Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,936,791 |
(G)6→5 |
pseudogene (1097/1180 nt) |
purT → |
formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,936,786 | 0 | G | . | 98.7%
| 3259.9
/ 23.4
| 683 | pseudogene (1092/1180 nt) | purT | formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/2); new base . (294/380); total (301/382) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 748 total aligned reads displayed.
TGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTG > NZ_CP025268/1936648‑1936925
|
tGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgg > 1:8881385/1‑140 (MQ=255)
tGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgg > 1:8504479/1‑140 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCCGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:6560470/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:5580341/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:955642/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:10726622/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:4345471/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:5155423/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 2:1179332/1‑140 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATACTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGACACGTTTGATAATTTGCAGAATGACGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTATATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCtggtgg > 2:1398033/1‑140 (MQ=255)
cTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACAAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgggggtg > 2:11033532/1‑138 (MQ=255)
cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATACTGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa < 2:1018547/140‑1 (MQ=255)
cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa > 2:5934899/1‑140 (MQ=255)
cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAAGGTCACGTGTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa < 1:8440535/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:2545164/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:2590370/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:6205450/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:5768347/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:10296604/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:5431602/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCAGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 2:4776322/140‑1 (MQ=255)
cTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTg > 2:5331767/1‑140 (MQ=255)
ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 1:3303527/140‑1 (MQ=255)
ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACGGACGAGTCAGAATGTCACGTGTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTAGTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 2:10078640/140‑1 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCTGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:11164249/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:5110200/130‑1 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc < 2:9702764/140‑1 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:2808221/1‑140 (MQ=255)
tCTGCAGTTATTCTTCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGAAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:4477539/1‑140 (MQ=255)
tGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCTGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTa > 1:1152724/1‑140 (MQ=255)
gCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTAc < 2:1823508/140‑1 (MQ=255)
ttATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 1:4582083/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 2:228206/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga > 2:6126125/1‑140 (MQ=255)
ccACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtgt > 2:3648629/1‑140 (MQ=255)
ccACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtgt > 2:4546964/1‑140 (MQ=255)
cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 1:1380775/140‑1 (MQ=255)
cTGACCAGTCAGAATGTCACGATTGATAATGAGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTAGCAGAATCGTTTCTTTGGAAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 2:8996917/140‑1 (MQ=255)
gACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACg < 1:4904158/140‑1 (MQ=255)
gACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACg > 2:9351152/1‑140 (MQ=255)
gACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACg > 2:890278/1‑140 (MQ=255)
aCCAGTCAGATTGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCATATTTGCAGATTCGTTTAGTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCATCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCAACTGCAGTGAGTGTTGTTGACGc > 2:11247999/1‑140 (MQ=255)
aCCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGGAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGc > 2:659697/1‑140 (MQ=255)
ccAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGcc > 1:8089575/1‑140 (MQ=255)
gTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCAtt > 1:9506959/1‑140 (MQ=255)
tCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg > 1:7331114/1‑140 (MQ=255)
tGTCACGTTTGATCATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAcgcg < 1:7868788/140‑1 (MQ=255)
tGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAcgcg < 1:405686/140‑1 (MQ=255)
tCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAcgcgcg < 2:9877123/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGaa > 1:3858488/1‑140 (MQ=255)
tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGACGCa < 1:1551203/140‑1 (MQ=255)
tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 1:7733838/140‑1 (MQ=255)
tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 1:3128951/140‑1 (MQ=255)
ttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAc > 1:10015674/1‑140 (MQ=255)
tAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAcgccg < 1:10827379/140‑1 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 2:10416036/140‑1 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa > 2:312681/1‑140 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:6752514/140‑1 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 2:5084817/140‑1 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:9415092/140‑1 (MQ=255)
cAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACa < 1:9679253/140‑1 (MQ=255)
cAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACa < 1:9088551/140‑1 (MQ=255)
aGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAg > 2:7797213/1‑140 (MQ=255)
aaTGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGt > 2:8247882/1‑140 (MQ=255)
tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 2:2158499/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 1:4281964/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTAGTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa > 1:5376049/1‑140 (MQ=255)
gCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaaa < 1:926504/140‑1 (MQ=255)
cGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAACGTGATGGCAGCCGTCGTC‑GGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:1785128/1‑140 (MQ=255)
cGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:8606165/1‑140 (MQ=255)
cGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:7176516/1‑140 (MQ=255)
tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:1049447/140‑1 (MQ=255)
tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 2:4029470/140‑1 (MQ=255)
tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:3603446/140‑1 (MQ=255)
tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:9810739/140‑1 (MQ=255)
tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:7496056/140‑1 (MQ=255)
tAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACCGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:10539365/140‑1 (MQ=255)
aGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 2:8442191/140‑1 (MQ=255)
ggCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACa < 1:3771133/140‑1 (MQ=255)
gcgcAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGACATTGAGGGCAGCCGGCGTCTGGGGGG‑GGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGACGCACGCCGCCGGACAGGGAAAAGTGCAg > 2:1064091/1‑140 (MQ=255)
gcgcAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAg > 1:3430939/1‑140 (MQ=255)
gcgcAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAg > 2:6899114/1‑140 (MQ=255)
tCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaa > 1:2468518/1‑140 (MQ=255)
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ATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGACGTAGGCGCAGATTTGCTGATTCGTTTATTTGTTAAGCCGGTAATTGATGGCATCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTT < SRR14920199.125584/151‑1 (MQ=60)
ATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGGTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCTGAGAGTGGTGTTG > SRR14920199.3220320/1‑151 (MQ=60)
TCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGAC < SRR14920199.7204923/151‑1 (MQ=60)
CTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCATAGAGTGTTGTTGACG > SRR14920199.4118070/1‑151 (MQ=60)
CTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACG > SRR14920199.6965208/1‑151 (MQ=60)
CTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACG < SRR14920199.9482358/151‑1 (MQ=60)
GCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCC > SRR14920199.8892570/1‑151 (MQ=60)
GCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCC > SRR14920199.11206595/1‑151 (MQ=60)
GCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCC > SRR14920199.114484/1‑151 (MQ=60)
GCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGGTTATGTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTC‑GGGGGGTGGCACAGGCTACTGCAGAGAGTGTTGGTGACGCC > SRR14920199.10169422/1‑151 (MQ=60)
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CTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAC < SRR14920199.4581039/151‑1 (MQ=60)
CTGACCAGTCACAATGTCACGTTTGAAAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAC < SRR14920199.2623519/151‑1 (MQ=60)
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AGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCA < SRR14920199.3351260/151‑1 (MQ=60)
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AATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGG < SRR14920199.1019702/151‑1 (MQ=60)
TGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCTTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGT < SRR14920199.4101524/151‑1 (MQ=60)
TGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGT < SRR14920199.8674070/151‑1 (MQ=60)
TGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGT < SRR14920199.6907972/151‑1 (MQ=60)
TGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGT < SRR14920199.10744458/151‑1 (MQ=60)
TGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGT < SRR14920199.2318042/151‑1 (MQ=60)
TGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGAGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGT < SRR14920199.4300403/151‑1 (MQ=60)
GCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTT > SRR14920199.4521762/1‑151 (MQ=60)
CCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTA < SRR14920199.1471259/151‑1 (MQ=60)
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TAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAAC < SRR14920199.10321026/151‑1 (MQ=60)
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AGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACC < SRR14920199.3373960/151‑1 (MQ=60)
AGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACC < SRR14920199.9581453/151‑1 (MQ=60)
GGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCC < SRR14920199.3545350/151‑1 (MQ=60)
CAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACCGGGTTAAACCCGGCA > SRR14920199.11148020/1‑151 (MQ=60)
GATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAA > SRR14920199.5444851/1‑151 (MQ=60)
GATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAACCACCCCCCCGGACAGcttaatgcaaagggaacaacacgtcaat > SRR14920199.4481873/1‑123 (MQ=60)
TTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAA > SRR14920199.3255706/1‑151 (MQ=60)
TTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTAC > SRR14920199.5213601/1‑151 (MQ=60)
CGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAA > SRR14920199.8153840/1‑151 (MQ=60)
GTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAA > SRR14920199.6771133/1‑151 (MQ=60)
GTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAA > SRR14920199.1833916/1‑151 (MQ=60)
TGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCC < SRR14920199.10701821/151‑1 (MQ=60)
GGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAATTTGCCCG > SRR14920199.7790660/1‑151 (MQ=60)
AGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCC < SRR14920199.382897/151‑1 (MQ=60)
AGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCC < SRR14920199.93109/151‑1 (MQ=60)
GCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCT > SRR14920199.5904007/1‑151 (MQ=60)
GGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGA < SRR14920199.7022420/151‑1 (MQ=60)
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GGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTGACTTTTACAGCTTA > SRR14920199.3393651/1‑151 (MQ=60)
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GTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTGACTTTTACAGCTTA > NZ_CP025268/1936641‑1936939
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |