Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,013,520 |
+G |
pseudogene (463/542 nt) |
zapC → |
cell division protein ZapC |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 98.3%
| 2285.8
/ 24.9
| 663 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/5); new base G (338/314); total (344/319) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 702 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCA > NZ_CP025268/1013380‑1013656
|
cGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑gggc > 1:26066/1‑138 (MQ=255)
ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCATGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑gggcga < 1:5907606/140‑5 (MQ=255)
ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑gggcga > 2:3751167/1‑136 (MQ=255)
ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGAT‑gggcga > 2:6419923/1‑136 (MQ=255)
gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGGTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGGGGTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGGT‑gggcgac > 1:38989/1‑135 (MQ=255)
ggCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTAGGCCTGCTGGCACAACCCTTCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTa < 2:5149231/140‑1 (MQ=255)
cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTaaaa < 1:10576659/140‑1 (MQ=255)
tGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTaaaag > 2:6011167/1‑139 (MQ=255)
cGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCa > 1:2511642/1‑140 (MQ=255)
gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCNGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGGTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCAt > 1:10488455/1‑140 (MQ=255)
gTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACg > 2:847142/1‑140 (MQ=255)
ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:8154665/140‑1 (MQ=255)
aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAATTGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGActg > 2:5880357/1‑138 (MQ=255)
aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACACCCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:11309775/1‑140 (MQ=255)
aCTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaa > 1:3744962/1‑140 (MQ=255)
cTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaaa > 2:5271200/1‑140 (MQ=255)
aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:9852676/140‑1 (MQ=255)
aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:8057153/140‑1 (MQ=255)
aCGACCAGGCCAATTTGCGGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:7331135/140‑1 (MQ=255)
gAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTAGGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCa < 2:7058119/140‑1 (MQ=255)
cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCTTGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:1279886/1‑140 (MQ=255)
cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt < 2:10390779/140‑1 (MQ=255)
cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:11110322/1‑140 (MQ=255)
cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:9765273/1‑140 (MQ=255)
cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:11177231/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 2:3265748/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa < 1:3272572/140‑1 (MQ=255)
ggTCAATGTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACGATGCCTGCTGGCACCTCCCTGCGGGGTGATTGCGGGTCGCGCGAGGCTGTTGGGCGACGCCATTAAATTCCTGAACGAGAGGCTGCAACCGCAGGTTa > 2:7178006/1‑140 (MQ=255)
gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgggtca > 1:7188474/1‑136 (MQ=255)
gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:4566504/1‑140 (MQ=255)
gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:1160295/1‑140 (MQ=255)
gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTGGGGATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAGATCAGGAACGACAGGCGGAACCCGCAGGtgcg > 2:6901294/1‑137 (MQ=255)
tttGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTg > 1:5437306/1‑140 (MQ=255)
tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 2:7531950/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCt > 1:1858626/1‑140 (MQ=255)
ggTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCAGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCAGGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCt < 2:2005438/140‑1 (MQ=255)
gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 2:2555654/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGa < 1:6230362/140‑1 (MQ=255)
ggCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCTCATCCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCTTTTAAATCATGTACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGCCAGCTTCAGCCTCGAAcc > 2:5655896/1‑139 (MQ=255)
ggCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACa > 2:10744544/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACa > 1:10788178/1‑140 (MQ=255)
cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg > 1:10184228/1‑140 (MQ=255)
cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:4534045/140‑1 (MQ=255)
cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:5222976/140‑1 (MQ=255)
cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCAATACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGGTATGTTGTTGGGAGACTCCATTAAAATCATGAAAGTCATGCTGAAACCGCAGTTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgt < 2:8699158/140‑2 (MQ=255)
cGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAc > 1:9138833/1‑140 (MQ=255)
cGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTAGTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCAGGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGATAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAc < 2:9627343/140‑1 (MQ=255)
aCTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAcgcg > 2:8076490/1‑140 (MQ=255)
tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGTGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa < 1:2723079/140‑1 (MQ=255)
tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 2:1480351/1‑140 (MQ=255)
tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:6063812/1‑140 (MQ=255)
gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 2:4942244/1‑140 (MQ=255)
gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 1:9938304/1‑140 (MQ=255)
ctgGCACAACCCTGCTTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTGGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCTGTCTAACGCGCCAACTTTAg > 2:4075289/1‑140 (MQ=255)
ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTCACGCGCCAACTTCAg > 2:9141841/1‑140 (MQ=255)
ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 1:5305415/1‑140 (MQ=255)
ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:1745393/116‑1 (MQ=255)
ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 1:9659075/1‑140 (MQ=255)
ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 1:3081437/140‑1 (MQ=255)
ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 1:9024273/140‑1 (MQ=255)
ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:6183545/140‑1 (MQ=255)
ggCACAACCCTGCGTTGTTAGTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTTATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:610954/140‑1 (MQ=255)
ggCACAACCCTGCGTGGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 1:4117198/140‑1 (MQ=255)
cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:1263264/1‑140 (MQ=255)
cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:2677233/140‑1 (MQ=255)
caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:7707768/140‑1 (MQ=255)
caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:3062624/140‑1 (MQ=255)
caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:8312112/140‑1 (MQ=255)
caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:9518190/140‑1 (MQ=255)
aCCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCt > 2:3513326/1‑140 (MQ=255)
cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTcgt > 2:10131923/1‑138 (MQ=255)
tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg > 2:2241848/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg > 1:1688861/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg > 1:6441661/1‑140 (MQ=255)
gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 1:7016529/1‑140 (MQ=255)
cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGtc > 1:9282425/1‑139 (MQ=255)
tgttATTGCGGGACGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGCCAGGCTGAAACAGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac < 1:10004208/140‑1 (MQ=255)
ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc > 2:7708206/1‑89 (MQ=255)
ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCNACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:6795877/1‑140 (MQ=255)
ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:5079655/1‑140 (MQ=255)
ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:5481298/1‑140 (MQ=255)
ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg < 1:2059783/140‑1 (MQ=255)
ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:5716733/1‑140 (MQ=255)
ttATGGCGGGTCGCGCGATGCCGTTGGGCGACGCCAGTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCCGGTGAATGTTGTCAGGATCCGCCGCGAACAGGCAGTCGAGCGCGCCACCGTAAGTGCAGTCGTCGGTACCCAg > 2:6683414/1‑140 (MQ=255)
tATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc > 1:4353585/1‑140 (MQ=255)
tATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 1:8307086/140‑1 (MQ=255)
gCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa < 1:1451876/140‑1 (MQ=255)
gCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:8527306/1‑140 (MQ=255)
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AGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAG < SRR14920199.8459125/151‑1 (MQ=60)
GGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGTCAGC > SRR14920199.8272159/1‑151 (MQ=60)
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GGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCAGTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGC > SRR14920199.4287545/1‑151 (MQ=60)
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TGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCT < SRR14920199.7360679/151‑1 (MQ=60)
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GTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGTTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAC > SRR14920199.9680231/1‑151 (MQ=60)
GTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAC < SRR14920199.557334/151‑1 (MQ=60)
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GTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGG > SRR14920199.10230571/1‑151 (MQ=60)
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TTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCGGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGC < SRR14920199.6460514/151‑1 (MQ=60)
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GAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAG > SRR14920199.3211644/1‑151 (MQ=60)
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GGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTGAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAC < SRR14920199.483289/151‑1 (MQ=60)
GCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACG < SRR14920199.6347266/151‑1 (MQ=60)
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CGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGC < SRR14920199.1438085/151‑1 (MQ=60)
ATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAA > SRR14920199.8132062/1‑151 (MQ=60)
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TGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTGAATGGTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAAC > SRR14920199.8375386/1‑151 (MQ=60)
CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAG > SRR14920199.5328407/1‑151 (MQ=60)
CTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTG < SRR14920199.5850819/151‑1 (MQ=60)
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CTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCT > SRR14920199.7666533/1‑151 (MQ=60)
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GGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCGAACTTAAGTGCAGTCTGCGGT > SRR14920199.1029268/1‑151 (MQ=60)
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GGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGT > SRR14920199.10422025/1‑151 (MQ=60)
GGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGT < SRR14920199.10098135/151‑1 (MQ=60)
GCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACNGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTA > SRR14920199.6012480/1‑151 (MQ=60)
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GCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCCACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACA > SRR14920199.301995/1‑151 (MQ=60)
GCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACA > SRR14920199.2791740/1‑151 (MQ=60)
GCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACA > SRR14920199.253567/1‑151 (MQ=60)
GGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGAGGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAG < SRR14920199.16629/151‑1 (MQ=60)
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CGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAG < SRR14920199.8577436/151‑1 (MQ=60)
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TTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCA > SRR14920199.7175880/1‑151 (MQ=60)
TTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCA > SRR14920199.4800194/1‑151 (MQ=60)
TTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCA > SRR14920199.10059035/1‑151 (MQ=60)
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ggtgGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATT > SRR14920199.3415218/5‑151 (MQ=60)
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G‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCT > SRR14920199.8946153/1‑151 (MQ=60)
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GGGTGCCCATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCT > NZ_CP025268/1013371‑1013668
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |