQ=255)
cGACCTTCCGCAATCCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCTCGGCTCTTTACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATTATGTGTCTGCGGTGATCCTCGAAACGAtt < 2:6059493/140‑1 (MQ=255)
cGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATCTCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGGTC‑TAAAAAACCGGAGATGATGTGGCTGCGGTGATCATCGAACCGAtt < 2:8812349/140‑1 (MQ=255)
cGACCTTCCGCAAACCGTTGATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATCTCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AACAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGAtt < 2:8262743/140‑1 (MQ=255)
gACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTc < 2:2265104/140‑1 (MQ=255)
ccTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAg < 1:5658964/140‑1 (MQ=255)
tCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGt > 1:5416982/1‑140 (MQ=255)
cGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGa < 2:2147359/140‑1 (MQ=255)
aaaCCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAgg < 1:3823745/140‑1 (MQ=255)
aaaCCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAgg < 2:11488759/140‑1 (MQ=255)
aCCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTg > 1:2457902/1‑140 (MQ=255)
tttATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGt > 2:6866457/1‑140 (MQ=255)
tttATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGt > 1:8706397/1‑140 (MQ=255)
gTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCACTATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgc < 1:7741140/140‑1 (MQ=255)
gTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgc > 2:6702307/1‑140 (MQ=255)
cTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgccgcc < 1:7212140/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgccgccg > 1:10666291/1‑140 (MQ=255)
gCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgccgccgc > 1:197905/1‑140 (MQ=255)
gCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgccgccgc < 1:5978017/140‑1 (MQ=255)
ccGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgccgccgcc < 1:6232566/140‑1 (MQ=255)
ccGGGCTTCCGTCATGTGCCGGTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgccgccgcc > 2:5870554/1‑140 (MQ=255)
cGGGCTTCCGTCATGTGCCGTGTGGCACTATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGccgccgccg < 2:11632637/140‑1 (MQ=255)
gCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAACAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGc < 2:7148157/140‑1 (MQ=255)
gCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGc < 1:462145/140‑1 (MQ=255)
cTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCt < 1:10240766/140‑1 (MQ=255)
ccGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTAtc > 1:478829/1‑140 (MQ=255)
ccGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTAtc > 1:9387971/1‑140 (MQ=255)
tcctgtgCCGCTAGGCACTATCGCAGCCAAGCGCTCGGCACTTATCGAGTGC‑AAAAACACCGGTGATGACGTGTCTGCGGGGATCCACGAACAGTTTCATTGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCa < 2:9794215/137‑1 (MQ=255)
tCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCa < 2:3695964/140‑1 (MQ=255)
tgtgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccg > 2:299895/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGTTTGTCAATATCGAAGCCTTGCGCACGTCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:7415384/140‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTTGGCTATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 1:4536147/140‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTTGGCAATATCGACGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 1:7420401/140‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 1:10502278/140‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:3845155/140‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 1:6598106/140‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:7523691/140‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 1:8088327/140‑1 (MQ=255)
tgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGTGTGCAAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:1940879/140‑1 (MQ=255)
tgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AATAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgcc > 1:2209902/1‑140 (MQ=255)
tgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgcc < 2:1047035/140‑1 (MQ=255)
tgCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgcc > 1:5181900/1‑140 (MQ=255)
ccGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCcgt > 2:9211285/1‑140 (MQ=255)
cGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCcgta > 1:2613305/1‑140 (MQ=255)
tttGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCcgtacg > 1:2784875/1‑140 (MQ=255)
ttGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAACAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCcgtacgt < 2:10686584/140‑1 (MQ=255)
gCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTCTCTCACCGCcgtacgtacg > 2:6957527/1‑138 (MQ=255)
tatCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTAt < 1:8400220/140‑1 (MQ=255)
tCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:6270638/124‑1 (MQ=255)
tCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGc > 1:3327790/1‑140 (MQ=255)
tCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGc > 2:7785995/1‑140 (MQ=255)
aaGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGACCCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGAt < 2:3415177/140‑1 (MQ=255)
aaGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGAt > 2:10295185/1‑140 (MQ=255)
aTGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGtt > 1:9813146/1‑140 (MQ=255)
tGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTc > 1:1542759/1‑140 (MQ=255)
tGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTc > 1:5076060/1‑140 (MQ=255)
tGCGCACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTc > 2:4488130/1‑140 (MQ=255)
gcgcACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAACAAACCGGTGATGAGGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCg < 1:6761198/140‑1 (MQ=255)
gcgcACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCg > 2:5209075/1‑140 (MQ=255)
gcgcACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCg > 1:4322434/1‑140 (MQ=255)
cgcACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCgg < 2:2652230/140‑1 (MQ=255)
cACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGgcg < 1:7614151/140‑1 (MQ=255)
cACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGgcg < 1:792048/140‑1 (MQ=255)
cACGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGAGGAGGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCGATCTCACCGCCGTACGGACGCGCTGCGAGGAGTgcggcg > 2:8416122/1‑140 (MQ=255)
aCGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGgcgc < 1:3480004/140‑1 (MQ=255)
ctgCTATTCACGAGTGC‑AAAAAAACCGGATCTGAGTTTGCTGAGGAGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAATGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGAAGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCa < 2:9646104/138‑1 (MQ=255)
cGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCa < 1:4047350/140‑1 (MQ=255)
cGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCa < 2:1528059/140‑1 (MQ=255)
cGGCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCa < 1:8232411/140‑1 (MQ=255)
ggCTCTTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCAc < 1:1711695/140‑1 (MQ=255)
ctctTAACGAGTGC‑AAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACtg > 2:2788283/1‑140 (MQ=255)
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|
AAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGACTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGA > NZ_CP025268/3220726‑3221026
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |